超100種擬南芥測序完成,又一生物理論受到沖擊
自二十世紀上半葉以來,進化論一直認為突變是隨機發生的。德國馬克斯·普朗克生物研究所研究團隊發現,DNA突變并不是隨機的,揭示了一種非隨機模式。該結果于近日發表在《Nature》上,題為:Mutation bias reflects natural selection in Arabidopsis thaliana。 研究人員對數百種,發現了超過100萬個突變,這些突變發生在基因組功能受限區域的頻率較低。與預期相反,在這些突變中,揭示了一種非隨機模式。該研究發現了一些非隨機且具有低突變率的基因組區域,這些區域的突變率比其他區域低三分之一。這些基因組中的重要區域對新突變的有害影響也很敏感。因此,DNA損傷修復在這些區域特別有效。此外,研究人員還發現,通過DNA包裹不同類型蛋白質的方式可以很好地預測基因是否會發生突變,這意味著可以預測哪些基因更有可能發生突變。 總之,該研究加深了我們對進化的理解,與表觀基因組相關的突變偏向減少了擬......閱讀全文
通過擬南芥揭示高溫下植物基因突變的原理
團隊以擬南芥為對象研究多代高溫下植物基因突變的原理(揚州大學供圖) 近日,揚州大學園植學院教授校金飚和農學院徐辰武在《基因組生物學》期刊在線發表題為“多代高溫脅迫下擬南芥全基因組DNA突變研究”的最新研究成果。該研究首次從種群遺傳譜系和單粒種子遺傳譜系兩個層面揭示了長期多代高溫下植物的DN
擬南芥突變體純合植株的獲得
實驗概要本實驗利用農桿菌轉化侵染野生型擬南芥獲得變體純合植株。實驗材料擬南芥(Arabidopsis thaliana, Col-0),培養條件,長日照為16h光照/8h黑暗,22oC;短日照為8h光照/16h黑暗,22oC。實驗步驟1. 擬南芥基因組的小量提取??? 1) 取0.2 g擬南芥葉片,
擬南芥轉基因植株的鑒定
實驗概要本實驗介紹了擬南芥轉基因植株的初步鑒定方法,包括:陽性苗的篩選,GUS基因表達分析,組織PCR和RT-PCR分析。主要試劑0.2%的Triton X-100,10%的次氯酸鈉,含20 mg/L Hygromycin的MS培養基,X-Gluc,75%乙醇,0.25 N NaOH,0.25
擬南芥基因組DNA的提取
實驗概要本實驗介紹了用CTAB法提取擬南芥基因組DNA。主要試劑CTAB提取液(2%CTAB,50mMEDTA,50mM Tris-HCl,PH 8.0,0.84M NaCI,0.05%巰基乙醇),氯仿,無水酒精,70%的酒精主要設備1.5 mL離心管,65℃水浴鍋,高速離心機,研缽實驗材料擬南芥葉
擬南芥轉基因植株PCs含量的測定
實驗概要本實驗測定了轉基因擬南芥總谷胱甘肽(GSH)含量、非蛋白巰基(NPT)含量。主要試劑200 uM CdSO4,5% sulfosalicylic acid(含6. 3 mM diethylenetriaminepentaacetic acid ),Co-enzyme working
轉基因擬南芥研究能提高作物生長速度
加拿大圭爾夫大學研究人員發現,在一種叫做擬南芥(Arabidopsis)的小花植物中插入一種特殊的玉米酶,會使其生長速度加倍,種子產量達到原來的4倍。 這一發現有望提高油菜籽、大豆等重要油料作物和生物燃料作物亞麻薺的產量,也會捕獲更多大氣二氧化碳,有可能給食用作物和生物燃料種植帶來變革。
擬南芥sos突變體在鹽脅迫下的離子流模式
SOS信號轉導途徑在植物離子平衡和耐鹽中非常重要。SOS模型認為高Na+引起了胞內自由Ca2+的升高,激活了Ca2+結合蛋白編碼的SOS3的表達,影響到下游的反應。SOS3激活了相連的SOS2(絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶),SOS2/SOS3復合體調節鹽忍耐因子編碼的SOS1(質膜Na+/H+反向轉運體
擬南芥轉化
實驗概要本實驗以擬南芥為試材介紹了轉化及篩選的過程。主要試劑1. 滲透培養基:(1L)1/2xMurashige-Skoog5%蔗糖0. 5克MES用KOH調至pH5. 7再加:10微升lmg/ml的6-BA母液200微升Silwet L-77Top agar0. 1%瓊脂PNS或水溶液2. 篩選培
基因突變
基因組DNA分子發生的突然的、可遺傳的變異現象叫做基因突變。基因突變是變異的主要來源,也是生物進化發展的根本原因之一。從分子水平上看,基因突變是指基因在結構上發生堿基對組成或排列順序的改變。基因雖然十分穩定,能在細胞分裂時精確地復制自己,但這種穩定性是相對的。在一定的條件下基因也可以從原來的存在
擬南芥的轉化
實驗概要本實驗采用花浸泡法利用農桿菌介導將目的基因轉入擬南芥。主要試劑YEB液體培養基,LB培養基,0.1 M CaCl2,0.05 M MgSO4,花浸泡緩沖液(0.5XMS,5%蔗糖,0. 03%Silwet L-77 ),Rif,Kan主要設備搖床,離心機,培養缽,溫室,托盤,塑料薄膜實驗材料
擬南芥的培養
實驗概要本實驗方法就擬南芥的培養技術進行了簡單介紹。主要試劑1. PNS營養液:每升含2.5m1 1M磷酸緩沖液(pH5.5)5ml 1M KN03,2m1 1M MgSO4.7H20,2m1 1M Ca(N03)a.4H20,2.5m1 20mM? Fe.EDTA,1 ml MS微量兀素。2. 人
研究揭示擬南芥孤兒基因調節花粉發育的分子機制
開花植物中,花粉的形成以及隨后的花粉管生長和受精在植物的育性中具有關鍵作用。花粉的適當發育和成熟對種子植物的遺傳多樣性具有重要影響,對農業作物生產產生重要作用。植物中孤兒基因的出現可能是植物不斷適應環境的進化結果,其功能可能促進植物的生存。近年來,擬南芥特異性孤兒基因Qua Quine Starch
cDNA宏陣列方法分離擬南芥的臭氧應答基因實驗
實驗步驟 ##一、 cDNA 宏陣列的樣品制備培養基: I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 養 基(GibcoBRL, Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料(Hypon
基因定點突變知識
實驗原理基因定點突變是指通過聚合酶鏈式反應(PCR)等方法改變目的基因的序列,包括堿基的插入、缺失、點突變等。基因定點突變是基因研究中比較常用的方法,可以短時間內研究目的DNA所表達的目的蛋白的性狀及表征。定點突變需要設計特定的突變引物。引物長度一般為25-45 bp,建議選擇30-35bp長度
基因突變的誘變機制移碼突變
誘發移碼突變的誘變劑種類較少,主要是吖啶類染料(圖6)。這些染料分子能夠嵌入DNA分子中,從而使DNA復制發生差錯而造成移碼突變。
基因突變的誘變機制自發突變
所謂自發突變是指未經誘變劑處理而出現的突變。從誘變機制的研究結果來看,自發突變的原因不外乎以下幾種。①背景輻射和環境誘變。短波輻射在宇宙中隨時都有,實驗說明輻射的誘變作用不存在閾效應,即任何微弱劑量的輻射都具有某種程度的誘變作用,因此自發突變中可能有一小部分是短波輻射所誘發的突變,有人估計果蠅的這部
基因重組和基因突變區別
1、基因突變是基因的從無到有,突變產生新基因。基因重組是原有基因的重新組合,產生的是新基因型。2、發生的時間:基因重組發生的時期是:減數分裂中四分體時期同源染色體的非姐妹染色單體之間的局部交換和減數diyi次分裂后期非同源染色體的而重新組合;基因突變發生的時間是在有絲分裂和減數分裂的間期。
Nature:科學家揭示擬南芥的突變偏向反映出自然選擇
自二十世紀上半葉以來,進化論一直認為突變是隨機發生的。德國馬克斯·普朗克生物研究所研究團隊發現,DNA突變并不是隨機的,揭示了一種非隨機模式。該結果于近日發表在《Nature》上,題為:Mutation bias reflects natural selection in Arabidopsis
cDNA宏陣列方法分離擬南芥的臭氧應答基因實驗(二)
11.用 mRNA 純 化 試 劑 盒(Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) 將 Poly.(A )+ RNA從總R N A 中分離出來(見注釋5)。####(2) c D N A 文 庫 的 構 建1.取1. 5 ?7. 5 μg poly (A )+ R
cDNA宏陣列方法分離擬南芥的臭氧應答基因實驗(二)
注意事項1.所有的試劑必須用電阻高于 17. 6 的雙蒸水配制。2.提取 RNA 所用的玻璃器具必須于 180°C 烘烤至少 8 h 以滅活 RNase。除緩沖液外的所有溶液都要用 0 ?1 % DEPC水 配 制(見注釋 3)。 RNase 的污染主要來源于實驗人員的手,所以進行 RN A 實驗時
cDNA宏陣列方法分離擬南芥的臭氧應答基因實驗(一)
實驗步驟 ##一、 cDNA 宏陣列的樣品制備培養基: I : 2 (V7 V ) Gamborg B5 培 養 基(GibcoBRL, Rockville, MD), I : 1000(V /V ) Hyponex肥 料(Hyponex 10 : 5 : 10; Hyponex Japan
擬南芥基因研究顯示:環境對遺傳多樣性影響巨大
一項針對多種擬南芥的基因研究表明,環境因素對物種遺傳多樣性和基因組的影響比之前人們預期的更大。相關論文發表在7月20日的《科學》雜志上。?除了實驗室中科學家的“最愛”,世界各地還分布著多種野生擬南芥。它們的生長速度、葉子顏色以及發枝方式都是不同的。在最新的研究中,由德國馬普發育生物學研究所(Max
cDNA宏陣列方法分離擬南芥的臭氧應答基因實驗(一)
除 cDNA 微陣列外,基于尼龍膜支持物的 cDNA 宏陣列方法是又一被廣泛應用的大規模基因表達數據的收集方法。從新基因的發現到基因表達譜的分析, cDNA 宏陣列被應用于分子生物學研究領域的各個方面。盡 管 cDNA 宏陣列的點陣密度低于微陣列,但由于應用靈敏度較高的同位素標記的 cDNA 探針,
基因定點突變step-by-step
本貼先講最簡單的一個點的定點突變技術,其它較長片段的突變,刪除,插入技術以后會慢慢奉上:在做實驗之前,我們首先要搞清楚實驗的目的和實驗的原理。實驗的目的應該比較明確吧:就是要把自己的基因上面的一個堿基換成另外一個堿基。一般情況下我們會有幾種可能使我們需要這樣去做:第一:我們吊出來的基因有點突變,相信
基因定點突變step-by-step
本貼先講最簡單的一個點的定點突變技術,其它較長片段的突變,刪除,插入技術以后會慢慢奉上:在做實驗之前,我們首先要搞清楚實驗的目的和實驗的原理。實驗的目的應該比較明確吧:就是要把自己的基因上面的一個堿基換成另外一個堿基。一般情況下我們會有幾種可能使我們需要這樣去做:第一:我們吊出來的基因有點突變,相信
基因突變的特性
隨機性:基因突變的發生是隨機的,沒有固定的規律可循。 不定向性:基因突變可以影響DNA序列的任何部分,包括編碼區和非編碼區。 有害性:大多數基因突變對生物體是有害的,可能導致疾病或死亡。只有少數突變對生物體是有益的。 可逆性:一些基因突變是可以逆轉的,例如DNA修復機制可以修復某些突變。
基因突變的發展
基因突變首先由T.H.摩爾根于1910年在果蠅中發現。H.J.馬勒于1927年、L.J.斯塔德勒于1928年分別用X射線等在果蠅、玉米中最先誘發了突變。1947年C.奧爾巴克首次使用了化學誘變劑,用氮芥誘發了果蠅的突變。1943年S.E.盧里亞和M.德爾布呂克最早在大腸桿菌中證明對噬菌體抗性的出
如何檢測基因突變?
PCR擴增和測序:PCR擴增可以快速擴增目標DNA片段,然后通過測序技術對擴增產物進行序列分析,從而檢測出基因突變。 基因芯片:基因芯片是一種高通量的基因檢測技術,可以同時檢測多個基因的突變情況。 毛細管電泳:毛細管電泳是一種分離和分析DNA片段的技術,可以通過比較不同樣本的DNA片段長度和
知識分享:基因定點突變
實驗原理 基因定點突變是指通過聚合酶鏈式反應(PCR)等方法改變目的基因的序列,包括堿基的插入、缺失、點突變等。基因定點突變是基因研究中比較常用的方法,可以短時間內研究目的DNA所表達的目的蛋白的性狀及表征。 定點突變需要設計特定的突變引物。引物長度一般為25-45 bp,建議選擇3
基因突變的概念
基因組DNA分子發生的突然的、可遺傳的變異現象(gene mutation)。從分子水平上看,基因突變是指基因在結構上發生堿基對組成或排列順序的改變。基因雖然十分穩定,能在細胞分裂時精確地復制自己,但這種穩定性是相對的。在一定的條件下基因也可以從原來的存在形式突然改變成另一種新的存在形式,就是在一個