RNA干擾相關知識SmallinterferingRNA(siRNA)
Small interfering RNA(siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。......閱讀全文
RNA干擾相關知識Small-interfering-RNA(siRNA)
Small interfering RNA(siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。
Small-interfering-RNA(siRNA)的概念
Small interfering RNA(siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。
Small-interfering-RNA(siRNA)是什么意思?
Small interfering RNA(siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。
RNA干擾相關知識RNARISC
RNA-induced silencing complex(RISC):一種RNA-蛋白質復合物,通過與目標mRNA完全或者部分的互補配對來實施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC,miRNA組裝miRISC。RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型。
RNA干擾相關知識RNARITS)
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一種組織染色質變型的復合物。RITS復合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質,通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。
RNAi制備小分子干擾RNA(small-interfering-RNAs,siRNAs)的方法2
越來越多的研究人員開始采用小分子干擾RNA(small interfering RNAs,siRNAs)來抑制特定的哺乳動物基因表達。siRNA是一種短片斷雙鏈RNA分子,能夠以同源互補序列的mRNA為靶目標降解特定的 mRNA,這個過程就是RNA干擾途徑(RNA interference
RNAi制備小分子干擾RNA(small-interfering-RNAs,siRNAs)的方法1
最適用于:快速而經濟地研究某個基因功能缺失的表型不適用于:長時間的研究項目,或者是需要一個特定的siRNA進行研究,特別是基因治療體內表達前面的3種方法主要都是體外制備siRNAs,并且需要專門的RNA轉染試劑將siRNAs轉到細胞內。而采用siRNA表達載體和基于PCR的表達框架則屬于:從轉染到細
RNA干擾相關知識Microprocessor
Microprocessor:一種核內的復合物,主要由Drosha和Pasha兩者組成,在miRNA的生物合成中促使原始的miRNA成為miRNA前體。
RNA干擾相關知識Slicer
Slicer:在切割型RISC中的內切酶的另外一種表述方法。
RNA干擾相關知識Holo-RISC
Holo RISC:是在果蠅中發現的有著RISC活性的最大的RNA-蛋白質復合物(80S)。Holo RISC的生物學活性牽涉到幾乎所有的RISC的成員,RLC成員,和一些其他通路上的蛋白質分子。Holo RISC的存在,表明了RISC組裝不是孤立的,同時還是一個有序的過程。以RISC為中心的RNA
RNA干擾相關知識Core-RISC
Core RISC:是介導目標mRNA切割過程或者翻譯抑制的最小的RNA-蛋白質復合物。在人和果蠅身上發現的分子量少于200kDa的RISCs可能就是core RISC的重要代表。AGO蛋白質和Core RISC密切相關。
RNA干擾相關知識MicroRNA(miRNA)
MicroRNA(miRNA):是含有莖環結構的miRNA前體,經過Dicer加工之后的一類非編碼的小RNA分子(~21-23個核苷酸)。MiRNA,以及miRISCs(RNA-蛋白質復合物)在動物和植物中廣泛表達。因之具有破壞目標特異性基因的轉錄產物或者誘導翻譯抑制的功能,miRNA被認為在調控發
RNA干擾相關知識Dicer(DCR)
Dicer(DCR):是RNAase Ⅲ家族中的一員,主要切割dsRNA或者莖環結構的RNA前體成為小RNAs分子。對應地,我們將這種小RNAs分子命名為siRNAs和miRNA。Dicer有著較多的結構域,最先在果蠅中發現,并且在不同的生物體上表現出很高的保守性。
RNA干擾相關知識Argonaute(AGO)
Argonaute(AGO):一類龐大的蛋白質家族,是組成RISCs復合物的主要成員。AGO蛋白質主要包含兩個結構域:PAZ和PIWI兩個結構域,但具體功能尚不清楚。研究表明,PAZ結構域結合到siRNA 的3’的二核苷酸突出端;一些AGO蛋白質的PIWI結構域賦予slicer以內切酶的活性。PAZ
RNA干擾相關知識RISC-loading-complex(RLC)
RISC loading complex(RLC):是一種促使RISC形成的復合物。RLC有方向性地調節小RNA雙螺旋,為以后的RISC組裝作好鋪墊。siRISC loading complexes (siRLCs)在果蠅中研究最多。有研究者認為在果蠅中的siRLCs包含DCR2-R2D2異型二聚體
關于小干擾RNA的siRNA設計介紹
最初,siRNA序列的選擇是基于實驗經驗而獲得的(Elbashir et al. 2001,2002)。最近,生物信息學工具被用來設計siRNA(表18-1),目前多個數據庫收錄了經過實驗確證的siRNA和shRNA。值得推薦的是,在設計新的siRNA之前可以通過搜索已有的siRNA數據庫和科研
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(3)
SiRNASmall interfering RNA (siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。ShRNAshRNA 短發夾RNAshRNA
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(2)
1RNA i的發現RNA i是在研究秀麗新小桿線蟲(C. elegans)反義RNA (antisenseRNA )的過程中發現的,由dsRNA 介導的同源RNA 降解過程。1995年,Guo等發現注射正義RNA (senseRNA )和反義RNA 均能有效并特異性地抑制秀麗新小桿線蟲par
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(1)
Rnai最近由于RNA 干擾(RNA interference,RNA i)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在 RNA i領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA 干擾是
關于小干擾RNA的基本介紹
小干擾RNA(Small interfering RNA;siRNA)有時稱為短干擾RNA(short interfering RNA)或沉默RNA(silencing RNA),是一個長20到25個核苷酸的雙股RNA,在生物學上有許多不同的用途。已知siRNA主要參與RNA干擾(RNAi)現象
RNAi表達載體構建
近年來的研究表明,一些短片斷的雙鏈RNA可以通過促使特定基因的mRNA降解來高效、特異的阻斷體內特定基因表達,誘使細胞表現出特定基因缺失的表型, 稱為RNA干擾(RNA interference,RNAi)。siRNA(small interfering RNAs)就是這種短片斷雙鏈RNA分子,能夠
RNAi及基因沉默原理
RNA 干擾(RNAinterference,RNAi)是由雙鏈RNA (double-strandedRNA,dsRNA) 引發的轉錄后基因靜默機制。其原理是:RNaseIII 核酶家族的Dicer,與雙鏈RNA 結合,將其剪切成21 - 25nt 及3'端突出的小干擾RNA (small
RNAi表達載體構建(一)
近年來的研究表明,一些短片斷的雙鏈RNA可以通過促使特定基因的mRNA降解來高效、特異的阻斷體內特定基因表達,誘使細胞表現出特定基因缺失的表型, 稱為RNA干擾(RNA interference,RNAi).siRNA(small interfering RNAs)就是這種短片斷雙鏈RNA分
RNAi術語表
RNAi GlossaryDicer?- Dicer is a member of the RNase III family of nucleases that specifically cleave double-stranded RNAs. Dicer processes long dsRNA
RNAi相關的名詞解釋[英文]
Argonaute?- A family of proteins containing multiple domains and involved in RNA interference (RNAi). Argonatue is the main component of RNAi effector
RNA干擾技術(RNA-interference,RNAi)
1995年,康乃爾大學的Su Guo博士在試圖阻斷秀麗新小桿線蟲(C. elegans)中的par-1基因時,發現了一個意想不到的現象。她們本是利用反義RNA技術特異性地阻斷上述基因的表達,而同時在對照實驗中給線蟲注射正義RNA(sense RNA)以期觀察到基因表達的增強。但得到的結果
RNA干擾主體實驗的相關介紹
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。 RNA干擾主體實驗的重點在于: 成功將siRNA表達載體導入目的細胞 如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。 設置好分組和對照
RNAi的作用機制及siRNA的合成方法(二)
2.3 倍增階段??? siRNA在RNA依賴性RNA聚合酶(RdRP)的作用下,以mRNA為模板,siRNA為引物,擴增產生足夠數量的dsRNA作為底物提供給Dicer酶,產生更多的siRNA, 可再次形成RISC,并繼續降解mRNA,從而產生級聯放大效應。并作用于靶mRNA。如此反復
miRNA、siRNA、dsRNA與shRNA-表示什么意思?
siRNA,shRNA,dsRNA,miRNA間的區別RNA干擾(RNAi),即用20多個核苷酸組成的短的雙鏈RNA(siRNA)代替傳統反義核酸進行轉錄后基因沉默,已經迅速而廣泛地應用到基因功能,基因表達調控機制研究等熱門領域,并為基因治療開辟了新的途徑。近兩年來,這方面的科學論文及報道爆炸性增長
Dicer-Pathway
The degradation of endogenous mRNA in a sequence-specific manner can be induced by dsRNA [RNA interfernce (RNAi)], antisense transcription, or viral i