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  • 迄今最全斑馬魚基因圖譜發布

    一個國際科研團隊在5日出版的《自然·遺傳學》雜志上發布了迄今最全面的斑馬魚基因圖譜。斑馬魚是醫學和生命科學研究領域使用量第二大的動物模型,這一成果將幫助科學家們更好地研究各種癌癥、心臟病和神經退行性疾病,以及在研究中用斑馬魚模型取代哺乳動物模型。 最新研究由DANIO-CODE聯盟開展,該聯盟由來自世界各地的27個實驗室組成。研究論文報告了參與調控斑馬魚基因表達的140000個DNA區域,并詳細介紹了涉及數字胚胎發育階段的DNA的細節。該研究利用了1802個斑馬魚樣本,每個樣本有數百萬個數據點,為轉基因育種和發育、疾病的基因研究提供了最廣泛的候選DNA區域。 該研究負責人之一、英國伯明翰大學發育遺傳學教授費倫茨·穆勒說:“斑馬魚是醫學和生命科學研究領域使用量第二大的動物模型,對斑馬魚的遺傳信息進行如此大規模的編目是一項重大突破,有望為未來幾年最激動人心的醫學和生命科學發展奠定基礎。” 研究人員進一步解釋道:“對醫學和......閱讀全文

    斑馬魚

    一、概述斑馬魚是生長在印度、巴基斯坦淡水河流中的一種硬骨魚(鯉魚),成年魚全身僅長4-5厘米,因全身橫向分布著一道一道褐色的斑馬線而得名。斑馬魚很容易在實驗室飼養,一般3個月就可以達到生殖成熟期,雌魚每次產卵200枚左右,一生可產卵數千枚,斑馬魚所產之卵經24小時即可胚胎發育成熟,仔魚期只有1個月。

    轉基因斑馬魚的構建

    實驗概要本實驗對斑馬魚導入含 EGFP的質粒,觀察其在動物體內的表達情況,在斑馬魚體內,綠色熒光蛋白從原腸胚到出苗期均能在熒光顯微鏡下觀察到綠色熒光。主要試劑EGFP、綠色熒光蛋白基因、pEGFP-N2載體、E.coli主要設備試管、試管架、可調式微量加樣器、電泳儀、電泳槽、染色缸、42℃恒溫水浴箱

    斑馬魚基因編輯技術介紹

    斑馬魚又叫藍條魚,因為其體表有暗藍色和銀色的類似于斑馬一樣的條紋而命名。斑馬魚屬于鯉科魚類,同屬鯉科的還有我們十分熟悉的鯉魚、鯽魚等。斑馬魚的體型較小,成魚體長約4-6厘米,而且成魚常年產卵且產卵量大,可達300-1000粒,還是體外受精并發育,因此十分適合進行實驗室的大規模養殖與篩選。斑馬魚這種原

    定向基因編輯改寫斑馬魚的DNA

      斑馬魚是基因研究中一種常用的模式生物。現在科學家可以對它們的基因組進行定向的編輯。   據Nature近日報導,在對脊椎動物和人類疾病的研究中,斑馬魚是一種重要的模式生物。它的卵是透明的,在體外孵化,它的繁殖周期很短,生長速度快,這些都意味著,很適合在生物生存的條件下對它的胚胎進行密切研究。而

    Dev-Cell:轉基因斑馬魚的彩色皮膚

      美國杜克大學的研究人員,利用基因工程改造的方法,造成單個的皮膚細胞可以產生70種不同顏色的熒光。該研究發表在最近的《Developmental Cell》上。  該團隊并非是為了好玩才做成這樣五彩斑斕的斑馬魚,實際上,他們希望通過顏色標記來研究斑馬魚皮膚的愈合。利用顏色來標記細胞,可以讓斑馬魚皮

    敲降斑馬魚基因的方法學比較

      一、基因敲降的前期準備工作相同   1.1 生物信息學分析目標基因在斑馬魚早期胚胎發送過程中是否有表達。   1.2 收集斑馬魚早期發育胚胎(通常為48 hpf前的胚胎),提取總RNA,然后進行體外轉錄(RT)。   1.3 設計檢測目標基因表達的PCR引物,以1.2獲得的cDNA為模板,

    斑馬魚基因敲除是怎么做的

      一、基因敲除的設計方案   1.1 基因的基本信息   確認斑馬魚基因的基本信息,包括名稱ID號等,一般會在NCBI等查詢。   1.2 分析基因結構、氨基酸序列等做生物學信息的分析   1.3分析蛋白質的保守結構功能域   通過綜合考慮,設計最佳的KO靶點。   1.4

    敲降斑馬魚基因的方法學比較

      一、基因敲降的前期準備工作相同   1.1 生物信息學分析目標基因在斑馬魚早期胚胎發送過程中是否有表達。   1.2 收集斑馬魚早期發育胚胎(通常為48 hpf前的胚胎),提取總RNA,然后進行體外轉錄(RT)。   1.3 設計檢測目標基因表達的PCR引物,以1.2獲得的cDNA為模板,

    Nature:系統解析斑馬魚參考基因組

      斑馬魚(Zebrafish)是研究發育生物學的新興模式動物。斑馬魚由于具有飼育容易、胚胎透明、體外受精、突變種多、遺傳學工具成熟等諸多優點,近年來已成為研究脊椎動物發育與人類遺傳疾病的新興模式動物。   近日,英國桑格研究所(Wellcome Trust Sanger Institute)

    敲降斑馬魚基因的方法學比較

    一、基因敲降的前期準備工作相同1.1 生物信息學分析目標基因在斑馬魚早期胚胎發送過程中是否有表達。1.2 收集斑馬魚早期發育胚胎(通常為48 hpf前的胚胎),提取總RNA,然后進行體外轉錄(RT)。1.3 設計檢測目標基因表達的PCR引物,以1.2獲得的cDNA為模板,進行PCR擴增,確認目標基因

    斑馬魚基因敲除是怎么做的

      一、基因敲除的設計方案   1.1 基因的基本信息   確認斑馬魚基因的基本信息,包括名稱ID號等,一般會在NCBI等查詢。   1.2 分析基因結構、氨基酸序列等做生物學信息的分析   1.3分析蛋白質的保守結構功能域   通過綜合考慮,設計最佳的KO靶點。   1.4

    斑馬魚基因敲除是怎么做的?

    一、基因敲除的設計方案1.1 基因的基本信息確認斑馬魚基因的基本信息,包括名稱ID號等,一般會在NCBI等查詢。?1.2?分析基因結構、氨基酸序列等做生物學信息的分析?1.3分析蛋白質的保守結構功能域通過綜合考慮,設計最佳的KO靶點。?1.4 分析并設計CRISPR,分析其效率及脫靶的情況一般使用C

    斑馬魚顯微CT實驗

    斑馬魚作為傳統的脊椎動物模型已經廣泛應用于人類疾病和胚胎發育過程的研究,斑馬魚全基因已經完全清楚,與人類基因組有85%同源性,這意味著在斑馬魚身上進行的實驗,其結果很多都適用于人類。斑馬魚與其他實驗常用動物相比,具有較高的繁殖率和生長速率,并且其胚胎發育過程是在體外進行的,科研人員通過顯微鏡直接觀察

    斑馬魚出生就識數!

      意大利科學家發現,斑馬魚幼魚在孵化后96小時里可以識別不同數量的黑條,研究者表示這一發現表明數字能力可能在新生斑馬魚中是與生俱來的。相關研究3月24日發表于《通訊—生物學》。  過去的研究表明,人類新生兒和新孵化的孔雀魚、小雞(孵化時腦已經高度發育的物種)具有數學能力。但在此之前,人們對新生時處

    斑馬魚基礎研究

    近期,我們收到了很多小伙伴提交的文獻獎勵申請,其中,有2篇成功吸引了小編的注意,這2篇文章的內容都是斑馬魚研究相關的。我們都知道,斑馬魚是一種常見的模式生物,但是市面上針對斑馬魚的抗體卻非常少,我們不僅有一百多種斑馬魚抗體,而且還可以根據客戶需求來進行定制生產。下面來看看這2篇文章吧。01標題:Sa

    斑馬魚胚胎DNA的制備

    材料和試劑1.????????蛋白酶K(羅氏03115836001)2.??????? 1M的Tris,pH值8.33.??????? 氯化鉀4.??????? 吐溫20(10%,EMD4 biosciences,655207)5.??????? NP40(10%,Merck,492018)設備1.

    斑馬魚胚胎細胞的培養

    成纖維細胞飼養層 原代培養 細胞系 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過用鏈酶蛋白酶除去絨毛膜、用添加成分的 FGF 培養液培養細胞和采用不同的胰蛋白酶消化

    一個抑癌基因可抑制斑馬魚再生

      總有一天,再生醫學會讓醫生能夠矯正先天性畸形,再生受損的手指,甚至修補一顆受損的心臟。但是要做到這一點,他們將必須對付身體的抗癌安全系統。現在,來自加州大學舊金山分校(UCSF)的研究人員,發現了一個人類基因,可能是這種權衡的一個關鍵介質,阻斷腫瘤和健康的再生。延伸閱讀:斑馬魚神經元助力人類出生

    深受科學家的熱愛斑馬魚基因編輯技術介紹

      斑馬魚又叫藍條魚,因為其體表有暗藍色和銀色的類似于斑馬一樣的條紋而命名。斑馬魚屬于鯉科魚類,同屬鯉科的還有我們十分熟悉的鯉魚、鯽魚等。斑馬魚的體型較小,成魚體長約4-6厘米,而且成魚常年產卵且產卵量大,可達300-1000粒,還是體外受精并發育,因此十分適合進行實驗室的大規模養殖與篩選。

    斑馬魚——CRISPR高通量基因功能研究新平臺

      近日,來自美國NIH的研究人員進行了一項研究,他們利用CRISPR-CAS9技術靶向斑馬魚特定DNA序列進行基因功能探索和人類治病基因的發現研究,相關研究成果在線發表在國際學術期刊genome research。  在這項研究中,研究人員發現利用基因編輯技術CRISPR-CAS9進行斑馬魚基因靶

    深受科學家的熱愛斑馬魚基因編輯技術介紹

      斑馬魚又叫藍條魚,因為其體表有暗藍色和銀色的類似于斑馬一樣的條紋而命名。斑馬魚屬于鯉科魚類,同屬鯉科的還有我們十分熟悉的鯉魚、鯽魚等。斑馬魚的體型較小,成魚體長約4-6厘米,而且成魚常年產卵且產卵量大,可達300-1000粒,還是體外受精并發育,因此十分適合進行實驗室的大規模養殖與篩選。

    斑馬魚的基因敲除定制(Cas9KO)法介紹

    利用 CRISPR/Cas9 技術,針對靶基因序列設計 sgRNA,?指導 Cas9 蛋白在特定基因位點引起 DNA 雙鏈斷裂,在非同源性末端接合修復斷裂 DNA 的過程中,靶基因堿基突變或缺失被引入到斑馬魚基因組中,最終導致靶基因無法正常轉錄翻譯,達到基因敲除的目的。目前我們利用 CRIS

    斑馬魚的基因敲除定制(Cas9KO)法介紹

      利用 CRISPR/Cas9 技術,針對靶基因序列設計 sgRNA, 指導 Cas9 蛋白在特定基因位點引起 DNA 雙鏈斷裂,在非同源性末端接合修復斷裂 DNA 的過程中,靶基因堿基突變或缺失被引入到斑馬魚基因組中,最終導致靶基因無法正常轉錄翻譯,達到基因敲除的目的。目前我們利用 CRISPR

    斑馬魚色素細胞如何形成條帶

      一項研究發現,斑馬魚的特征條帶反映了這種動物的皮膚上的色素細胞的運動和它們之間的相互作用。盡管科研人員長久以來就注意到了數學模型可以準確地重現動物界的許多特征條帶和斑點,動物圖案背后的生物過程在很大程度上尚未得到解釋。為了更好地理解這些過程,Hiroaki Yamanaka 和Shigeru

    斑馬魚人類疾病模型的構建

      斑馬魚是唯一的經過大規模遺傳篩選的脊椎動物物種。許多斑馬魚的哺乳動物同源基因已經被克隆,并且發現有相似的功能,證實了斑馬魚作為人類疾病模型的可行性。通過Tol2轉座子技術、基因突變(插入誘變、ENU化學誘變)、基因敲除(TALEN,CRISPER)等技術,構建在特點靶點標記熒光蛋白的轉基因品系及

    基因組學突破性成果:斑馬魚序列解析

      人類發育,生理功能及疾病發生的過程涉及到成千上萬的基因和其變異體,但是大部分的基因和其變異體的功能依然是未知的。過去的20年里,斑馬魚逐漸成為研究人類基因功能的重要模式動物。在《自然》雜志網站發表的兩篇文章里1,2,報道了斑馬魚參考基因組序列和完成超過10,000個蛋白編碼基因的斷裂性突變體的鑒

    斑馬魚造血干細胞生成機理

    法國家日前通過對斑馬魚胚胎進行即時監控,發現了其造血的生成機理。這一成果為醫學界研究白血病療法提供了新思路。該研究由法國國家中心和巴斯德研究所共同完成。研究人員在最新一期英國雜志上報告說,他們采用即時成像對斑馬魚的胚胎進行了觀察。結果發現,斑馬魚胚胎主動脈的部分內皮細胞先是發生卷曲,隨后蜷縮成一團,

    方案27.6-斑馬魚胚胎細胞的培養

    成纖維細胞飼養層 原代培養 細胞系 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過用鏈酶蛋白酶除去絨毛膜、用添加成分的 FGF 培養液培養細胞和采用不同的胰蛋白酶消化

    解鎖電鰻發電之謎,讓斑馬魚發電

    研究人員證實,他們發現的基因控制區只控制肌肉中鈉通道基因的表達,而不控制其他組織。電魚和電鰻一樣,可以根據種類、性別、甚至個體來區分其他電魚,這要歸功于它們的電器官,它還允許它們傳輸和接收類似于鳥叫聲的信息。最近發表在《科學進展》(Science Advances)上的一項研究描述了微小的基因改變是

    研究揭示斑馬魚“自我定位”神經回路

    斑馬魚幼魚能夠弄清它們在哪里,去過哪里,以及如何回到原來的位置。幼體斑馬魚在被洋流推離航道后如何追蹤自己的位置并導航呢?科學家發現,這與一種多區域的大腦回路有關。相關研究近日發表于《細胞》。 “我們研究了一種行為,在這種行為中,斑馬魚幼魚必須記住過去的位移,以準確地保持它們的位置,因為水流可能把

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