中科院、華大基因Nature子刊測序新成果
來自中科院遺傳與發育生物學研究所、深圳華大基因研究院和亞利桑那大學等機構的研究人員完成了對短花藥野生稻(Oryza brachyantha)的全基因組測序，并揭示出了稻屬基因組進化的機制。相關成果發表在3月12日的《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。 中科院遺傳與發育生物學研究所的陳明生(Mingsheng Chen)研究員、華大基因研究院的王俊(Jun Wang)教授和亞利桑那大學的Rod A. Wing教授為這篇論文的共同通訊作者。 以全面測序模式生物基因組為基礎的比較基因組學獲得了一些關于基因和基因組進化的認識。在植物中，全基因組復制、轉座因子和序列重排使得基因組組構復雜化。甚至如擬南芥屬或稻屬中的近緣物種其基因組大小、基因數量和基因共線性也存在顯著的波動。到目前為止，主要是在一個遠程進化時間范圍內全面測序植物基因組，限制了推論基因組改變機制的能力。而比較分析短進化......閱讀全文
基因組測序揭示須鯨的罕見進化模式
單一物種如何演化成兩個新物種？進化學家給出的答案通常是地理隔離。不過，有時沒有地理隔離也能產生新的物種，這種罕見的情況被稱為同地物種形成（sympatric speciation）。根據瑞典和德國的最新研究成果，須鯨正是經歷了這種同地物種形成。 文章的共同第一作者、德國法蘭克福大學的Fritj
最新果蠅基因組測序，展現奇妙的進化
對真核生物進行全基因組測序在二十世紀還是一項了不起的大工程，直到2000年末人們還只完成了四項這樣的研究。不過自那以后，測序技術的飛速進步使全基因組測序對于許多研究團隊來說觸手可及，現在每隔不久就會涌現出一項新的測序成果。日前，維也納獸醫大學Christian Schl?tterer研究組的
基因組測序揭示多細胞生物進化之謎
最近，研究人員通過對各種綠藻進行基因組測序，已經接近于解開了“引起多細胞生物的遺傳變化”的謎團。 從單細胞生物到多細胞生物的過渡，是地球上生命進化的關鍵進步；在不同的系統發育譜系中，這種改變已經獨立地發生了多次。了解“有多少基因以及有哪些基因，對單細胞祖先成為多細胞來說是必要的”，是一個有趣的
基因組測序挑戰由來已久的進化理論
在Lewis Carroll寫的《愛麗絲魔鏡之旅》（Through the Looking-Glass）這本書中，紅皇后向愛麗絲解釋說：“你必須盡力地不停奔跑，才能使你保持在原地。”用中國話說就是“逆水行舟，不進則退”。 在逆水中要保持在原來的地方，也要不停地盡力地劃。或者更形象地比喻為魚兒在急
基因組測序揭示龜鱉軀體發育及進化機制
龜鱉類有著漫長且成功的演化歷史，是形態學上最為特化的爬行動物之一。全球共有龜鱉類動物13科、89屬、270余種，被分為兩個特征明確的支系 ——側頸龜亞目和曲頸龜亞目。中華鱉和綠海龜分別是曲頸龜中鱉類和海龜類的典型代表，對其進行基因組學研究，有助于理清龜鱉類系統發育及其軀體進化機制。 日
454測序參與棉花基因組進化研究工作
棉花是全球重要的經濟作物之一。它的纖維，俗稱皮棉，是紡織工業主要的天然原料。全世界棉花種植面積約5億畝，我國常年種植面積近8千萬畝。棉花不但是重要的纖維和油料植物，而且是重要的植物蛋白來源。在食用油中，棉籽油的亞油酸含量最高，達到55.6%。除此以外，棉花種子中還含有極為豐富的蛋白質和脂肪等物質
我國領銜完成木薯基因組測序并揭示其進化特征
記者從9月13日在海南海口召開的973項目“重要熱帶作物木薯品種改良的基礎研究”課題驗收會上獲悉，我國科學家同步完成了木薯野生祖先種和栽培種兩個全基因組測序，首次揭示了栽培木薯高光效、光合產物運輸及淀粉高效積累途徑基因的進化特征，這為今后通過分子定向設計育種培育出“超級木薯”奠定了良好的基礎。
全基因組測序揭示喀斯特植物適應性進化機制
中國南方喀斯特起源古老、分布廣泛，被認為是生態與進化研究的“天然實驗室”。中國科學院華南植物園研究員康明團隊等完成了首個喀斯特植物懷集報春苣苔的全基因組測序。相關研究近日在線發表于《新植物學家》。 喀斯特植物是我國植物多樣性和特有性的重要組成部分，但迄今為止對喀斯特植物的多樣性起源和適應性進
猿類基因組測序為人類進化研究提供“里程碑”視角
經過20多年的努力，科研人員成功地對6種現存猿類的基因組進行了完整測序，為研究人類進化提供了近距離視角，這被英國《自然》雜志稱為“遺傳學的一個里程碑”。 123名來自多個國家和地區的科研人員組成的團隊9日在《自然》發表了這項研究結果，預計將有助猿類保護，并增進科學家對人類進化的理解。 基因組
基因測序技術進化史
DNA上承載了關于我們的太多信息：發展史、祖先、特征、疾病易感性、甚至性格和命運。因此很多人迫不及待地想將DNA看得一清二楚。解碼人類基因組的第一次鄭重嘗試是始于1990年的人類基因組計劃。盡管合作和艱苦工作無疑扮演了重要角色，但一系列工程上的突破推動了這個項目，以前所未有的速率收集并核對數據。
基因組的進化特征
基因組不僅僅是生物體基因的總和，基因組還含有其它可以考慮特定基因及其產物的特征。復制在基因組的塑造過程中起了重要作用。復制的范圍包括短串聯重復序列的延伸、基因簇的復制、整個染色體甚至整個基因組的復制。這種復制可能是創造遺傳新性狀的基礎。
什么是基因組進化？
基因組不僅僅是生物體基因的總和，基因組還含有其它可以考慮特定基因及其產物的特征。復制在基因組的塑造過程中起了重要作用。復制的范圍包括短串聯重復序列的延伸、基因簇的復制、整個染色體甚至整個基因組的復制。這種復制可能是創造遺傳新性狀的基礎。
我國科學家對桃進行全基因組重測序－繪制進化路線
我們平時吃的桃是如何進化而來的？近日，一項針對桃的全基因組重測序研究揭開了這一謎底。該研究對84份桃種質進行重測序，在全基因組水平上繪制了從光核桃到普通桃的進化路線，并鑒定了與人工選擇相關的候選基因，揭示了桃的進化歷史及人類活動對果樹的影響。 這項研究由中國農業科學院鄭州果樹研究所王力榮研究團
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
解碼“基因組學之父”桑格：測序，測序，測序
“桑格當之無愧地被稱為‘基因組學之父’，他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎，徹底變革了生物學并極大促進了當今的醫學發展。”、 有一天，65歲的英國生物化學家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗，轉身走出實驗室，宣布自己正式退休。那一年是1983
二代測序技術助龍膽族葉綠體基因組進化和系統學獲進展
隨著二代測序技術的發展，植物葉綠體基因組序列已普遍應用于重建植物“生命之樹”研究中。大多數植物葉綠體基因組呈環狀四分體結構，包含約80個蛋白編碼基因。葉綠體基因組由于缺乏重組，而常被認為是連鎖的單一基因座；然而，越來越多的研究表明，葉綠體基因組中不同區域以及不同編碼基因具有不同的核酸替代速率，經
認識泛基因組測序
什么是泛基因組？2005年，Tettelin等人提出了微生物泛基因組概念（pangenome，pan源自希臘語‘παν’，全部的意思），泛基因組即某一物種全部基因的總稱。2009 年，Li等人首次采用新全基因組組裝方法對多個人類個體基因組進行拼接，發現了個體獨有的DNA序列和功能基因，并首次提出了“
PNAS：甜瓜基因組測序
甜瓜在世界范圍具有很高的經濟價值，日前西班牙的九個研究中心通力合作，利用羅氏454平臺完成了甜瓜基因組的測序。除了甜瓜的全基因組，科學家還得到了 7個特定甜瓜品種的基因組，文章發表在Proceedings of the National Academy雜志上。 聯合國糧農組織2009年
基因組測序儀簡介
基因組測序儀是一種用于生物學領域的分析儀器，于2012年12月19日啟用。 技術指標 個體化基因組測序儀主機/ION TORRENT主機。 主要功能 樣品處理、快速的運行時間以分析單個或多個樣品 支持多重文庫，從而實現最大的效率和經濟性 可在必要時禁用個別測序通道，以節約試劑用量。
關于全基因組測序的測序指標介紹
一、全基因組測序的測序指標— 深度 測序深度（Sequencing depth）是指測序得到的堿基總量（bp）與基因組大小的比值，它是評價測序量的指標之一。測序深度與基因組覆蓋度之間是一個正相關的關系，測序帶來的錯誤率或假陽性結果會隨著測序深度的提升而下降。測序的個體，如果采用的是雙末端或Ma
NEJM：利用基因測序譜寫“腫瘤進化樹”
近幾年來，腫瘤產生耐藥突變以逃逸靶向治療的假說已被業內科學家所默認。最近一段時間，幾項重要的研究對這一假說進行了充分的證實，腫瘤學家Charles Swanton領導的肺癌癌癥進化阻斷計劃（TRACERx）讓耐藥逃逸的假說逐漸為更多人所認可。 為了使TRACERx計劃能夠充分證實部分腫瘤細胞耐
關于基因組的大小和進化介紹
1、基因組大小： 基因組大小是一個拷貝的單倍體基因組中DNA堿基對的總數。 基因組大小與原核生物和低等真核生物的形態復雜性呈正相關 [8]。然而，在軟體動物和上述所有其它高等真核生物之后，這種相關性已不再存在 [8]，主要是因為重復DNA的緣故。 2、基因組進化： 基因組不僅僅是生物體基
蝴蝶基因組大小進化進展－發現表型多樣性進化遺傳基礎
蝴蝶因其豐富的形態多樣性，自達爾文時代就作為研究物種適應性進化的重要類群之一，近幾年更被認為是研究形態遺傳、進化和發育的理想模型，已成為發育生物學、進化生物學、種群遺傳學、保護生物學和生態學等研究領域的重要模式生物之一。 中國科學院昆明動物研究所科研團隊在2015年完成所有蝴蝶模式種金鳳蝶及其
454測序用于美洲奶牛種牛基因組測序項目
一只名為Pawnee Farm Arlinda Chief的種牛和它的兒子Walkway Chief Mark大約有60000個后代，其后代是牛奶生產的主力。最近一項研究中1，科學家通過454全基因組測序，掌握了他們的基因組中控制重要性狀的基因，包括抗病能力、牛奶產量，這些性狀已通過北美的當
盤點最新基因組測序成果
the scientist雜志發表文章盤點了幾項最新的基因組測序成果以饗讀者： 種屬：非洲腔棘魚（Latimeria chalumnae） 基因組：~2.86 billion bp 人們曾經認為腔棘魚早在七千萬年前就已滅絕，直到1938年一只腔棘魚在南非海岸被漁民捕獲。這種魚看上去跟三億年
白肉靈芝完成基因組測序
?在韶關產業園種植的白肉靈芝。吳清平團隊 供圖 近日，中國工程院院士、廣東省科學院微生物研究所名譽所長吳清平團隊完成了第一個白肉靈芝全基因組測序。據悉，這是世界上首次對白肉靈芝的基因組進行組裝和注釋。相關研究發表于《G3：基因，基因組，遺傳學》（G3-Genes Genomes Genet
讓基因組測序繞過PCR
?在基因組測序中，PCR擴增似乎是繞不過去的一步。然而，PCR也帶來一些問題，包括不均勻擴增，導致某些序列的比例過高。對目前的新一代測序（NGS）平臺而言，測序某些堿基組成上存在嚴重偏向的基因組區域仍是一大挑戰。在GEN雜志上，Patricia Fitzpatrick Dimond博士介紹了PCR-
測序解讀基因組，真的好嗎？
測序解讀基因組，真的好嗎？ “對基因組了解過多也不全是好事。”貝勒醫學院生物醫學倫理學副教授、醫學倫理和健康中心主任Amy McGuire，在今年舊金山舉辦的TEDMED機構年度大會上說，“尤其是對自己基因組信息的了解。” 雖然McGuire 從事人類基因組學研究已有多年，但
454用于西紅柿基因組測序
最近，西紅柿基因組學會完成了一個農業種植西紅柿品系Solanum lycopersicum的基因組圖譜，以及一個野生型西紅柿品系S. pimpinellifolium的基因組圖譜，并將其與已知的土豆基因組以及其他植物比較，尋找與水果有些特性相關的基因，相關文獻在Nature雜志作為封面文章發
Nature突破：香蕉基因組測序
由法國的研究人員領導的一個國際小組近日完成了對香蕉品種小果野蕉(Musa acuminata)的基因組測序，并開始分析這一基因組草圖。相關研究成果發布在了7月11日的《自然》(Nature)雜志上。 研究人員采用Roche 454、Sanger和Illumina的測序方法繪制出了雙單倍