國際科研團隊繪制出人類心臟細胞圖譜
一個國際科研團隊最近在英國《自然》雜志上發表論文說,他們繪制出迄今最詳盡、全面的人類心臟細胞圖譜,涵蓋心臟的8個部位、75種細胞狀態。 該研究由英國惠康桑格研究所等機構參與,屬于國際項目“人類細胞圖譜”的一部分。新圖譜相當于一份分子水平的心臟“導游圖”,可幫助深入理解心臟細胞的運作,探究心臟疾病發病機制,開發新療法。 研究人員利用來自25位心臟移植手術捐贈者的組織樣本,結合單細胞測序和空間轉錄組測序技術,對各種心臟細胞和它們所處的微環境進行了詳細描繪。這些捐贈者年齡在20歲至75歲之間,均無心臟病或心律失常病史,其細胞代表了成年人心臟細胞的正常狀態。 新圖譜的一個亮點是對心臟的“供電網絡”——心臟傳導系統的描繪,包括心臟起博點竇房結的詳細結構,以及起博細胞與心臟膠質細胞的相互作用等,將幫助預防和治療心律失常。研究還發現,心外膜上有一個由漿細胞組成的免疫結構,可產生抗體,抵抗來自肺部的感染。 研究團隊還開發出一種運算工......閱讀全文
《細胞》:單細胞測序助力基因重組圖譜
來自斯坦福大學醫學院等處的研究人員發表了題為“Genome-wide Single-Cell Analysis of Recombination Activity and De Novo Mutation Rates in Human Sperm”的文章,首次公布了來自一個成人男子91個
PNAS:單細胞測序繪制大腦的細胞圖譜
斯坦福大學的著名學者Stephen Quake及其同事本周在《美國科學院院刊》(PNAS)上發表文章,介紹了人類腦細胞的單細胞轉錄組測序研究成果。 研究小組對近500個成人或胎兒腦細胞進行了單細胞RNA測序。利用這種方法,他們能夠鑒定出大腦中所有主要的細胞類型,并確定神經元的亞型。他們還觀察了
Nature重磅成果:人類心臟細胞的圖譜
砰……砰……砰”盡管大多數時候我們幾乎沒有注意到它,但是我們體內穩定的心跳聲其實是一種復雜的機理表現,就像是樂團一樣,成千上萬的細胞必須掌握各自的演奏節奏,并共同努力。近,一組科學家創建了人類心臟細胞的個圖譜,這些圖集展示了將近50萬個心臟細胞,確定了每種細胞在心臟交響樂中的作用!研究人員檢查了14
單細胞測序揭示肺癌腫瘤免疫細胞亞型的細胞圖譜
最近免疫療法的出現標志著多種癌癥的研究和護理發生了巨大變化,給世界各地的患者和家庭帶來了新的希望。對于那些對治療有反應的人來說,結果可能是激動人心的。激活病人的癌癥免疫系統可以殺死或縮小腫瘤,在某些情況下,會導致完全緩解。 盡管取得了重大進展,但只有少數人從免疫治療中獲益,原因尚不清楚。 免
Cell:單細胞測序繪制骨髓基質細胞全景圖譜
最新發布在Cell上的一項研究表明,單細胞測序可以繪制骨髓基質細胞的完整類群,并為白血病研究提供新的視角。這一新研究由美國哈佛大學的David T. Scadden教授和馬薩諸塞州綜合醫院Broad研究所的Aviv Regev團隊合作而成。他們創新地使用單細胞RNA測序(scRNA-seq)技術
國際科研團隊繪制出人類心臟細胞圖譜
一個國際科研團隊最近在英國《自然》雜志上發表論文說,他們繪制出迄今最詳盡、全面的人類心臟細胞圖譜,涵蓋心臟的8個部位、75種細胞狀態。 該研究由英國惠康桑格研究所等機構參與,屬于國際項目“人類細胞圖譜”的一部分。新圖譜相當于一份分子水平的心臟“導游圖”,可幫助深入理解心臟細胞的運作,探究心臟疾
國際科研團隊繪制出人類心臟細胞圖譜
一個國際科研團隊最近在英國《自然》雜志上發表論文說,他們繪制出迄今最詳盡、全面的人類心臟細胞圖譜,涵蓋心臟的8個部位、75種細胞狀態。 該研究由英國惠康桑格研究所等機構參與,屬于國際項目“人類細胞圖譜”的一部分。新圖譜相當于一份分子水平的心臟“導游圖”,可幫助深入理解心臟細胞的運作,探究心臟疾
Nature重磅!利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一,在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是,肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%,就能夠完全再生的內臟器官。另外,包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一,也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要,但健康
Nature重磅!利用單細胞RNA測序構建人類肝臟細胞圖譜
肝臟是人體最大、功能最多的器官之一,在人體的新陳代謝及免疫過程中發揮著關鍵作用。更值得關注的是,肝臟還是人體唯一一種僅需原體積的25%,就能夠完全再生的內臟器官。另外,包括脂肪肝、肝癌及肝炎在內的各類肝病是當今世界最大的健康問題之一,也是導致死亡的主要原因。 盡管肝臟對人類健康極為重要,但健康
基于單細胞測序繪制腫瘤微環境相關細胞代謝圖譜
腫瘤作為一個異常復雜的“生態系統”,不同類型的腫瘤細胞與非腫瘤細胞共同構成了腫瘤微環境。腫瘤存在腫瘤間異質性和腫瘤內異質性,可以說腫瘤內每種細胞都存在于不同的微環境中,每種細胞都可能有不同的代謝狀態。由于異質性,腫瘤細胞會通過改變自身代謝模式(即“代謝重編程”)來適應不同的微環境,以滿足其對能量
構建單細胞圖譜,將心臟細胞重編程為健康的心肌細胞
每年有79萬名美國人遭受心臟病發作,這會讓受損的瘢痕組織存在于心臟中,并限制心臟的高效跳動能力。但是,如果科學家們能夠將稱為成纖維細胞的瘢痕組織細胞重編程為健康的心肌細胞會怎樣呢?人們通過實驗室實驗和小鼠研究在這方面取得了很大進展,但人類心臟重編程仍然是一項巨大的挑戰。 如今,在一項新的研究中
高通量測序技術實現繪制人類視網膜高精度發育細胞圖譜
人類胚胎發育從受精卵開始,經過著床前胚胎發育(胚內和胚外組織的產生),原腸胚產生(三胚層的特化)和器官發生等階段,最終新生兒出生。人類胚胎發育從單個細胞到上萬億個細胞,歷時二百八十天,整個過程的基因表達受到多種因素的精細調控,其中很多機制尚未明確。 為了解析人類胚胎發育各個階段的基因表達調控網
單細胞核RNA測序技術建立了種子早期胚乳發育的轉錄圖譜
種子是裸子植物和被子植物特有的繁殖體,是胚珠經過受精以后形成的結構,在植物生命周期中處于關鍵位置。種子主要由種皮、胚和胚乳組成。其中胚乳是大多數開花植物雙受精后產生的組織,一般為三倍體(每個細胞核有三套染色體),胚乳中含有豐富的營養物質,是人類消耗熱量的主要來源。 基因組印跡是一種表觀遺傳基因
我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜
在國家自然科學基金項目(項目編號:31722027)等資助下,浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板測序
基于單細胞RNA測序繪制人類大腦高分辨率免疫細胞圖譜
近日,在德國弗賴堡大學醫學中心科學家的指導下,一個聯合研究團隊利用單細胞RNA測序技術繪制了首個人類大腦高分辨率免疫細胞圖譜!有史以來第一次證明大腦中的小膠質細胞(即吞噬細胞)具有相同的核心特征,并會根據大腦功能需求進行適應性表達,揭示了小膠質細胞的時間和空間異質性。2月14日,相關研究成果發表
我國學者發表基于單細胞轉錄組測序數據的小鼠細胞圖譜
在國家自然科學基金項目(項目編號:31722027)等資助下,浙江大學醫學院干細胞與再生醫學中心郭國驥教授團隊在單細胞組學技術及哺乳動物全細胞表達譜系分析研究中取得突破性進展。相關成果以“Mapping the Mouse Cell Atlas by Microwell-seq”(利用微孔板測序
單細胞轉錄組測序構建胸腺器官發生的分子圖譜
2019年10月8日,四川大學胡洪波研究組、解放軍總醫院第五醫學中心劉兵研究組與暨南大學基礎醫學院蘭雨研究組合作在Immunity雜志在線發表了題為“Single-cell RNA Sequencing Resolves Spatiotemporal Development of Pre-thy
干細胞技術有望修復受損心臟組織
最近來自威爾士的研究人員研究發現干細胞技術有望能夠修復受損的心臟組織。研究人員認為這一成果令人激動,并預期這一技術可能會在未來五年內進入臨床階段用于治療心臟疾病。Cell Therapy Limited公司的CEO Ajan Reginald介紹說研究人員確定了一種能夠專一分化為心臟組織細
Nat Genet:干細胞技術能夠再生心臟
根據最近由USC的研究者們做出的一項發表在《Nature Genetics》雜志上的研究,一些人的心臟受損后的修復能力相比其他人群要明顯高一些。 在這項研究中,第一作者,來自Henry Sucov實驗室的博士后Michaela Patterson等人將研究重點放在一類叫做“MNDCM”的可再生
干細胞技術有望修復受損心臟組織
最近來自威爾士的研究人員研究發現干細胞技術有望能夠修復受損的心臟組織。研究人員認為這一成果令人激動,并預期這一技術可能會在未來五年內進入臨床階段用于治療心臟疾病。Cell Therapy Limited公司的CEO Ajan Reginald介紹說研究人員確定了一種能夠專一分化為心臟組織
2016值得關注的技術:綜合單細胞圖譜
《Nature Methods》盤點2015年度技術,選出了最受關注的技術成果:單粒子低溫電子顯微鏡(cryo-EM)技術。 除此之外,也整理出了2016年最值得關注的幾項技術,分別為:細胞內蛋白標記(Protein labeling in cells)、細胞核結構(Unraveling nuc
單細胞測序新突破: 北大繪制出人類胚胎基因調控圖譜
北京大學第三醫院的湯富酬研究員等采用先進的單細胞RNA測序技術,繪制出人類植入前胚胎和胚胎干細胞的轉錄組圖譜,有望在干細胞領域改善人類輔助生殖技術,以及預測潛在遺傳病產生的健康影響。研究成果發表在8月11日《自然結構與分子生物學》(Nature Structural & Molecular
《自然》發布重要單細胞RNA圖譜:首張小腸細胞圖譜
我們腸道上皮是人體內多樣性最高,最具活力的組織之一, 作為機體與外界的主要界面之一,組成了一個細胞的生態系統。為了更好地理解這些復雜的組織及其功能,還有影響它的疾病,麻省理工學院、哈佛大學和麻省總醫院研究人員領導的一個研究團隊通過分析從小鼠腸道或腸道類器官中取樣的5.3萬多個單獨的細胞,完成了一
Nature methods發布單細胞測序新技術
來自瑞典Ludwig癌癥研究所及Karolinska研究所的研究人員,在最新一期(9月22日)的《自然方法》(Nature Methods)雜志上報告了一項獲得重大改良的新技術,可以利用它來分析單細胞中的基因表達——這一性能與從基礎研究到未來癌癥診斷的一切事物均存在關聯。 資深作者Ri
Science:單細胞分析?并行測序技術可以
近日,一項發表于國際雜志Science上的研究論文中,來自美國的研究者描述了一種新型的大規模并行技術,通過利用新一代測序技術來在單細胞水平上實現對基因表達的監測;研究者表示,單細胞分析對于理解人類造血系統的必要性及重要性不斷凸顯,如果沒有這種分析的話,來自少許細胞的大量表達改變就和來自許多細胞的
Nature新技術:CRISPR+單細胞測序=?
CRISPR-Cas9“基因剪刀”的基因組編輯技術是生物研究和新型靶向藥物研發的有力工具。比如利用CRISPR篩選基因(pooled CRISPR screens),可以通過CRISPR gRNAs靶向成百上千個不同的基因,同時編輯許多細胞,然后實驗篩選編輯細胞,gRNA可以幫助確定哪些基因對于生物
當代謝組學技術遇到單細胞測序技術
代謝組的狀態是對遺傳因素、外部環境和治療干預等信息的綜合反映,因此是一個跟蹤和了解上述因素對表型影響的理想研究目標。代謝組可做多種樣品類型、結果富含各種信息、可作為連接其他組學數據與表型之間的橋梁。過去20年,組學研究飛速發展,處于中心法則末端的代謝組學雖然起步較晚但是發展很快。很多組學研究目前已進
Nature:7萬個單細胞測序,繪制人類妊娠早期的胎盤圖譜
11月15日,來自英國劍橋桑格研究所(Wellcome Sanger Institute)的研究人員在Nature上以長文形式發表了題為Single-cell reconstruction of the early maternal–fetal interface in humans的研究成果,
腸道細胞綜合圖譜面世
腸道是人體重要的消化器官,腸道由不同的解剖區域組成,這些區域發育速度不同,在消化、營養吸收、代謝和免疫調節中也發揮著不同的作用。正確認識腸道細胞的分化過程對于腸道疾病的研究至關重要。 近期,英國桑格研究所的研究團隊發布了人體腸道細胞綜合圖譜。相關研究在《Nature》發表,題為:Cells o
新型單細胞測序技術:準確描述單個癌細胞的空間信息
德克薩斯大學醫學院安德森癌癥中心的研究人員研發了一種新技術,并由此構建了新型遺傳模型,解釋了一種常見的早期乳腺癌(乳腺導管內原位癌,DCIS)是如何發展為更具侵襲性的癌癥形式。這一研究成果公布在 1 月 4 日的 Cell 雜志上,該研究為了解 DCIS 如何發展成浸潤性導管癌(IDC)提出了新見解