Nature:癌癥基因組分析的新浪潮
肺癌與乳腺癌不一樣,與胰腺癌也不一樣,然而根據發表在《自然遺傳學》(Nature Genetics)的兩項最新研究表明在分子水平上它們具有許多相同之處。同日,Nature網站對這一研究成果進行了即時新聞報道 這項“泛癌癥”研究針對12種不同類型的腫瘤3000多個基因組進行了分析,尋找跨越組織界限的癌癥共同特征。初步的研究結果揭示,超過100個基因組區域有可能包含從前未發現的藥物靶點,并為建立一種新的腫瘤分類法從而讓個別患者得到更為匹配的治療,以最大的可能性緩解他們的癌癥奠定了基礎。 將不同器官的癌癥歸并到一起,有可能獲得關于引起疾病的一些共同信號通路的新認識。這也使得研究人員數據集中的樣本數量相應增加。樣本數量越多,往往意味著具有更大的統計效力來尋找與癌癥相關的基因組改變。 安大略癌癥研究所所長Tom Hudson(未參與該研究)說:“這是新一波的癌癥基因組分析浪潮。它賦予了我們更大的能力來檢測單次......閱讀全文
Nature發布大規模癌癥表觀基因組研究成果
科學家們鑒別出了有可能生成第4亞型髓母細胞瘤的細胞。新研究發現為這種最常見的腦腫瘤亞型開發出更有效的靶向療法清除了一個障礙。他們的研究結果發布在1月27日的《自然》(Nature)雜志上。 圣猶大兒童研究醫院發育神經生物學系的Paul Northcott,德國癌癥研究中心(DKFZ)的Stef
梁晗:從癌癥基因組中尋找性別差異
如果有一種軟件能告訴你今后患上癌癥的可能性是多少,而其中判斷的因素之一就是你的性別是男還是女,你會相信嗎?可能大部分人都會搖頭:怎么可能性別影響如此之大。但越來越多的研究表明,性別在癌癥中起著不可忽視的作用。 來自美國德州大學MD安德森癌癥中心的一項研究通過調查13種癌癥類型,在分子水平上認識
震驚!全基因組測序還能這樣用在癌癥治療上?
近年來,隨著全基因組測序所需時間和成本的降低,個體化治療將造福更多的癌癥患者。近日發表于《Nature Medicine》的一項研究表明,開發新的機器學習算法對腫瘤全基因組序列信息進行分析,有助于預測患者的預后,幫助患者選擇最佳的治療方案。 全基因組測序(Whole-genome seque
Nature里程碑成果:解析21種癌癥基因組
針對21種癌癥類型開展大規模分析,一項里程碑式的研究揭示癌癥突變的世界遠比以前認為的要大得多。通過分析數以千計的患者腫瘤基因組,由Broad研究所領導的一個研究小組發現了許多的新癌癥基因,將與這些癌癥相關聯的已知基因目錄擴增了25%。此外,這項研究表明還有許多重要的癌基因有待發現。這項研究工作為
全基因組測序是癌癥診斷的強有力工具
? 一位沒有明顯癌癥家族史的婦女卻罹患了早發性乳腺癌和卵巢癌,以及與治療有關的急性髓細胞樣白血病。研究人員對這名婦女進行了全基因組測序,所用的是從該患者的皮膚和骨髓中獲取的DNA。在許多被懷疑患癌癥可能性增加了的病人中,常規性的候選基因測試(如BRCA1??和??BRCA2突變檢測)無法顯示出有用的
梁晗:從癌癥基因組中尋找性別差異
如果有一種軟件能告訴你今后患上癌癥的可能性是多少,而其中判斷的因素之一就是你的性別是男還是女,你會相信嗎?可能大部分人都會搖頭:怎么可能性別影響如此之大。但越來越多的研究表明,性別在癌癥中起著不可忽視的作用。 來自美國德州大學MD安德森癌癥中心的一項研究通過調查13種癌癥類型,在分子水平上認
梁晗:從癌癥基因組中尋找性別差異
如果有一種軟件能告訴你今后患上癌癥的可能性是多少,而其中判斷的因素之一就是你的性別是男還是女,你會相信嗎?可能大部分人都會搖頭:怎么可能性別影響如此之大。但越來越多的研究表明,性別在癌癥中起著不可忽視的作用。 來自美國德州大學MD安德森癌癥中心的一項研究通過調查13種癌癥類型,在分子水平上認識
《科學》:基因組大規模篩選新技術助力癌癥研究
3000種基因經初次篩選后,大約24個符合要求 ?多年來生物學家一直在搜尋癌細胞的弱點,以期找到對付癌癥的線索。美國科學家近日研究出了一種基因組大規模篩選技術,有望提供一種強大的經濟有效的方法以挑選出對付癌癥的新藥靶。相關論文發表在2月1日的《科學》(Science)上。?2005年,美國國立衛
關于癌癥全基因組-我們有了全新的認識
今日,最新一期《自然》雜志如約上線,而登上封面的“癌癥全基因組”則是本期的主題:在本期《自然》雜志上,一共發表了6篇相關的論文。而在Nature Genetics、Nature Biotechnology、以及Nature Communications等子刊上,也有系列論文發表。 那么,是什么
Science:應為廣泛的癌癥基因組測試提供醫保覆蓋
美國前國家癌癥研究所主任Harold Varmus和密歇根大學法學院教授Rebecca Eisenberg在Science期刊上發表一篇政策論壇論文,主張讓癌癥患者更好地使用基因組測試。他們建議政府和私人支付者(保險公司)更好地利用數據庫和登記處來確定基因組測試是否能夠用于癌癥患者的個人化治療。
-Nature:基因組復制或為解析癌癥進化提供線索
有機體細胞中的基因組拷貝數越多,細胞或越易于從生長和適應中獲益。近日,一篇刊登于國際雜志Nature上的研究論文中,來自克瑞頓大學(Creighton University)的研究人員通過對酵母菌的研究發現,多倍體或許可以極大地幫助細胞去適應周圍的環境,多倍體即有機體細胞中的基因組拷貝數超過2倍
美印藥物基因組學與癌癥基因組學檢測商業化
美國Companiondx實驗室擬與健康信息技術服務商Enable Healthcare合作,向醫生推廣藥物基因組學檢測;印度癌癥醫學公司HCG宣布建立一個新的腫瘤基因中心,旨在下代測序技術能夠幫助定位腫瘤,從而提高化療和放療的效率和響應率 美國藥物基因組學檢測商業化 Companiondx實驗
基因組學大牛Science發布癌癥重大成果
Whitehead研究所的科學家們發現,稱作為“隔絕鄰域”的環狀染色質結構遭到破壞可以激活能夠推動侵襲性腫瘤生長的癌基因。這一研究發現對于癌癥診斷及治療均具有重大的意義。相關論文發布在《科學》(science)雜志上。 領導這一研究的是Whitehead生物醫學研究所的Richard A Yo
美大規模評估癌癥病人臨床和基因組數據
英國《自然·遺傳學》雜志1月15日在線發表的一項大型研究稱,美國癌癥中心展開了大規模癌癥晚期患者臨床數據和基因組數據評估,結果顯示癌細胞的突變水平與患者接受檢查點抑制劑治療后的存活率相關。該研究意味著這一現象普遍存在于眾多類型的癌癥中,或有助于預測哪些患者將對這種免疫療法應答良好。 人們一直致
NIH-340萬美元資助癌癥基因組圖譜研究計劃
美國國立衛生研究院于當地時間7月2日宣布,決定對八個單位(或個人)進行為期兩年、總值340萬美元的資助,以支持癌癥基因組圖譜研究計劃(Cancer Genome Atlas pilot program)。 癌癥基因組圖譜計劃是美國國立癌癥研究所和美國國家人類基因組研究的合作項目,于2005年晚期,
EBioMedicine:全基因組測序高效識別癌癥相關基因突變
UT西南醫學中心癌癥研究人員已經證明,全基因組測序可用于識別癌癥的遺傳性風險,其可以潛在地改善癌癥的預防,診斷和治療。 這是首次研究使用了全基因組測序以評估一系列258癌癥患者的基因組,診斷其癌癥傾向性突變情況。這項研究發表在雜志EBioMedicine上。全基因組測序是新的基因工具,能夠確定
Nature:基因組研究讓兩類癌癥合而為一
根據癌癥基因組圖譜(TCGA)計劃一項針對結腸與直腸癌組織樣本的大型研究,盡管解剖位置不同分別起源于結腸或直腸,結腸和直腸組織的基因組改變模式是相同的,這使得研究人員得出結論可將這兩種癌癥類型合而為一。 在多種類型的基因組分析中,結腸癌與直腸癌的結果幾乎是難以區分的。最初,TCGA研究網絡
Nature:基因組錯誤折疊或提供新的癌癥研究思路
近日,發表在Nature雜志上的一篇研究論文中,來自麻省總醫院和博德研究所的科學家揭示了隱藏在癌癥背后的一種新型生物學機制,文章中,通過對攜帶異檸檬酸脫氫酶基因(IDH)突變的腦瘤進行研究,研究者揭開了指導基因組自身折疊指令的罕見改變,這些指令改變可以靶向作用基因組的關鍵部分—絕緣子,絕緣子可以
全基因組測序可識別癌癥相關變異-有助預防護理
美國德州大學(UT)西南醫學中心研究人員證明,全基因組測序可識別病人患遺傳性癌癥的風險,有望改善癌癥的預防、診斷和護理。這項研究首次用全基因組測序評估了258個癌癥病人的基因組,提高了診斷出有癌變傾向的基因變異的能力。相關論文在線發表于最近的《E生物醫學》雜志上。 “全基因組測序是一種新的基因
細胞核重編程與癌癥基因組學論壇召開
近日,由《自然—遺傳學》雜志主辦、中科院廣州生物醫藥與健康研究院承辦的“細胞核重編程與癌癥基因組學”論壇在廣州召開。 據了解,在干細胞研究中,誘導多能干細胞的重編程是該領域最受關注的問題之一。目前,干細胞研究和腫瘤研究存在很多交叉。將這兩個領域的研究結合起來,有利于更好地使再生醫學得以應用并輔
6篇Nature齊發!癌癥基因組計劃成果成井噴之勢
除了Nature一次性發表6篇論文外,Nature Genetics雜志發表了3篇,Nature Communications發表9篇,Nature Biotechnology一篇,詳細報道BioArt后續會陸續發布。文章合集網址:https://www.nature.com/collectio
Nature子刊:對年輕癌癥患者進行全基因組測序勢在必行
相關研究最近以“Clinical cancer genomic profiling by three-platform sequencing of whole genome, whole exome and transcriptome”為題發表在《Nature Communications》雜志
CRISPR逐個篩查基因組找到癌癥免疫治療必需基因
一項8月7日在線發表在Nature上的最新研究確定了在癌細胞中免疫治療起作用所必需的基因,解決了為什么一些腫瘤對免疫治療沒有反應或最初有反應,但隨著腫瘤細胞對免疫療法出現抗性而停止的問題。該研究是由美國國立癌癥研究所Nicholas Restifo博士為首與MIT、哈佛大學和Broad研究院等單
Nat-Genet:揭秘線粒體基因組奧秘有望開發多種癌癥新療法
近日,一項刊登在國際雜志Nature Genetics上的研究報告中,來自德克薩斯大學安德森癌癥中心等機構的科學家們對細胞的能量工程—線粒體進行了深入研究,由于線粒體在腫瘤發生中扮演著關鍵角色,因此深入研究線粒體的基因組對于揭示腫瘤發生機制及開發新型療法至關重要。圖片來源:CC0 Public
Nature子刊:非編碼RNA癌癥藥物基因組圖譜新突破
近日,匹茲堡大學藥物遺傳研究中心的楊達和張敏課題組借力于一種名為彈性網絡回歸(Elastic Net regression)的機器學習模型,從1,001個腫瘤細胞系的高通量長非編碼RNA表達譜(long noncoding RNAs, lncRNAs)與265種抗癌藥物敏感性數據中,挖掘出了27
1300多名學者合作-迄今最全面癌癥基因組分析完成
英國韋爾科姆基金會桑格研究所5日宣布,一個國際團隊完成了迄今覆蓋面最廣泛的癌癥全基因組分析,這有助于加深研究人員對癌癥的認識,為開發出更高效的治療方案鋪平道路。這個被稱為“泛癌癥計劃”的項目由來自37個國家的1300多名科學家合作開展,旨在研究可導致癌癥的變異基因,繪制出這些基因的全圖譜,桑格研
-AACR:“GENIE”呼之欲出,志在共享癌癥基因組臨床數據
11月6日,Genomeweb報道,美國癌癥研究協會(AACR)推出了一項叫做“GENIE”的國際基因組和臨床數據共享項目,旨在將不同癌癥中心的基因組和結果數據匯總起來。 該項目中的“GENIE”寓意Genomics(基因組學)、Evidence(證據)、Neoplasia(腫瘤)Inform
國際癌癥基因組聯盟在中國發起四個新項目
2012年12月5日,國際癌癥基因組聯盟(ICGC)宣布在中國發起四個新項目,主要對結直腸癌、食道癌、肝癌和鼻咽癌的驅動基因進行檢測,為實現個體化醫療奠定基礎。中國是ICGC的創始成員之一,在2008年時曾經發起了胃癌基因組項目。 ICGC帶領全球科學家對各種常見和罕見的癌癥進行基因組圖譜
Nature子刊公布癌癥基因組研究重要成果:新的遺傳突變
在一項多達10萬人(包括17,000名最常見類型的卵巢癌患者)的遺傳分析研究中,研究人員確定了12種新的增加卵巢癌患病風險的遺傳變異,并找到了它們與以前發表的18種變異之間的關聯。 這項研究成果公布在3月27日的Nature Genetics雜志上,由OncoArray Consortium聯
Nature-Genetics公布又一大規模癌癥基因組分析結果
超過20個研究機構的63位研究人員公布了一項包括30,000多人血液樣本的大規模研究成果,通過這項分析,研究人員確定了13種膠質瘤新遺傳危險因素,這揭示了增加膠質瘤易感性的個體DNA的特殊差異,同時也首次為臨床醫師提供了一種能區分成膠質細胞瘤和非膠質母細胞瘤等膠質瘤類型的新方法。 這一研究成果