基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺，是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重要的糧食作物之一，同時也是研究農作物及其他相關植物的重要模式生物。因此，水稻成為第一個全基因組測序的農作物。隨著水稻基因組學和轉錄組學研究的深入，先后出現了BGI-RIS，TIGR，RAP-DB和RGKbase等專業數據庫。這些數據庫多是依賴專業人員的編輯更新，不僅費時費力，而且成本也逐漸增加，導致其更新速度遠遠落后于水稻數據的指數增長。RiceWiki數據庫的優勢在于匯集整個水稻研究領域的科研人員的智慧和力量，共同完善水稻基因的相關信息和數據更新，以期構建一部水稻基因的百科全書。 目前，RiceWiki已經整合了兩個水稻栽培亞......閱讀全文
基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺，是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩
期刊數據庫更新
圖片來源：B. DOUTHITT/SCIENCE 期刊影響因子多年來備受批評，認為其扭曲了學術出版。近日，美國賓夕法尼亞州克拉尼特分析公司推出了其期刊引用報告（JCR）數據庫的更新版本，并表示它提供了理解期刊特征和受眾的背景信息。 影響因子代表期刊文章的引用次數，除以其兩年間發表
核酸數據庫的概念
中文名稱核酸數據庫英文名稱nucleic acid data bank定 義DNA、RNA序列的資料庫，主要包括已知序列名稱、DNA或RNA全序列及其特性，如啟動區、起始和終止密碼的位置、編碼區、限制酶切位點以及推導的翻譯產物蛋白質序列等。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），方法與技術（二級
GenBank數據庫概述（四）
NCBI站點地圖---其他基因組數據介紹：1、 小鼠基因組 1) 小鼠基因組資源向導 ：把從各個中心來的各種小鼠相關的資源整合在一起，包括序列，圖譜，和克隆信息以及指向小鼠種系和突變資源的指針。 2) 小鼠基因組測序：小鼠基因組計劃的測序進展，HTG序列contigs（可以用大小和染色體號來瀏覽）由
GenBank數據庫概述（一）
1. GenBank屬于一個序列數據庫的國際合作組織，包括EMBL和DDBJ。是NIH遺傳序列數據庫，一個所有可以公開獲得的DNA序列的注釋過的收集。GenBank同日本和歐洲分子生物學實驗室的DNA數據庫共同構成了國際核酸序列數據庫合作。唯一人類基因序列集合（UniGene），人類基因組基因圖
GenBank數據庫概述（二）
FTP GenBank and Daily Updates：1. GenBank普通文件格式 — 參見GenBank記錄樣本和在GenBank公布通知中的詳細描述，下載大多數最近的完全公告和日常積累或非積累更新數據。 2. ASN.1格式 — 摘要句法記號1，國際標準組織（ISO）數據表示格式，下載
GenBank數據庫概述（三）
結構： 1、 結構主頁 — 關于NCBI結構小組的一般信息和他們的研究計劃，另外也可以訪問分子模型數據庫（MMDB）和用來搜索和顯示結構的相關工具。 2、 MMDB：分子模型數據庫 — 一個關于三維生物分子結構的數據庫，結構來自于X-ray晶體衍射和NMR色譜分析。MMDB是來源于Brook
生命科學常用數據庫
The NationalCenter for Biotechnology Information.?http://www.ncbi.nlm.nih.gov/National Center for GenomeResources.http://www.ncgr.org/ncgr/ncgr.html?T
QP2010農藥數據庫
Shimadzu氣質聯用的多種農藥庫 QP2010農藥數據庫
美國更新食品摻假數據庫
9月5日食品安全新聞網消息，美國藥典委員會（USP）更新了食品摻假數據庫（FFD2.0）。食品摻假數據庫主要為行業、監管部門以及消費者預防和應對食品摻假事件發生提供技術支持。最新的FFD2.0涵蓋了科研文獻、媒體信息、食品監管記錄、司法裁決記錄中涉及食品摻假事件的各種信息。新版食品摻假數據庫將于
拉曼光譜免費數據庫
拉曼數據庫在物質鑒定和化學分析方面具有重要的作用。關于拉曼數據，我們一般會關注兩個峰的位置，分別是D峰和G峰。D峰和G-峰均是C原子晶體的 Raman特征峰，分別在1350cm-1和 1580 cm-1附近，D峰反應的是晶格的碳缺陷，G峰反應的是材料的碳化程度。I(D) / I(G) 是 D峰和G峰
英國啟動細胞產品試驗數據庫
英國細胞治療產品行業現在擁有了一個數據庫，該數據庫囊括了該國所有正在進行之中的臨床試驗項目。建立這個數據庫的目的是要擴大研究合作，將更多的早期試驗推進到后期開發階段。 囊括21個研究項目 這個數據庫包括21個細胞治療研究項目，由英國細胞療法中心(CTC)發起，并得到了英國技術戰略委員
鹽湖資源環境信息數據庫建成
? 日前，中國科學院青海鹽湖研究所在科技部基礎專項、中科院“百人計劃”等項目的支持下，立足柴達木盆地鹽湖資源優勢，歷時6年建成的鹽湖資源與環境科學基礎數據共享數據庫正式通過科技部驗收。這標志著目前我國數據量最大的鹽湖資源與環境科學基礎數據共享系統正式建成，并對基于科學數據的鹽湖資源合理利用、長遠決策
北京正在建罕見病數據庫
今日，2014第三屆中國罕見病高峰論壇在京舉辦。北京醫學會罕見病分會副主任王琳在論壇中透露，北京正在建立罕見病病例登記系統和病人數據庫，嘗試單病種追蹤調研和罕見病診治地圖的設置。 王琳介紹，中國目前所應用的罕見病相關數據都是基于歐盟、美國等地所提供的資料。“而國內到現在也沒有對本國進行過罕見病
國內首個向量數據庫標準發布
11月15日，中國信通院聯合騰訊云計算（北京）有限責任公司、中移（蘇州）軟件技術有限公司等多家企業共同編制的、國內首個向量數據庫標準正式發布，將為我國向量數據庫研發、測試及選型提供重要參考，推動我國人工智能產業高質量發展。 向量數據能夠從多個維度記錄事物特征，是人工智能時代的基礎數據形式。人工
生命科學國外重要數據庫
EMBL數據庫結構EMBL數據庫的基本單位也是序列條目，包括核甘酸堿基排列順序和注釋兩部分。序列條目由字段組成，每個字段由標識字起始，后面為該字段的具體說明。有些字段又分若干次子字段，以次標識字或特性表說明符開始，最后以雙斜杠“//”作本序列條目結束標記。條目的關鍵字包括ID（序列名稱），DE（序列
siRNA數據庫與設計工具
siRNA DatabaseSearchable database of Silencer ? Validated and Pre-designed siRNAs to >34,000 human, mouse, and rat targets. All siRNAs in the database
植物生物學研究數據庫
實驗概要植物生物學研究數據庫實驗步驟http://bioinf.scri.sari.ac.uk/cgi-bin/plant_snorna/home?英國 Top 植物種的snoRNA基因數據庫。 綜合?http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plant
全球首個冰川微生物數據庫
青藏高原被稱為世界“第三極”和“亞洲水塔”。除南北極外，它是全球最大的冰川分布區，現有冰川2萬條以上，面積超過2萬平方公里，也是我國及亞洲20億人賴以生存的十多條大江大河的源頭。青藏高原冰川是微生物的天然存儲器，封存了不同歷史時期的微生物。 現在，中國科學家構建的
美國CDC將建炭疽桿菌公共數據庫
日前，美國疾病預防控制中心（CDC）表示，將在亞特蘭大建立一個有關炭疽桿菌的公共數據庫。CDC稱，已經在尋找可以建立這一公共數據庫的承包商。 這一舉動源于6月份在亞特蘭大實驗室發生的炭疽桿菌事件。由于實驗室部分研究人員，在讓炭疽桿菌失去活性時未遵守適當程序，便將可能含有活菌樣本轉移到安全措施
天津建成食品污染物數據庫
日前從天津市衛生計生委、市衛生監督所獲悉，為了擴大食品污染物及有害因素監測覆蓋面，實現對食源性疾病的主動監測，該市食品安全風險監測區域已覆蓋全市16個區縣，食源性疾病監測哨點醫院已由18家增加到33家，并已形成了市食品污染物數據庫。 根據目前在食品安全領域擔負的職責，該市衛生計生部門規劃建立了
全球最大地震數據庫建成
國際地震學中心繪制的2萬次地震數據集。 2004年蘇門答臘島地震、2008年中國汶川地震、2010年海地地震、2011年日本地震，在每次災難中，故事都是相同的：一場地震在毫無征兆的情況下發生，奪走成千上萬條生命，并且摧毀了像沙子城堡一樣的建筑。 地球科學家依然無法預測一場大地震
Nature：癌癥數據庫ClinVar打破Myriad壟斷
??????? 去年，美國最高法院判定Myriad Genetics持有的BRCA1和BRCA2 DNA序列測試ZL無效，美國最高法院判定也意味著未來美國國內的癌癥檢查價格將變得更加便宜、普遍。 BRCA1基因的發現和致病相關性是Mary-Claire King博士在1990年發現，盡管當時她的研
美國CDC將建炭疽桿菌公共數據庫
日前，美國疾病預防控制中心（CDC）表示，將在亞特蘭大建立一個有關炭疽桿菌的公共數據庫。CDC稱，已經在尋找可以建立這一公共數據庫的承包商。 這一舉動源于6月份在亞特蘭大實驗室發生的炭疽桿菌事件。由于實驗室部分研究人員，在讓炭疽桿菌失去活性時未遵守適當程序，便將可能含有活菌樣本轉移到安
全球最大自閉癥數據庫上線
總部位于美國紐約的Simons基金會日前宣布，全球最大的自閉癥數據庫（SSC）正式上線并向全球科學家開放。目前已有來自美國、加拿大、中國、法國、冰島、澳大利亞、愛爾蘭、巴西和卡塔爾等17國家相關機構的自閉癥研究人員，通過云端查詢等方式使用了這一數據庫。 SSC包含近2600個家庭的基因組序列數
我國首個尋親DNA數據庫在京建立
?? 科技日報消息，我國第一個專門面向失散人員的尋親DNA數據庫日前在京宣告建立。據數據庫建設方中科院北京華大方瑞司法物證鑒定中心的有關負責人介紹，通過該庫，尋親工作將變得方便快捷。同時，該庫將免費為我國失散人群提供尋親幫助，包括港澳臺地區。 ??? 據悉，該庫的第一批樣本檢測用試劑已經得到了美國
英特爾將建帕金森患者數據庫
帕金森癥的患者通常都會被要求盡可能細致地做好自己的病情記錄，以便于醫生判斷病情的進展。但不少患者都抱怨，我雖然正視自己的病情，但帕金森病并不是我生活的全部啊，按醫生要求那樣的忠實完整記錄自己的病情？說起來容易做起來難！ 好消息是，現在的病情監測可以很容易了。拜可穿戴技術所賜，帕金森病患者運
代謝組學常使用的數據庫
代謝組主要是對小分子代謝物（一般50-1500 Da）進行高通量定性和定量分析，代謝組分析產生了大量的生物信息數據。代謝組數據庫的開發對于歸納總結這些大數據，方便后續的代謝組學數據分析，揭示隱藏在大數據背后的生物學機理具有十分重要的作用。 目前常用的代謝組學數據庫有HMDB、NIST、LMSD
法律糾紛延遲大型毒性數據庫啟動
研究人員表示，一個包含近萬種化學物質的大型健康風險數據庫或將讓預測此前不存在任何數據的千萬種消費化學品的毒性變得更加容易。但相關法律爭議卻意味著，他們不能像希望的那樣公開這一數據庫。 一個包含近萬種化學物質的藥物毒性數據庫或能減少動物安全測試的需求。 “這個數據庫具有能夠挽救