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    全基因組測序解讀重要甲基化機制

    DNA看起來只是AGTC四種堿基的簡單排列,可一旦它與組蛋白包裝形成染色質,情況就復雜得多了。組蛋白主要有四種,分別是H2A、H2B、H3和H4。這些組蛋白要么令DNA盤繞起來保持沉默,要么將DNA解開允許基因表達。組蛋白上的化學修飾(如甲基化),能夠影響它對基因的控制。 H3K4me3是激活基因表達的一種組蛋白修飾,這種修飾使組蛋白H3上的特定位點帶有三個甲基。Stowers醫學研究所的Ali Shilatifard博士在Genes & Development雜志上發表文章,揭開了出人意料的H3K4三甲基化機制,闡述了這種修飾在基因組中的定位。 酵母中負責H3K4三甲基化的甲基化酶是SET1,其人類版稱為MLL。這種甲基化酶的編碼基因發生突變,與多種惡性疾病有關(例如兒童白血病),因此Ali Shilatifard博士的這項研究非常重要。 研究人員強調,這項工作還展示了全基因組測序對分......閱讀全文

    年終盤點:2016年國內不容錯過的重磅生物研究

      時間總是過得很快,2016年馬上就要過去了,迎接我們的將是嶄新的2017年,2016年,我國有很多優秀科研機構的科學家們都做出了意義重大、影響深遠的研究成果,發表在國際頂級期刊上。本文中小編盤點了2016年我國科學家發表的一些重磅級研究,以饕讀者。   --結構生物學 --  1.清華大學 施一

    2019中國生命科學領域CNS盤點:曹雪濤 顏寧 施一公上榜

      截至2019年12月23日,中國學者在Cell,Nature及Science在線發表了107篇文章(2019年的Cell ,Nature 及Science 已經全部更新),iNature團隊對于這些文章做了系統的總結:  按雜志來劃分:Cell 發表了31篇,Nature 發表了44篇,Scie

    2019年中國學者發表CNS統計,誰是CNS發表之王?

      【51/52】2019年4月4日,清華大學柴繼杰課題組、中科院遺傳發育所周儉民課題組和清華大學王宏偉課題聯合同期背靠背發表兩篇重量級Science文章,完成了植物NLR蛋白復合物的組裝、結構和功能分析,揭示了NLR作用的關鍵分子機制,是植物免疫研究的里程碑事件。兩篇文章分別是: "Li

    大躍進 | 中國學者CNS發表超過100篇生命科學領域研究成果

      【50】2019年4月12日,中科院上海藥物所徐華強,王明偉,浙江大學張巖及匹茲堡大學醫學院Jean-Pierre Vilardaga共同通訊在Science發表題為“Structure and dynamics of the active human parathyroid hormone r

    達爾文加拉馬克,可能才是完整的進化論

      隨著科學的進一步發展,達爾文理論也顯示出了一些不足之處。  所謂物競天擇,適者生存,現代生物學的許多主流研究方向都以查爾斯·達爾文(Charles Darwin)“自然選擇”的進化論為基礎:只有最能適應環境的生命體才能在物種演化的洪流中獲得生存和繁衍的權利。這個自然選擇的過程也被稱為適應,而最容

    Nat Rev Genetics | 環狀RNA的合成與功能

      環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一種新興的內源性非編碼RNA(noncoding RNA,ncRNA),是繼microRNA (miRNA)以及long noncoding RNA (IncRNA)后非編碼RNA家族中極具研究潛力的新成員。越來越多的研究表明,環狀RNA具

    多種測序技術或將深入推動癌癥領域研究

      本文中小編整理了多篇文章,來解讀測序技術在闡明癌癥發生機制、癌癥診斷及療法開發等方面的巨大潛力,與各位一起學習!  【1】JAMIA:新工具深入挖掘外顯子測序結果 幫助找到最佳癌癥治療藥物  doi:10.1093/jamia/ocw022  科羅拉多大學的研究人員最近在國際學術期刊JAMIA上

    Nature 表觀遺傳學進展將遺傳學、環境與疾病聯系了起來!

      21世紀,表觀遺傳學的研究得到了快速發展,同時其產生了讓研究人員感興趣和憧憬的東西,當然了,這其中也存在一些大肆宣傳的成分,本文中,我們回顧了表觀遺傳學在過去幾十年里是如何演變的,同時分析了近年來改變科學家們對生物學理解的一些研究進展;我們討論了表觀遺傳學和DNA序列改變之間的相互作用,以及表觀

    RNA甲基化研究深度剖析(一)

    一、聽說最近 RNA甲基化很火,它是何方神圣?1、高分文章頻現 說起近來的科研熱點,RNA甲基化修飾的相關研究可以說是當前整個生命科學領域最熱門的方向之一,亮點文章頻出,著實讓人有些目不暇接。RNA甲基化的研究近3月發表的文章影響因子為10分以上的,就有高達 17 篇。

    劉伯寧:后基因組時代10年間生命科學的發展與挑戰

      8月2日,我國科學家利用“全基因組關聯分析”的方法,在人類1號染色體上發現了肝癌的易感基因區域。這將為肝癌的風險預測、早期預防和個體化治療提供理論依據。  事實上,自2000年人類基因組草圖繪制完成迄今,科學家已經相繼發現70余種疾病的易感基因,基于此的基因診斷產業已經初現端倪,但10

    為植物表觀遺傳研究打開一扇門

      DNA測序技術發明之后,科學家們認為自己可以通過DNA全基因組測序解析生命的全部密碼。漸漸的,他們發現有些重要信息并不編碼于DNA序列里面,即便基因序列沒有發生變化,生物體的表型也可以改變。這種研究被稱為“表觀遺傳學”,繼傳統遺傳學之后,表觀遺傳學如火如荼地發展起來了。  中科院院士、中科院遺傳

    遺傳發育所曹曉風團隊開辟水稻表觀遺傳研究新方向

      DNA測序技術發明之后,科學家們認為自己可以通過DNA全基因組測序解析生命的全部密碼。漸漸的,他們發現有些重要信息并不編碼于DNA序列里面,即便基因序列沒有發生變化,生物體的表型也可以改變。這種研究被稱為“表觀遺傳學”,繼傳統遺傳學之后,表觀遺傳學如火如荼地發展起來了。曹曉風供圖  中科院院士、

    吉林大學Cell子刊發表表觀遺傳學研究成果

      高等生物的基因組DNA圍繞著由四種組蛋白組成的八聚體,形成碟狀的核小體結構。基因組DNA以這樣的形式包裝成為染色質,使DNA受到良好的保護。染色質的結構和動態受到組蛋白表觀遺傳學修飾的調控,比如最近發現的組蛋白賴氨酸巴豆酰化。這種組蛋白修飾在基因表達、DNA損傷應答等重要的細胞過程中起到了關鍵性

    組蛋白研究進展速覽!

      本文中,小編盤點了多篇研究報告,共同解析科學家們在組蛋白研究上取得的新成就,與大家一起學習!圖片來源:Daniel N. Weinberg et al,doi:10.1038/s41586-019-1534-3  【1】Nature:揭示組蛋白標記H3K36me2招募DNMT3A并影響基因間DN

    【大盤點】胰腺癌的基因和靶向治療

      NCI 和 SEER 的數據顯示胰腺癌 5 年生存只有 5-6%,大多數患者診斷時都已是進展期,區域性和遠處轉移分別為 27% 和 53%。胰腺癌治療方面最近也沒有突破性進展,含吉西他濱的治療和手術是近 10 余年來的標準治療,無論是用作新輔助還是輔助化療,化療選擇很有限。美國 Frank 博士

    Science:梳理患兒腫瘤細胞的基因組尋求答案

      組蛋白翻譯后修飾方式出現異常,以及組蛋白修飾位置出現異常都會導致腫瘤發生。   高通量DNA測序技術的快速擴張讓我們能夠以前所未有的速度和精細度對人體疾病展開遺傳學分析,尤其是對罕見的小兒疾病進行全基因組測序(whole-genome sequencing)更是有助于我們對兒童發育,以及多

    2017年5月Science期刊不得不看的亮點研究

      5月份即將結束了,5月份Science期刊又有哪些亮點研究值得學習呢?小編對此進行了整理,與各位分享。  1.Science:重磅!開發出延緩癌細胞生長的新方法  doi:10.1126/science.aai9372  癌癥是一種非常復雜的疾病,但是它的定義是相當簡單的:細胞發生異常和不受控制

    單分子測序在腫瘤基因檢測中的6大應用

      腫瘤是當今導致人類主要死亡的主要疾病之。由于其發病隱匿、治療方法局限、多數預后不良,且分子生物學特征復雜多變,因而腫瘤的預防、早期篩查與診斷、臨床治療、預后評估一直是臨床醫生致力于解決的關鍵問題。隨著現代醫學技術的發展,腫瘤已經進人了個體化治療階段。腫瘤的基因組轉錄組和表觀遺傳特征在探究腫瘤的發

    中國科學家發現新的白血病抑癌基因

      我國科學家主導研究發現了一個在急性白血病病人中有較常見突變的抑癌基因,且揭示其功能異常與多種不同致癌基因之間的協同作用,為研發白血病新的治療方法提供了重要基礎。該成果2月10日在學術期刊《自然—遺傳學》上發表。   該研究是在國家自然科學基金委、科技部、中科院以及天津市科委多個重點基金資助下,

    Pacbio單分子實時測序技術于藥用植物基因組研究應用

      藥源短缺成為限制臨床治療和新藥研發的最大瓶頸,因此,開發新的藥物來源途徑是迫切需要解決的問題。利用現代生物技術和次生代謝工程手段是未來生產藥物最有潛力的發展方向。我國藥用植物有1 萬多種,大多數藥用植物遺傳背景不清楚,基因組信息缺乏,遺傳信息和功能基因的研究亦極為薄弱。例如人參屬(Panax)

    科學家揭開“垃圾”DNA的神秘角色!

      生物學家們在很長一段時間里都認為,既然幾乎所有具體的生理機能都要由蛋白質來完成,那么不編碼蛋白質的DNA應該是沒有用的,可以稱為“垃圾DNA”;而且人類基因組項目發現人的基因組中僅有1.5%的序列是給蛋白質編碼的,其余的98.5%的序列是以前認為的“垃圾”DNA。  此前研究人員進行了一項名為E

    解讀2015年度中國科學十大進展

      實現多自由度量子隱形傳態   量子隱形傳態在概念上非常類似于科幻小說中的“星際旅行”,可以利用量子糾纏把量子態傳輸到遙遠地點,而無需傳輸載體本身。中國科學技術大學潘建偉、陸朝陽等組成的研究小組在國際上首次成功實現多自由度量子體系的隱形傳態,成果以封面標題的形式發表于《自然》雜志。這是自1997年

    精準治療時代下基因檢測的重要性

    眾所周知,基因突變是導致腫瘤的重要因素,而對腫瘤患者樣本進行基因檢測已成為臨床常用是檢驗內容。基因檢測,顧名思義就是通過測序等手段對基因位點進行檢測。最初的基因檢測只是檢測基因載體——染色體的數目異常,之后測序技術使得人們可以更清晰地認識基因序列。2005年第一臺高通量測序儀Genome Seq

    甲基化領域重要研究成果解讀!

      本文中,小編整理了近年來科學家們在甲基化研究領域取得的重要研究成果,與大家一起學習!  【1】Science:重大進展!揭示DNA甲基化增強基因轉錄機制  doi:10.1126/science.aar7854  DNA甲基化(DNA methylation)為DNA化學修飾的一種形式,能夠在不

    IVD這個細分領域未來市場容量或達200億

      2017年6月,世界經濟論壇與《科學美國人》雜志的專家委員會聯合選出了2017年度全球十大新興技術榜單,其中腫瘤的無創診斷技術成功入選并榮膺榜首。腫瘤無創診斷技術即液體活檢(liquid biopsies)的出現,標志著人類在攻克腫瘤的道路上又前進了一大步。與傳統的組織活檢相比,液體活檢具備實時

    陳建軍/楊建華/何川/黃剛 揭示RNA m6A由組蛋白修飾決定

      近年來,RNA表觀遺傳學的研究發現RNA甲基化修飾,特別是m6A甲基化修飾,在哺乳動物的轉錄組中廣泛存在,并且在多種生理和病理過程中發揮著重要的生物學功能,引領了RNA以及表觀遺傳學領域的又一個熱潮。高通量測序揭示在人和小鼠的轉錄組中有1/3-1/2的mRNA轉錄本具有m6A修飾【1,2】。理論

    Nature:RNA 修飾研究有助表觀轉錄組學進一步發展

      這是一個與 mRNA 結合的細菌核糖體的分子模式圖,該核酸蛋白復合體正在合成蛋白質。  隨著科研人員逐漸揭開 RNA 修飾的奧秘,幫助我們了解表觀轉錄組學(epitranscriptomics)的工具也變得越來越多了。  2004 年,以色列特拉維夫大學(Tel Aviv University

    最新!北京大學何愛彬研究組Molecular Cell發文

      2019年8月27日,北京大學分子醫學研究所,北京大學-清華大學生命科學聯合中心研究員何愛彬研究組在Molecular Cell雜志在線發表題為“CoBATCH for high-throughput single-cell epigenomic profiling”的文章,報道了一種新的具有普

    27篇SNC論文!他憑這些學術成就獲億元融資

      基因修飾動物是研究在發育和疾病中基因功能的重要工具。CRISPR/Cas9系統有效的應用于構建基因敲除和敲入小鼠。而楊輝團隊正好專注于該領域。  楊輝,30歲時,就成為中科院上海生科院神經所研究員;2015年,入選國家“青年千人計劃”;2019年,楊輝博士獲得國家杰出青年基金資助。  由楊輝創辦

    第七屆國際基因組學大會在香港成功召開

      2012年11月29日至12月1日,為期三天的第七屆國際基因組學大會暨2012年亞太區生物信息學峰會在香港九龍成功召開。本次會議由華大基因主辦,《GigaScience》雜志協辦。來自全球300多名專家學者云集香港,共同探討了基因組學、生物信息學、云計算、生物倫理等研究領域內的最新進展,并深入探

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