SMRT測序改善CRISPR效果的評估
新興的CRISPR技術在短短一年多的時間內掀起了基因組編輯的熱潮。然而,對于這些基因改造手段的效率和結果,我們仍難以評估。目前的一些工具如熒光報告基因、克隆分析,缺乏生成報告細胞系時所需的靈敏度。高通量測序方法雖然能克服這一問題,但無奈讀長太短,而供體DNA模板往往很長。 到目前為止,還沒有一種測序平臺能夠同時評估非同源性末端接合(NHEJ)和同源介導修復(HDR)的發生頻率,而這正是雙鏈DNA斷裂的兩種主要修復機制。最近,單分子測序帶來了一個好消息。研究人員證實,單分子實時(SMRT)測序技術能夠同時測定任何位點的基因組編輯結果。這項研究成果發表在3月27日的《Cell Reports》上。 研究由斯坦福大學的Matthew Porteus領導。研究人員在文中指出,這種方法可應用于各種基因組編輯平臺,包括TALEN、CRISPR/Cas9和鋅指核酸酶(ZFN),以確定理想的改造結果出現時的條件和策略。 ......閱讀全文
小麥基因組編輯抗病育種研究取得進展
民為國基,谷為民命。糧食安全是國家安全的重要基礎,是關乎國運民生和社會穩定的頭等大事。植物病害每年造成全球作物減產可達30%,全球氣候變化、耕作制度改變及種植品種單一化等多種因素的疊加,致使植物病害更加頻繁發生,嚴重威脅全球和我國糧食安全。選育和推廣抗病新品種是防治作物病害經濟、有效和環境友好的策略
臨床多重耐藥菌基因組編輯研究取得進展
直接在臨床分離的多重耐藥菌中進行功能基因組學研究是解析耐藥機制以及開發抗耐藥策略最直接有效的方法。然而,由于缺乏能在臨床耐藥菌中直接進行高效基因編輯的工具,目前耐藥機制仍主要是采用組學分析加在模式菌中的異源驗證進行研究。這種脫離了臨床耐藥菌本身遺傳背景的研究策略,往往忽略了遺傳背景本身對耐藥因子
作物基因組單堿基編輯方法研究取得進展
單核苷酸點突變是作物許多重要農藝性狀發生變異的遺傳基礎。單堿基的變異會導致氨基酸替換或蛋白質翻譯終止,使基因功能發生改變,從而有可能產生優良的等位基因與優異性狀。傳統誘變及單堿基突變篩選技術(如TILLING)需要進行基因組規模的篩選,耗時、耗力且鑒定到的點突變數目和種類有限。基因組編輯技術,特
臨床多重耐藥菌基因組編輯研究取得進展
直接在臨床分離的多重耐藥菌中進行功能基因組學研究是解析耐藥機制以及開發抗耐藥策略最直接有效的方法。然而,由于缺乏能在臨床耐藥菌中直接進行高效基因編輯的工具,目前耐藥機制仍主要是采用組學分析加在模式菌中的異源驗證進行研究。這種脫離了臨床耐藥菌本身遺傳背景的研究策略,往往忽略了遺傳背景本身對耐藥因子
體內基因組編輯介紹
這應該是最受期待的基因治療方法,即使用基因編輯技術直接修改體內突變的靶DNA,消除致病基因,恢復身體功能。這種方法的優點是可以治愈這種疾病。例如,在亨特綜合征或血友病A患者中,尿酸-2-硫酸酯酶(IDS)或凝血因子-8在體內沒有正常表達。如果將IDS或八因子基因插入基因組,它可以終身正常表達;缺點是
“基因組編輯核酸酶”當選《自然》年度研究方法
? 《自然—方法學》視頻介紹“基因組編輯核酸酶” 《自然》雜志子刊《自然—方法學》在最新一期推出了2011年度研究方法專刊,評選出了本年度研究方法——基因組編輯核酸酶(Gene-editing nucleases)。專刊包括社論、新聞特寫、評論、視頻等內容;同時,還評出其他8個值得關注的研
微生物所等發表植物基因組編輯研究綜述
序列特異性核酸酶使得基因組編輯成為可能,快速推動了基礎和應用生物學的發展。CRISPR-Cas9系統自出現以來,作為可轉化植物的基因組編輯工具已得到廣泛應用。CRISPR-Cas9對基因組靶位點進行定向切割,造成DNA雙鏈斷裂。DNA雙鏈斷裂主要通過兩種高度保守的機制進行修復,即非同源末端連接
遺傳發育所揭示作物基因組編輯育種技術方法研究
遺傳與變異是物種進化的基礎。通過物理、化學方法(如輻射誘變、EMS誘變)產生全基因組的隨機突變已經成為農作物育種的常規手段,但其中具有新型農藝性狀突變體的篩選較為費時、費力。定向進化(Directed Evolution)則通過創制目標基因的突變文庫,在施加一定選擇壓力下能夠快速獲得目的突變體。
專家稱人類基因組編輯研究必不可少
在今年五月份,中山大學的研究人員,利用基因編輯系統除去了人類胚胎中的一個突變基因,引發了科學界關于道德倫理的廣泛爭論。相關閱讀:Nature爆炸性新聞:中山大學人類基因組編輯引發科學界大動作。 最近,在全球第一次針對有爭議的新技術的討論會議上,專家指出,涉及人類基因組編輯的研究,包括人類胚胎研
日本與英國將聯合開展“基因組編輯”基礎研究
日英兩國政府間醫療研究機構將合作開展“基因組編輯”的基礎研究,它是一項能自由改變生物基因的新技術。基因組編輯有望治療先天性疑難疾病,英國在該領域處于領先地位,日英合作將共享最新的研究數據,提高研究能力。 日本醫療研究開發機構(AMED)將與英國國立衛生研究院(NIHR)、英國醫學研