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  • 王文研究組連發Science,Nature子刊文章解析基因組

    在“973”項目的支持下,中國科學院昆明動物研究所研究員王文領導的團隊繼2013年解析山羊基因組揭示羊絨生長的基因基礎之后,近日再次攜手華大基因研究院、澳大利亞聯邦科學與工業研究組織等國內外機構“破譯”了綿羊基因組。至此,所有重要家畜動物的基因組密碼全部告破。 山羊和綿羊是反芻動物的典型代表動物,而瘤胃是反芻動物獨有的消化器官。科學家們首次觀測到兩種在反芻動物中發生特異蛋白結構改變,且僅在瘤胃中特異高表達的結構蛋白。一種是首次報道和命名的毛透明蛋白類似蛋白,另外一種是小脯氨酸豐富蛋白II家族。它們發揮瘤胃表面基板的作用,通過轉谷氨酰胺酶介導交聯瘤胃表達的角蛋白,從而構成瘤胃壁粘膜層的堅韌的角質化表面。與消化吸收密切聯系的是代謝。 研究發現除了肝臟,反芻動物的皮膚也是重要的脂類代謝器官。綿羊毛囊的皮脂腺分泌、附著在羊毛的羊毛脂占羊毛重量的10-25%。 有意思的是,兩個重要脂肪代謝的基因,單酰甘油-O-酰基轉移酶MO......閱讀全文

    馬科動物基因組與物種形成理論

      一項研究發現,包括馬、驢和斑馬在內的馬科動物的進化史與物種形成的某些理論相矛盾。盡管細節豐富的馬科動物化石記錄常常作為進化的例子,導致現代馬科動物多樣性的一系列事件仍然不清楚。為了填補這些動物的進化歷史——目前代表這一歷史的只有馬和家驢的遺傳史——Ludovic Orlando及其同事對每一個現

    知識分享:動物細胞基因組DNA提取

      實驗原理   真核生物的DNA是以染色體的形式存在于細胞核內,制備DNA將DNA與蛋白質、脂類和糖類等分離,同時保持DNA分子的完整。提取DNA的過程是指將分散好的組織細胞在含SDS(十二烷基硫酸鈉)和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質,再用酚和氯仿/異戊醇抽提分離蛋白質,得到的DNA溶液經乙醇沉

    全基因組重測序技術揭示綿羊尾脂形成的分子生物學機制

      近日,中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所肉羊遺傳育種科技創新團隊揭示了中國地方綿羊品種在適應性馴化過程中,如何通過基因組層面的選擇和重組來影響綿羊尾型的遺傳進化機制。相關研究成果已發表在《BMC Genomics》上。圖片來源于網絡  綿羊的尾型是一個重要的經濟性狀,可以為綿羊提供能量抵御惡劣環境

    農業科學院牧醫所揭秘蒙古羊肥尾表型的遺傳進化機制

      近日,中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所肉羊遺傳育種創新團隊聯合中國科學院上海生命科學研究院等單位在綿羊肥尾性狀功能解析方面取得重要進展,揭示了中國地方綿羊品種在適應性馴化過程中,如何通過基因組層面的選擇和重組來影響綿羊尾型的遺傳進化機制。該研究完善了綿羊尾脂形成的分子生物學機制,同時為綿羊分子育

    綿羊跳躍病的臨床表現

      跳躍病最易感染2歲以下的綿羊,但與綿羊一起放牧的牛也可能發病。  人對跳躍病病毒也有易感性,除實驗室感染外,也曾報道過自然感染病例,例如Reid等報道3個跳躍病輕癥腦炎病例,曾從其中2例分離到病毒。猴和人可能發生飛沫感染。  綿羊的潛伏期為6~18天。典型病例呈雙相體溫曲線,或稱雙相病期。  第

    重大測序成果,改寫綿羊遺傳史

      在當前羊肉價格不斷攀升、羊毛織品價格下跌之時,一項突破性的新研究利用先進的遺傳測序技術,重寫了綿羊沿著古老的絲綢之路育種及交易的歷史。研究發現可以幫助發展中國家的當代牧民維持或恢復對于食物和經濟安全至關重要的一些有價值的性狀)。  這一發表在《MolecularBiologyandEvoluti

    昆明動物所等家養動物線粒體DNA基因組學研究取得進展

      近年來,家養動物線粒體DNA(mtDNA)基因組學得到了迅速發展,積累了大量的mtDNA序列數據。與此同時,一些問題隨之浮現出來。除了數據質量存在缺陷(Shi, et al. 2014. Mol Ecol)之外,mtDNA世系劃分標準不一,世系命名混亂的問題也已開始干擾家養動物mtDNA的研究工

    衛星DNA的多態性和保守性

      衛星DNA具有多態性和保守性,衛星位點由微衛星的核心序列與其兩側的側翼序列構成,側翼序列使某一衛星特異地定位于染色體的某一部位,而衛星本身的重復單位變異則是形成微衛星多態性的基礎。在某一個體基因組中兩條同源染色體的相對(側翼序列相同)位置上如兩側翼序列間所包含的衛星重復單位數相同與不同,則分別表

    科學家測序動物界最大基因組

    科技日報北京8月15日電(記者張佳欣)據最新一期《自然》雜志報道,德國康斯坦茨大學和維爾茨堡大學領導的國際研究團隊,對動物界最大基因組的擁有者——肺魚進行了基因組測序。肺魚基因組約為人類基因組大小的30倍。測序數據有望揭示當今陸地脊椎動物的魚類祖先如何成功登陸的奧秘。泥盆紀時期(約4.2億至3.6億

    科學家測序動物界最大基因組

    據最新一期《自然》雜志報道,德國康斯坦茨大學和維爾茨堡大學領導的國際研究團隊,對動物界最大基因組的擁有者——肺魚進行了基因組測序。肺魚基因組約為人類基因組大小的30倍。測序數據有望揭示當今陸地脊椎動物的魚類祖先如何成功登陸的奧秘。泥盆紀時期(約4.2億至3.6億年前),一種具有強健胸鰭和肺的肉鰭魚類

    植物和哺乳動物線粒體基因組的差異

    植物細胞植物細胞的線粒體基因組的大小差別很大,最小的為100kb左右,大部分由非編碼的DNA序列組成,且有許多短的同源序列,同源序列之間的DNA重組會產生較小的亞基因組環狀DNA,與完整的“主”基因組共存于細胞內,因此植物線粒體基因組的研究更為困難。哺乳動物哺乳動物的線粒體基因DNA沒有內含子,幾乎

    動物基因組DNA-的分離純化實驗——鹽溶法

    本實驗目的是掌握鹽溶法大量制備動物基因組DNA 的基本原理和方法,根據核糖核蛋白與脫氧核糖核蛋白在一定濃度的氯化鈉溶液中的溶解度不同進行分離, 然后用蛋白質變性沉淀劑去除蛋白,使核酸釋放出來, 再利用核酸不溶于乙醇的性質將核酸析出, 達到分離提純的目的。實驗方法原理根據核糖核蛋白與脫氧核糖核蛋白在一

    細胞化學基礎衛星DNA的系統特點

    多態性和保守性衛星DNA衛星DNA具有多態性和保守性,衛星位點由微衛星的核心序列與其兩側的側翼序列構成,側翼序列使某一衛星特異地定位于染色體的某一部位,而衛星本身的重復單位變異則是形成微衛星多態性的基礎。在某一個體基因組中兩條同源染色體的相對(側翼序列相同)位置上如兩側翼序列間所包含的衛星重復單位數

    衛星DNA的系統特點

    多態性和保守性衛星DNA具有多態性和保守性,衛星位點由微衛星的核心序列與其兩側的側翼序列構成,側翼序列使某一衛星特異地定位于染色體的某一部位,而衛星本身的重復單位變異則是形成微衛星多態性的基礎。在某一個體基因組中兩條同源染色體的相對(側翼序列相同)位置上如兩側翼序列間所包含的衛星重復單位數相同與不同

    衛星DNA的基本系統特點介紹

    多態性和保守性衛星DNA具有多態性和保守性,衛星位點由微衛星的核心序列與其兩側的側翼序列構成,側翼序列使某一衛星特異地定位于染色體的某一部位,而衛星本身的重復單位變異則是形成微衛星多態性的基礎。在某一個體基因組中兩條同源染色體的相對(側翼序列相同)位置上如兩側翼序列間所包含的衛星重復單位數相同與不同

    衛星DNA的系統特點

    多態性和保守性衛星DNA具有多態性和保守性,衛星位點由微衛星的核心序列與其兩側的側翼序列構成,側翼序列使某一衛星特異地定位于染色體的某一部位,而衛星本身的重復單位變異則是形成微衛星多態性的基礎。在某一個體基因組中兩條同源染色體的相對(側翼序列相同)位置上如兩側翼序列間所包含的衛星重復單位數相同與不同

    衛星DNA的系統特點

    多態性和保守性衛星DNA具有多態性和保守性,衛星位點由微衛星的核心序列與其兩側的側翼序列構成,側翼序列使某一衛星特異地定位于染色體的某一部位,而衛星本身的重復單位變異則是形成微衛星多態性的基礎。在某一個體基因組中兩條同源染色體的相對(側翼序列相同)位置上如兩側翼序列間所包含的衛星重復單位數相同與不同

    衛星DNA的系統特點

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    綿羊跳躍病病毒的治療和預防

      跳躍病具有堅強的病后免疫力,尚未有二次發病的報道。恢復動物和注射疫苗動物的體內具有中和抗體、血凝抑制抗體和補體結合抗體。補體結合抗體的維持時間不長。  目前應用福爾馬林滅活的感染綿羊腦、鼠腦和雞胚制備疫苗,給綿羊、牛以及實驗室工作人員作免疫注射。Brotherstone等報道一種油佐劑滅活疫苗,

    昆明動物所等揭示動物適應性進化的第二套基因組學機制

      動物適應青藏高原極端環境的過程中,逐漸形成了耐低氧、耐高寒、耐粗飼料等復雜性狀的適應性。以往針對高原適應遺傳機制的研究大多數局限在動物自身遺傳物質的變異,很少了解與動物宿主共進化的第二套基因組(即腸道微生物組)的重要貢獻,特別是能量代謝方面。  中國科學院昆明動物研究所研究員施鵬領導的團隊和中國

    哺乳動物基因組三維結構首次確定

      英國醫學研究理事會網站日前報道稱,英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構,顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。  很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉,但事實上,染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。

    哺乳動物基因組三維結構首次確定

      英國醫學研究理事會網站日前報道稱,英國科學家從單個細胞中確定出完整保存的哺乳動物基因組的首個3D結構,顯示了細胞核內所有染色體中的DNA是如何復雜地折疊在一起的。該項研究成果發表在近日出版的《自然》雜志上。  很多人對于呈現“X”形狀的染色體十分熟悉,但事實上,染色體僅在細胞分裂時呈現這種形態。

    中國啟動“世界三極”動物基因組研究項目

      這是繼“國際大熊貓基因組計劃”后的又一重大研究計劃   中國科學家4月24日在深圳宣布啟動“世界三極”動物基因組研究項目,對企鵝、北極熊和藏羚羊這三種分別生長于南極、北極和高海拔嚴酷環境下的動物展開基因組水平上的研究。該計劃是繼“國際大熊貓基因組計劃”之后,中國科學家啟動的生命科學領域又一重大

    2018年基因組測序盤點——各種有趣的動物

      2018年,各國科學家繼續卯足了勁,對本國的珍(qi)稀(pa)動物進行基因組測序。他們的目標是保護瀕危動物(如考拉、金槍魚),對付入侵物種(如小龍蝦、海蟾蜍),抑或是從中發現長壽的秘密(如烏龜、鸚鵡)。  與之前采用單一技術的研究不同,如今的基因組測序研究大多結合Illumina短讀長和Pac

    “萬種脊椎動物基因組計劃”宣布啟動

      擬兩年解碼101種物種 建立遺傳信息數據庫   深圳華大基因研究院與“萬種脊椎動物基因組計劃”聯盟(G10KCOS)的科學家聯合宣布啟動萬種脊椎動物基因組一期計劃。該計劃將依托華大基因先進的新一代測序技術平臺、前沿的信息分析和數據處理能力,在未來兩年內完成對101種脊椎動物的全基因組測序,解析

    首次利用CRISPR從活動物基因組中清除HIV

      坦普爾大學劉易斯·卡茨醫學院(LKSOM)和內布拉斯加大學醫學中心(UNMC)的研究人員進行了一次重大合作,首次從活動物的基因組中消除了可復制的HIV-1 DNA,這是一種導致艾滋病的病毒。這項研究于近日在線發表在《Nature Communications》雜志上,它標志著人類艾滋病病毒(HI

    10種靈長類動物基因組研究成果公布

    在最新一期的《基因組研究》雜志的網絡版上,來自美國科羅拉多衛生科學中心大學和斯坦福大學的研究人員公布了一項大規模基因組研究的結果。 該研究的目的是分析調查10種包括人類在內的靈長類動物之間基因復制數量的差異,剩余九種靈長類動物分別為黑猩猩、大猩猩、倭黑猩猩、猩猩、長臂猿、短尾猿、狒狒、狨和狐猴。

    哺乳動物中制備基因組DNA實驗——制備DNA

    在DNA提取過程中應盡量避免使DNA斷裂和降解的各種因素,以保證DNA的完整性,為后續的實驗打下基礎。一般真核細胞基因組DNA有107-9bp,可以從新鮮組織、培養細胞或低溫保存的組織細胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等試劑存在下用蛋白酶K消化細胞,隨后用酚抽提而實現的。實驗材料動物組織試劑、

    基因組編輯技術讓新疆細毛羊“天賦異稟”披上彩色外衣

      天生原本應該是白白的小羊羔,如今一出生卻與眾不同:兩只毛色純黑,頭頂部有白色斑點;兩只毛色黑白相間像大熊貓的外衣;還有一只毛色是棕白相雜。  它們的“天賦異稟”來源于新疆畜牧科學院生物技術研究所研究員劉明軍課題組的基因組編輯技術。  7日,新疆畜牧科學院院長王力儉在新聞發布會上說:“這是利用基因

    蘭州大學、中科院Cell子刊發表微生物組研究新成果

      來自中科院昆明動物研究所、中科院北京生命科學研究院和蘭州大學的研究人員,在新研究中揭示出了高海拔哺乳動物瘤胃微生物組的趨同進化。研究結果發布在6月16日的《Current Biology》雜志上。  中科院昆明動物研究所的施鵬(Peng Shi)研究員、中科院北京生命科學研究院趙方慶(Fangq

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