中科院院士賀福初:大發現時代的“生命組學”
縱觀自然科學史,我們常常可以看到“厚積薄發”的現象:當人類對某個領域的認知積累到一定程度時,必然會出現一個甚至數個劃破歷史長空的科學巨星,他(們)促使重大發現蜂擁而至、噴薄而出,促使一個或多個相關學科呈現爆發式成長,乃至革命性突變,如此該學科可謂進入了“大發現時代”。 A 自然科學史上的若干“大發現時代” 人們對于自然科學的了解和學習大多從數學開始,近代許多重大突破,都是基于數學的發展。古希臘畢達哥拉斯學派的突出貢獻,開啟了自然科學的第一個大發現時代。該學派最早證明了勾股定理,提出了奇數、偶數、質數、親和數、完全數等概念,他們發現:算術的本質是“絕對的不連續量”,音樂的本質是“相對的不連續量”,幾何的本質是“靜止的連續量”,天文學的本質是“運動的連續量”。在此基礎上,該學派提出“數即萬物”學說。 地理學的“大發現時代”爆發于短短的40年,卻影響了世界數百年的格局。十五、十六世紀之交,以地球說為理論指導,借助......閱讀全文
破譯蛋白質組-打開生命“解剖圖”
?據新一期英國《自然》雜志報道,人類蛋白質組組織前主席約翰·伯杰龍發起一項大規模的破譯人類蛋白質組計劃,目標是花費約10年時間將人體所有蛋白質歸類并描繪出它們的特性,并揭示它們在細胞中所處的位置以及每種蛋白質與其他哪些蛋白質存在相互作用。 早在上世紀90年代,科學家就已經啟動了基因組計劃,并經過1
北京基因組所生命組學數據資源建設獲進展
近日,中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊題為The BIG Data Center: from deposition to integration to translation 的研究論文被國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發表。該研究成
基因組學推動生命科學大步向前
2010年下旬,河南安陽曹操墓真偽之辯正酣。而一則來自上海的重磅消息更是引發了多方關注。復旦大學現代人類學教育部重點實驗室宣布,向全國征集曹姓男性DNA樣本,擬用基因組科學的手段驗證出土的頭骨是否為曹操本人。 一下子,基因組科學成為熱門,這一話題“落入尋常百姓家”。 事實上,伴隨著2
細胞遺傳學——比較基因組雜交(CGH)
·?????????Comparative Genomic Hybridization (CGH) CGH is a molecular Cytogenetic method of screening a tumor for genetic changes. The alterations are
全新角度探索生命奧秘:脂質組學
血漿中約70%的代謝物是脂類,脂類代謝是動植物的第一大類代謝。加上質譜法的廣泛應用,大大加速了脂質組學的發展,脂質組學已成為代謝組學中最為活躍的研究領域之一。 萬事萬物都存在著辯證,盡管我們對高血脂深惡痛絕,心痛它對我們身體的摧殘。但脂質卻又是人體無法舍棄的重要組成,少了它,生命將一團亂麻以至
脂質組學:全新角度探索生命奧秘
血漿中約70%的代謝物是脂類,脂類代謝是動植物的第一大類代謝。加上質譜法的廣泛應用,大大加速了脂質組學的發展,脂質組學已成為代謝組學中最為活躍的研究領域之一。 萬事萬物都存在著辯證,盡管我們對高血脂深惡痛絕,心痛它對我們身體的摧殘。但脂質卻又是人體無法舍棄的重要組成,少了它,生命將一團亂麻以至
空間轉錄組學開啟生命科學基因研究的3D模式
近來單細胞組學研究的發展使生命科學研究步入更加微觀的層面。對單個細胞基因功能的了解不僅刷新了我們對組成組織的細胞類型的發現,也讓我們對組織中的細胞功能和互作機制有了全新認識。但是,需要將新鮮組織進行單細胞解離,需要足夠活性的細胞進行實驗,這些要求使得很多研究在一開始就被拒之門外。另外,雖然通過數據還
空間轉錄組學開啟生命科學基因研究的3D模式
近來單細胞組學研究的發展使生命科學研究步入更加微觀的層面。對單個細胞基因功能的了解不僅刷新了我們對組成組織的細胞類型的發現,也讓我們對組織中的細胞功能和互作機制有了全新認識。但是,需要將新鮮組織進行單細胞解離,需要足夠活性的細胞進行實驗,這些要求使得很多研究在一開始就被拒之門外。另外,雖然通過數
組織學——顯微解剖
Laser Capture Microdissection (LCM)Introduction to LCM??(BJMU)??Preparation, LCM and RNA/DNA extraction of Frozen Tissue Sections?(NIH Laser Capture M
Nature發布單細胞基因組學新技術
胚胎是如何形成我們肺臟、肌肉、神經和其他組織中的細胞的?一種新的方法可以解碼使得胚胎萬能細胞能夠增殖并轉變為機體許多特化細胞類型的遺傳指令。 一開始是一團相同的細胞,隨著增殖不斷地改變形狀和功能,最終變為我們肺臟、肌肉、神經和機體所有其他特化組織中的細胞。胚胎擁有這種創造奇跡的能力。
《細胞》特輯:聯接組學
“Cell Press Selections”是由Cell出版社推出的一份推薦文章集合手冊,主要介紹某個生命科學研究領域最新的進展及突出成果。相關特輯內容包括研究論文,評論性文章以及snapshots,涉及了同一領域的方方面面,更為重要的是這些文章由贊助商贊助,可以免費獲取。 所謂聯接組學(c
利用植物表型組學挖掘基因組學的成果
到2050年,全球人口將達到97億,預計作物產量翻一番才能滿足全球人口的糧食需求。為了達到這一目標,作物產量需每年增長2.4%,但目前作物產量平均增長率僅為1.3%。作物生產性能的遺傳改良仍然是提高作物生產力的關鍵因素,但當前的改善速度無法滿足可持續性和糧食安全的需要。為了確保糧食安全、生態系統的可
人體解剖學空間圖譜-(SAHA)-項目——探索新細胞類型
對宇航員的樣本進行測序讓威爾康奈爾醫學院的克里斯梅森開始從天文學角度思考。 現在,他正在嘗試進行與發現新行星相同的生物學研究——發現新的細胞類型。 就像通過與其他行星或恒星的引力相互作用發現行星一樣,空間組學技術使研究人員能夠“第一次看到相互作用以挑選出新型細胞”或功能改變的細胞,這些細胞實際
單細胞基因組學:通往個體化醫療之門
隨著第二代測序技術的普及,單細胞測序迎來了迅猛發展。 近日,南方科技大學生物學系副教授賀建奎在美國冷泉港參加了單細胞分析會議后,在科學網博客里寫道:“這是一個非常令人激動的前沿學術會議,我深深地體會到了單細胞基因組學時代的來臨。” 他對《中國科學報》表示:“單細胞基因測序技術的突破,只是開了
Nature論述:單細胞基因組學揭開“免疫新世界”
人類對生命的好奇,從來沒有減退。一個多世紀以來,科學家們一直試圖解析構成我們機體的成千上萬億個細胞,從一米長的神經元到8微米寬的紅細胞。他們希望從中找到解析重要生理、病理過程,挖掘重要的細胞類型和信號通路。 但是,過去幾十年,包括熒光抗體標記技術、DNA和RNA測序技術等在內的研究工具卻不能解
新產品前瞻-空間轉錄組學開啟生命科學基因研究的3D模式
近來單細胞組學研究的發展使生命科學研究步入更加微觀的層面。對單個細胞基因功能的了解不僅刷新了我們對組成組織的細胞類型的發現,也讓我們對組織中的細胞功能和互作機制有了全新認識。但是,需要將新鮮組織進行單細胞解離,需要足夠活性的細胞進行實驗,這些要求使得很多研究在一開始就被拒之門外。另外,雖然通過數
宏基因組測序揭示神秘的生命領域
生物通報道:美國國家能源部Lawrence Berkeley實驗室和加州大學伯克利分校的研究人員采用科羅拉多蓄水層的沉積物和地下水樣本,通過宏基因組測序重建了二千五百多個微生物的基因組。這項研究發表在十月二十四日的Nature Communications雜志上,為人們揭示了地下世界驚人的生物學
解碼基因組“暗物質”,拓寬生命認知疆域
人類約有2萬個基因,僅占DNA的2%,剩下的98%是什么?這些區域如同基因組中的“暗物質”,有待科學家去發現。非編碼RNA(核糖核酸)是基因組“暗物質”中的一類重要分子,最近十幾年才被發現。它們不僅在生命活動中發揮功能,還與許多疾病息息相關。 作為國際上較早從事長非編碼RNA研究的科學家之一,
宏基因組測序揭示神秘的生命領域
美國國家能源部Lawrence Berkeley實驗室和加州大學伯克利分校的研究人員采用科羅拉多蓄水層的沉積物和地下水樣本,通過宏基因組測序重建了二千五百多個微生物的基因組。這項研究發表在十月二十四日的Nature Communications雜志上,為人們揭示了地下世界驚人的生物學多樣性,給生
整合基因組和組織學信息-基因組學公司聯手開拓新前沿
10x Genomics公司宣布收購位于瑞典斯德哥爾摩的Spatial Transcriptomics公司。Spatial Transcriptomics公司是空間基因組學(spatial genomics)領域的領先公司。空間基因組學是一個新興領域,它不但讓研究人員可以獲得單細胞內的基因組數據
美印藥物基因組學與癌癥基因組學檢測商業化
美國Companiondx實驗室擬與健康信息技術服務商Enable Healthcare合作,向醫生推廣藥物基因組學檢測;印度癌癥醫學公司HCG宣布建立一個新的腫瘤基因中心,旨在下代測序技術能夠幫助定位腫瘤,從而提高化療和放療的效率和響應率 美國藥物基因組學檢測商業化 Companiondx實驗
賀福初院士:“生命組學”研究模式已現端倪
近日,來自軍事醫學科學院、北京蛋白質組研究中心的賀福初院士介紹了生命科學領域的“大發現時代”,指出集多種組學之大成的“生命組學”研究模式已現端倪,大發現時代將如影隨形。相關論文發表在《中國科學: 生命科學》2013年第一期。 自然科學史表明,當人類對某一領域的認知積累到一定程度時,常
第一屆生命組學與精準醫學大會
大會主題: 生命組學與精準醫學,從基礎研究到臨床應用 精準醫學在出生缺陷防控領域的前沿進展 精準醫學在腫瘤精準檢測領域的前沿進展 精準醫學在微生物快速檢測領域的前沿進展 創業投資助力精準醫學發展 基本信息: 會議報到:2015年12月11日全天
聚焦生命組學與精準醫學大會-引領未來-共享精彩
邀請函 大會背景 精準醫學是對現有醫療模式的革新和革命,本質上是通過基因組、蛋白質組、代謝組、糖基組、分子成像等組學技術,精確尋找到疾病的原因和治療的靶點,為患者提供更具有針對性和有效性的治療措施,最終實現精準治療。在中國,精準醫療已被列入“
Science專題:癌癥基因組學
在2001年完成人類基因組測序后,許多的研究人員立即將目光放到了利用這些信息來更好地了解遺傳學上。最近,越來越多的研究確定了表觀遺傳學在癌癥的發生、形成及發展過程中起效應。從鑒別與遺傳性癌癥相關的單基因變異的前基因組時代轉向,測序技術的進步使得研究人員能夠利用全基因組方法來檢測基因組間的差異,以
藥物基因組學的定義
藥物基因組學(pharmacogenomics),又稱基因組藥物學或基因組藥理學,是藥理學的一個分支,定義為在基因組學的基礎上,通過將基因表達或單核苷酸的多態性與藥物的療效或毒性聯系起來,研究藥物如何由于遺傳變異而產生不同的作用。
毒理基因組學的定義
毒理基因組學(toxicogenomics)是從多基因、全基因組水平研究毒物作用與基因表達的相互影響。其研究內容主要包括3個方面:促進環境應激原與疾病易感性關系的理解、闡明毒性分子機制、篩選和確認與疾病和毒物暴露相關的生物標志物(biomarkers)。
細胞核重編程與癌癥基因組學論壇召開
近日,由《自然—遺傳學》雜志主辦、中科院廣州生物醫藥與健康研究院承辦的“細胞核重編程與癌癥基因組學”論壇在廣州召開。 據了解,在干細胞研究中,誘導多能干細胞的重編程是該領域最受關注的問題之一。目前,干細胞研究和腫瘤研究存在很多交叉。將這兩個領域的研究結合起來,有利于更好地使再生醫學得以應用并輔
Autoimmunity:能研究細胞表觀基因組學特性的新型工具
如今研究人員都知道,表觀基因組在控制DNA表達上扮演著關鍵角色,而且表觀基因組的一系列改變與多種健康問題直接相關,比如癌癥、自身免疫性障礙等多種疾病,但目前科學家們關于表觀基因組并不是知道地很多,甚至也并沒有工具去研究表觀基因組。圖片來源:CC0 Public Domain 刊登在國際雜志Au