Nature解析水平基因轉移
盡管在許多真核生物中是突變和有性繁殖驅動了遺傳創新，對于生命中獨特的單細胞領域：古細菌和細菌而言，水平基因轉移是獲得新性狀的一種關鍵機制。 水平基因轉移, 又稱橫向基因轉移, 指不同于常規的由親代到子代的垂直基因傳遞, 能跨越種間隔離, 在親緣關系或遠或近的生物有機體間進行的遺傳信息轉移. 通過將新基因導入現有的基因組, 水平基因轉移能幫助受體生物繞過通過點突變和重組創造新基因的緩慢過程, 從而加速基因組的革新和進化。 通過對2.5萬個古細菌基因家族進行系統進化分析，研究人員證實從細菌處獲得的一些基因似乎在形成古細菌的主要類群中起重要作用。這項發表在10月15日《自然》（Nature）雜志上的研究，還表明了遺傳物質從細菌轉移至古細菌比從古細菌轉移至細菌常見5倍。 論文的共同作者、德國杜塞爾多夫大學分子進化研究所的William Martin說：“我們往往認為進化是以一種漸進的方式推進，點點滴滴的點突變沿著不同的譜系累積......閱讀全文
原核細胞的生物系統
傳統分類法根據生物的營養方式、運動能力和細胞結構的特點，把生物劃分為動物界和植物界。植物細胞的主要特征是具有硬的細胞壁和進行光合作用的葉綠體。按傳統分類系統，雖然大多數生物種容易歸類，可是對某些生物來說卻遇到了分類上的困難，例如眼蟲（Euglena）是一種單細胞生物，含有葉綠體，卻不具有細胞壁；
ac4C榮登NatureRNA修飾研究大有可為
RNA修飾是表觀遺傳學中調控轉錄后基因表達的關鍵過程，目前對m6A RNA修飾的研究已進行的如火如荼，但除了m6A以外仍有多種RNA修飾類型參與調控轉錄后的基因表達，其中包括m1A、m5C、m7G、2’-O-甲基化修飾以及ac4C乙酰化修飾，在這些領域的研究中也不斷有高 分文章的出現（如表1
淀粉酶的特性和應用
淀粉酶是非常重要的工業用酶，占酶制劑市場25%。目前工業主要是高溫酶，來自深海液口嗜熱厭氧古細菌熱球菌屬Thermococcus產胞外耐熱高溫酶，最適溫度95 ℃，100 ℃仍有60%活力，用PCR法克隆此酶基因，并在E. coli中得到表達。又從云南騰沖分離兩株耐熱生淀粉生產的Geobacillu
重磅！科學家深入解析CRISPR起源的5個謎團
Francisco Mojica并不是第一個觀察到CRISPR的研究者，但他卻是第一個被CRISPR“深深打動”的人，他還記得，1992年的某一天當他首次看到微生物的免疫系統時，他就認為這或許能夠帶來一場生物技術的變革，隨后Francisco Mojica對來自地中海富鹽菌(Haloferax
Science：可編程的DNA剪刀
勞倫斯伯克利國家實驗室(Berkeley Lab)的科學家發現了一種更有效的基因組編輯新方法，為基因工程和基因組研究者帶來了福音。基因工程改造的微生物(如細菌和真菌)在生物能源和藥物研發等方面起到了關鍵作用，而這一研究成果能為科學家提供極大的幫助。 勞倫斯伯克利國家實驗室的研究團隊發現
關于基因表達的基本信息介紹
基因表達產物通常是蛋白質,但是非蛋白質編碼基因如轉移RNA（tRNA）或小核RNA（snRNA）基因的表達產物是功能性RNA。 所有已知的生命,無論是真核生物（包括多細胞生物）、原核生物（細菌和古細菌）或病毒,都利用基因表達來合成生命的大分子。 基因表達可以通過對其中的幾個步驟,包括轉錄,R
真核細胞與原核細胞的主要區別
①真核細胞具有由染色體、核仁、核液、雙層核膜等構成的細胞核；原核細胞無核膜，故無真正的細胞核，僅有由核酸集中組成的擬核。②真核細胞的轉錄在細胞核中進行，蛋白質的合成在細胞質中進行，而原核細胞的轉錄與蛋白質的合成交聯在一起進行。③真核細胞有內質網、高爾基器、溶酶體等細胞器，原核細胞沒有。④真核生物
強大的基因組編輯工具Crisp/cas9（一）
關于Crisp/cas9，這個是目前研究的一個大熱門，相關的文章和技術解析層出不窮，大家對什么是Crisp/cas9應該也有了一定的了解，今天就跟大家簡單的介紹一下相關的產品吧。不過首先，我們還是再過一遍Crisp/cas9的相關概念吧。??一、 相關概念?（1）CRISPR/Cas是什么？CRIS
昆明動物所賈第蟲原始進化地位研究取得進展
作為單細胞原生動物的賈第蟲（Giardia）因發現其存在一系列的原始特征而一度被認為是目前已知的最原始真核細胞，對研究真核細胞如何從原核細胞進化而來具有極為重要的意義。但也有不少學者堅持認為，這些所謂的“原始特征”應該是由于賈第蟲高度適應寄生生活方式而次生性退化所致。這種“原始性”
與真細菌主要區別
1、形態學上，古細菌有扁平直角幾何形狀的細胞，而在真細菌中從未見過。2、中間代謝上，古細菌有獨特的輔酶。如產甲烷菌含有F420，F430和COM及B因數。3、有無內含子(introns)上，許多古細菌有內含子。4、膜結構和成分上，古細菌膜含醚而不是酯，其中甘油以醚鍵連接長鏈碳氫化合物異戊二烯，而不是
昆明動物所揭示rRNA加工機器的進化機制
核糖體是蛋白質合成的分子機器。核糖體RNA的加工成熟及其與核糖體蛋白的結合是核糖體亞基裝配的基本過程。真核生物的該過程是在核仁中進行的。在酵母上已有報道核糖體小亞基rRNA(SSU rRNA)的加工成熟，是由一個被稱為SSU Processome(小亞基rRNA加工體)的核酸蛋白復合體所
關于基因表達的概念簡介
基因表達（gene expression）是指將來自基因的遺傳信息合成功能性基因產物的過程。基因表達產物通常是蛋白質，所有已知的生命，都利用基因表達來合成生命的大分子。 基因表達產物通常是蛋白質，但是非蛋白質編碼基因如轉移RNA（tRNA）或小核RNA（snRNA）基因的表達產物是功能性RNA
Cell：大規模微生物組分析發現了數千個新物種
意大利特倫托大學等機構的研究人員通過測序人類微生物組樣本中的9,000多個宏基因組，發現了超過15萬個微生物基因組，其中大多數是此前未知的。這項重要成果于上周發表在《Cell》雜志上。 意大利特倫托大學等機構的研究人員通過測序人類微生物組樣本中的9,000多個宏基因組，發現了超過15萬個微生物
原核生物基因組的特點
原核生物基因組的特點如下：1、基因組較小，通常只有一個環形或線形的DNA分子；2、通常只有一個DNA復制起點；3、非編碼區主要是調控序列；4、存在可移動的DNA序列；5、基因密度非常高，基因組中編碼區大于非編碼區；6、結構基因沒有內含子，多為單拷貝，結構基因無重疊現象；7、重復序列很少，重復片段為轉
細菌的主要分類
按細菌形狀分類細菌具有不同的形狀，并可根據形狀分為三類，即：球菌、桿菌和螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺桿菌）。按細菌的生活方式來分類，分為兩大類：自養菌和異養菌，其中異養菌包括腐生菌和寄生菌。按細菌對氧氣的需求來分類，可分為需氧（完全需氧和微需氧）和厭氧（不完全厭氧、有氧耐受和完全厭氧）細菌。按細菌生存
細菌的種類和主要分類方式
按細菌形狀分類細菌具有不同的形狀，并可根據形狀分為三類，即：球菌、桿菌和螺旋菌（包括弧菌、螺菌、螺桿菌）。按細菌的生活方式來分類，分為兩大類：自養菌和異養菌，其中異養菌包括腐生菌和寄生菌。按細菌對氧氣的需求來分類，可分為需氧（完全需氧和微需氧）和厭氧（不完全厭氧、有氧耐受和完全厭氧）細菌。按細菌生存
修復蛋白質生產錯誤能延長壽命
英國倫敦大學學院和英國醫學研究理事會(MRC)倫敦醫學科學研究所的研究人員在簡單模式生物中進行的一項新研究發現，減少蛋白質合成（生產）中的自然錯誤可以改善健康和延長壽命。14日發表在國際著名期刊《細胞代謝》上的這項新發現，首次證明了蛋白質錯誤減少與壽命之間的直接聯系。 “DNA突變會致癌，而這
內含肽的基本信息介紹
生物體本身就是一個神秘而精密地高效運作的機器。大到各系統之間，小到每個細胞，無一不展示著生命的神奇，他們之間的配合是那樣的天衣無縫。繼內含子的自我剪接功能發現之后，第一個內含肽——命名為Sce VMA1 發現了，它的發現使內含肽陸續在各種生物中發現，它們在單細胞真核生物、真細菌、古細菌、噬菌體和
什么是CRISPR/CAS9技術
CRISPR/Cas9（Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats）是最新出現的一種由RNA指導的Cas9核酸酶對靶向基因進行編輯的技術。CRISPR/Cas9是細菌和古細菌為應對病毒和質粒不斷攻擊而演化來的獲得性免疫防御機制。
什么是CRISPR/CAS9技術
CRISPR/Cas9（Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats）是最新出現的一種由RNA指導的Cas9核酸酶對靶向基因進行編輯的技術。CRISPR/Cas9是細菌和古細菌為應對病毒和質粒不斷攻擊而演化來的獲得性免疫防御機制。
核酸內切酶的簡介
30多年前，當人們在對噬菌體（細菌病毒）的宿主特異性的限制-修飾現象進行研究時，首次發現了限制性內切酶。細菌可以抵御新病毒的入侵，而這種"限制"病毒生存的辦法則可歸功于細胞內部可摧毀外源DNA的限制性內切酶。首批被發現的限制性內切酶包括來源于大腸桿菌的EcoR I和EcoR II，以及來源于He
什么是肌動蛋白？
肌動蛋白是一個球狀多功能蛋白家族，在細胞骨架中形成微絲，在肌纖維中形成細絲。它基本上存在于所有真核細胞中，其濃度可能超過100μM；它的質量大約為42kDa，直徑為4到7nm。肌動蛋白是細胞中兩種細絲的單體亞基：微絲，細胞骨架的三個主要成分之一，和細絲，肌肉細胞中收縮裝置的一部分。它可以作為稱為G-
測序過程中出現“流氓基因”污染
Supratim Mukherjee在進行數據分析的時候，發現數以百計的微生物基因組中會重復出現同一種噬菌體序列，這令他感到很驚訝。這位來自勞倫斯伯克利國家實驗室的生物信息學家最開始是為了比對這些微生物的代謝途徑，但后來他發現了幾乎無處不在的序列，“我以為我們發現了一些新的東西，”他回憶道，“在
關于產甲烷菌的基本信息介紹
產甲烷菌，是專性厭氧菌，屬于古菌域，廣域古菌界，寬廣古生菌門。產甲烷菌是一類能夠將無機或有機化合物厭氧發酵轉化成甲烷和二 氧化碳的古細菌。產甲烷菌是重要的環境微生物，在自然界的碳素循環中起重要作用。迄今已有 5種產甲烷菌基因組測序完成。基因組信息使人們對產甲烷菌的細胞結構、進化、代謝及環境適應性
關于原核生物的DNA包裝介紹
原核生物不具有以核膜為界限的細胞核，它們的DNA被組織在一個類核結構中。類核是獨特的結構并占據細菌細胞確定的區域。但這種結構是動態的，可被與細菌染色體相關的一系列組蛋白樣蛋白的作用來維持和重塑 [6] 。古細菌染色體中的DNA被包裝在與真核核小體相似的結構中。某些細菌還含有質粒或其它染色體外DN
科學家解析膜蛋白DGGGPase結構與功能
膜脂是細胞膜的重要組成部分，主要由脂類分子以雙分子層的形式構成的膜骨架。微生物在生長過程中，生物膜脂的合成與代謝調控具有重要作用。雖然微生物細胞膜脂質合成的主要機制已被闡明，但古細菌細胞膜的甘油磷脂生物合成機制，由于涉及膜內多個蛋白的參與，目前仍不完全清晰。 其中，古細菌膜脂關鍵合成酶CDP-
廣州生物院在熱帶爪蛙中建立了高效基因敲除技術
中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院陳永龍博士的研究團隊成功利用CRISPR/Cas9系統在熱帶爪蛙中獲得了高效的靶向基因破壞，該研究成果Efficient RNA/Cas9-mediated genome editing in Xenopus tropicalis 于1月8日在線發表在D
III型A－CRISPRCas系統改造耐藥金黃色葡萄球菌的基因組
CRISPR-Cas系統是古細菌及其他細菌的獲得性免疫系統，是細菌為了抵御外源基因入侵而形成的自我保護機制。根據CRISPR相關蛋白（CRISPR-associated proteins ,cas）的結構和功能，將為CRISPR-Cas系統分為5個類型，其中I 型、 II型和III型CRISPR
12月24日《自然》雜志精選
封面故事： 2009年度新聞人物 Nature雜志2009年度新聞人物是美國總統奧巴馬大膽提名的能源部部長人選朱棣文。這位曾經獲得過諾貝爾獎的物理學家受命推動世界最大經濟體及其能源行業的變革，以適應21世紀的需要。朱棣文曾在勞倫斯伯克利國家實驗室工作4年時間，在這期間，他將該實驗
“萬種微生物基因組計劃”在深圳啟動
由深圳華大基因研究院聯合中國微生物領域頂尖研究機構、院校和企業組成的“萬種微生物基因計劃”，八月一日在深圳啟動。 據悉，該計劃是深圳華大基因研究院在“國際千人基因組計劃”后啟動的又一重大基因組計劃，目前該計劃的地位為亞洲第一、世界第三。 該計劃預計在三年內完成一萬種微生物物種全基因組