張鋒Nature發表重要突破：用CRISPR啟動基因
麻省理工的科學家們對目前最熱門的基因編輯系統CRISPR/Cas9進行了改造，這一成果發表在十二月十日的Nature雜志上。現在，人們可以用這一技術在活細胞中有效啟動任何基因。 這個系統可以讓科學家們更簡便地研究不同基因的功能，領導這項研究的CRISPR技術先驅張鋒（Feng Zhang）說。 改造后的CRISPR技術，可以快速對整個基因組進行功能篩選，幫助人們鑒定涉及特定疾病的基因。張鋒等人在這項研究中就鑒定了讓黑色素瘤細胞抵抗癌癥藥物的幾個基因。 CRISPR的新功能 CRISPR原本是細菌抵御病毒感染的免疫體系。之前人們利用這個系統建立了基因編輯復合體，這個復合體包括Cas9酶和引導RNA。引導RNA結合到基因組的特定序列，告訴Cas9在哪里進行剪切。 近兩年來，Cas9工具被廣泛用于關閉或替換基因，而張鋒等人這次成功將它改造來啟動基因。 之前也有人嘗試過用CRISPR系統啟動基因。他們失活了Cas9的剪切......閱讀全文
T細胞基因的轉錄激活及其表達
? TCR/CD3復合物與配體結合后，經多種信號轉導途徑傳遞信號，最終導致T細胞活化和增殖。信號轉導中所涉及的基因根據其活化時間可以分為早早期、早期、晚期基因三種類型（表8-5)。早早期基因的轉錄不需蛋白的合成，而早期及晚期基因的轉錄則需蛋白的合成。早早期及早期基因轉錄在有絲分裂期之前，而晚期基因轉
關于基因轉錄的轉錄因子介紹
轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態，RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄，只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后，基因才開始表達。轉錄因子的結合位點
基因轉錄調控的途徑
可分為三種主要途徑：1）遺傳調控（轉錄因子與靶標基因的直接相互作用）；2）調控轉錄因子與轉錄機制相互作用，3）表觀遺傳調控（影響轉錄的DNA結構的非序列變化）。
基因轉錄后調控方式
真核生物的RNA被翻譯之前需要通過核孔輸出，因此核輸出對基因表達有著顯著影響。所有進出細胞核的mRNA的運輸都是通過核孔進行的，受到各種輸入蛋白和輸出蛋白的控制。攜帶遺傳密碼的mRNA需要存活足夠長的時間才能被翻譯，因為mRNA在翻譯之前必須經過很長距離的運輸。在典型的細胞中，RNA分子僅在特異性保
基因轉錄因子的相關介紹
轉錄因子(transcription factor)是起調控作用的反式作用因子。轉錄因子是轉錄起始過程中RNA聚合酶所需的輔助因子。真核生物基因在無轉錄因子時處于不表達狀態，RNA聚合酶自身無法啟動基因轉錄，只有當轉錄因子(蛋白質)結合在其識別的DNA序列上后，基因才開始表達。轉錄因子的結合位點
關于基因轉錄的基本介紹
基因轉錄是在細胞核和細胞質內進行的。它是指以DNA的一條鏈為模板，按照堿基互補配對原則，在RNA聚合酶作用下合成RNA的過程。基因轉錄有正調控和負調控之分。 如細菌基因的負調控機制是當一種阻遏蛋白(repressor protein)結合在受調控的基因上時，基因不表達；而從靶基因上去除阻遏蛋白
基因表達的轉錄機制介紹
轉錄過程由RNA聚合酶（RNAP）進行,以DNA為模板,產物為RNA。RNA聚合酶沿著一段DNA移動,留下新合成的RNA鏈。 基因組DNA由兩條反向平行和反向互補鏈組成,每條鏈具有5'和3'末端。這兩條鏈分別稱為“模板鏈”（產生RNA轉錄物的模板）和“編碼鏈”（含有轉錄本序列的
關于基因轉錄的過程介紹
(1)基因轉錄— 轉錄的啟動 DNA上存在著轉錄的起始信號，它是特殊的核苷酸序列，稱為啟動子。 轉錄是由RNA聚合酶全酶結合于啟動子而被啟動的。 其機理是：s因子能識別啟動子，并識別有義鏈，它與核心酶結合，引導核心酶定位到啟動子部位。 (2)基因轉錄—?轉錄的起始 當聚合酶結合到啟動子
多階段單細胞轉錄數據的基因識別統計方法問世
近日，西安交通大學公共衛生學院孫世權教授團隊開發了一種高效靈活的非參數方法，用于檢測多個時間點上的基因表達模式。該方法稱為TDEseq，即時間序列scRNA-seq數據的時間差異表達基因，近日該成果發表于《基因組生物學》上。TDEseq采用線性可加混合模型（LAMM）來擬合單個基因表達值和時間點的關
多階段單細胞轉錄數據的基因識別統計方法問世
近日，西安交通大學公共衛生學院孫世權教授團隊開發了一種高效靈活的非參數方法，用于檢測多個時間點上的基因表達模式。該方法稱為TDEseq，即時間序列scRNA-seq數據的時間差異表達基因，近日該成果發表于《基因組生物學》上。TDEseq采用線性可加混合模型（LAMM）來擬合單個基因表達值和時間點的關
Nat－Commun：揭秘轉錄因子“勘察”細胞基因組的分子機制
轉錄因子（TFs）是一種能調節基因表達的特殊蛋白，其能在完整的基因組中搜索并結合特殊區域來調節基因的表達；我們都知道，轉錄因子不僅能結合特殊的DNA序列，還能非特異性結合任何DNA鏈。這些非特異性的關聯就能夠明顯增加轉錄因子尋找特殊靶點的能力，然而目前研究人員并不清楚在掃描大量基因組、定位以及結
人血細胞中的所有蛋白編碼基因進行全基因組轉錄組分析
在臨床和研究環境中，血液都是對人類進行分子分析的主要來源，并且是許多治療策略的目標，這突顯了需要對構成人類血液的細胞進行全面的分子圖譜構建。人類蛋白質圖譜計劃（www.proteinatlas.org）是一個開放式數據庫，旨在通過整合各種組學技術（包括基于抗體的成像）來繪制所有人類蛋白的圖譜。在
同濟大學康九紅：lncRNAs如何精確調控干細胞基因轉錄
來自同濟大學生命科學與技術學院的研究人員發表了題為 “LincRNA-1614 coordinates Sox2/PRC2 mediated repression of developmental genes in pluripotency maintenance”的研究成果。著重揭示了多能干細
使用轉錄定位法進行基因定位
許多?RNA病毒的整個基因組往往作為一個單位轉錄。隨著轉錄的進行，由基因組上各個基因所編碼的蛋白質也依序在寄主細胞中出現。當寄主細胞被紫外線照射使本身的蛋白質合成受到抑制時，病毒蛋白的出現更為明顯。紫外線照射也起著抑制病毒基因組的轉錄的作用。紫外線在 RNA分子的某一部位造成損傷后，損傷的部位和它后
基因轉錄圖的結構或功能
轉錄圖基因轉錄圖即是把細胞內染色體或DNA上所有基因定位在染色體或DNA基因組的不同位置上，反映在 正常或受控條件下能夠表達的cDNA片段數目、種類、結構與功能的信息，是用來表示DNA上哪些核苷酸序列可以編碼蛋白質。生物性狀是由結構或功能蛋白決定的，功能蛋白是由信使RNA（mRNA）編碼的，mRNA
RNA干擾（轉錄后基因沉默）實驗
RNA干擾 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 1. 病毒基因、人工轉入基因、轉座子等外源性基因隨機整合到宿主細胞基因組內，并利用宿主細胞進行轉錄時，常產生一些dsR
用CRISPR實現基因轉錄活體成像
最近，日本的一個研究小組開發出一種實時成像方法，用于內源基因轉錄活性和核定位的同步測量。研究人員用該方法來檢測亞基因組范圍的流動性變化，這取決于小鼠胚胎干細胞中多能性相關基因的活性。 Hiroshi Ochiai博士和他的同事Takeshi Sugawara博士、Takashi Yamamoto
關于基因表達的轉錄機制介紹
基因表達的轉錄過程由RNA聚合酶（RNAP）進行，以DNA為模板，產物為RNA。RNA聚合酶沿著一段DNA移動，留下新合成的RNA鏈。 基因組DNA由兩條反向平行和反向互補鏈組成，每條鏈具有5'和3'末端。這兩條鏈分別稱為“模板鏈”（產生RNA轉錄物的模板）和“編碼鏈”（含有轉
基因表達轉錄調控的主要途徑
基因表達轉錄調控可分為三種主要途徑:1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用);2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用,3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。
RNA干擾（轉錄后基因沉默）實驗
RNA干擾（RNA interference, RNAi）是指在進化過程中高度保守的、由雙鏈RNA（double-stranded RNA，dsRNA）誘發的、同源mRNA高效特異性降解的現象。目前主要用于（1）特異性剔除或關閉特定基因的表達 （2）探索基因功能和傳染性疾病及惡性腫瘤的治療 （3）使
基因表達的轉錄調控的介紹
可分為三種主要途徑： 1）遺傳調控（轉錄因子與靶標基因的直接相互作用）； 2）調控轉錄因子與轉錄機制相互作用； 3）表觀遺傳調控（影響轉錄的DNA結構的非序列變化）。 通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合
關于基因表達的轉錄調控介紹
基因表達的轉錄調控可分為三種主要途徑：1）遺傳調控（轉錄因子與靶標基因的直接相互作用）；2）調控轉錄因子與轉錄機制相互作用，3）表觀遺傳調控（影響轉錄的DNA結構的非序列變化）。 通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白
突破性單細胞表觀基因組與轉錄組分析新技術
由英國及比利時的研究人員開發出的一種新方法，使得在單細胞中同時研究表觀基因組及轉錄組成為可能。發布在《自然方法》（Nature Methods）上的實驗方案，可幫助科學家們精確描繪出DNA甲基化改變與基因表達之間的關系。 近年來單細胞測序技術發展迅速，被廣泛用于研究細胞間的基因表達譜（轉錄組）
中國科大基因轉錄調控研究取得進展
近日，中國科學技術大學生命科學學院教授單革實驗室研究發現，秀麗線蟲中兩個高度保守的轉錄因子UNC-30和UNC-55，共調控包括cAMP通路、微小RNA（microRNA）和長鏈非編碼RNA（lncRNA）等在內的數以千計的靶基因的表達，從而調控D型運動神經元的發育和可塑性。研究論文近日發表在《
真核基因轉錄水平的調控2
（3）增強子的位置可在基因5′上游、基因內或其3′下游的序列中，而其作用與所在基因旁側部位的方向似無關系，因為無論正向還是反向，它都具有增強效應；（4）增強子所含核苷酸序列大多為重復序列，其內部含有的核心序列，對于它進入到另一宿主之后重新產生增強子效應至關重要；（5）增強子一般都具有組織和細胞特異性
PNAS驚人發現：基因轉錄成雙對
DNA轉錄是指根據DNA模板生成信使RNA用于蛋白質合成的過程。現在Whitehead研究所的科學家發現，編碼蛋白的DNA在開始轉錄時會同時啟動一個逆向轉錄程序，生成相應的長非編碼RNA（lncRNA）。而且，在干細胞分化為其他類型細胞的過程中，成對mRNA 和lncRNA的轉錄是相協調的。這一
關于基因轉錄的基本內容介紹
基因轉錄是在細胞核和細胞質內進行的。它是指以DNA的一條鏈為模板，按照堿基互補配對原則，在RNA聚合酶作用下合成RNA的過程。基因轉錄有正調控和負調控之分。 如細菌基因的負調控機制是當一種阻遏蛋白(repressor protein)結合在受調控的基因上時，基因不表達；而從靶基因上去除阻遏蛋白
基因表達的轉錄后調控的介紹
真核生物的RNA被翻譯之前需要通過核孔輸出,因此核輸出對基因表達有著顯著影響。所有進出細胞核的mRNA的運輸都是通過核孔進行的,受到各種輸入蛋白和輸出蛋白的控制。 攜帶遺傳密碼的mRNA需要存活足夠長的時間才能被翻譯,因為mRNA在翻譯之前必須經過很長距離的運輸。在典型的細胞中,RNA分子僅在
真核基因轉錄水平的調控1
一、真核生物的RNA聚合酶有三種RNA聚合酶：RNA聚合酶Ⅰ；RNA聚合酶Ⅱ；RNA聚合酶Ⅲ。二、真核基因順式作用元件（一）、順式作用元件概念指DNA上對基因表達在調節活性的某些特定的調控序列，其活性僅影響其自身處于同一DNA分子上的基因。（二）、種類啟動子、增強子、靜止子1、啟動子的結構和功能啟動
關于基因轉錄的位置和方式介紹
１、基因轉錄—轉錄位置 在真核生物中，DNA的轉錄在細胞核中進行，其中rRNA的合成發生在核仁，mRNA的tRNA的合成發生在核質中。 在原核生物中，轉錄在細胞質的核質區進行。 ２、基因轉錄—轉錄方式 轉錄開始不需要引物，鏈的延長方向也是 5′→ 3′。 每次被轉錄的DNA只是一個小區