基本原理
CRISPR簇是一個廣泛存在于細菌和古生菌基因組中的特殊DNA重復序列家族,其序列由一個前導區(Leader)、多個短而高度保守的重復序列區(Repeat)和多個間隔區(Spacer)組成。
前導區一般位于CRISPR簇上游,是富含AT長度為300~500bp的區域,被認為可能是CRISPR簇的啟動子序列。重復序列區長度為21~48bp,含有回文序列,可形成發卡結構。
重復序列之間被長度為26~72bp的間隔區隔開。Spacer區域由俘獲的外源DNA組成,類似免疫記憶,當含有同樣序列的外源DNA入侵時,可被細菌機體識別,并進行剪切使之表達沉默,達到保護自身安全的目的。
工作原理
當細菌抵御噬菌體等外源DNA入侵時,在前導區的調控下,CRISPR被轉錄為長得RNA前體(Pre RISPR RNA,pre-crRNA),然后加工成一系列短的含有保守重復序列和間隔區的成熟crRNA,最終識別并結合到與其互補的外源DNA序列上發揮剪切作用。
目前發現的CRISPR/Cas系統有三種不同類型即I型、II型和III型,它們存在于大約40%已測序的真細菌和90%已測序的古細菌中。其中II型的組成較為簡單,以Cas9蛋白以及向導RNA(gRNA)為核心組成,也是目前研究中最深入的類型。
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