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  • circRNA再發IF=18.88高分文章circRNA機制研究匯總

    超強子調控circRNA-Nfix缺失誘導成年小鼠心肌梗死后再生 circRNAs正在成為心臟發育和疾病強有力的調節因子,但其在心臟再生中的作用仍然未知。鑒于此,作者與他的團隊探究了與超增強子(SEs)相關的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生過程中的功能,并探究了其調節心臟重塑的分子機制,并于2019年4月5日,將該成果發表在了circulation雜志(IF=18.88)中。在本研究中,作者首先利用生物信息學分析RNA測序數據并結合SE目錄,識別與SE相關的circRNAs,并利用qPCR和原位雜交技術檢測發現發現circNfix在人類、大鼠和小鼠的成年心臟中過表達。然后通過在心肌梗死(MI)后心肌細胞(CM)中干擾或過表達circNfix,探究其對細胞增殖和心肌修復過程中的作用,并發現下調circNfix能夠促進心肌梗死后CM增殖和血管生成,并抑制CM凋亡,減輕心功能障礙,改善預后效果。最后作者利用染色質免疫沉淀......閱讀全文

    circRNA再發IF=18.88高分文章circRNA機制研究匯總

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    circRNA再發IF=18.88高分文章circRNA機制研究匯總

      超強子調控circRNA-Nfix缺失誘導成年小鼠心肌梗死后再生   circRNAs正在成為心臟發育和疾病強有力的調節因子,但其在心臟再生中的作用仍然未知。鑒于此,作者與他的團隊探究了與超增強子(SEs)相關的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生過程中的功能,并探究了其調節心臟重塑的

    circRNA機制研究匯總(二)

    結合蛋白:(2)CircNfix與Ybx1結合并促進其降解:circNfix和對照組的蛋白質譜分析(A)。采用Ybx1、Nedd4l或陰性IgG抗體進行RIP實驗(云序生物提供該服務)(B)。P0 CMs中過表達circNfix后Ybx1蛋白表達水平(C-D)。qRT-PCR檢測P0 CMs中Y

    circRNA機制研究匯總(一)

    文章導讀超強子調控circRNA-Nfix缺失誘導成年小鼠心肌梗死后再生circRNAs正在成為心臟發育和疾病強有力的調節因子,但其在心臟再生中的作用仍然未知。鑒于此,作者與他的團隊探究了與超增強子(SEs)相關的circRNA-Nfix在小鼠心肌梗死后再生過程中的功能,并探究了其調節心臟重塑的分子

    circRNA研究新成果

    研究背景放射治療是肝癌治療的有效手段之一,然而放射性肝纖維化是肝癌放射治療的常見并發癥,制約肝癌放療效果。放射性肝纖維化的發病機制仍未明晰,有待進一步研究。環狀RNA(circular RNA,circRNA)是一類廣泛參與多種生物學進程的非編碼RNA,在人類多種疾病的發生和發展中發揮重要作

    前列腺癌circRNA研究

    circRNA研究是現在科研領域的大紅人,作為熱點領域,circRNA的研究成果猶如雨后春筍,層出不窮。我們也可以看到,雖然circRNA很熱,但是目前對circRNA的理解還處于社會主義初級階段,有大把大把的空間值得探索。伯豪作為國內第一批科研服務公司,在circRNA領域也是緊隨時代潮流,致力于

    云序客戶再發高分文章,教你如何玩轉tRNA機制研究

      文章導讀:   “忽如一夜春風來,千樹萬樹梨花開!”自然界的花花草草在悄無聲息的感受著大自然的變化。隨著全球氣候的變化,環境溫度也在不斷的變化,那么什么是溫度感受器?AET1是tRNA上鳥苷轉移酶,它是水稻高溫條件下正常生長所必需的。本文研究結果表明,tRNAHis鳥苷轉移酶AET1在植物應對

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    circRNA_104075在促進肝癌發生和進展的機制研究

      在全球范圍內原發性肝癌是造成癌癥相關死亡的三大原因之一。肝細胞癌(HCC)是最常見的原發性肝臟癌癥。由于缺乏高特異性和敏感性的早期診斷生物標志物,HCC患者往往得不到及時有效的治療。相比于長鏈非編碼RNA和miRNA,circRNA作為一種新型環狀RNA,具有共價閉合環狀結構,在組織和血液中具有

    circRNA在胃癌海綿調控機制的應用(三)

    6. 體內實驗驗證hsa_circ_0004872抑制腫瘤發生和轉移通過皮下注射過表達hsa_circ_0004872的BGC-823細胞和對照組BGC-823細胞發現,過表達hsa_circ_0004872組生成的腫瘤明顯小于對照組,并且腫瘤中Smad4和p21表達升高。尾靜脈注射實驗也發現過表達

    circRNA在膀胱癌中的作用機制

    研究背景膀胱癌(Bladder cancer)是一種常見的泌尿系統腫瘤,由于易轉移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的發病機制,有助于對膀胱癌的診斷和治療。circRNA是一類具有閉合環形結構的非編碼RNA,是現階段轉錄組學研究的新星。本研究從circRNA的角度出發,深入闡述

    circRNA在胃癌海綿調控機制的應用(二)

    3. hsa_circ_0004872作為分子海綿吸附miR-224作者首先通過FISH實驗觀測到hsa_circ_0004872主要分布在細胞質。然后通過RIP-qPCR驗證到hsa_circ_0004872與AGO2蛋白結合,pull down實驗顯示hsa_circ_0004872與miR-2

    circRNA在胃癌海綿調控機制的應用(一)

    環狀RNA (circRNA)作為新型非編碼RNA,具有比線性RNA更加穩定的環狀結構,可通過多種機制調控靶基因。近年來,circRNA被發現在多種腫瘤組織和細胞中異常表達,作為腫瘤的診斷生物標志物或治療靶點,具有巨大的價值,受到廣泛的關注。癌癥新的證據表明,circRNAs在癌癥的發生發展中起

    Arraystar-CircRNA芯片應用于肝癌研究

    第二軍醫大學免疫所所長、中國醫學科學院院長曹雪濤院士課題組主要從事天然免疫與免疫調節基礎研究、免疫治療應用研究。近期其實驗室用Arraystar CircRNA芯片研究發現circMTO1可以作為microRNA的吸附海綿結合癌基因miR-9從而上調p21的表達從而抑制肝細胞癌(hepatocell

    云序生物最新m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇

      RNA甲基化是目前申請國自然項目熱點,也是唯一能在短短3個月內發數十篇nature,cell級別高分文章領域,近期RNA甲基化研究引起了科研工作者的研究熱潮。因mRNA參與蛋白編碼,之前多數文章針對mRNA甲基化進行研究(詳細見云序課堂之前往期回顧)。然而許多研究表明發生m6A甲基化的非編碼RN

    circRNA_104075在促進肝癌發生和進展的機制研究(二)

    5. circ_104075可以結合miR-582-3p作者首先想到circRNA通過海綿作用吸附miRNA,直接調控靶蛋白的表達,作者利用miRanda數據庫預測了circ_104075最有可能結合的5個miRNA,接著通過RNA pull down技術(云序生物提供此項實驗)捕獲復合物后RT-q

    circRNA_104075在促進肝癌發生和進展的機制研究(一)

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    環狀RNA研究深度剖析(一)

    1.環狀RNA為什么火?它到底是何方神圣?2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世,徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界!經過嚴格統計匯總后,2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項,其中有兩項杰出青年基金,一項優秀青年基金,兩

    全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制(二)

    3. 環狀RNA的差異表達與前列腺癌的進展有關研究者對144個前列腺癌進行了聚類分析,與線性RNA相比,環狀RNA最強模式與它們在每個樣本中的總體豐度相一致。另外,極端circRNA分布的患者的預后明顯較circRNA分布穩定的患者差,同時極端circRNA index組也與更高的轉移發生率

    全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制(一)

    2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Circ

    2018國自然研究熱點一:環狀RNA研究深度剖析

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    環狀RNA研究深度剖析

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    環狀RNA(circRNA)功能研究又一利器——過表達載體

    circRNAs 環狀 RNA(circular RNAs,circRNA)是一類具有閉合環狀結構的 RNA 分子,早在 20 世紀八十年代即有研究報道,但由于其表達豐度低,文獻報道較少,一直被認為是 RNA 轉錄剪切的罕見錯誤而被忽視。直到 2012 年開始有研究者開始大批量鑒定 circRN

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    m6A“RNA甲基化”研究匯總—非編碼RNA篇

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    中山大學Blood封面文章:circRNA對翻譯進程的正調控作用

       2012年以前,經典教科書和主流觀點里,RNA還是線性的,主要有這3類RNA:mRNA、tRNA和rRNA,但隨著時間的推進,研究的深入,越來越多的RNA被發現,除了本世紀初備受關注的miRNAs,snRNA,siRNA,LncRNA,還有近年來研究最火熱的環狀RNA(circRNA),與其它

    《EMBO-reports》上闡述circRNA在膀胱癌中的作用機制

      研究背景   膀胱癌(Bladder cancer)是一種常見的泌尿系統腫瘤,由于易轉移,死亡率高,5年生存率只有8.1%。因此,研究膀胱癌的發病機制,有助于對膀胱癌的診斷和治療。circRNA是一類具有閉合環形結構的非編碼RNA,是現階段轉錄組學研究的新星。本研究從circRNA的角度出發,

    Cell》重磅!全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制!

      2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci

    《Cell》重磅!全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制

      2月7日,加拿大多倫多大學的Paul C. Boutros教授和Housheng Hansen He教授團隊對144例前列腺癌樣本進行全轉錄組測序,結合后續的功能機制研究,揭示了前列腺癌circRNA新的調控機制!該研究成果以題為“Widespread and Functional RNA Ci

    環狀RNA(circRNA)主要有哪些類型

    目前發現的circRNA主要來源于基因外顯子,但多項研究也表明circRNA的類型比想象的要復雜,可以來自基因組上多種基因結構。?同一基因位置可以產生不同類型的環狀RNA

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