劉小樂教授發布CRISPR實用工具
必需基因是指細胞生存的關鍵基因。近年來，研究基因重要性（gene essentiality）的功能基因組技術發展很快。舉例來說，大規模shRNA篩選已經被用于多個細胞系，幫助人們尋找必需基因。如果一個轉錄因子使細胞在特定條件下存活，就可以用ChIP-seq鑒定其調控靶標，進而找出必需基因。最近，CRISPR篩選成為了在基因組中分析基因重要性的新途徑。 CRISPR-Cas9是細菌在漫長的進化史中演化出的重要防御機制。這一系統最初用于特異性修改基因序列，被視為基因組工程領域的革命性工具。細菌免疫系統的天然蛋白Cas9，能像分子剪刀一樣精確切割或編輯特定的DNA片段。不過最近科學家們也開始用CRISPR-Cas9系統進行基因調控，隨心所欲的開/關基因。 CRISPR篩選可以系統可靠地在不同條件下分析基因重要性。眾所周知，生物學網絡中高度關聯的蛋白對于細胞生存尤為重要。此前人們已經通過整合蛋白互作網絡，改善了RNAi篩選的結果......閱讀全文
劉小樂、張鋒CRISPR最新論文
最近，來自哈佛大學醫學院Dana-Farber癌癥研究院、哈佛大學統計系和麻省理工學院-哈佛大學布羅德研究所的研究人員，在國際基因組研究權威期刊《Genome Research》發表題為“Sequence determinants of improved CRISPR sgRNA design”
劉小樂教授發布CRISPR實用工具
必需基因是指細胞生存的關鍵基因。近年來，研究基因重要性（gene essentiality）的功能基因組技術發展很快。舉例來說，大規模shRNA篩選已經被用于多個細胞系，幫助人們尋找必需基因。如果一個轉錄因子使細胞在特定條件下存活，就可以用ChIP-seq鑒定其調控靶標，進而找出必需基因。最近，
魏文勝、劉小樂攜手發表CRISPR新成果
CRISPRCCas9篩選已被廣泛用于分析編碼基因功能，但是，用這種方法對非編碼元件進行高通量篩選，是更具挑戰性的，因為非編碼區域中單次切割所引起的缺失，不可能產生一次功能性的基因敲除。因此，非常需要一種高通量的方法，來產生非編碼DNA的缺失。10月31日在《Nature Biotechnology
劉小樂教授：CRISPR高通量篩選的新算法
高通量的CRISPR篩選，已在功能基因組學研究中顯示出巨大的潛力。12月16日，華人女學者、哈佛大學公共衛生學院Dana-Farber癌癥研究所的劉小樂教授，在國際著名學術期刊《Genome Biology》發表題為“Quality control, modeling, and visualiz
劉小樂教授：CRISPR高通量篩選的新算法
高通量的CRISPR篩選，已在功能基因組學研究中顯示出巨大的潛力。12月16日，華人女學者、哈佛大學公共衛生學院Dana-Farber癌癥研究所的劉小樂教授，在國際著名學術期刊《Genome Biology》發表題為“Quality control, modeling, and visualiz
Nature－Biotechnology：魏文勝、劉小樂攜手發表CRISPR新成果
CRISPR–Cas9篩選已被廣泛用于分析編碼基因功能，但是，用這種方法對非編碼元件進行高通量篩選，是更具挑戰性的，因為非編碼區域中單次切割所引起的缺失，不可能產生一次功能性的基因敲除。因此，非常需要一種高通量的方法，來產生非編碼DNA的缺失。10月31日在《Nature Biotechnolo
CRISPRCas9－原理
CRISPR/Cas技術是什么？CRISPR/Cas系統是一種原核生物的免疫系統，用來抵抗外源遺傳物質的入侵，比如噬菌體病毒和外源質粒。同時，它為細菌提供了獲得性免疫：這與哺乳動物的二次免疫類似，當細菌遭受病毒或者外源質粒入侵時，會產生相應的“記憶”，從而可以抵抗它們的再次入侵。CRISPR/Cas
antiCRISPR沉默CRISPRCas9系統的分子機理
中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組和加拿大多倫多大學Karen Maxwell課題組的合作論文Inhibition of CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein complex assembly by anti-CRISPR AcrIIC2 在《自然-通訊》（Nature
antiCRISPR沉默CRISPRCas9系統的分子機理
王艷麗課題組和加拿大多倫多大學Karen Maxwell課題組的合作論文“Inhibition of CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein complex assembly by anti-CRISPR AcrIIC2”在《Nature Communications》雜志在
揭示antiCRISPR沉默CRISPRCas9系統的分子機理
中國科學院生物物理研討所王艷麗課題組和加拿大多倫多大學Karen Maxwell課題組的協作論文Inhibition of CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein complex assembly by anti-CRISPR AcrIIC2 在《自然-通訊》（Nature
媲美CRISPRCas9,－新CRISPR－工具探知90％的基因編輯領域
2類CRISPR–Cas系統，例如Cas9和Cas12，已被廣泛用于靶向真核基因組中的DNA序列。但是，代表自然界中所有CRISPR系統90％的1類CRISPR-Cas系統在基因組工程應用中仍未開發。杜克大學(Duke University)的生物醫學工程師利用此前未被探索的CRISPR技術，精
CRISPRCas9基因編輯技術簡介
CRISPR-Cas9是繼ZFN、TALENs等基因編輯技術推出后的第三代基因編輯技術，短短幾年內,CRISPR-Cas9技術風靡全球, 成為現有基因編輯和基因修飾里面效率最高、最簡便、成本最低、最容易上手的技術之一，成為當今最主流的基因編輯系統。一、什么是CRISPR-Cas系統CRISPR-Ca
CRISPR先驅獲得新突破：開發更安全的CRISPRCas9基因療法
人們一直希望用CRISPR-Cas9基因編輯技術治療甚至治愈復雜的神經疾病。帕金森病、亨廷頓舞蹈病和阿爾茨海默癥的現有藥物只能緩解癥狀，無法阻止疾病的發展。“但對于確定了致病基因的疾病來說，基因編輯技術有望永久終止其進程，”加州大學伯克利分校Jennifer Doudna實驗室的博士后Brett
CRISPR先驅獲得新突破：開發更安全的CRISPRCas9基因療法
人們一直希望用CRISPR-Cas9基因編輯技術治療甚至治愈復雜的神經疾病。帕金森病、亨廷頓舞蹈病和阿爾茨海默癥的現有藥物只能緩解癥狀，無法阻止疾病的發展。“但對于確定了致病基因的疾病來說，基因編輯技術有望永久終止其進程，”加州大學伯克利分校Jennifer Doudna實驗室的博士后Brett S
Nature發布CRISPRCas9重大新成果
來自麻省總醫院的一個研究小組找到了一種新方法來擴大強大基因編輯工具——CRISPR-Cas9 RNA引導核酸酶的使用及提高其精確性。他們的研究論文在線發表在6月22日的《自然》（Nature）雜志上。 在這篇Nature文章中，研究人員描述了一種演化版本的DNA切割酶Cas9。相比于迄今為止
CRISPRCas9治療視網膜血管生成疾病
血管生成是導致視力喪失、失明和多種退化性眼部疾病（包括增生性糖尿病視網膜病變、濕性老年黃斑變性、早產兒視網膜病變等）的特征之一，隨著病程發展，這些血管還會滲漏、破裂、甚至導致視網膜脫離，使視力受損。根據最新《Nature Communications》報道，研究人員提出用基因編輯技術防止視網膜血
基因編輯工具CRISPRCas9遭遇新挫折！
在一項新的研究中，來自德國明斯特大學的研究人員發現，在小鼠進行常規的CRISPR-Cas9基因插入過程中，不必要的DNA重復頻率很高。相關研究結果發表在2020年2月21日的Science Advances期刊上，論文標題為“Pervasive head-to-tail insertions o
Nature技術突破：光控CRISPRCas9系統
發表在6月15日《自然生物技術》（Nature Biotechnology）雜志上的一項研究中，來自日本的研究人員報告稱他們構建出了更好的CRISPR基因編輯系統：一種光激活的新型Cas9核酸酶使得研究人員能夠在空間和時間上更好地控制RNA引導的核酸酶的活性。 加州大學戴維斯分校干細胞生物學家
生物物理所等揭示antiCRISPR沉默CRISPRCas9系統的分子機理
6月26日，中國科學院生物物理研究所王艷麗課題組和加拿大多倫多大學Karen Maxwell課題組的合作論文Inhibition of CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein complex assembly by anti-CRISPR AcrIIC2 發表于《自然-通訊》
Nat－Meth:－新方法終結CRISPRCAS9爭論
基因編輯是近年來發展起來的可以對基因組完成精確修飾的一種技術，可完成基因定點InDel突變、敲入、多位點同時突變和小片段的刪失等。這項革命性的技術可讓研究人員精確地改變基因組，從而有著廣泛應用，包括基礎研究、生物技術和人類基因療法。 自從基因組編輯技術引爆科學界熱潮以來，就有許多研究小組發現具
Nature發布突破性CRISPRCas9新技術
一種改良版本的新型基因編輯CRISPR-Cas9核酸酶似乎可以強有力地消除當前這一技術一個非常重要的限制：不必要的脫靶DNA斷裂，將它們降低至無法檢測到的水平。在發表于《自然》（Nature）雜志上的研究論文中，麻省總醫院（MGH）的研究人員描述了改造Cas9酶，減少它與靶DNA的非特異性互作
Nature：CRISPRCAS9推動后基因組時代
近日，來自美國的科學家在國際期刊Nature發表了他們的最新研究成果，他們利用結構導向的方法改造了CRISPR-CAS9復合物來系統性研究基因功能，并通過構建sgRNA文庫大規模篩選抵抗BRAF抑制劑的激活基因。該文章利用CRISPR-CAS9技術研究基因功能，對后基因組時代的基因功能研究具有推
Nature子刊：提高CRISPRCas9保真度
上海科技大學，中科院-馬普計算生物學研究所，南京醫科大學三處的研究人員合作發表了題為“APOBEC3 induces mutations during repair of CRISPR-Cas9-generated DNA breaks”的文章，證實了APOBEC在CRISPR/Cas9引發的同
PNAS：CRISPRCas9系統構建心臟衰竭小鼠模型
突變體小鼠模型為我們研究個別基因對發育、生理以及疾病發生等科學問題提供了極大的便利。然而，傳統的小鼠突變體模型構建是一項十分耗時耗力的工程。最近的CRISPR-Cas9系統對于動物體的遺傳修飾是一項革命性的突破。 CRISPR系統首先被發現于細菌抗病毒侵染的免疫系統，通過一類sgRNA的介導，
劉小樂教授連發多項研究成果
華人女學者、哈佛大學公共衛生學院Dana-Farber癌癥研究所的劉小樂(X Shirley Liu)教授，也是教育部“長江學者”講座教授、中組部“千人計劃”入選者，是國際生物信息學界的領軍人物。其帶領的課題組長期致力于生物大數據的收集和信息挖掘、篩選治療癌癥藥物的有效靶點，以及開發個性化癌癥診
Trends－in－Parasitol：CRISPRCas9技術把蚊子給“閹了”
隨著寨卡病毒、基孔肯雅熱及登革熱爆發的不斷上升，衛生官員迫切需要采取措施阻斷這些病毒的傳播。近來刊登在國際雜志Trends in Parasitology上的一項研究中，來自弗吉尼亞理工大學（Virginia Tech）的研究者就利用了一種特殊方法，即對雄性蚊子進行基因工程修飾，這或許可以有效阻
《Nature》子刊巧妙運用CRISPRCas9誘導遺傳傷疤
每一本生物學教材都指出，細胞是生命的基石。但是直到最近幾年，科學家們才開始了解細胞的多樣性。圖片來源于網絡 RNA測序等技術揭示單個細胞的基因表達，通過類似的表達譜，所有細胞得以被系統地排列。“無論什么時候，當我們用這類技術探索器官或有機體時，我們不僅看到了熟悉的細胞類型，而且總能發現未知和罕
CRISPRCas9靶向突變－探索眉毛濃密的遺傳機制
眉毛濃密與遺傳密切相關，但是相關研究卻比較少，來自中科院上海生命科學研究院（營養與健康研究院）計算生物學研究所汪的一組研究人員發表了題為Genome-wide Association Studies and CRISPR/Cas9-mediated Gene Editing Identify R
CRISPRCas9技術及其在腫瘤研究中的應用
CRISPR的前世今生1987年，日本科學家在研究大腸桿菌的時候發現其基因組上存在一些看起來“奇怪”的重復結構：有一段29堿基的序列反復出現了5次，且兩兩之間被32個堿基形成的序列隔開了！但這個發現在當時并沒有引起科學界的很大關注，畢竟在自然界的生物體內，各種奇奇怪怪的發現實在太多。然后僅僅幾年后，
CRISPRCas9蛋白提高基因編輯技術精準度
由香港城市大學（香港城大）和瑞典卡羅琳醫學院合組的一支研究團隊，最近成功研發出一種新的蛋白質，有助提高基因組編輯過程中定位的精準度，相信對未來要求高精準度的人類基因治療可發揮重要作用。 CRISPR-Cas9（成簇、規律、間隔、短回文的重複序列及其相關蛋白9）是一種具有廣泛應用前景的基因編輯技