張志國教授Science解析腫瘤表觀基因組
來自梅奧臨床醫學院、明尼蘇達大學和中科院生物物理研究所等機構的研究人員證實，組蛋白H3.3K36M突變重編程了成軟骨細胞瘤（chondroblastomas）的表觀基因組。這一重要的研究發現發布在5月26日的《科學》（Science）雜志上。 領導這一研究的是著名分子生物學家、梅奧臨床醫學院的張志國（Zhiguo Zhang）教授。其早年畢業于國防科技大學應用化學專業，后于中國科學院大連化學物理研究所獲得碩士學位，主要進行表觀遺傳方面的研究，近年在 Science、Cell等權威期刊發表了大量重要的研究成果。 2007年，張志國教授發現Ty1轉座基因的蛋白產物109（Rtt109）是一種特殊的組蛋白乙酰轉移酶。相關文章刊登于Science雜志上。 2008年，張志國領導研究人員發現了DNA復制－核小體組裝過程中組蛋白乙酰化的作用，為進一步研究組蛋白乙酰化，以及表觀遺傳學提出了新的觀點。這一研究成果公布Cell雜志上。 ......閱讀全文
表觀基因組的概念
中文名稱表觀基因組英文名稱epigenome定 義全基因組的甲基化圖譜。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
不容忽視的表觀基因組
肥胖有可能不僅寫在基因之中，也寫在基因之上。迄今為止最大型的一項探討人類表觀基因組(epigenome)的研究發現，某些表觀遺傳標記與身體質量指數(body mass index,BMI)相關。 科學家們報告稱在2500多人的血液和脂肪細胞發現與新陳代謝相關的一個基因發生了化學改變。這
首次繪制小麥表觀基因組圖譜
最近，英國利物浦大學的科學家們，對小麥中調節基因活性的遺傳性分子變化，進行了首次全基因組范圍的調查，這可能成為提高作物育種技術的一種新工具。相關研究結果發表在最新一期的《Genome Biology》。延伸閱讀：權威期刊發布首個小麥單體型圖譜。 表觀遺傳標記是一種化學標簽，將自己附著在DNA上
Science：揭示大腦回路的表觀基因組成
表觀基因組學的變化，包括DNA的化學修飾，可以作為基因組的一層額外信息。表觀基因組學在學習和記憶及年齡相關的認知度方面扮演著重要的角色。新的研究發現DNA甲基化，一種特殊的表觀基因組學修飾的形式。從出生到成年，DNA甲基化形式在大腦細胞中是動態變化的。從而幫助理解大腦細胞中基因組學的信息是如何控
表觀基因組學研究指南（一）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
Nature：不容忽視的表觀基因組
肥胖有可能不僅寫在基因之中，也寫在基因之上。迄今為止最大型的一項探討人類表觀基因組（epigenome）的研究發現，某些表觀遺傳標記與身體質量指數（body mass index,BMI）相關。 在上個月的《柳葉刀》（The Lancet）雜志上，科學家們報告稱在2500多人的血液
表觀基因組學研究指南（三）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal
Nature子刊：用CRISPR操控表觀基因組
杜克大學的研究人員開發出了一種新方法，可以精確地控制基因開啟及激活的時間。借助這一新技術研究人員可通過化學操控包裝DNA的蛋白，來開啟特異的基因啟動子和增強子——控制基因活性的基因組片段。 研究人員說，擁有操控表觀基因組的能力將有助于他們探究特殊啟動子和增強子在細胞命運或遺傳病風險中所起的作用
GenomeResearch：雙生子表觀基因組研究
基因決定了人生命中的方方面面，不過環境也能對基因產生強烈的影響，這種影響在人出生前就已產生，而且其造成的影響將會伴隨人的一生。日前，研究人員首次展示了子宮內環境對新生兒表觀遺傳學圖譜的影響，即我們出生時就帶有的DNA化學修飾，這項研究將為人們提供寶貴的疾病風險信息。文章發表在7月16日的Geno
只需100個細胞的表觀基因組分析
近年來，表觀遺傳學已經成為了干細胞分化、炎癥、癌癥等多個領域的研究熱點，但它在臨床上的潛力還未得到充分挖掘。表觀基因組分析可以幫助醫生根據患者的自身狀態調整治療方案，最終實現個性化醫療。問題在于，表觀基因組分析需要的細胞量很大。舉例來說，檢測全基因組的蛋白-DNA互作和染色質修飾大約需要一千萬細
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
基因組所發布表觀基因組關聯研究開放平臺EWAS－Open－Platform
近日，由中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心（NGDC）開發的表觀基因組關聯研究資源開放平臺EWAS Open Platform上線。相關研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
表觀基因組關聯研究開放平臺EWAS－Open－Platform
近日，由中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心（NGDC）開發的表觀基因組關聯研究資源開放平臺EWAS Open Platform上線。相關研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
表觀基因組對糖尿病發展作用揭示
英國《自然·通訊》期刊近日發表的一篇表觀遺傳學論文，揭示了表觀基因組對疾病發展的作用，探索了環境對Ⅰ型糖尿病發展產生影響的線索。科學家在Ⅰ型糖尿病病人中發現了免疫基因的表觀遺傳變化，而這些機制對人類來說仍是未解的謎題。 過去十年來，Ⅰ型糖尿病的發病率出現了顯著上升，這被認為是環境因素（比如感
新方法：超低細胞數表觀基因組研究
日本九州大學和東京理工學院的科學家們研發了一種使用非常少量的細胞，范圍從100到1000的細胞，來分析DNA-蛋白質相互作用的新技術。他們的方法可以捕獲前所未有的細胞內表觀遺傳組信息，該技術獎促進生物標記的發現并為精準醫學開辟新道路。 這項被稱為染色質整合標記測序（Chromatin Inte
PNAS熱點文章：表觀基因組可因環境而改變
長期以來，人們普遍認為作為有機體發育關鍵步驟的甲基化只是靜態地DNA修飾，不會隨環境條件變化而改變。Salk生物研究所的研究人員發現，處于逆境下植物的DNA甲基化模式會發生變化，從而改變對基因的調控。 科學家發現植物遭遇致病菌后，其表觀遺傳學密碼會發生廣泛的大量改
張志國教授Science解析腫瘤表觀基因組
來自梅奧臨床醫學院、明尼蘇達大學和中科院生物物理研究所等機構的研究人員證實，組蛋白H3.3K36M突變重編程了成軟骨細胞瘤（chondroblastomas）的表觀基因組。這一重要的研究發現發布在5月26日的《科學》（Science）雜志上。 領導這一研究的是著名分子生物學家、梅奧臨床醫學院的
北大湯富酬發表表觀基因組新成果
表觀遺傳學修飾可以在不改變DNA序列的情況下調控基因的活性。基因表達在時間和空間上的表觀遺傳學調控，對于人類發育是至關重要的。近年來，表觀基因組已經成為了生物醫學領域的一大研究熱點。 北京大學的研究團隊對早期人類胚胎進行深入研究，獲得了胎兒大腦、心臟和肝臟的表觀基因組景觀。這一成果發表在十二月
研究繪制迄今最大規模個人表觀基因組圖譜
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/497746.shtm 日前，復旦大學類腦智能科學與技術研究院楊禹丞等DNA元件百科全書計劃國際合作團隊，首次繪制迄今全球最大規模個人表觀基因組圖譜。作為人類基因組計劃以來最大的基因組學協作計劃，“DN
Nature里程碑成果：擴展人類表觀基因組圖譜
10年前，科學家們宣布人類基因組計劃(Human Genome Project)完工。通過這一國際項目人們旨在了解人類獨特的四種核苷酸——腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鳥嘌呤的組合。這一生物學字母表幫助研究人員確定了人類基因組中大約2.5萬個編碼基因，然而隨著時間的推移，他們開始提出一些關于這些
研究繪制迄今最大規模個人表觀基因組圖譜
日前，復旦大學類腦智能科學與技術研究院楊禹丞等DNA元件百科全書計劃國際合作團隊，首次繪制迄今全球最大規模個人表觀基因組圖譜。作為人類基因組計劃以來最大的基因組學協作計劃，“DNA元件百科全書計劃”（Encyclopedia of DNA Elements）從2003年啟動至今整整20周年；本研
Nature發布大規模癌癥表觀基因組研究成果
科學家們鑒別出了有可能生成第4亞型髓母細胞瘤的細胞。新研究發現為這種最常見的腦腫瘤亞型開發出更有效的靶向療法清除了一個障礙。他們的研究結果發布在1月27日的《自然》（Nature）雜志上。 圣猶大兒童研究醫院發育神經生物學系的Paul Northcott，德國癌癥研究中心(DKFZ)的Stef
Nature醫學：表觀基因組決定你胖得健不健康
肥胖容易帶來糖尿病，但并不是所有胖子都會生病。不少肥胖的人擁有正常的代謝能力，“健康”的胖子發展成糖尿病的機率并不高。瑞典卡羅林斯卡學院（Karolinska Institutet）和法國國家健康和醫學研究院（INSERM）的研究人員在Nature Medicine雜志上發表文章指出，與肥胖有關
研究繪制迄今最大規模個人表觀基因組圖譜
日前，復旦大學類腦智能科學與技術研究院楊禹丞等DNA元件百科全書計劃國際合作團隊，首次繪制迄今全球最大規模個人表觀基因組圖譜。作為人類基因組計劃以來最大的基因組學協作計劃，“DNA元件百科全書計劃”（Encyclopedia of DNA Elements）從2003年啟動至今整整20周年；本研
分子生物學篇之基因組DNA純化
2007年剛過，各種年終匯總琳瑯滿目，生物通也將于未來一個多月里大擺生物技術饕餮盛宴，為讀者帶來前沿技術和信息的思維享受和滿足--每日密集精選各廠家及經銷商過去一年在中國大陸地區著力推廣的重點產品文章或者上市的新產品新技術文章，將2007年當中生物通倍受矚目的產品和技術一一呈遞，打造精彩紛呈的生物技
表觀遺傳學分子生物學軟件——DNA甲基化分析工具
第一類：基于引物設計功能的軟件。此類軟件主要是針對重亞硫酸鹽序列進行甲基化特異性PCR（methylation-specific PCR, MS-PCR or MSP）和重亞硫酸鹽測序（bisulfite sequencing, BS）引物的設計。由于重亞酸鹽修飾的特殊性，使常規的分子生物學
新型表觀基因組技術——助力了解人體如何對抗疾病
關于疾病，以及我們的身體對疾病的反應方式，至今我們仍然知之甚少，部分原因在于人類基因組是一個完整的DNA組裝體，我們每個人都有獨一無二的序列。 弗吉尼亞理工大學的一個研究小組近期研發了一種新的表觀基因組技術，可以幫助我們了解人體如何對抗疾病。這一研究成果公布在Nature Protocols
頂級實驗室《Nature》發布表觀基因組學圖譜
基因組中表觀遺傳變化是能遺傳的，近期來自Salk生物學研究所等處的一組研究人員完成了一項野生植物表觀基因組學全范圍內的研究分析，從中發現了這種修飾與遺傳信息相互作用的共同模式。這一成果公布在3月7日Nature雜志在線版上。 文章通訊作者是Salk研究所的著名教授Joseph R. E
Autoimmunity：能研究細胞表觀基因組學特性的新型工具
如今研究人員都知道，表觀基因組在控制DNA表達上扮演著關鍵角色，而且表觀基因組的一系列改變與多種健康問題直接相關，比如癌癥、自身免疫性障礙等多種疾病，但目前科學家們關于表觀基因組并不是知道地很多，甚至也并沒有工具去研究表觀基因組。 圖片來源：CC0 Public Domain 刊登