新型表觀基因組技術——助力了解人體如何對抗疾病
關于疾病，以及我們的身體對疾病的反應方式，至今我們仍然知之甚少，部分原因在于人類基因組是一個完整的DNA組裝體，我們每個人都有獨一無二的序列。 弗吉尼亞理工大學的一個研究小組近期研發了一種新的表觀基因組技術，可以幫助我們了解人體如何對抗疾病。這一研究成果公布在Nature Protocols雜志上。從左到右，Bohan Zhu 和Yuan-Pang Hsieh、Chang Lu 弗吉尼亞理工大學化學工程學教授Chang Lu和他的兩個博士生：Bohan Zhu和Yuan-Pang Hsieh，研發了一種介紹了微流體新技術，可以研究從乳腺癌、腦癌到精神分裂癥和藥物成癮等多種疾病。 Chang Lu表示：“由于缺乏先進和精確的技術，即使經過了多年的研究，許多疾病的分子基礎仍然難以捉摸。” 最新文章介紹了開發的這一新技術有關的設備制造，設置和操作的詳細說明，該技術是基于微流體振蕩洗滌的染色質免疫沉淀，其次是稱為MOWCh......閱讀全文
表觀基因組的概念
中文名稱表觀基因組英文名稱epigenome定 義全基因組的甲基化圖譜。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
首次繪制小麥表觀基因組圖譜
最近，英國利物浦大學的科學家們，對小麥中調節基因活性的遺傳性分子變化，進行了首次全基因組范圍的調查，這可能成為提高作物育種技術的一種新工具。相關研究結果發表在最新一期的《Genome Biology》。延伸閱讀：權威期刊發布首個小麥單體型圖譜。 表觀遺傳標記是一種化學標簽，將自己附著在DNA上
不容忽視的表觀基因組
肥胖有可能不僅寫在基因之中，也寫在基因之上。迄今為止最大型的一項探討人類表觀基因組(epigenome)的研究發現，某些表觀遺傳標記與身體質量指數(body mass index,BMI)相關。 科學家們報告稱在2500多人的血液和脂肪細胞發現與新陳代謝相關的一個基因發生了化學改變。這
Nature：不容忽視的表觀基因組
肥胖有可能不僅寫在基因之中，也寫在基因之上。迄今為止最大型的一項探討人類表觀基因組（epigenome）的研究發現，某些表觀遺傳標記與身體質量指數（body mass index,BMI）相關。 在上個月的《柳葉刀》（The Lancet）雜志上，科學家們報告稱在2500多人的血液
表觀基因組學研究指南（一）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal of Bi
Science：揭示大腦回路的表觀基因組成
表觀基因組學的變化，包括DNA的化學修飾，可以作為基因組的一層額外信息。表觀基因組學在學習和記憶及年齡相關的認知度方面扮演著重要的角色。新的研究發現DNA甲基化，一種特殊的表觀基因組學修飾的形式。從出生到成年，DNA甲基化形式在大腦細胞中是動態變化的。從而幫助理解大腦細胞中基因組學的信息是如何控
表觀基因組學研究指南（三）
今年九月，對于基因組研究者們來說是一個具有紀念意義的月份，因為美國人類基因組研究院(NHGRI)資助的ENCODE項目在 Nature，Genome Biology，Genome Research等雜志上公布了三十多份論文，還有在Science，Cell，以及the Journal
只需100個細胞的表觀基因組分析
近年來，表觀遺傳學已經成為了干細胞分化、炎癥、癌癥等多個領域的研究熱點，但它在臨床上的潛力還未得到充分挖掘。表觀基因組分析可以幫助醫生根據患者的自身狀態調整治療方案，最終實現個性化醫療。問題在于，表觀基因組分析需要的細胞量很大。舉例來說，檢測全基因組的蛋白-DNA互作和染色質修飾大約需要一千萬細
GenomeResearch：雙生子表觀基因組研究
基因決定了人生命中的方方面面，不過環境也能對基因產生強烈的影響，這種影響在人出生前就已產生，而且其造成的影響將會伴隨人的一生。日前，研究人員首次展示了子宮內環境對新生兒表觀遺傳學圖譜的影響，即我們出生時就帶有的DNA化學修飾，這項研究將為人們提供寶貴的疾病風險信息。文章發表在7月16日的Geno
Nature子刊：用CRISPR操控表觀基因組
杜克大學的研究人員開發出了一種新方法，可以精確地控制基因開啟及激活的時間。借助這一新技術研究人員可通過化學操控包裝DNA的蛋白，來開啟特異的基因啟動子和增強子——控制基因活性的基因組片段。 研究人員說，擁有操控表觀基因組的能力將有助于他們探究特殊啟動子和增強子在細胞命運或遺傳病風險中所起的作用
Nature：表觀遺傳與基因調控的新發現
最近在《Nature》雜志發表的一篇研究中，瑞士Friedrich Miescher生物醫學研究所（FMI）的Dirk Schübeler和他的研究小組，描述了轉錄因子和DNA表觀遺傳修飾之間的相互作用，會對基因調控有何影響。科學家發現，轉錄因子可以通過DNA甲基化模式的改變而間接合作：通過去除
Science新聞：表觀遺傳學印記讓基因“窒息”
吸煙留下的可不僅僅是衣服和手指上的煙味，現在一項新研究提出了強有力的證據指出，吸煙能夠通過表觀遺傳學修飾影響增加癌癥發病風險的基因活性。這一發現，為研究者們提供了一個評估吸煙人群癌癥風險的新工具。 我們DNA上的化學修飾可以影響基因的功能，決定基因的開啟和關閉，這些化學修飾被稱為表觀遺傳學
新方法可無損破譯基因表觀遺傳密碼
美國賓夕法尼亞大學研究人員開發出一種破譯DNA表觀遺傳密碼的新方法，利用DNA脫氨酶進行基因測序。他們8日在《自然·生物技術》雜志上發表論文稱，新測序方法克服了沿用數十年的亞硫酸氫鹽測序法的局限，將有助于更深入理解腫瘤生成等復雜生物過程。 表觀遺傳指的是在基因核苷酸序列不發生改變的情況下，基因
表觀遺傳學開關控制基因節律性轉錄
當夜晚降臨，我們就會慢慢入睡，這是受晝夜節律circadian cycle影響的結果，我們的每個器官甚至基因中都存在這樣的節律。 Salk研究所的科學家發現，表觀遺傳學修飾是使肝臟活性與晝夜節律同步的遺傳學開關。這一發現能夠幫助人們進一步了解高血糖、高膽固醇等健康威脅背后的機制，文章于近期
新CRISPR轉基因鼠體內基因表達和表觀遺傳修飾精準調控
CRISPR-Cas9系統為基礎的基因編輯技術極大的推動了生物醫學研究的進步。除直接編輯基因組DNA外，研究者還將失活型Cas9（dCas9）與轉錄調控元件或染色體修飾元件融合，構建出可實現轉錄和表觀遺傳學修飾調控的新工具如CRISPRa（轉錄激活工具），CRISPRi（轉錄抑制工具）以及CRI
表觀基因組對糖尿病發展作用揭示
英國《自然·通訊》期刊近日發表的一篇表觀遺傳學論文，揭示了表觀基因組對疾病發展的作用，探索了環境對Ⅰ型糖尿病發展產生影響的線索。科學家在Ⅰ型糖尿病病人中發現了免疫基因的表觀遺傳變化，而這些機制對人類來說仍是未解的謎題。 過去十年來，Ⅰ型糖尿病的發病率出現了顯著上升，這被認為是環境因素（比如感
新的基因編輯領域突破口—表觀遺傳調控
幾十年來，DNA一直被認為是決定生命遺傳信息的核心物質，但是近些年不斷的研究表明，生命遺傳信息從來就不是基因所能完全決定的，比如科學家們發現，可以在不影響DNA序列的情況下改變基因組的修飾，這種改變不僅影響個體的發育，而且還可遺傳給后代。如腫瘤等多種疾病并非僅由基因突變而引起，且與DNA和組蛋白
關節炎中的表觀遺傳學基因開關
一項新研究發現DNA甲基化是控制MMP13酶基因的開關，而MMP13酶具有重要的軟骨破壞作用。文章發表在FASEB Journal雜志的網站上。 骨關節炎是一種退行性關節疾病，該疾病的典型癥狀是患者關節軟骨持續不可逆的損失，這主要是由于基質金屬蛋白酶MMP13破壞基質中的II型膠原引起
表觀基因組關聯研究開放平臺EWAS－Open－Platform
近日，由中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心（NGDC）開發的表觀基因組關聯研究資源開放平臺EWAS Open Platform上線。相關研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
PNAS熱點文章：表觀基因組可因環境而改變
長期以來，人們普遍認為作為有機體發育關鍵步驟的甲基化只是靜態地DNA修飾，不會隨環境條件變化而改變。Salk生物研究所的研究人員發現，處于逆境下植物的DNA甲基化模式會發生變化，從而改變對基因的調控。 科學家發現植物遭遇致病菌后，其表觀遺傳學密碼會發生廣泛的大量改
下一代轉基因工具：表觀遺傳調控
2015年，加州大學圣地亞哥分校的生物學家Ethan Bier和Valentino Gantz提出了一項突破性技術，這種名為“活躍遺傳（active genetics）”的新技術打破了父母向后代傳遞遺傳性狀的幾率（超越孟德爾式遺傳）。 今年2月，他們和Shannon Xu在《eLife》發表文
新方法：超低細胞數表觀基因組研究
日本九州大學和東京理工學院的科學家們研發了一種使用非常少量的細胞，范圍從100到1000的細胞，來分析DNA-蛋白質相互作用的新技術。他們的方法可以捕獲前所未有的細胞內表觀遺傳組信息，該技術獎促進生物標記的發現并為精準醫學開辟新道路。 這項被稱為染色質整合標記測序（Chromatin Inte
新的基因編輯領域突破口—表觀遺傳調控
幾十年來，DNA一直被認為是決定生命遺傳信息的核心物質，但是近些年不斷的研究表明，生命遺傳信息從來就不是基因所能完全決定的，比如科學家們發現，可以在不影響DNA序列的情況下改變基因組的修飾，這種改變不僅影響個體的發育，而且還可遺傳給后代。如腫瘤等多種疾病并非僅由基因突變而引起，且與DNA和組蛋白
張志國教授Science解析腫瘤表觀基因組
來自梅奧臨床醫學院、明尼蘇達大學和中科院生物物理研究所等機構的研究人員證實，組蛋白H3.3K36M突變重編程了成軟骨細胞瘤（chondroblastomas）的表觀基因組。這一重要的研究發現發布在5月26日的《科學》（Science）雜志上。 領導這一研究的是著名分子生物學家、梅奧臨床醫學院的
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
華大基因等Cell子刊首次全基因組水平解析等級表觀遺傳
來自華大基因，紐約大學醫學院，賓州大學醫學院等多處研究機構組成的研究小組發表了題為“Genome-wide and Caste-Specific DNA Methylomes of the Ants Camponotus floridanus and Harpegnathos salta
基因組所發布表觀基因組關聯研究開放平臺EWAS－Open－Platform
近日，由中國科學院北京基因組研究所（國家生物信息中心）國家基因組科學數據中心（NGDC）開發的表觀基因組關聯研究資源開放平臺EWAS Open Platform上線。相關研究成果以EWAS Open Platform: integrated data, knowledge and toolkit
Nature里程碑成果：擴展人類表觀基因組圖譜
10年前，科學家們宣布人類基因組計劃(Human Genome Project)完工。通過這一國際項目人們旨在了解人類獨特的四種核苷酸——腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶和鳥嘌呤的組合。這一生物學字母表幫助研究人員確定了人類基因組中大約2.5萬個編碼基因，然而隨著時間的推移，他們開始提出一些關于這些
Nature醫學：表觀基因組決定你胖得健不健康
肥胖容易帶來糖尿病，但并不是所有胖子都會生病。不少肥胖的人擁有正常的代謝能力，“健康”的胖子發展成糖尿病的機率并不高。瑞典卡羅林斯卡學院（Karolinska Institutet）和法國國家健康和醫學研究院（INSERM）的研究人員在Nature Medicine雜志上發表文章指出，與肥胖有關