Science：鑒定出保持細菌基因組完整性的關鍵分子ppGpp
在一項新的研究中，來自美國紐約大學朗格尼醫學中心和俄羅斯科學院的研究人員發現一種關鍵的生物化學分子ppGpp能夠讓細菌修復它們DNA上的致命性損傷，包括抗生素導致的DNA損傷。相關研究結果發表在2016年5月20日那期Science期刊上，論文標題為“ppGpp couples transcription to DNA repair in E. coli”。 研究人員說，在未來的治療中，調整ppGpp分子的作用可能破壞細菌的DNA修復能力，從而使得它們對現存的抗生素敏感性提高好多倍。根據美國疾病控制與預防中心的說法，細菌重復性地接觸相同的藥物會產生耐藥性，而且在美國，耐藥性細菌感染每年與23,000例死亡和200萬感染病例相關聯。 論文通信作者、紐約大學朗格尼醫學中心生物化學與分子藥理學系生物化學教授Evgeny Nudler博士說，“大多數抗生素通過讓細菌DNA遭受損傷而直接或間接地發揮作用，因此找到破壞DNA修復......閱讀全文
細菌基因組DNA提取實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 本試劑盒采用獨特的細胞裂解和相分離技術，結合DNA 制備膜選擇性地吸附DNA 的方法達到純化基因組DNA 的目的。適合于從1.0x109 細菌中獲得多至20 ug 的基因組DNA。用于PCR、Southern 印跡分析、RAPD
細菌基因組DNA提取實驗
細菌基因組DNA提取可應用于：（1）獲得細菌基因組DNA；（2）作為PCR模板；（3）用于測序、遺傳信息分析等。實驗方法原理本試劑盒采用獨特的細胞裂解和相分離技術，結合DNA 制備膜選擇性地吸附DNA 的方法達到純化基因組DNA 的目的。適合于從1.0x109?細菌中獲得多至20 ug 的基因組DN
細菌基因組DNA提取實驗
實驗方法原理 本試劑盒采用獨特的細胞裂解和相分離技術，結合DNA 制備膜選擇性地吸附DNA 的方法達到純化基因組DNA 的目的。適合于從1.0×109 細菌中獲得多至20 μg 的基因組DNA。用于PCR、Southern 印跡分析、RAPD、RFLD 等分子生物學實驗。實驗材料 細菌培養物
細菌中制備基因組DNA實驗
小量制備 氯化銫法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS（十二烷基硫酸鈉）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質，再用酚和氯仿
細菌中制備基因組DNA實驗
實驗方法原理?提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS（十二烷基硫酸鈉）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質，再用酚和氯仿/異戊醇抽提分離蛋白質，得到的DNA溶液經乙醇沉淀使DNA從溶液中析出。實驗材料?細菌試劑、試劑盒?TE氯化銫溴化乙錠NaCl乙醇CTAB儀器、耗材?離心機搖床實驗步驟 1
細菌基因組DNA提取方法綜述
細菌基因組DNA的提取方法綜述，提供了5種方法。?1 快速微量提取法A.取1.5ml菌體培養物于一滅菌Ep管中，12000rpm離心1min, 丟去上清夜，收集菌體。B.加入400ul裂解液（40mMTris-醋酸，20mM醋酸鈉,1mMEDTA,1%SDS,pH7.8）混勻,置于37oC水浴1hr
《科學》：古老蛋白塑造細菌緊湊基因組
該發現可能有助于開發其它標靶Rho的抗生素 ?與人類相比，細菌不攜帶過多的“垃圾DNA”，它們的基因組要“整潔”得多。比如大腸桿菌大約90%的基因組都包含編碼蛋白質的DNA，而人類基因組的90%都是非編碼的“垃圾DNA”。?美國科學家近日研究發現，細菌基因組的這種“整潔”可能要歸功于一種名為R
人體腸道細菌基因組集研究成果
2019年2月5日上午，深圳華大團隊在國際知名學術期刊自然旗下子刊自然生物技術上發表了關于人體腸道細菌基因組集（Culturable GenomeReference, CGR）研究成果。該研究提供了1500多條高質量的人體腸道細菌基因組，為腸道微生物組研究提供了大量全新的參考基因組數據，同時
細菌中制備基因組DNA實驗——小量制備
真核生物的一切有核細胞（包括培養細胞）都能用來制備基因組 DNA。真核生物的DNA是以染色體的形式存在于細胞核內，因此，制備DNA的原則是既要將DNA與蛋白質、脂類和糖類等分離，又要保持DNA分子的完整。實驗方法原理提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS（十二烷基硫酸鈉）和蛋白酶K的溶液
《基因組生物學》：一種超級細菌的基因組測序完成
最近，英國桑格研究所（Wellcome Trust Sanger Institute）和布里斯托爾大學的研究者們共同完成了一種名為Steno的超級細菌的基因測序工作，研究結果顯示，這是一種具有顯著抗藥性的生物體。對這種細菌基因組的了解將有助于研究者們發現如何應對這種具有獨特抗藥性的生物體。這一研究論
方法二：細菌基因組DNA的微量提取法
本方法通過SDS裂解細胞，蛋白酶降解蛋白，CTAB去除多糖成分一：儀器：同方法一?二：試劑：TE、TAE緩沖液；10%SDS；５ＭNaCL；20mg/ml蛋白酶Ｋ；CTAB/NaCL溶液(10% CTAB，0.7M NaCL? 4.1gNaCL 溶于80ml水中，緩慢加入10gCTAB，加熱溶解)；
Nature子刊：基因編輯揭開細菌基因組秘密
由美國伊利諾伊大學香檳分校化學和生物分子工程系的趙惠民教授(音譯，Huimin Zhao)帶領的一個研究團隊指出，他們利用一種創新的DNA工程技術，發現了隱藏在細菌基因組中的潛在的、有價值的功能。這項研究成果發表在12月5日的Nature Communications雜志上。 每種
細菌基因組DNA快速提取試劑使用說明
細菌基因組DNA快速提取試劑◆?產品說明核酸抽取系列是檢測試劑配套使用的DNA/RNA提取系列產品。本產品為細菌基因組DNA快速提取試劑，采用獨特的溶解系統，可快速地從樣品中制備DNA。提取過程中無需使用有毒的酚氯仿，也無需進行耗時的醇類沉淀，整個過程只需10-15分鐘。◆?產品組成?071011M
細菌基因組DNA提取試劑使用說明（二）
三.組織或液體樣品中細菌DNA提取該方案適合于從各種組織、血液、分泌液等液體樣品中提取基因組DNA和寄生的細菌DNA。純化的DNA可直接用于各種細菌的檢測。若需從糞便樣品中提取細菌DNA，我們推薦使用DePure Stool DNA Kit，若需要從土壤樣品中提取細菌DNA，推薦使用DePure
細菌基因組DNA提取試劑使用說明（一）
細菌基因組DNA提取試劑使用說明書◆?產品說明基于硅膠柱純化方式。試劑中的溶菌酶消化去除細菌的細胞壁，革蘭氏陽性細菌還可加入玻璃珠渦旋破壁，在裂解液和蛋白酶作用下裂解消化，DNA釋放到裂解液中。加入乙醇后，轉移至吸附柱中過濾，DNA被吸附至吸附柱的膜上，而蛋白質則被去除。吸附柱經Buffer G
Genome－Res：全基因組測序追蹤耐藥細菌傳播機制
耐甲氧西林金黃色葡萄球菌（MRSA）是一種常見的引發院內感染的致病菌，其也是資源不足醫院感染的一大負擔，此前當資源較好的臨床機構運用全基因組測序來追蹤MRSA的擴散時，針對有限的感染控制的傳播動力學常常并不清楚，近日，來自劍橋大學的研究人員就利用全基因組測序的技術揭示了高傳播率的資源受限醫院中M
細菌中制備基因組DNA實驗——氯化銫法
實驗方法原理提取DNA的一般過程是將分散好的組織細胞在含SDS（十二烷基硫酸鈉）和蛋白酶K的溶液中消化分解蛋白質，再用酚和氯仿/異戊醇抽提分離蛋白質，得到的DNA溶液經乙醇沉淀使DNA從溶液中析出。實驗材料細菌試劑、試劑盒溴化乙錠氯化銫丁醇儀器、耗材離心機巴斯吸管搖床實驗步驟1. ?培養100 ml
研究證實細菌DNA可整合至人類基因組
日前，馬里蘭大學醫學院(University of Maryland School of Medicine)的科學家們找到了細菌基因可偶然性地整合至人類基因組中的強力證據。研究發現，大約 1/3 的健康基因組中含有細菌 DNA 序列，而癌細胞中則更高。從而證實了來自細菌的側向基因轉移(L
科學家為一種細菌重編基因組密碼
報道，最近，美國耶魯大學和哈佛大學的科學家合作，為一種細菌重新編寫了完整的基因組編碼，并提高了其抗病毒能力。相關論文發表在10月18日的《科學》雜志上。 “這是第一次從根本上改變了遺傳密碼。”論文共同高級作者、耶魯大學分子、細胞與發育生物學副教授法倫·艾薩克斯說，“創造一個有著新基因編碼的
中國科大研究組在CRISPRCas系統調控細菌基因組重塑...
近日，中國科學技術大學生命學院及醫學中心孫寶林研究組在CRISPR-Cas系統領域研究取得進展，在美國微生物學會知名期刊mSphere上發表題為《Chromosomal Targeting by the Type III-A CRISPR-Cas System Can Reshape Genom
哈爾濱醫科大學最新文章：細菌基因組的奧秘
科學通報，中國科學C輯:生命科學，這兩份期刊均是由中國科學院和國家自然科學基金委員會共同主辦的，我國學術期刊中的知名品牌，被國內外各主要檢索系統收錄，如國內的《中國科學論文與引文數據庫》(CSTPCD)、《中國科學引文數據庫》(CSCD)等;美國的SCI、CA、EI，英國的SA，日本的《科技文獻
俄生物學家篩選出可降解石油的細菌基因組
莫斯科羅蒙諾索夫國立大學物理化學生物研究所在巴倫支海尋找到一種細菌，并從該細菌中篩選出可降解石油和其它環境污染物的基因組，相關成果發表在《Marine Genomics》學術期刊上。 Thalassolituus oleivorans細菌K–188型菌種是在巴倫支海水面收集到的，該菌種含有可
中國科大CRISPRCas系統調控細菌基因組重塑研究獲進展
CRISPR-Cas（成簇的規律間隔的短回文重復序列及其相關蛋白質）系統是原核生物特有的一類適應性免疫系統，可以保護宿主不受外源核酸的入侵。目前關于CRISPR-Cas系統的研究主要集中在防御機制、被開發為基因編輯工具運用于原核和真核生物的基因組編輯等方面，而關于CRISPR-Cas系統對于宿主
Science：鑒定出保持細菌基因組完整性的關鍵分子ppGpp
在一項新的研究中，來自美國紐約大學朗格尼醫學中心和俄羅斯科學院的研究人員發現一種關鍵的生物化學分子ppGpp能夠讓細菌修復它們DNA上的致命性損傷，包括抗生素導致的DNA損傷。相關研究結果發表在2016年5月20日那期Science期刊上，論文標題為“ppGpp couples transcri
新進展：基因組監測技術助力發現并減緩“超級細菌”傳播
澳大利亞一項最新的研究顯示，基因組監測技術的進步可以幫助人們發現并減緩“超級細菌”的傳播，從而改善全球健康狀況。 “超級細菌”是指那些對常規抗生素和抗菌藥物產生抗性的細菌，使感染更難治療，并增加了疾病傳播、嚴重疾病和死亡的風險。據研究，這種抗藥性主要是由于細菌、病毒、真菌和寄生蟲隨著時間的推移
Sanger采用SMRT測序技術獲得－NCTC－3,000株細菌基因組圖譜
英國著名的Wellcome Sanger研究所與Pacific Biosciences（PacBio）合作已完成了對英國公共衛生部國家標準菌庫NCTC中 3,000多株細菌的基因組的測序工作，其中包括一些世界上最危險的細菌，如引起鼠疫、痢疾和霍亂的細菌。通過解碼DNA，研究人員能夠更好地了解細菌
中科院“細菌全基因組測序及分析”取得階段性成果
中科院北京基因組研究所的胡松年研究員和浙江大學醫學院附屬二院的胡訊教授合作研究的項目“細菌Phenylobacterium zucineum全基因組測序及分析”取得階段性成果，相關論文發表在今年第9期的BMC Genomics上。 P.zucineum是合作方從K562細胞系中分離到的兼性細菌。系
山東大學構建dsDNA重組工程的細菌多元基因組編輯方法
近日，微生物技術國家重點實驗室卞小瑩教授和張友明教授團隊在微生物基因組編輯技術領域取得突破。相關研究成果以“Improved dsDNA recombineering enables versatile multiplex genome engineering of kilobase-scale
科學家為細菌重編基因組密碼－提高抗病毒能力
據物理學家組織網10月18日(北京時間)報道，最近，美國耶魯大學和哈佛大學的科學家合作，為一種細菌重新編寫了完整的基因組編碼，并提高了其抗病毒能力。相關論文發表在10月18日的《科學》雜志上。 “這是第一次從根本上改變了遺傳密碼。”論文共同高級作者、耶魯大學分子、細胞與發育生物學副教授法倫
北京基因組所細菌陸生化研究取得階段性成果
近日，中國科學院北京基因組研究所章張課題組對DnaE2酶的研究取得了新進展。該研究合理地解釋了新基因產生和基因組進化對細菌環境適應性的影響，并進一步討論了真核生物與陸生菌之間的共進化。研究成果在Nature子刊The ISME (International Society for Micro