為何大家愿意公開自己基因組數據？
2007年，在諾貝爾獎得主James Watson共同發現DNA結構的54年之后，他成為了第一個完成個人基因組測序的人，當時這花費了近100萬美元。但隨著近年來測序成本的下降，到了測序先驅Craig Venter這里，已經可以在一個小時內，花不到100美元的錢就能得到個人基因組序列了。 這一市場也越來越受到重視，因此人類遺傳數據的另一個來源就是消費者基因測試（direct-to-consumer genetic testing，DTC-GT）。緊跟著分析遺傳信息的成本急劇下降，譬如23andMe，FamilyTreeDNA和Ancestry.com這樣的公司現在已經開始為客戶提供相對實惠的價格，分析他們的遺傳數據。而且這一行業還在不斷增長。 然而隨著這種情況愈演愈烈，一個新的問題出現了：誰將會從遺傳信息私有化中受益嗎？一些科學家和消費者為了不讓公司完全占據DTC-GT數據，將數據分享到了openSNP平臺（https:/......閱讀全文
缺乏數據使用指導原則，基因組數據共享遇阻
基因組數據共享將生物醫學研究推向快車道，但向公共領域發布的現有數據指南一方面承認免費和無條件使用數據的重要性，另一方面還未能解決這種重要性與數據生產者首次發布數據的“權利”之間的關系。 在美國能源部聯合基因組研究所負責人Nikos Kyrpides看來，這種自相矛盾導致了數據生產者和數據使用
基因組數據分析的“金標準”
五月十八日，美國安大略癌癥研究所、俄勒岡健康與科學大學、賽智生物網絡（Sage Bionetworks）、分布式DREAM 團體(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大學圣克魯茲分校的癌癥研究人員，在《Nature M
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
國家基因組科學數據中心公布數據資源整合挖掘體系
近日，國家基因組科學數據中心在國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表題為Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章，以整體形式介紹基因組數據資源整合與挖掘體系建設
國際癌癥基因組聯盟公布逾1萬個癌癥基因組數據
國際癌癥基因組聯盟(International Cancer Genome Consortium，簡稱"ICGC")近日向科研界公布了超過1萬個癌癥基因組的數據。這些數據能更好地幫助全世界的癌癥研究者從基因方面了解癌癥，加快對癌癥的研究并幫助更多癌癥靶向治療的發展。 安大略癌癥研究所所
為何大家愿意公開自己基因組數據？
2007年，在諾貝爾獎得主James Watson共同發現DNA結構的54年之后，他成為了第一個完成個人基因組測序的人，當時這花費了近100萬美元。但隨著近年來測序成本的下降，到了測序先驅Craig Venter這里，已經可以在一個小時內，花不到100美元的錢就能得到個人基因組序列了。 這一市
又一滅絕物種全基因組數據解析
日前，吉林大學考古學院蔡大偉教授團隊與西北農林科技大學動物科技學院姜雨教授團隊在馬屬動物古DNA研究領域取得重要進展。該研究在國際上首次成功獲取已滅絕馬屬動物奧氏馬的高質量全基因組數據，重建了馬屬動物的演化歷史。 馬科動物自古以來就與人們的關系密切,對人類社會文明的發展產生了重大影響。中國家馬起源
中國開放最新家蠶基因組研究數據
“我們通過網絡，以開放的姿態與世界共享家蠶基因組最新研究成果”，中國家蠶基因組計劃項目主持人、中國工程院院士向仲懷26日介紹，包含有最新研究數據的中國家蠶遺傳數據庫目前已收到來自國內外科研人員的訪問25萬余次。 向仲懷介紹，中國家蠶遺傳數據庫由西南大學家蠶基因研究團隊和深圳華大基因研究院合
北京基因組所數據資源建設取得進展
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊研究論文在線發表于《核酸研究》期刊。該研究成果的發表是國內首次以數據中心為模式，整體發布我國生命組學數據資源建設情況，標志著生命與健康大數據中心建設取得實質性重要進展，也標志著我國建設綜合性基因組數據資源獲得國際同行認可。 生命與健康大數
基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺，是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重
北京基因組所構建完成質體基因組結構變異數據庫
多相催化是實現高效定向化學轉化的關鍵技術，其中的一個重要基礎科學問題是如何通過精確設計和調控催化活性位結構及所在環境，從而強化其定向催化功能并創造新型高效催化劑。近日，中國科學技術大學熊宇杰教授課題組和江俊教授課題組繼在電催化體系中提出表面極化概念后,再次通過與黃偉新教授課題組合作，證實界面極化
Illumina收購Edico－Genome，加速基因組數據分析
Edico的DRAGEN? Bio-IT平臺為新一代測序帶來了更快更簡化的輸出。 圣迭戈——2018年5月15日——Illumina公司（納斯達克代碼：ILMN）宣布收購新一代測序（NGS）數據分析加速解決方案的領先供應商Edico Genome。Edico Genome的DRAGEN? B
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
全球藥典草藥基因組數據庫已上線
近期，中國中醫科學院中藥研究所團隊建立了全球藥典基因組數據庫(GPGD)。該數據庫是全球首個針對藥典收載草藥物種的大型基因組學數據庫。相關研究成果發表在《Science China-Life Sciences》雜志，標題為“Global Pharmacopoeia Genome Database
基因組新數據或改寫人類進化史
新的人類進化模型表明，人類起源于非洲大陸的多個祖先種群。5月17日發表在《自然》雜志上的一項新研究對主流理論提出了挑戰，認為智人是從非洲多個不同的種群進化而來的，在經歷了長期的基因混合后，最早可檢測到的分裂發生在12萬至13.5萬年前。 在檢測非洲當前種群的遺傳物質，并將其與那里早期智人種群的現有
科學家搭建草莓基因組數據庫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓為薔薇科草莓屬，因芳香多汁、營養豐富受到喜愛，在全國各地均可種植。栽培草莓為異源多倍體，基因組復雜，雜合度高。 2019年，《自然—遺傳學》發表了利用三代測序數據組裝的高
加拿大個人基因組計劃公布首批數據
加拿大個人基因組計劃（PGP-Canada）于2012年啟動，欲建立一個在線的加拿大人基因組數據庫，供全世界的研究人員使用。近日，該計劃公布了首批測序數據。根據《加拿大環球郵報》（the Globe and Mail）的報道，研究人員發現了許多意想不到的結果。 這個計劃測序了首批56名參與者的
15000年前“農民”全基因組數據出爐
英國《自然·通訊》雜志近日發表的一項遺傳學報告中，德國科學家公布了生活在15000年前的安納托利亞“農民”的首個全基因組數據。該研究結果有助于認識歐亞大陸的農業起源。圖片來源于網絡 農業在公元前10000年至9000年左右起源于亞洲西南部的新月沃土（Fertile Crescent），隨后傳
首個中國地區古人全基因組數據被測序
近日，《當代生物學》發表了首次針對中國地區古人類的全基因組研究成果。該項目由中國科學院古脊椎動物與古人類研究所和德國馬普進化人類研究所等團隊合作完成，研究分析了距今4萬年前出土于北京房山田園洞的一具男性個體基因組，發現東亞早期人群組成十分復雜。 雖然歐洲和西伯利亞地區都有古人類樣本基因組被測序
基因組數據顯示現代人類進化細節
據物理學家組織網報道，發表在5日出版的《公共科學圖書館·生物學》雜志上的研究論文顯示，對英美兩國21萬人基因組數據分析發現，在長壽人群中，較少發生與阿爾茨海默癥和重度吸煙相關的遺傳變異，這表明自然選擇一直在“努力”消除這些不利種群的變異。 進一步研究發現，與心臟病、高膽固醇、肥胖和哮喘相關的遺
基因組育種大數據計算新工具“天權”發布
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494792.shtm近日，國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）發表了華中農業大學動物遺傳育種團隊開發的基因組育種大數據計算新工具HIBLUP，中文名為“天權”。相關論文
分析和比較各種基因組數據的多面手
Partek?是一家致力于開發與整合用于生命科學研究數據分析軟件的公司。該公司的系列軟件包括――Partek? Flow?, Partek? Genomics Suite?, and Partek? Pathway?――可以提供基因組數據分析的整體解決方案，也是唯一一家可以提供
北京基因組所開發系列特色科學數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇數據庫文章在國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表，并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas
首次公布！河南仰韶村遺址古人基因組數據發表
近日，河南省文物考古研究院、廈門大學等單位在國際學術期刊《科學通報》發表研究成果。研究發現，仰韶村遺址仰韶文化與龍山文化相關人群之間具有高度的遺傳連續性，并對中華民族的形成有著重要的遺傳貢獻。 河南省文物考古研究院和廈門大學的研究人員取樣提取和測序了仰韶村遺址的古人DNA，并于論文《古代基因組
基因組育種大數據計算新工具“天權”發布
近日，國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）發表了華中農業大學動物遺傳育種團隊開發的基因組育種大數據計算新工具HIBLUP，中文名為“天權”。相關論文被期刊評為“突破性進展”論文。 該研究系統分析了已有遺傳評估算法特點，針對現有算法在處理快速增長的基因組育種大
迄今最詳細人類基因組分析數據出爐
迄今最詳細的人類基因組分析數據出爐。圖片提供：ENCODE計劃? ?一項大型國際計劃顯示，與青少年在學校掌握的知識相比，人類基因組—— 一個人的遺傳信息總和——包含有更多的蛋白質編碼基因。當研究人員決定在上世紀90年代晚期對人類基因組進行測序時，他們專注于尋找那些用來確定全部生
阿里聯合生物技術公司打造基因組數據云
本報訊 近日，北京貝瑞和康生物技術有限公司與阿里云共同向外界宣布，雙方將共同打造以海量的中國人群基因組數據為核心的數據云，實現對個人基因組數據的精準解讀。此次，雙方共同合作的“神州基因組數據云項目”將首先聚焦于基因組大數據在云平臺上的批量計算、分析、存儲，進而在基因大數據領域共同進行前沿探索。
北京基因組所開發系列特色科學數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇數據庫文章在國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表，并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas
Secure－Federated－GWAS：打破數據壁壘，開啟基因組研究新篇
在生命科學的廣袤領域中，基因組關聯研究（Genome-Wide Association Studies，GWAS）宛如一座燈塔，照亮了探索遺傳變異與健康、疾病關系的道路。想象一下，若能整合全球各機構的基因數據進行研究，那將為攻克疑難病癥、揭示生命奧秘帶來多大的助力！然而，現實卻如同一堵高墻，橫亙在理