漢字首登Nature農科院等完成亞洲栽培稻基因組變異研究
水稻是全世界最重要的糧食作物之一，對水稻全球品種進行基因組研究，對于挖掘有利等位基因和指導基于全基因組信息的分子育種具有重大的理論和實踐意義，是關系著國家乃至全球糧食安全的重大戰略問題。 2011年9月，全球3000份水稻核心種質資源基因組項目（3K Rice Project）正式啟動，該項目是由中國農業科學院的黎志康研究員主持，聯合國際水稻研究所和華大基因共同參與的重大國際合作研究項目。2014年5月，3000份水稻基因組序列與世界饑餓日公開發布于 Giga Science 雜志，同時測序數據發布在NCBI, DDBJ，Giga Science 以及阿里云等數據庫,供全世界下載。在3,000份水稻基因組初步分析的基礎上建立了SNP數據庫（Rice SNP-Seek Database）、3K 泛基因組數據庫（RPAN: RicePan-genome Browser）等多個數據庫。泛基因組和結構變異（SVs）原始數據將發布在......閱讀全文
迄今分辨率最高的野生稻栽培稻泛基因組圖譜繪就
亞洲栽培稻馴化歷史可追溯至一萬年前的普通野生稻。 面對全球人口增長和氣候變化加劇的雙重壓力，如何將野生稻歷經萬年錘煉的“生存智慧”注入現代品種，培育出兼具高產潛力與抗病抗逆特性的“超級水稻”已成為重要研究課題。然而，傳統依賴單一參考基因組的研究模式譬如以管窺天，僅能捕捉水稻遺傳多樣性的冰山一角。
漢字首登Nature－農科院等完成亞洲栽培稻基因組變異研究
水稻是全世界最重要的糧食作物之一，對水稻全球品種進行基因組研究，對于挖掘有利等位基因和指導基于全基因組信息的分子育種具有重大的理論和實踐意義，是關系著國家乃至全球糧食安全的重大戰略問題。 2011年9月，全球3000份水稻核心種質資源基因組項目（3K Rice Project）正式啟動，該項目
中國科學家完成水稻5個“近親”基因組測序
中國科學家３日說，他們完成了亞洲栽培稻（一般稱為水稻）５個“近親”的全基因組測序，獲得了高質量的基因組參考序列。這有望進一步推動水稻品種的改良。 中國科學家在美國《國家科學院學報》上報告說，他們從２００７年至今，自主完成了尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展穎野生稻和南方野生
我國學者在野生稻基因解析和種質資源利用領域取得進展
圖普通野生稻和亞洲栽培稻泛基因組及進化分析 在國家自然科學基金項目（批準號：32388201）等資助下，中國科學院分子植物科學卓越創新中心韓斌院士團隊完成了145份亞洲栽培稻及普通野生稻的參考基因組級別的基因組組裝，繪制了高質量“野生稻-栽培稻泛基因組圖譜”，系統挖掘了普通野生稻廣泛的遺傳多樣
植生生態所等在水稻馴化起源研究中取得新突破
?????? 最近，中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所國家基因研究中心韓斌課題組與中國水稻研究所及日本國立遺傳所等單位合作，于10月4日在《自然》雜志在線發表了題為“水稻全基因組遺傳變異圖譜的構建及馴化起源”的論文。 水稻、小麥等農作物的馴化、栽培對人類文明的進程產生過重大的影響，
基因組研究讓水稻育種走向精準設計
由中國主導的國際間科研大協作項目“3000份水稻基因組研究”26日結出碩果——北京時間當日凌晨1時，國際頂級學術期刊《自然》正式發表《3010份亞洲栽培稻基因組研究》。該研究針對水稻起源、分類和馴化規律進行了深入探討，揭示了亞洲栽培稻的起源和群體基因組變異結構，剖析了水稻核心種質資源的基因組遺傳
中科院合作研究發現野生稻并不“野”
中國科學院遺傳發育所研究員儲成才研究組和丹麥哥本哈根大學、美國加州大學伯克利分校研究人員合作開展的一項研究發現，野生稻基因組中有著人工選擇馴化的痕跡，他們巧妙地證實有大量栽培稻基因流入野生稻群體。日前出版的美國《基因組學研究》雜志發表了這一成果。 研究人員通過對已發表的大量野生稻和栽培稻基因
研究發現野生稻并不“野”
中國科學院遺傳發育所研究員儲成才研究組和丹麥哥本哈根大學、美國加州大學伯克利分校研究人員合作開展的一項研究發現，野生稻基因組中有著人工選擇馴化的痕跡，他們巧妙地證實有大量栽培稻基因流入野生稻群體。日前出版的美國《基因組學研究》雜志發表了這一成果。 研究人員通過對已發表的大量野生稻和栽培稻基因組
野生稻并不“野”
近日，我國科學家對野生稻的研究取得了新進展，研究成果在線發表于《基因組學研究》雜志。他們發現，野生稻并不“野”，顛覆了之前科學家對野生稻的認知，很多相關理論都要重新思考和修訂，對野生資源的科學保護也已刻不容緩。 普通野生稻一直被認為是亞洲栽培稻的野生祖先，也是水稻改良過程中的重要種質資源。普通
世界首個種間遠緣雜交后代粳稻新品種選育成功
7月7日，“2021年度云南省科學技術獎勵大會”在昆明海埂會堂舉行。云南省農業科學院陶大云團隊歷時二十余年攻關，首次利用非洲栽培稻資源培育出國際上首個種間遠緣雜交后代粳型水稻新品種“云稻一號”。該團隊項目“稻屬AA基因組種間雜種不育的遺傳研究”榮獲自然科學類一等獎。 據介紹，世界各國收集并保存的
中國科學家主導國際大協作助力水稻精準育種
英國時間4月25日，《自然》雜志長文報道由中國農業科學院作物科學研究所牽頭，聯合國際水稻研究所、上海交通大學、華大基因、深圳農業基因組研究所、安徽農業大學、美國亞利桑那大學等16家單位共同完成的3000份亞洲栽培稻基因組研究。 該研究針對水稻起源、分類和馴化規律進行了深入探討，揭示了亞洲栽培稻
吃了一輩子的水稻，為何如此多樣？
近日，中國農業科學院作物科學研究所水稻優異種質資源發掘與創新利用創新團隊、作物基因組選擇育種創新團隊和華盛頓圣路易斯大學的肯·奧爾森團隊合作完成了水稻（亞洲栽培稻）及其祖先種（普通野生稻）非編碼區長鏈非編碼RNA（lncRNA）的注釋，研究了水稻lncRNA的進化歷史，并從全基因組水平揭示了ln
高立志團隊破解水稻“祖先”野生稻－優秀刻在基因里
水稻是世界上最重要的糧食作物之一，是中國第一大糧食作物，其產量多年來不斷挑戰著新高峰。然而被公認為水稻祖先的普通野生稻，卻被列為了瀕危植物。不同種類野生稻。（華南農業大學供圖） 事實上，野生稻資源在應對未來水稻穩產高產的挑戰中具有重大價值。 由于對生物多樣性的認知逐漸深刻，近年來，我國對于野
昆明植物所破譯稻屬植物5個物種全基因組
亞洲栽培稻（一般稱為水稻）是世界上最重要的糧食作物之一，是中國第一大糧食作物，養活了80％以上的中國人口。在水稻與其它約23個物種共同組成的稻屬植物中，它和7個稻種（普通野生稻、尼瓦拉野生稻、非洲栽培稻、短舌野生稻、展穎野生稻、長雄蕊野生稻和南方野生稻）都是AA基因組類型，這些水稻近緣物種間斷分
農科院研究揭示水稻全基因組功能單倍型自然變異特征
近日，中國農業科學院作物科學研究所（以下簡稱作科所）水稻分子設計技術與應用創新團隊構建了一個全基因組基因功能單倍型（gcHap）數據集，全面揭示了亞洲栽培稻基因功能單倍型自然變異特征，提出亞洲栽培稻多起源（馴化）假說，并開發了適用于功能單倍型數據全基因組關聯分析和全基因組預測的軟件包“HAPS”
大規模基因重測序確認亞洲栽培稻起源于中國
美國研究人員在一項通過大規模基因重測序分析稻米進化史的研究中確認，亞洲栽培稻起源于中國，最早可能8000多年前就出現在中國長江流域。 亞洲栽培稻是世界上最古老的農作物物種之一。此前曾有研究認為，亞洲栽培稻有兩個起源地——印度和中國。但5月2日刊登在美國《國家科學院院
全球水稻去馴化、趨同野化的證據找到了
近日，開放獲取期刊《基因組生物學》（Genome Biology）在線發表了全球首次雜草稻調查研究結果。浙江大學教授樊龍江領導的一個國際研究團隊，通過對全球稻區雜草稻（俗稱鬼稻）材料采集與分析發現，水稻在世界各稻區均存在野化或去馴化的現象，并描繪了野化水稻的基因組特征。該成果對水稻進化、資源利用
科學家揭示水稻“編碼基因集”－有助提升產量
北京時間1月16日，《自然-遺傳學》雜志在線發表了中國科學家題為“泛基因組分析揭示栽培稻和野生稻中基因組變異”的研究論文，該研究首次繪制了栽培稻-野生稻的泛基因組圖譜，有助于育種家充分利用各類群水稻豐富的遺傳變異，進一步提升中國水稻的產量潛力等。 這項研究由中科院分子植物科學卓越創新中心/植物
中科院，上海師范大學Nature－Genetics發文：
來自中科院植物生理生態研究所，上海師范大學生命與環境科學學院等處的研究人員發表了題為“Pan-genome analysis highlights the extent of genomic variation in cultivated and wild rice”的文章，通過泛基因組分析揭示
超級泛基因組助水稻種質資源遺傳變異挖掘利用
?水稻泛NLRs家族基因的共線性位點（左）；基于全基因組SNPs的水稻系統發生樹（右）。中國農科院供圖 近日，中國農業科學院深圳農業基因組研究所與國內多家高校、科研單位合作，組裝了251份高質量的水稻基因組，構建了目前植物中群體規模最大、基因組充分注釋、稻屬中最為系統的超級泛基因組。該圖譜
我科學家參與完成非洲稻基因組測序
最近，美國亞利桑那大學（UA）研究人員帶領的一個國際研究小組，完成了非洲稻（Oryza glaberrima）的全基因組測序。中科院遺傳與發育生物學研究所的陳明生（Mingsheng Chen）和Jinfeng Chen也參與了此項研究工作。相關研究結果，以“The genome sequenc
華中農大建成全球首個水稻基因索引數據庫
華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室張建偉教授課題組近日發表最新研究成果，他們建成世界上首個基于同源基因的水稻泛基因組綜合數據庫——水稻基因索引數據庫。據介紹，這個數據庫如同一本近義詞詞典。在數據庫里，亞洲稻的每一個基因都能輕松找到同源或相近的基因，以及追蹤其演變歷史。目前，數據庫
中國科學家主導完成“綠色超級稻”國際扶貧項目
自2008年啟動以來，由中國農業科學院主導的“為亞洲和非洲資源貧瘠地區培育綠色超級稻”國際農業科技扶貧項目，已在18個非洲和亞洲國家審定高產、優質、多抗品種78個，累計推廣面積達612萬公頃，令160萬農戶收入顯著增加。 4月2日，“綠色超級稻”項目結題會在京舉行。項目首席科學家、中國農科院作
華中農大建成全球首個水稻基因索引數據庫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498200.shtm 華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室張建偉教授課題組近日發表最新研究成果，他們建成世界上首個基于同源基因的水稻泛基因組綜合數據庫——水稻基因索引數據庫。 據
128個環境適應性位點：有望培育廣適性水稻
近日，《植物生物技術》（Plant Biotechnology Journal）在線發表了中國農業科學院作物科學研究所水稻優異種質資源發掘與創新利用團隊與國際水稻研究所合作的最新成果。通過對185個野生稻和743個栽培稻品種進行關聯分析，他們找到了128個與水稻環境適應性相關聯的基因位點，解析了水稻
基于同源基因簇的水稻泛基因組綜合數據庫建成
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/4/498300.shtm近日，華中農業大學作物遺傳改良全國重點實驗室、湖北洪山實驗室教授張建偉課題組聯合國內外高校與科研機構在《自然—通訊》與《分子植物》連續發表兩篇研究論文。這兩項工作以代表亞洲稻群體結構的
科學家闡述水稻馴化分子遺傳機制
將野生植物馴化為人賴以生存的栽培作物是人類歷史上最偉大的創舉之一，對人類文明的發展起到至關重要的作用。揭示作物馴化過程中一些重要性狀發生改變的分子機制不僅有助我們認識從野生植物到栽培作物的演化規律，也為現代作物育種提供重要的理論基礎。 水稻是世界最重要的糧食作物之一，也是馴化最早的作物之一。稻屬
院士團隊揭示控制水稻雜種不育的自私基因系統
中國農科院作物科學研究所水稻功能基因組學創新研究組萬建民院士領銜的科研團隊系統解析了水稻粳稻與秈稻雜種不育問題及遺傳特性，發現自私基因系統控制水稻雜種不育，并影響稻種基因組的分化。該研究有望解決水稻雜種不育難題。相關研究成果在線發表于《科學（Science）》期刊。 自私基因是指雙親雜交后，父
Science－Advance|?農科院揭示lncRNAs調控水稻農藝性狀變異機制
2019年12月18日，Science Advances雜志在線發表了來自中國農業科學院作物科學研究所楊慶文團隊、劉君團隊和華盛頓圣路易斯大學的Ken Olsen團隊完成了水稻（亞洲栽培稻）及其祖先種（普通野生稻）非編碼區lncRNA的注釋，結合多重組學方法研究了水稻lncRNA的進化歷史，從全
中國農業科學家首次揭秘水稻自私基因
中國農業科學家系統解析了水稻粳稻與秈稻雜種不育問題及遺傳特性，發現自私基因系統控制水稻雜種不育，影響稻種基因組的分化，并有望解決水稻雜種不育的難題。該項研究成果于6月8日在國際學術頂級期刊《科學（Science）》雜志上在線發表。該研究由中國農科院作物科學研究所與南京農業大學等單位合作完成，獲得科技