國家重點實驗室破解中國種茶樹全基因組密碼
當前，世界主栽茶樹分屬兩個變種: 中國種和阿薩姆種。省部共建茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室安徽農業大學宛曉春教授研究團隊，聯合深圳華大基因和中國科學院國家基因研究中心等相關研究團隊，以國家級茶樹品種舒茶早（中國種）為材料，用二代和三代測序技術對其進行測序，采取雜合組裝策略，獲得覆蓋基因組93%區域的高質量序列草圖，注釋出33,932個高可信度的茶樹基因。研究結果顯示，中國種基因組大小為3.1Gb，重復序列含量為64%，基因組組裝的完整性和質量遠高于現有同類已測序物種組裝水平。研究發現，茶樹祖先種大約在8000萬年前與親緣關系最近的獼猴桃物種發生分化，繼而在38-154萬年前，又分化形成中國種和阿薩姆種。 宛曉春教授研究團隊發現了一個參與茶氨酸合成的關鍵酶基因（CsTSI），并通過轉錄組學和轉基因分析，證明CsTSI具有合成茶氨酸的酶活性。比較基因組分析發現，萜烯類等物質的合成酶基因拷貝數在茶樹基因組中也發生顯著擴增，有......閱讀全文
我國首次成功破譯茶樹基因組
茶作為最早飲料，其相關的可信記錄可以推至公元前三世紀--商代時期。茶葉不僅在中國而且在世界范圍內具有巨大的經濟和文化價值。日前，我國科學家經過七年研究，終于率先在國際上破解了茶樹的基因組。 相對于“世界三大飲料植物”中的咖啡和可可而言，茶樹基因組具有高雜合、高重復和基因組龐大等特點。由中科
中國種茶樹全基因組密碼破解
記者從安徽農業大學獲悉，該校茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室宛曉春教授研究團隊，聯合深圳華大基因等單位，破解了世界上分布最廣的中國種茶樹的全基因組信息，成果日前在線發表于《美國科學院院刊》上。 世界主栽茶樹分屬兩個變種：即中國種和阿薩姆種，前者葉小，分布廣泛，適制綠茶等六大茶類；后者葉大，主
陳亮小組茶樹功能基因組研究取得進展
我國只有不到25%的茶園栽種經過改良的品種 茶樹是一種重要的經濟植物，由于其自身特性的限制，茶樹分子生物學尤其是功能基因研究相對遲緩。在國家自然科學基金等的資助下，中國農業科學院茶葉研究所研究員陳亮率先展開茶樹功能基因組、茶樹分子標記研究，從更深層次上認識茶樹生長發育、起源、
昆明植物所等首次成功破譯茶樹基因組
茶是世界上最為古老也是最為廣泛飲用的含咖啡因軟飲料，目前全球160多個國家的30億人喝茶愛茶。普遍認為，茶樹起源于中國的云南、四川等地；作為傳播中國文化的使者，在茶從中國起身向世界各地傳播的數千年的漫長歷程里，與全球100多個國家多元的文化邂逅交融，發展形成了地球上復雜而美妙的茶文化。除了因為迷
攻克基因組測序難題－探究茶樹生物學奧秘
我國現存最早的中醫醫藥典籍《本草經》記載：“神農嘗百草，日遇七十二毒，得荼（茶）而解之。”這說明了茶的神奇功效。茶樹起源于我國的云南、四川等地，在從中國向世界各地數千年漫長傳播歷程里，與全球多元文化邂逅交融，發展形成了今天地球上復雜而美妙的茶文化。茶之所以廣受歡迎，除了有迷人的香氣和令人愉悅的滋
龍井茶樹染色體級別基因組組裝成功
? ?龍井43 ?? 中國農科院供圖 近日，《自然—通訊》在線發表了我國科學家在茶樹全基因組組裝和茶樹起源演化研究上取得的重要突破。該項研究由中國農業科學院茶葉研究所（以下簡稱茶葉所）和中國農業科學院深圳農業基因組研究所（以下簡稱基因組所）主導并攜手中國科學院昆明動物研究所（以下簡稱昆
國家重點實驗室破解中國種茶樹全基因組密碼
當前，世界主栽茶樹分屬兩個變種: 中國種和阿薩姆種。省部共建茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室安徽農業大學宛曉春教授研究團隊，聯合深圳華大基因和中國科學院國家基因研究中心等相關研究團隊，以國家級茶樹品種舒茶早（中國種）為材料，用二代和三代測序技術對其進行測序，采取雜合組裝策略，獲得覆蓋基因組93
世界第一個茶樹基因組測序計劃在昆啟動
2月3日，記者從中國科學院昆明植物研究所獲悉，在中國科學院昆明植物研究所3名中科院院士吳征鎰、周俊、孫漢董的大力推動下，一個在世界生物學界和推動普洱茶產業發展上均具有重大意義和經濟價值的科研創新項目——世界上第一個茶樹基因組測序計劃已在昆明正式啟動。此舉，將為云南省利用高科技實現對普洱茶的全新研究和
茶樹抗寒功能基因模塊被發現
近日，中國農業科學院茶葉研究所茶樹遺傳育種創新團隊研究鑒定出茶樹低溫脅迫功能基因模塊，闡明了茶樹抗寒機制，相關研究成果發表在《植物細胞與環境（Plant, Cell & Environment）》。低溫是限制茶樹生長最重要的環境因子之一。鈣調磷酸酶B類似蛋白互作蛋白激酶（CIPK）廣泛參與植物的生長
科學家破解中國種茶樹全基因密碼
?? 記者24日從安徽農業大學獲悉，該校茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室，聯合深圳華大基因和中國科學院國家基因研究中心（上海）等相關研究團隊，破解了世界上分布最廣的中國種茶樹的全基因組信息，從基因組層面系統解開了茶葉中富含獨特的風味物質之謎，標志著中國茶樹生物學基礎研究取得重大突破。?? 據介紹，
種茶樹也有基因密碼了？生物學與資源重點實驗室成立
?? 記者24日從安徽農業大學獲悉，該校茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室，聯合深圳華大基因和中國科學院國家基因研究中心（上海）等相關研究團隊，破解了世界上分布最廣的中國種茶樹的全基因組信息，從基因組層面系統解開了茶葉中富含獨特的風味物質之謎，標志著中國茶樹生物學基礎研究取得重大突破。?? 據介紹，
茶樹不賞花
茶花 茶樹花■付雷 金華這座城市并不大，卻有多處茶花園，不但有一個中國茶花文化園，更有一個國際山茶物種園，顯得很有聲勢。茶花在冬春時節開得頗盛，讓冬季的色彩不再單調了。 供人觀賞的茶花是山茶科植物的花，名列“中國十大名花”之中。山茶屬于雙子葉植物山茶科山茶屬，有灌木，也有小喬木。它的葉片很硬
小葉茶染色體級別基因組圖譜聯合研究成果首次完成
近日，生物學預印本服務器（www.biorxiv.org）在線發表了中美科學家聯合研究團隊的最新成果，該團隊采用單分子實時測序（SMRT）和 Hi-C技術，在20多個代表性小葉茶品種中選用雜合度較低的小葉茶良種“碧云”，將組裝獲得的約2.85Gb 的基因組序列掛載到了15 條假染色體上，在國際上
我國科學家在茶樹起源演化研究上取得重要突破
? 由中國農業科學院茶葉研究所和中國農業科學院深圳農業基因組研究所主導的一項研究，日前揭示了茶樹群體的系統發生關系，描繪了栽培茶樹的進化歷史。研究成果為茶樹基因組學研究和育種研究，以及茶樹遺傳和進化研究提供了豐富素材。 茶是世界性飲料。茶樹起源于中國，在我國分布廣泛，種質資源豐富，紅茶、綠茶、烏
茶樹的馴化歷史和遺傳機制研究新發現
茶樹是重要的經濟植物，其特征是基因組大、雜合度高、物種多樣性高。中國農業科學院茶葉研究所、深圳農業基因組研究所和中國科學院昆明動物研究所在基因組層面上對茶樹開展合作研究。 該研究獲得染色體級別高質量的中國茶（Camellia sinensis var.sinensis）“Longjing 43
“基因組編輯核酸酶”當選《自然》年度研究方法
? 《自然—方法學》視頻介紹“基因組編輯核酸酶” 《自然》雜志子刊《自然—方法學》在最新一期推出了2011年度研究方法專刊，評選出了本年度研究方法——基因組編輯核酸酶（Gene-editing nucleases）。專刊包括社論、新聞特寫、評論、視頻等內容；同時，還評出其他8個值得關注的研
植物基因組DNA提取、酶切及電泳分析
一、目的 ?掌握植物基因組DNA提取的一般方法及注意事項。大分子量DNA分子的酶切分析。 ?二、原理 ?十六烷基三乙基溴化胺是一種去污劑，可溶解細胞膜，它能與核酸形成復合物，在高鹽溶液中（0.7mol/L NaCl）是可溶的，當降低溶液鹽濃度到一定程度(0.3 ?mol/L
植物基因組DNA提取、酶切及電泳分析
實驗概要掌握植物基因組DNA提取的一般方法及注意事項。大分子量DNA分子的酶切分析。實驗原理十六烷基三乙基溴化胺（CTAB）是一種去污劑，可溶解細胞膜，它能與核酸形成復合物，在高鹽溶液中（0.7mol/L ?NaCl）是可溶的,當降低溶液鹽濃度到一定程度(0.3 mol/L ?NaCl)時,從溶液中
誰在先？“雞基因組”和“雞蛋基因組”
是先有雞還是先有雞蛋？這個問題相當惱人，恐怕很難說清楚。現在，研究人員回答了與這個問題一樣惱人的問題：是人類基因組中的成千上萬的長重復DNA片段中，那個是第一個產生的？那些被復制了？ 這個答案發表在10月7日的《自然·遺傳學》雜志上。該研究給出了人類基因組中DNA重復片段復制的第一個進化證據，這種
基因組測序
如果樓主指的是人類基因組計劃，那時用的方法叫做雙脫氧終止法，也叫做sanger法。它的原理是在DNA合成過程中，DNA聚合酶能夠使用ddNTP(雙脫氧核苷酸）來作為原料，但它的反應會在加入ddNTP的時候終止。具體實驗是通過PCR來完成的，但與普通PCR不同，它只需要一個引物而不是一對。在4個相同的
葉綠體基因組
葉綠體是地球上綠色植物把光能轉化為化學能的重要細胞器，葉綠體中進行的光合作用是嚴格地受到遺傳控制的。早在20世紀初，人們就已知葉綠體的某些性狀是呈非孟德爾式遺傳的，但直到60年代才發現了葉綠體DNA(chloroplast DNA，ctDNA)。葉綠體基因組是一個裸露的環狀雙鏈DNA分子，其大小在1
酶切后的質粒和基因組DNA有何不同
分離質粒時,可以將質粒去得很干凈.方法為：先用TE之類的試劑將菌液懸浮起來,再用NaOH和SDS將菌液裂解（起裂解作用的主要是NaOH,但此時,SDS可以與蛋白很好的結合）.第三步,加入酸中合第二步中的堿,并且將SDS沉淀下來,同時,SDS和蛋白也一起沉淀下來,而基因組上面有很多的蛋白,這樣基因組就
首張拓撲異構酶II全基因組剪切圖譜
DNA切割酶對基因結構調節起著關鍵作用。研究人員發現，它在導致癌癥的（如白血病和實體瘤）易位（translocations）異常重排中表現活躍。 II型拓撲異構酶（type II topoisomerase， TOP2）通過斷裂DNA雙鏈磷酸二酯鍵，來更正DNA連環數，使細胞DNA正常轉錄、復
全基因組的比較基因組雜交技術介紹
Whole-Genome and Custom Fine-Tiling Array CGHComparative Genomic Hybridization (CGH) measures DNA copy number differences between a reference genome a
GenomeResearch發表基因組研究新發現基因組
多倫多大學的科學家們發現，作為基因組看門人的C2H2-鋅指蛋白（C2H2-ZF）實際上肩負著更加多樣化的職責。這項發表在Genome Research雜志上的研究，有助于我們更準確地解讀個人基因組。C2H2-ZF有大約七百個成員，是規模最大的一種人類蛋白。然而，人們對這些蛋白一直知之甚少。C2H2-
茶樹CsHAC1基因和蛋白及其應用獲發明ZL
記者4月21日獲悉，由中科院華南植物園羅鳴等科研人員完成的“茶樹CsHAC1基因和蛋白及其應用”獲國家發明ZL授權。該發明公開了一種茶樹CsHAC1基因和蛋白在改變植物抗逆性中的應用。該發明構建了插入茶樹CsHAC1 基因的釀酒酵母重組表達載體，將該重組表達載體轉化進入釀酒酵母中，通過半乳糖誘導該基
首款茶樹高密度SNP芯片開發成功
利用茶樹高密度SNP芯片發掘茶樹重要功能基因。中國農科院供圖近日，中國農業科學院茶葉研究所茶樹遺傳育種團隊基于“龍井43”基因組參考序列和茶樹重測序數據，開發出一款200K茶樹SNP芯片。相關研究成果在《植物生物技術雜志》（Plant Biotechnology Journal）上發表。該芯片是首款
《基因組研究》：首張貓基因組草圖繪就
貓是研究人類失明和艾滋病模型之一，因此測序結果大有用處 一只名為“肉桂”（Cinnamon）的4歲雌性阿比西尼亞貓有幸成為第一只完成基因組測序草圖的貓。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在內的基因組“俱樂部”。相關論文11月1日在線發表于《基因組研究》（Genome Research）雜
中國新生兒基因組、胚胎基因組計劃啟動
為從根本上實現新生兒遺傳病的早發現、早診斷、早干預，7日，中國遺傳學會遺傳咨詢分會聯合復旦大學附屬兒科醫院在上海發起中國新生兒基因組計劃。 中國新生兒基因組計劃將在未來的5年內開展10萬例樣本的新生兒基因檢測，旨在構建中國新生兒基因組數據庫，建立新生兒遺傳病基因檢測標準，促進新生兒遺傳病基因檢
茶樹生物學與資源利用安徽省實驗室設立
該實驗室依托安徽農業大學茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室建設。茶學學科是安徽農業大學傳統優勢學科，茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室先后獲批農業部、安徽省、教育部重點實驗室，并于2015年獲批為科技部和安徽省共建的國家重點實驗室。“十二五”以來，茶樹生物學與資源利用國家重點實驗室主持國家和省部級科