數據非依賴采集DIA解決方案(四)
Skyline 軟件Skyline 軟件是華盛頓大學 MacCoss 教授實驗室開發的目標蛋白質組學分析軟件(https://skyline.gs.washington.edu),是 DIA/SWATH 數據處理的權威工具,由于功能全面、性能強大而受到普遍認可,是目前使用最廣泛的 DIA/SWATH 解析軟件。通過與Thermo Fisher Scientific 的緊密合作,MacCoss 教授實驗室有針對性地優化了 Skyline 對 Orbitrap 數據的處理,一步實現從原始數據到最終結果的完整 DIA 解析流程,使 Orbitrap DIA 如虎添翼。 以 Proteome Discoverer 軟件(或 MaxQuant、Mascot 等)搜庫鑒定結果為譜圖庫,導入 Skyline 軟件;設置肽段、離子對挑選規則;將符合條件的肽段及子離子從譜圖中挑選出來,生成 Target List......閱讀全文
數據非依賴采集DIA-解決方案(四)
Skyline 軟件Skyline 軟件是華盛頓大學 MacCoss 教授實驗室開發的目標蛋白質組學分析軟件(https://skyline.gs.washington.edu),是 DIA/SWATH 數據處理的權威工具,由于功能全面、性能強大而受到普遍認可,是目前使用最廣泛的 DIA/S
數據非依賴采集DIA-解決方案(五)
九、相關產品Q Exactive 系列 Orbitrap 超高分辨質譜儀(Q Exactive、Q Exactive Plus 和 Q Exactive HF)?UltiMate ? 3000 RSLCnano 納升超高效液相色譜儀?Orbitrap Fusion“三合一”系列 Orbitrap 超
數據非依賴采集DIA-解決方案(三)
?圖 9. 三步完成 DIA 方法編輯?典型 DIA 數據如圖 10 所示,從色譜圖上看 DIA 數據與傳統 Shotgun 數據沒有明顯區別,只是每個循環的二級譜圖數量固定,因此掃描點分布均勻。?圖 10. 典型的 DIA 數據?圖 11. 四步完成 msxDIA 方法編輯?2. msxDIAOr
數據非依賴采集DIA-解決方案(二)
二、特點與優勢?數據非依賴采集(DIA):? 采集所有離子及碎片譜圖,不丟失任何信息,重現性好;? 數據易于追溯,即使目前的水平無法發現某些蛋白/ 化合物,未來可以回溯;? 無需優化方法,對于易降解樣品可以即刻采集,獲得數據后再深入挖掘;? 基于碎片離子(即母子離子對)定量,選擇性好,與 SRM/M
數據非依賴采集DIA-解決方案(一)
一、數據非依賴采集(DIA)隨著生命科學的快速發展,蛋白質組學的關注焦點和研究趨勢已經逐漸從定性轉向定量。定量蛋白質組學是對細胞、組織乃至完整生物體的蛋白質表達量及差異進行分析,對于生物過程機理的探索和臨床診斷標志物的發現與驗證具有重要意義。基于靜電場軌道阱 Orbitrap 的數據非依賴采集(Da
SCIEX發布全新數據非依賴性采集技術—Zeno-SWATH-DIA
弗雷明翰市,美國馬薩諸塞州——作為生命科學分析技術創新者,SCIEX在2022年美國質譜年會(ASMS) 期間正式發布Zeno??SWATH??數據非依賴性采集(Zeno SWATH DIA)技術,標志著其在生物標志物發現及轉化應用中又向前邁進了重要一步。 Zeno SWATH DIA實現了高保真
Thermo-Fisher-Scientific和Biognosys推出非相關數據采集(DIA)
分析測試百科網訊 在2017年6月4日-8日舉行的ASMS 2017上,世界科學服務領先供應商賽默飛世爾科技公司宣布與下一代蛋白質組學領導者Biognosys AG達成共同營銷協議,為數據庫的創建和數據處理研究,通過組合使用Orbitrap質譜儀和Spectronaut Pulsar軟件,為非相
SCIEX發布多領域應用的尖端SWATH非數據依賴型采集技術
——SCIEX 發布用于食品、法醫和環境樣品綜合分析的尖端 SWATH 非數據依賴型采集技術SCIEX TripleTOF? 系統搭配 SWATH? 采集技術提供的強大功能實現了工業化蛋白質組學,這一模式現在有望在其他應用領域掀起類似變革 馬薩諸塞州弗雷明翰(2017 年 6 月1 日)行業領先的
創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(三)
對10 條肽段的分析結果匯總(表1),結果表明,3 種DIA 方法在fg ~ pg 數量級肽段范圍內均顯示出良好的線性、重現性和靈敏度。3 種方法的最低定量限均達到amol 級,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限達14 amol,超越了常規SRM 和PRM 的定量水平。比
創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(一)
創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質的定量分析摘要 數據非依賴性采集(DIA)是隨著定量蛋白質組學而建立的質譜掃描技術。DIA 能夠獲得掃描范圍內所有母離子及二級子離子信息,不會造成低豐度離子信息的丟失,同時突破了高分辨質譜二級定量的通量限制。本研究基于靜電場軌道阱Q-qIT-OT 三
創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(二)
肽段納流液相分離的出峰時間一般在30 s 以上,因此在合適的循環時間內,3 種DIA 方法可以根據樣本復雜程度靈活調節質量范圍、分辨率、選擇窗口等參數,達到最佳分析效果。例如,分析分子量較大的肽段時,質量范圍可以調整為m / z 400 ~1200 或更寬。??圖1 基于Q-qIT-OT 的
ASMS-2024-|-SCIEX全新ZT-Scan-DIA質譜采集技術引領生命科學前沿
在2024 ASMS(美國質譜學會年會)上,全球生命科學分析技術創新者SCIEX推出了ZT Scan DIA for LC-MS/MS,這是全新一代數據非依賴采集(DIA)技術,將四極桿維度和Zeno Trap阱獲得的豐富MS2數據相結合。DIA以非依賴性的方式檢測樣品中的所有化合物,已成為從發現科
ASMS-2024-|-SCIEX全新ZT-Scan-DIA質譜采集技術引領生命科學前沿
2024年6月3日在2024 ASMS(美國質譜學會年會)上,全球生命科學分析技術創新者SCIEX推出了ZT Scan DIA for LC-MS/MS,這是全新一代數據非依賴采集(DIA)技術,將四極桿維度和Zeno Trap阱獲得的豐富MS2數據相結合。?DIA以非依賴性的方式檢測樣品中的所有化
工業創新智能數據采集器應用解決方案
智能數據采集器SKA-A1 ?一.產品介紹1.?產品概述?智能數據采集器SKA-A1 采用全工業化硬件設計,適用于戶外多變復雜的工作環境。采集器可直連運營商網絡信號,幫助用戶節省布線成本,免除大規模施工煩惱。同時,儀器還設計了GPS和GPRS傳輸方式,一路開關量輸出,可滿足用戶對終端設備實時、動態監
SCIEX發布ZenoTOF-7600+新品!ZT-Scan-DIA實現精準蛋白質組學發現
2024年10月22日,在2024年第23屆國際人類蛋白質組(HUPO)大會上,全球生命科學分析技術創新者SCIEX通過推出高分辨質譜ZenoTOF 7600+系統,進一步拓展了其高分辨率精確質量質譜系列產品,并宣布了三項新的合作以提升蛋白質組學能力。 作為ZenoTOF高分辨質譜系列的最新系
破界而來-|-SCIEX發布ZenoTOF-8600旗艦新品:極速超敏多重碎裂高分辨質譜系統
美國東部時間2025年6月2日上午7時 在ASMS 2025年會上,全球生命科學分析技術創新者、丹納赫集團(紐約證券交易所代碼:DHR)旗下運營公司SCIEX正式推出ZenoTOF 8600系統,為高分辨質譜產品樹立全新標桿。該系統在定性和定量的能力均有出色表現,其不僅提升了對復雜結構的解析能
通過Zeno-SWATH-DIA,SCIEX宣布推出下一代數據獨立采集技術
近日,丹納赫公司(NYSE:DHR)旗下公司SCIEX推出Zeno SWATH DIA,這是生物標志物發現和翻譯工作流程的重要一步。 Zeno SWATH DIA 是樣本的最終數字記錄,可以使研究人員發現更多的潛在生物標志物,可用于臨床試驗的開發和新療法的發現。通過將 ZenoTOF 7600
Nature介紹2015值得關注的質譜技術:DIA策略
2014年末,《Nature Methods》雜志將年度技術授予了激光層照熒光顯微技術(Light-sheet fluorescence microscopy)。同時,雜志也介紹了2015年值得關注的技術,包括非編碼RNA、新一代CRISPR、DIA質譜以及微小晶體的結構等。 傳統的
蛋白質DIA檢測原理
數據非依賴性的掃描模式(Data-independent acquisition, DIA)是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式。可以對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂,采集所有母離子的碎片離子信息進行蛋白定性和定量。目前流行的蛋白質組學研究手段,如iTRAQ\TMT、 Label-fr
定量蛋白質組學質譜采集技術進展(三)
然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有
一小時DDA鑒定DIA定量4000個Hela蛋白(一)
引言數據非依賴性的掃描模式(data-independent acquisition, DIA)是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式[1]。它的理念是用二級碎片離子進行蛋白相對/絕對定量。 DIA 掃描模式中,超高分辨質譜對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂,采集所有母離子的碎片離子,并
定量蛋白數>1000個!血液樣本DIA技術“質”的提升
傳統的蛋白質組技術,如iTRAQ、TMT或者label-free等,采用的是DDA(data-dependent acquisition,數據依賴采集)數據采集方式,其策略是對響應最高的部分母離子進行二級采集。而新一代的蛋白質組學技術DIA(Data Independent Acquisitio
數據采集器
數據采集器(Bar code Hand Terminal),又稱盤點機、掌上電腦。它是將條碼掃描裝置與數據終端一體化,帶有電池可離線操作的終端電腦設備。具備實時采集、自動存儲、即時顯示、即時反饋、自動處理、自動傳輸功能。為現場數據的真實性、有效性、實時性、可用性提供了保證。其具有一體性、機動性、
一小時-DDA-鑒定-DIA-定量-4000-個-Hela-蛋白(一)
引言數據非依賴性的掃描模式(data-independent acquisition, DIA)是近幾年來發展的一種新的質譜數據采集方式[1]。它的理念是用二級碎片離子進行蛋白相對/絕對定量。DIA 掃描模式中,超高分辨質譜對特定質量范圍內的所有母離子進行碎裂,采集所有母離子的碎片離子,并快
新方法提升農獸藥殘留篩查效率
? 近日,中國農業科學院蜜蜂研究所(以下簡稱蜜蜂所)蜜粉源植物產地識別與控制團隊基于液相串聯高分辨質譜平臺,開發一種新型集成式數據采集方法,適用于農產品中獸藥、農藥、霉菌毒素等混合污染物的高通量篩查,顯著提升液相串聯高分辨質譜技術在高通量篩查方面的準確性和實用性,為保障我國食品安全提供了一條新的策略
專訪蘇黎世聯邦理工學院Ruedi-Aebersold教授
蘇黎世聯邦理工學院的Ruedi Aebersold團隊一直致力于蛋白質組學的研究,其中包括開發將蛋白質組作為一個完整實體加以研究的相關技術。通過與SCIEX合作,該團隊開發了SWATH? 質譜采集技術,這是一種能夠同時碎裂多種多肽的數據非依賴性采集(DIA) 方法。得到的全面數據集可以通過回溯進
新品前瞻|突破800Hz極速邊界!SCIEX新一代ZT-Scan-DIA全景質譜采集技術詳解
延續經典,超越期待!全新一代SCIEX質譜系統即將重磅亮相,標志性ZT Scan DIA采集技術也將再度進化——突破每秒800Hz超高速掃描速度,結合新一代智能觸發邏輯,將復雜樣本的深度覆蓋與數據完整性推向全新高度! 01 ZT Scan DIA介紹 ZT Scan DIA的核心創新在于通
GCMS數據采集
有機混合物樣品用微量注射器由色譜儀進樣口注入,經色譜柱分離后進入質譜儀離子原在離子源被電離成離子。離子經質量分析器,檢測器之后即成為質譜儀信號并輸入計算機。樣品由色譜柱不斷流入離子源,離子由離子源不斷進入分析器并不斷得到質譜,只要沒定好分析器掃描的質量范圍和掃描時間,計算機就可以采集到一個個的質譜。
GCMS數據采集
有機混合物樣品用微量注射器由色譜儀進樣口注入,經色譜柱分離后進入質譜儀離子原在離子源被電離成離子。離子經質量分析器,檢測器之后即成為質譜儀信號并輸入計算機。樣品由色譜柱不斷流入離子源,離子由離子源不斷進入分析器并不斷得到質譜,只要設定好分析器掃描的質量范圍和掃描時間,計算機就可以采集到一個個的質
GCMS數據采集
有機混合物樣品用微量注射器由色譜儀進樣口注入,經色譜柱分離后進入質譜儀離子原在離子源被電離成離子。離子經質量分析器,檢測器之后即成為質譜儀信號并輸入計算機。樣品由色譜柱不斷流入離子源,離子由離子源不斷進入分析器并不斷得到質譜,只要沒定好分析器掃描的質量范圍和掃描時間,計算機就可以采集到一個個的質譜。