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  • 創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(三)

    對10 條肽段的分析結果匯總(表1),結果表明,3 種DIA 方法在fg ~ pg 數量級肽段范圍內均顯示出良好的線性、重現性和靈敏度。3 種方法的最低定量限均達到amol 級,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限達14 amol,超越了常規SRM 和PRM 的定量水平。比較3 種方法可以看出,DIA與WiSIM-DIA 結果差異不大,證明了基于高分辨的二級定量和基于超高分辨的一級定量選擇性相當,均能有效排除基質和共流出肽段的干擾,定量能力出色。兩種方法又各有特點,形成優勢互補:DIA 通過四極桿和Orbitrap 兩級篩選,能有效分析極復雜的樣品;WiSIM-DIA 使用母離子定量,避免了碎裂過程中的損失,在相對簡單的基質中靈敏度更高。 表1 3種數據非依賴性采集的線性范圍、重現性、靈敏度Table 1 Linearity, reproducibility and s......閱讀全文

    創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(三)

    對10 條肽段的分析結果匯總(表1),結果表明,3 種DIA 方法在fg ~ pg 數量級肽段范圍內均顯示出良好的線性、重現性和靈敏度。3 種方法的最低定量限均達到amol 級,其中肽段GEEMEEMVQSAR在DIA 中最低定量限達14 amol,超越了常規SRM 和PRM 的定量水平。比

    創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(一)

    創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質的定量分析摘要 數據非依賴性采集(DIA)是隨著定量蛋白質組學而建立的質譜掃描技術。DIA 能夠獲得掃描范圍內所有母離子及二級子離子信息,不會造成低豐度離子信息的丟失,同時突破了高分辨質譜二級定量的通量限制。本研究基于靜電場軌道阱Q-qIT-OT 三

    創新數據非依賴性采集用于復雜基質目標蛋白質...(二)

    肽段納流液相分離的出峰時間一般在30 s 以上,因此在合適的循環時間內,3 種DIA 方法可以根據樣本復雜程度靈活調節質量范圍、分辨率、選擇窗口等參數,達到最佳分析效果。例如,分析分子量較大的肽段時,質量范圍可以調整為m / z 400 ~1200 或更寬。??圖1 基于Q-qIT-OT 的

    SCIEX發布全新數據非依賴性采集技術—Zeno-SWATH-DIA

    弗雷明翰市,美國馬薩諸塞州——作為生命科學分析技術創新者,SCIEX在2022年美國質譜年會(ASMS) 期間正式發布Zeno??SWATH??數據非依賴性采集(Zeno SWATH DIA)技術,標志著其在生物標志物發現及轉化應用中又向前邁進了重要一步。  Zeno SWATH DIA實現了高保真

    數據非依賴采集DIA-解決方案(三)

    ?圖 9. 三步完成 DIA 方法編輯?典型 DIA 數據如圖 10 所示,從色譜圖上看 DIA 數據與傳統 Shotgun 數據沒有明顯區別,只是每個循環的二級譜圖數量固定,因此掃描點分布均勻。?圖 10. 典型的 DIA 數據?圖 11. 四步完成 msxDIA 方法編輯?2. msxDIAOr

    用于復雜基質殘留分析時選擇離子掃描程序的建立

    單四極氣相色譜質譜(DSQ)用于復雜基質中殘留分析時選擇離子掃描程序的建立 食品中農藥殘留物的分析方法,已有較多報道。但大多數樣品是干擾較少的品種。但對于復雜的谷物類,動物源類樣品,需要精心設計檢測方法。該文使用Thermo的DSQ氣質聯用儀,詳細描述了建立選擇離子程序的過程,選擇最能代表目標化合

    出色靈敏度提升復雜基質中目標肽段定量能力(一)

    前言生物標志物的研究包括發現(Discovery),驗證(Verification),確認(Validation) 階段, 最后進入臨床檢驗(Clinical Utilization)等更深入的階段。在研究生物標志物的過程中,主要的挑戰在于如何在成分復雜的生物樣品中發現中等豐度或低豐度的蛋白

    出色靈敏度提升復雜基質中目標肽段定量能力(二)

    高效液相色譜分離高效液相色譜儀: Thermo Scientific EASY-nLC 1000預柱:Dionex PepMap C18 色譜柱(2cm, ID75μm, 3μm)分析柱:Dionex PepMap C18 色譜柱(15cm, ID75μm, 3μm)流動相:A,含0.1% 甲酸的

    數據非依賴采集DIA-解決方案(五)

    九、相關產品Q Exactive 系列 Orbitrap 超高分辨質譜儀(Q Exactive、Q Exactive Plus 和 Q Exactive HF)?UltiMate ? 3000 RSLCnano 納升超高效液相色譜儀?Orbitrap Fusion“三合一”系列 Orbitrap 超

    數據非依賴采集DIA-解決方案(四)

    Skyline 軟件Skyline 軟件是華盛頓大學 MacCoss 教授實驗室開發的目標蛋白質組學分析軟件(https://skyline.gs.washington.edu),是 DIA/SWATH 數據處理的權威工具,由于功能全面、性能強大而受到普遍認可,是目前使用最廣泛的 DIA/S

    數據非依賴采集DIA-解決方案(二)

    二、特點與優勢?數據非依賴采集(DIA):? 采集所有離子及碎片譜圖,不丟失任何信息,重現性好;? 數據易于追溯,即使目前的水平無法發現某些蛋白/ 化合物,未來可以回溯;? 無需優化方法,對于易降解樣品可以即刻采集,獲得數據后再深入挖掘;? 基于碎片離子(即母子離子對)定量,選擇性好,與 SRM/M

    數據非依賴采集DIA-解決方案(一)

    一、數據非依賴采集(DIA)隨著生命科學的快速發展,蛋白質組學的關注焦點和研究趨勢已經逐漸從定性轉向定量。定量蛋白質組學是對細胞、組織乃至完整生物體的蛋白質表達量及差異進行分析,對于生物過程機理的探索和臨床診斷標志物的發現與驗證具有重要意義。基于靜電場軌道阱 Orbitrap 的數據非依賴采集(Da

    基質輔助激光解析儀高速數據采集系統設計和實現

    生物安全是指生物性的傳染媒介通過直接感染或間接破壞環境而導致對人類、動物或植物的直接或潛在的威脅。通過研究發現,傳染媒介大部分是由微生物引起的。由于微生物種類繁多,且容易發生突變,在面對突發生物安全事件時,需要迅速確定微生物的種類及來源,才能夠采取有效措施抑制傳染媒介的擴散和發展,因此安全、可靠、快

    Thermo-Fisher-Scientific和Biognosys推出非相關數據采集(DIA)

      分析測試百科網訊 在2017年6月4日-8日舉行的ASMS 2017上,世界科學服務領先供應商賽默飛世爾科技公司宣布與下一代蛋白質組學領導者Biognosys AG達成共同營銷協議,為數據庫的創建和數據處理研究,通過組合使用Orbitrap質譜儀和Spectronaut Pulsar軟件,為非相

    定量蛋白質組學質譜采集技術進展(一)

    摘要 質譜是定量蛋白組學的主要工具。近年來隨著定量蛋白質組學研究的深入,傳統質譜定量技術面臨著復雜基質干擾、分析通量限制等諸多問題。而最近一系列質譜新技術的發展,包括同步母離子選擇(SPS)、質量虧損標記、平行反應監測(PRM)、多重累積(MSX)和多種全新數據非依賴性采集(DIA)等,為解決目前蛋

    復雜基體中目標肽的測定

    本文介紹了使用Thermo Scientific公司的TSQ Quantum Ultra質譜儀進行復雜生物機體中目標肽的方法,結果表明,基于串連質譜的選擇反應監測(SRM)流程,該方法可以在具有高化合物背景的復雜基體中檢測低濃度水平肽,同時保證良好的定量準確度和精密度。 目前一般生物標

    定量蛋白質組學質譜采集技術進展(三)

    然而PRM 的分析通量不如SRM。PRM 能同時監測最多10 ~15 個母離子,而SRM 能同時監測上百個離子對,因為高分辨質譜的有效掃描速度通常只有10 ~15 Hz,遠慢于SRM 的有效掃描速度。但是這一問題正逐步得到解決,多重累積(Multiplexing, MSX)技術的發展和使用有

    工業創新智能數據采集器應用解決方案

    智能數據采集器SKA-A1 ?一.產品介紹1.?產品概述?智能數據采集器SKA-A1 采用全工業化硬件設計,適用于戶外多變復雜的工作環境。采集器可直連運營商網絡信號,幫助用戶節省布線成本,免除大規模施工煩惱。同時,儀器還設計了GPS和GPRS傳輸方式,一路開關量輸出,可滿足用戶對終端設備實時、動態監

    許國旺:復雜食品基質中獸藥及代謝物非靶向篩查新策略

      近日,大連化物所高分辨分離分析及代謝組學研究組(1808組)許國旺研究員團隊在食品中風險物質非靶向篩查技術研究方面取得新進展,通過系統研究獸藥及其相應代謝物的質譜碎裂特征,構建了復雜食品基質中獸藥及其代謝物的非靶向篩查策略,可為食品中風險物的發現提供重要的技術手段。  食品安全關系國計民生,不斷

    非貼壁依賴性細胞的概念

    不需要貼附到固體介質上才能生存和生長的細胞。大多數動物細胞在培養時,皆需貼壁。從形態上,貼壁依賴性細胞又常分為成纖維細胞和上皮樣細胞等。

    什么是胸腺非依賴性抗原?

    胸腺非依賴性抗原(TI-Ag)是指刺激B細胞產生抗體時不需要Th細胞輔助的抗原。可分為TI-1抗原和TI-2抗原,如細菌脂多糖,聚合鞭毛素。

    成都生物所成功開發用于非目標型篩查的軟件平臺

      食品安全是社會公共安全的重要環節,近年來,食品安全事件中出現的危害物種類逐年增加,從三聚氰胺毒奶粉和蘇丹紅事件,到各種添加劑的使用、農藥殘留、瘦肉精濫用、轉基因作物的種植與安全、塑化劑和地溝油事件,無論深度和廣度,涉及的危害物已不拘泥于食品添加劑和農獸藥殘留物質。   食品危害物種類繁多,如何

    數據采集器

      數據采集器(Bar code Hand Terminal),又稱盤點機、掌上電腦。它是將條碼掃描裝置與數據終端一體化,帶有電池可離線操作的終端電腦設備。具備實時采集、自動存儲、即時顯示、即時反饋、自動處理、自動傳輸功能。為現場數據的真實性、有效性、實時性、可用性提供了保證。其具有一體性、機動性、

    線性離子阱質譜儀在應用上主要分為以下五點

     線性離子阱質譜儀是高通量分析的工具。結合多種解離技術,包括脈沖碰撞解離(PQD)和電子轉移解離(ETD),LTQ XL提供豐富的結構信息。廣泛應用于蛋白質組學、代謝物鑒定、藥物研發定量分析、法醫和臨床分析等領域。?  線性離子阱質譜儀功能簡介:  1、可升級的電子轉移裂解(ETD)模塊可以提供傳統

    SCIEX發布多領域應用的尖端SWATH非數據依賴型采集技術

    ——SCIEX 發布用于食品、法醫和環境樣品綜合分析的尖端 SWATH 非數據依賴型采集技術SCIEX TripleTOF? 系統搭配 SWATH? 采集技術提供的強大功能實現了工業化蛋白質組學,這一模式現在有望在其他應用領域掀起類似變革  馬薩諸塞州弗雷明翰(2017 年 6 月1 日)行業領先的

    非貼壁依賴性細胞的應用特點

    細胞培養過程添加的血清中會含有貼壁因子,細胞就是靠這些貼壁因子而貼壁生長的,一般的,細胞都會貼壁生長,但是經過無血清馴化后的細胞,會從貼壁生長轉到懸浮生長,目前在生物工程制藥領域,趨勢是使用無血清的懸浮培養為主。細胞不貼壁一樣可以生長。

    T細胞非依賴性激活過程

    在沒有T細胞幫助的情況下激活B細胞的抗原被稱為T細胞非依賴性(TI)抗原,包括外來多糖和未甲基化的CpG DNA 。它們能夠在缺乏T細胞的生物體中誘導體液反應。B細胞對這些抗原的反應是快速的,盡管所產生的抗體傾向于具有比T細胞依賴性激活所產生的抗體更低的親和力和更少的功能。[7]與TD抗原一樣,被T

    專訪蘇黎世聯邦理工學院Ruedi-Aebersold教授

      蘇黎世聯邦理工學院的Ruedi Aebersold團隊一直致力于蛋白質組學的研究,其中包括開發將蛋白質組作為一個完整實體加以研究的相關技術。通過與SCIEX合作,該團隊開發了SWATH? 質譜采集技術,這是一種能夠同時碎裂多種多肽的數據非依賴性采集(DIA) 方法。得到的全面數據集可以通過回溯進

    GCMS數據采集

    有機混合物樣品用微量注射器由色譜儀進樣口注入,經色譜柱分離后進入質譜儀離子原在離子源被電離成離子。離子經質量分析器,檢測器之后即成為質譜儀信號并輸入計算機。樣品由色譜柱不斷流入離子源,離子由離子源不斷進入分析器并不斷得到質譜,只要沒定好分析器掃描的質量范圍和掃描時間,計算機就可以采集到一個個的質譜。

    GCMS數據采集

      有機混合物樣品用微量注射器由色譜儀進樣口注入,經色譜柱分離后進入質譜儀離子原在離子源被電離成離子。離子經質量分析器,檢測器之后即成為質譜儀信號并輸入計算機。樣品由色譜柱不斷流入離子源,離子由離子源不斷進入分析器并不斷得到質譜,只要設定好分析器掃描的質量范圍和掃描時間,計算機就可以采集到一個個的質

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