Cell發布表觀遺傳重要成果
為了將兩米長的DNA分子裝入到只有幾千分之一毫米大小的細胞核中,DNA長片段必須強力地緊密壓縮。表觀遺傳學標記維持著這些稱作異染色體的部分。來自馬克思普朗克免疫生物學和表觀遺傳學研究所的科學家們現在進一步發現了異染色質形成必需的兩種機制。相關論文發布在近期的《細胞》(Cell)雜志上。 由Thomas Jenuwein領導的研究小組揭示了兩種新酶Prdm3和Prdm16將甲基團添加到了DNA的一種特異包裝蛋白上。這些表觀遺傳學標記確保了異染色質維持完整。此外,在進一步的研究中他們確定了結合在異染色質中,抑制非編碼RNA輸出信號的轉錄因子。與稱作常染色質不太緊密壓縮的區域轉錄因子積聚在特異的位點相反,異染色質中轉錄因子的結合位點更多的是隨機分布。 染色質是由DNA分子和包括組蛋白的大量蛋白質組成。與包含大多數基因的易于接近的常染色質相反,緊密壓縮的異染色質大多數是由能夠形成非編碼RNA分子的重復序列組成。 ......閱讀全文
Cell發布表觀遺傳重要成果
為了將兩米長的DNA分子裝入到只有幾千分之一毫米大小的細胞核中,DNA長片段必須強力地緊密壓縮。表觀遺傳學標記維持著這些稱作異染色體的部分。來自馬克思普朗克免疫生物學和表觀遺傳學研究所的科學家們現在進一步發現了異染色質形成必需的兩種機制。相關論文發布在近期的《細胞》(Cell)雜志上。 由
Nature-表觀遺傳學進展將遺傳學、環境與疾病聯系了起來!
21世紀,表觀遺傳學的研究得到了快速發展,同時其產生了讓研究人員感興趣和憧憬的東西,當然了,這其中也存在一些大肆宣傳的成分,本文中,我們回顧了表觀遺傳學在過去幾十年里是如何演變的,同時分析了近年來改變科學家們對生物學理解的一些研究進展;我們討論了表觀遺傳學和DNA序列改變之間的相互作用,以及表觀
免疫系統和表觀遺傳學調控:一個新的前沿領域
? ?表觀遺傳學(epigenetics)研究轉錄前基因在染色質水平的結構修飾對基因功能的影響,這種修飾可通過細胞分裂和增值周期進行傳遞。表觀遺傳學已成為生命科學中普遍關注的前沿,在功能基因組時代尤其如此。免疫系統被認為是一個解析表觀遺傳學調控機制的良好模型,而且免疫細胞伯分化及功能表達和表觀遺
新的基因編輯領域突破口——表觀遺傳調控(一)
幾十年來,DNA一直被認為是決定生命遺傳信息的核心物質,但是近些年不斷的研究表明,生命遺傳信息從來就不是基因所能完全決定的,比如科學家們發現,可以在不影響DNA序列的情況下改變基因組的修飾,這種改變不僅影響個體的發育,而且還可遺傳給后代。如腫瘤等多種疾病并非僅由基因突變而引起,且與DNA和組蛋白修飾
關于基因表達的轉錄調控介紹
基因表達的轉錄調控可分為三種主要途徑:1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用);2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用,3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。 通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白
基因表達的轉錄調控的介紹
可分為三種主要途徑: 1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用); 2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用; 3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。 通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合
表觀遺傳學修飾
組蛋白修飾 表觀遺傳學是指表觀遺傳學改變 (DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼 RNA 如 miRNA) 對 表觀基因組基因表達的調節,這種調節不依賴基因序列的改變且可遺傳表觀。因素如 DNA 甲基化、組蛋白修飾和 miRNA 是對環境刺激因素變化的反映,這些表觀遺傳學因素相互作用以調節基因
山東大學Cellstemcell干細胞研究新成果
來自山東大學醫學院和密歇根大學的研究人員發表了題為“The Histone Acetyltransferase MOF Is a Key Regulator of the Embryonic Stem Cell Core Transcriptional Network”的研究論文,證實組
ChIPChip技術的介紹與應用
人類基因組計劃的完成開啟了一個新的紀元——功能基因組時代來臨,與基因信息相比較,人們更關注于基因的功能、調控網絡與信號通路等信息。表觀遺傳學研究與核內蛋白因子的功能分析成為基因表達調控研究的重要組成部分。結合了染色質免疫共沉淀與基因芯片技術的ChIP-chip技術的浮現使得全基因組范圍內DNA與蛋白
清華Nature子刊發表表觀遺傳學新成果
生物通報道:高等生物的基因組DNA圍繞著由四種組蛋白組成的八聚體,形成碟狀的核小體結構。基因組DNA以這樣的形式包裝成為染色質,使DNA受到良好的保護。通過“讀取”模塊識別組蛋白共價修飾是表觀遺傳學調控的一個主要機制。 最近人們發現了多種組蛋白賴氨酸酰化,比如巴豆酰化(Kcr)、丁酰化(Kbu
上海巴斯德所等揭示長鏈非編碼RNA調控HIV復制新機制
2月21日,國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)在線發表了中國科學院上海巴斯德研究所王建華課題組的研究論文“Long noncoding RNA MALAT1 releases epigenetic silencing of HIV-1 replication
解讀重要表觀調控因子:保護端粒的非編碼RNAs
在2008年,西班牙國家癌癥研究中心(CNIO)的Maria A. Blasco博士領導的端粒和端粒酶研究組是世上首個發現TERRAs的團隊。這是一段非編碼端粒RNAs,屬于染色質端粒的一部分。從那時起,該團隊就致力于研究這些序列有什么作用。 最近他們在《Nature Communicatio
基因表達的調控
轉錄調控可分為三種主要途徑:1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用);2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用,3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合位點,具有調
基因表達的調控模式介紹
轉錄調控可分為三種主要途徑:1)遺傳調控(轉錄因子與靶標基因的直接相互作用);2)調控轉錄因子與轉錄機制相互作用,3)表觀遺傳調控(影響轉錄的DNA結構的非序列變化)。通過轉錄因子直接調控靶標DNA表達是最簡單和最直接的轉錄調控改變轉錄水平的方法。基因的編碼區周圍通常都具有幾個蛋白質結合位點,具有調
曹雪濤發Nature綜述:抗感染固有免疫反應的表觀遺傳調控
曹雪濤院士全面闡述了近年來關于表觀遺傳調控因子在感染誘導的天然免疫和炎癥反應中的調控作用的代表性研究成果。 表觀遺傳學立足于染色質層面,涉及DNA、非編碼RNA和組蛋白等染色質相關分子的調控,為近年來世界生命科學前沿的熱點領域。其研究生命體分化發育過程中,在基因組不變的情況下,產生表型和功能各
新的基因編輯領域突破口—表觀遺傳調控
幾十年來,DNA一直被認為是決定生命遺傳信息的核心物質,但是近些年不斷的研究表明,生命遺傳信息從來就不是基因所能完全決定的,比如科學家們發現,可以在不影響DNA序列的情況下改變基因組的修飾,這種改變不僅影響個體的發育,而且還可遺傳給后代。如腫瘤等多種疾病并非僅由基因突變而引起,且與DNA和組蛋白
染色質,解鎖癌癥表觀遺傳學的鑰匙
表觀遺傳學指基因序列不變化的前提下,基因表達發生了可遺傳的變化,包括DNA甲基化、染色質改型、基因沉默、RNA編輯、組蛋白修飾(甲基化、乙酰化、磷酸化等)等。其中,染色質改型調控基因表達的過程,涉及多種導致DNA和組蛋白組成變化、染色質構象變化的蛋白質。 眾多研究已經證明,染色體畸變和染色質異
組蛋白的簡介
組蛋白(histone)是指所有真核生物的細胞核中,與DNA結合存在的堿性蛋白質的總稱。其分子量約10000~20000。 真核生物體細胞染色質中的堿性蛋白質,含精氨酸和賴氨酸等堿性氨基酸特別多,二者加起來約為所有氨基酸殘基的1/4。組蛋白與帶負電荷的雙螺旋DNA結合成DNA-組蛋白復合物。因
清華大學Cell子刊發表表觀遺傳學新成果
組蛋白修飾和DNA甲基化是重要的表觀遺傳學修飾,決定著基因組的表觀遺傳學景觀。組蛋白修飾和DNA甲基化能共同起作用調控基因的表達,但人們并不清楚它們在作用機制和功能上的具體關聯。 清華大學和洛克菲勒大學的研究團隊發現,改變DNA甲基轉移酶的組蛋白識別區域會影響表觀遺傳學景觀和小鼠的胚胎干細胞。
染色質蛋白非組蛋白的介紹
非組蛋白主要是指與特異DNA序列相結合的蛋白質,所以又稱序列特異性DNA結合蛋白(sequence specific DNA binding protein)。利用凝膠延滯實驗(gel retardation assay),可以在細胞抽提物中進行檢測。首先制備一段帶有放射性標記的已知特異序列的D
ChIP實驗的三大法寶
在基因調控領域,可以說沒有比表觀遺傳學更熱的話題了。而染色質免疫共沉淀ChIP是表觀遺傳學研究中最常用的方法。? ChIP通過針對染色質相關蛋白(組蛋白、轉錄因子等)的抗體,來鑒定與該蛋白(或蛋白修飾)相連的序列。這種方式能夠幫助人們定位基因組中發生的表觀遺傳學改變。舉例來說,針對H3K4me3(賴
解讀“生命之書”--新發現填補人類基因組圖譜空白
美國加州大學圣地亞哥分校(UCSD)的研究人員制作了一份人類基因組的單細胞染色質圖譜,確定了240種多基因特征和與疾病特征相關的細胞類型,并注釋了非編碼DNA變異的風險,有利于更好地理解遺傳學與疾病之間的聯系。這一發現發表在12日的《細胞》雜志在線版上。 此前,科學家在公布最新的被稱為“生命之
專家指南:如何研究基因調控(一)
隨著基因組學研究的深入,人們已經不再滿足于了解基因的功能,而是對基因調控表現出愈加濃厚的興趣。現在,我們知道,DNA甲基化和組蛋白修飾可調控基因,microRNA和非編碼RNA也可以。基因調控的研究工具也越來越多,包括RNA-seq、ChIP-seq、ChIP-chip等。究竟該采用哪種方法來測定m
分子遺傳學詞匯?轉錄因子
真核生物轉錄起始過程十分復雜,往往需要多種蛋白因子的協助,轉錄因子與RNA聚合酶Ⅱ形成轉錄起始復合體,共同參與轉錄起始的過程。根據轉錄因子的作用特點可分為二類;第一類為普遍轉錄因子,它們與RNA聚合酶Ⅱ共同組成轉錄起始復合體時,轉錄才能在正確的位置開始。除TFⅡD以外,還發現TFⅡA,TFⅡB,TF
操縱組蛋白H3.3或可抹除細胞“記憶”
取出一個成熟細胞并移除其身份,從而使其可成為任何種類細胞——核重組,在修復受損組織及在化療后替換骨髓等領域具有廣闊前景。2012年諾貝爾醫學獎得主約翰·格登博士最新發表在《表觀遺傳學和染色質研究》雜志上的論文表明,由Hira蛋白存儲的組蛋白H3.3,是將細胞核恢復多能性,即發展成為多種細胞類型的
操縱組蛋白H3.3或可抹除細胞“記憶
取出一個成熟細胞并移除其身份,從而使其可成為任何種類細胞――核重組,在修復受損組織及在化療后替換骨髓等領域具有廣闊前景。2012年諾貝爾醫學獎得主約翰?格登博士最新發表在《表觀遺傳學和染色質研究》雜志上的論文表明,由Hira蛋白存儲的組蛋白H3.3,是將細胞核恢復多能性,即發展成為多種細胞類型的
操縱組蛋白H3.3的路徑為多能細胞提供一種新方法
取出一個成熟細胞并移除其身份,從而使其可成為任何種類細胞——核重組,在修復受損組織及在化療后替換骨髓等領域具有廣闊前景。2012年諾貝爾醫學獎得主約翰·格登博士最新發表在《表觀遺傳學和染色質研究》雜志上的論文表明,由Hira蛋白存儲的組蛋白H3.3,是將細胞核恢復多能性,即發展成為多種細胞類型的
研究發現染色質裝配因子1具有重要表觀遺傳調控作用
中國科學院生物物理研究所焦仁杰研究員課題組最新研究發現,染色質裝配因子 1(chromatin assembly factor 1, CAF-1)對異染色質區域的基因表達發揮十分重要的表觀遺傳調控作用。他們的成果已被細胞生物學研究領域的專業期刊J. Cell Sci.接受發表。
簡述染色質蛋白非組蛋白的特性
①酸堿性:組蛋白是堿性的,而非組蛋白則大多是酸性的。 ②多樣性:非組蛋白占染色質蛋白的60%~70%,不同組織細胞中其種類和數量都不相同,代謝周轉快。包括多種參與核酸代謝與修飾的酶類如DNA聚合酶和RNA聚合酶、HGM蛋白(high mobility group protein)、染色體支架蛋
染色質非組蛋白鋅指模式簡介
負責 5S RNA、tRNA 和部分 snRNA 基因轉錄的RNA聚合酶Ⅲ所必須的轉錄因子。TFⅢ A 是首先被發現的鋅指蛋白,由344個氨基酸組成。TFⅢ A 含有9個有規律的鋅指重復單位,每個單位30個氨基酸殘基,其中一對半胱氨酸和一對組氨酸與Zn2+形成配位鍵。每個鋅指單位是一個DNA結合