RNA干擾的發現與研究
RNAi是在研究秀麗新小桿線蟲(C. elegans)反義RNA(antisense RNA)的過程中發現的,由dsRNA介導的同源RNA降解過程。1995年,Guo等發現注射正義RNA(sense RNA)和反義RNA均能有效并特異性地抑制秀麗新小桿線蟲par-1基因的表達,該結果不能使用反義RNA技術的理論做出合理解釋。直到1998年,Fire等證實Guo等發現的正義RNA抑制同源基因表達的現象是由于體外轉錄制備的RNA中污染了微量dsRNA而引發,并將這一現象命名為RNAi。此后dsRNA介導的RNAi現象陸續發現于真菌、果蠅、擬南芥、錐蟲、水螅、渦蟲、斑馬魚等多種真核生物中,并逐漸證實植物中的轉錄后基因沉默(posttranscriptional gene silencing,PTGS)、共抑制(cosuppression)及RNA介導的病毒抗性、真菌的抑制(quelling)現象均屬于RNAi在不同物種的表現形式。19......閱讀全文
RNA干擾回復實驗
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA干擾主體實驗
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
RNA干擾回復實驗
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA干擾主體實驗
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
RNA干擾實驗技術
實驗概要本文介紹了RNA干擾的原理及基本實驗方法,包括了siRNA的設計、siRNA的制備和siRNA的轉染等方法,及RNA干擾實驗中的注意事項。實驗原理近年來的研究表明,將與mRNA對應的正義RNA和反義RNA組成的雙鏈RNA(dsRNA)導入細胞,可以使mRNA發生特異性的降解,導致其相應的基因
RNA干擾相關知識RNARISC
RNA-induced silencing complex(RISC):一種RNA-蛋白質復合物,通過與目標mRNA完全或者部分的互補配對來實施切割或者翻譯抑制功能。SiRNA組裝siRISC,miRNA組裝miRISC。RISCs(無論siRISC還是miRISC)包括兩種類型:切割型和不切割型。
RNA干擾相關知識RNARITS)
RNA-induced initiation of transcriptional gene silencing(RITS):是一種組織染色質變型的復合物。RITS復合物也包含Dicer加工形成的siRNA和AGO蛋白質,通過結合到異染色質的基因池上來促使異染色質上基因的沉默。
反義技術——RNA干擾(RNA-interference,RNAi)
最近由于RNA干擾(RNA interference,RNAi)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在RNAi領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA干擾是由長的雙鏈 RNA
倚天屠龍,誰與爭鋒——且看基因敲除與RNA干擾的關系
研究歷史 20世紀80年代初,胚胎干細胞分離和體外培養的成功為基因敲除奠定了技術基礎。1985年,首次證實的哺乳動物細胞中同源重組(homology recombination, HR)的存在為基因敲除奠定了理論基礎[2]。為了編輯基因,傳統的靶向特定等位基因的同源重組技術被使用,但是,這
過表達質粒與RNA干擾質粒有什么不同
本質上是一樣的,都是讓外源性的基因序列在細胞內得到表達。但是由于目的不同,技術細節上也會有不同。過表達的質粒如果是一過性表達,不需要整合到細胞染色體組,只要有強的啟動子就可以了。穩定表達的,需要有篩選基因的表達來選出整合的細胞。而干擾質粒一般都需要是穩定的表達,現在都是通過慢病毒來實現,質粒基本都棄
RNA干擾技術的作用機制
病毒基因、人工轉入基因、轉座子等外源性基因隨機整合到宿主細胞基因組內,并利用宿主細胞進行轉錄時,常產生一些dsRNA。宿主細胞對這些dsRNA迅即產生反應,其胞質中的核酸內切酶Dicer將dsRNA切割成多個具有特定長度和結構的小片段RNA(大約21~23 bp),即siRNA。siRNA在細胞內R
RNA干擾的主要特點
1.高效性:Elbashir等在研究中發現分別為25 nmol/L與100 nmol/L的起始雙鏈RNA產生的結果是一樣的,只是高濃度起始的更有效些。將雙鏈RNA濃度降低到1.5 nmol/L時產生的基因沉默效果變化不大,只有當濃度降低到0.05 nmol/L時,沉默的效果才消失。Holen等也證實
產生RNA干擾RANi-的方法
4 產生RANi 的方法產生RANi 的方法主要有體外合成和體內合成siRNA 法。將siRNA 導入細胞的方法又分為微量注射法、電穿孔法、浸泡法、工程菌喂養法、轉基因法和病毒感染法等。Harborth 等[14 ]設計體外合成21nt siRNA 的方法是:在基因庫中尋找靶向基因的mRNA 序列,
RNA干擾的詳細實驗步驟
步驟包括:(一)siRNA的設計1. 在設計RNAi實驗時,可以先在以下網站進行目標序列的篩選:GenesilAmbion2. RNAi目標序列的選取原則:(1)從轉錄本(mRNA)的AUG起始密碼開始,尋找“AA”二連序列,并記下其3'端的19個堿基序列,作為潛在的siRNA靶位點。有研究
RNA干擾RNAi的生物特性
RNAi抑制轉座子活性兩方面的證據提示轉座子活性的抑制與siRNA有關① 發現蠕蟲mut-7 基因參與RNAi 并且與轉座子的轉座抑制有關;② 在果蠅中,參與RNAi 的RNA 解螺旋酶Spindle-E 的突變將導致該基因引起的基因沉默的缺失,同時提高了反轉錄轉座子活性。RNAi抵御病毒感染在擬南
簡述RNA干擾效率的檢測
一般應該從mRNA水平、蛋白質水平、細胞表型水平三個層次來檢測干擾效率。 mRNA水平:RT-PCR、Real-time PCR;蛋白質水平:Western-blot、ELISA、免疫組化;細胞表型水平:MTT、克隆形成實驗、流式細胞檢測、細胞小室實驗等。RNA干擾效率在動物模型上的進一步驗證
RNAi(RNA干擾)的分子機制
通過生化和遺傳學研究表明,RNA干擾包括起始階段和效應階段(inititation and effector steps)。在起始階段,加入的小分子RNA被切割為21-23核苷酸長的小分子干擾RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。證據表明;一個稱為Dic
關于小干擾RNA的簡介
小干擾RNA(siRNA),有時稱為短干擾RNA或沉默RNA,是一類雙鏈RNA分子,長度為20-25個堿基對,類似于miRNA,并且在RNA干擾(RNAi)途徑內操作。它干擾了表達與互補的核苷酸序列的特定基因的轉錄后降解的mRNA,從而防止翻譯。 siRNA由雙鏈RNA (double str
RNA干擾相關知識Small-interfering-RNA(siRNA)
Small interfering RNA(siRNA):是一種小RNA分子(~21-25核苷酸),由Dicer(RNAase Ⅲ家族中對雙鏈RNA具有特異性的酶)加工而成。SiRNA是siRISC的主要成員,激發與之互補的目標mRNA的沉默。
RNA干擾相關知識Slicer
Slicer:在切割型RISC中的內切酶的另外一種表述方法。
RNA干擾主體實驗介紹
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
RNA干擾主體實驗介紹
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
RNA干擾相關知識Microprocessor
Microprocessor:一種核內的復合物,主要由Drosha和Pasha兩者組成,在miRNA的生物合成中促使原始的miRNA成為miRNA前體。
RNA干擾主體實驗介紹
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
RNA干擾回復實驗介紹
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA干擾實驗技術介紹
通過生化和遺傳學研究表明,RNA干擾包括起始階段和效應階段(inititation and effector steps)。在起始階段,加入的小分子RNA被切割為21-23核苷酸長的小分子干擾RNA片段(small interfering RNAs, siRNAs)。證據表明;一個稱為Dicer
細胞化學詞匯RNA干擾
中文名稱:RNA干擾外文名稱:RNA interference定?????? 義:RNA干擾(RNA interference,RNAi)是指在進化過程中高度保守的、由雙鏈RNA(double-stranded RNA,dsRNA)誘發的、同源mRNA高效特異性降解的現象。分?????? 類:基因沉
小RNA(tsRNA)的發現與臨床價值
轉移 RNA (tRNA) 衍生的小RNA (tsRNA) 是一種新型的非編碼小 RNA,可通過酶從 tRNA 上切割下來,在轉錄和翻譯水平調節基因表達。tRNA的化學修飾可以直接影響 tsRNA 的產生和生物學功能。tsRNA參與多種疾病的發病機制,包括免疫紊亂、代謝紊亂和惡性腫瘤的發展,并且是各
孟山都CTO談基因編輯、RNA干擾與行業并購影響
Fraley對兩公司的合并持樂觀態度,并認為這是一次積極健康的合并。通過合并,兩者可擴大規模,同時得到更多研發資金,繼續保持育種優勢。 記者:關于基因編輯的問題。之前有報道說孟山都已經在談基因編輯的ZL問題,很多人猜測孟山都很可能已經有基因編輯的產品在研發,或者是將要推出來,能不能介紹一下基因
RNA干擾(RNA-interference,RNAi)基礎知識(1)
Rnai最近由于RNA 干擾(RNA interference,RNA i)的發現使反義領域的研究增多。這種自然發生的現象最早是在秀麗線蟲中發現的(1),是序列特異性地使轉錄后的基因沉默的有力機制。由于最近兩年在 RNA i領域取得的進步,已經有許多這方面的綜述發表(2-4)。RNA 干擾是