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  • 序列特異性引物的概念

    中文名稱序列特異性引物英文名稱sequence specific primer;SSP定 義一種測定基因突變的方法。即利用針對點突變的2個等位特異性寡核苷酸(ASO)引物(A、B標記其中之一)與另一共同引物(C)組成引物系統;在引物延伸時,A與B同時競爭靶序列上同一復性位點,擴增反應后,經凝膠電泳及放射自顯影,膠片上的顯帶是標記同位素的引物所擴增的產物。應用學科免疫學(一級學科),應用免疫(二級學科),免疫學檢測和診斷(三級學科)......閱讀全文

    序列特異性引物的概念

    中文名稱序列特異性引物英文名稱sequence specific primer;SSP定  義一種測定基因突變的方法。即利用針對點突變的2個等位特異性寡核苷酸(ASO)引物(A、B標記其中之一)與另一共同引物(C)組成引物系統;在引物延伸時,A與B同時競爭靶序列上同一復性位點,擴增反應后,經凝膠電泳

    序列特異性引物的概念

    中文名稱序列特異性引物英文名稱sequence specific primer;SSP定  義一種測定基因突變的方法。即利用針對點突變的2個等位特異性寡核苷酸(ASO)引物(A、B標記其中之一)與另一共同引物(C)組成引物系統;在引物延伸時,A與B同時競爭靶序列上同一復性位點,擴增反應后,經凝膠電泳

    序列特異性引物的作用

    序列特異性引物指一種測定基因突變的方法。即利用針對點突變的2個等位特異性寡核苷酸(ASO)引物(A、B標記其中之一)與另一共同引物(C)組成引物系統;在引物延伸時,A與B同時競爭靶序列上同一復性位點,擴增反應后,經凝膠電泳及放射自顯影,膠片上的顯帶是標記同位素的引物所擴增的產物。

    序列特異性引物的定義和技術特點

    序列特異性引物指一種測定基因突變的方法。即利用針對點突變的2個等位特異性寡核苷酸(ASO)引物(A、B標記其中之一)與另一共同引物(C)組成引物系統;在引物延伸時,A與B同時競爭靶序列上同一復性位點,擴增反應后,經凝膠電泳及放射自顯影,膠片上的顯帶是標記同位素的引物所擴增的產物。

    常用的βactin-引物序列

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    常用的βactin-引物序列

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    通用引物和特異性引物的區別

    通用引物,含義為克隆位點兩旁的序列匹配,目的是引擴出DNA片段,主要用來測序。而序列特異性引物指一種測定基因突變的方法。通用引物是一般和載體多克隆位點兩旁的序列匹配,或者是與載體里面的一些啟動、終止元件匹配。這樣不管載體插入什么DNA片段,都可以用通用引物擴出來。通用引物可以用來測序,但是只是“通用

    設計引物用cds序列和cdna序列的區別

    cDNA和mRNA的序列是互補的,如果用兩個引物,最后的兩條DNA序列分別對應于mRNA和cDNA中的一段。由于引物方向從5‘至3’,所以兩個引物對應于mRNA和cDNA中相應序列即可。

    簡述引物的特異性

      引物設計完成以后,應對其進行BLAST檢測。如果與其它基因不具有互補性,就可以進行下一步的實驗了。  值得一提的是,各種模板的引物設計難度不一。有的模板本身條件比較困難,例如GC含量偏高或偏低,導致找不到各種指標都十分合適的引物;用作克隆目的的PCR,因為產物序列相對固定,引物設計的選擇自由度較

    簡并引物的概念

    簡并引物是指代表編碼單個氨基酸所有不同堿基序列可能性引物的混合物。PCR為了增加特異性,可以參考密碼子使用表,根據不同生物的堿基使用偏好,減少簡并性。簡并度越低,產物特異性越強,設計引物時應盡量選擇簡并性小的氨基酸,并避免引物3’末端簡并。

    引物延伸的概念

    中文名稱引物延伸英文名稱primer extension定  義從與模板(RNA或DNA)結合的引物3′-OH端開始,在核酸聚合酶的作用下,按照堿基配對的原則,逐個連上核苷酸,由5′→3′方向合成與模板互補鏈的過程。該反應可用于聚合酶鏈反應、單核苷酸多態性檢測等。應用學科生物化學與分子生物學(一級學

    引物修補的概念

    中文名稱引物修補英文名稱primer repair定  義當DNA模板受損時,可根據其損傷情況,以一套或幾套引物借助核酸聚合酶的作用合成新的互補核酸鏈,以修復損傷形成的錯誤序列的方法。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),方法與技術(二級學科)

    反向引物的概念

    反向引物(下游引物)是沿著正鏈進行延長的。體外擴增DNA,雙螺旋是部分或完全打開的,不存在岡崎片段,也不會一段段延長,理論上正反引物都是不間斷延長的,和體內DNA自我復制是有區別的。

    正向引物的概念

    中文名稱正向引物英文名稱forward primer定  義處于DNA雙鏈上游的引物。如用于測序,則從5′向3′方向讀出DNA正鏈的序列。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),方法與技術(二級學科)

    轉化序列的概念

    中文名稱轉化序列英文名稱transforming sequence定  義起變化作用的基因或序列。應用學科遺傳學(一級學科),發育遺傳學(二級學科)

    核心序列的概念

    中文名稱核心序列英文名稱core sequence定  義重復序列共有的核苷酸序列。應用學科遺傳學(一級學科),分子遺傳學(二級學科)

    同位序列的概念

    同位序列(Homeobox)或稱同源異型盒,是某些影響動物、真菌及植物發育的基因所擁有的一段DNA序列,擁有homeobox的基因稱作homeobox基因,統稱homeobox基因家族。同源異形盒模體在進化中廣泛存在。其重要意義是通過同源異形盒探針與很多真核的基因組進行雜交而獲得。在蛙,小鼠和人的D

    信號序列的概念

    信號序列是引導蛋白質定向轉移的線性序列,通常有16-26個氨基酸殘基,對所引導的蛋白質沒有特異性要求。

    轉化序列的概念

    中文名稱轉化序列英文名稱transforming sequence定  義起變化作用的基因或序列。應用學科遺傳學(一級學科),發育遺傳學(二級學科)

    引物的質量是否跟序列有關?

    四種堿基的性質和各自保護基的性質都有差別。所以合成難度是不一樣的。難度最大的當屬GC重復多的和序列中還有多個連續的G的引物。尤其對于后者,國內公司一般都做不了20個G以上的引物。實驗證明,如果引物中有超過三個連續G的結構,傳統方法得到的產物質量就會開始下降。而且目前通用的脫鹽、OPC和PAGE方法都

    關于引物序列堿基隨機分布的介紹

      引物序列在模板內應當沒有相似性較高,尤其是3’端相似性較高的序列,否則容易導致錯誤引發(False priming)。降低引物與模板相似性的一種方法是,引物中四種堿基的分布最好是隨機的,不要有聚嘌呤或聚嘧啶的存在。尤其3′端不應超過3個連續的G或C,因為這樣會使引物在GC富集序列區錯誤引發。

    如何設計基因cds序列的pcr引物

    提取細胞總RNA然后用試劑盒反轉錄成cDNA,用cDNA作為模板擴增基因的CDS區,然后想要轉染進細胞中。比如MYOD1基因,首先在NCBI找到它的mRNA序列,然后找到它的CDS序列,全部復制下來,在primer5.0中。正向引物直接從CDS的第一個核酸開始(比如18bp),反向引物從CDS最后一

    引物步移的概念

    中文名稱引物步移英文名稱primer walking定  義一種長鏈DNA測序的策略。根據已測出的序列結構設計測序引物,按第一輪測序得出的新序列,再設計引物進行第二輪測序,如此重復,直至獲得全序列。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),方法與技術(二級學科)

    巢式引物的概念

    中文名稱巢式引物英文名稱nested primer定  義為巢式聚合酶鏈反應所設計的引物,第二組引物是在第一組引物擴增得到的產物序列范圍內設計的。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),方法與技術(二級學科)

    如何在NCBI上查找引物序列

    在NCBI中BLAST引物(注意選擇BLAST的數據庫),然后再Blast結果中找尋符合要求的序列。后面會列出很多鏈接,直接就能看到NCBI號 進入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&

    如何在NCBI上查找引物序列

    在NCBI中BLAST引物(注意選擇BLAST的數據庫),然后再Blast結果中找尋符合要求的序列。后面會列出很多鏈接,直接就能看到NCBI號 進入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&

    DNA序列家族的概念

    中文名稱DNA序列家族英文名稱DNA sequence family;sequence family定  義DNA分子變性后可復性形成穩定的堿基配對雙鏈分子的一組序列。序列之間有很高的同源性。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)

    重復[DNA]序列的概念

    中文名稱重復[DNA]序列英文名稱repetitive [DNA] sequence定  義DNA分子中重復出現的核苷酸序列。應用學科遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)

    低度重復序列的概念

    低度重復序列在單倍體基因組中只出現一次或數次,因而復性速度很慢。單拷貝順序在基因組中占50-80%,如人基因組中,大約有60-65%的順序屬于這一類。單拷貝順序中儲存了巨大的遺傳信息,編碼各種不同功能的蛋白質。尚不清楚單拷貝基因的確切數字,但是是有其在單拷貝順序中只有一小部份用來編碼各種蛋白質,其他

    高度重復序列的概念

    高度重復序列是一組基因序列,在基因組中重復頻率高,可達百萬(10^6)以上,因此復性速度很快。在基因組中所占比例隨種屬而異,約占10-60%,在人基因組中約占20%。

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