新探針可實現對蛋白質N端組學深度富集檢測
中國科學院上海藥物研究所研究員黃河、柳紅合作,研究設計合成了一種含有吡啶甲醛片段的可斷裂分子探針2PCA-Probe,可實現對蛋白質N-端的深度富集檢測。相關研究發表于《美國化學會志》。蛋白質水解是一種廣泛存在的翻譯后修飾方式,在多種生物過程中發揮重要作用。在正常組織中,大多數蛋白酶的活性受到嚴格調控,而在腫瘤組織中則往往被異常激活,并通過介導免疫逃逸、腫瘤細胞侵襲等多個途徑促進腫瘤的發生發展。通過對蛋白質N-端進行系統檢測可獲得蛋白水解斷裂信息,但現有的N-端組學檢測方法存在操作復雜、檢測深度不高等缺陷,限制了蛋白水解相關研究的進展。研究團隊發現,吡啶甲醛片段與N-端氨基酸可以選擇性發生環化反應形成咪唑烷酮結構,還可發生羥醛縮合反應,并由此發現該類標記方法生成的新診斷片段。通過該診斷片段信息,可以規避以往此類探針標記時遇到的限制,即無法標記2位氨基酸為脯氨酸的多肽。利用該方法,研究團隊對三對結直腸癌組織和癌旁組織的N-端組進行......閱讀全文
靶向探針精確操縱蛋白質
北京大學化學與分子工程學院教授陳鵬正在實驗中。 作為生物體內含量最多的一類生物大分子,蛋白質是生物功能的主要執行者,在各種生命活動中扮演著關鍵角色。科學家一直在探索適用于活體環境的蛋白質操縱工具,以實現對目標蛋白質結構和功能的深入研究,這已經成為當今化學生物學領域的前沿熱點之一。 在
蛋白質芯片技術探針的制備方法
低密度蛋白質芯片的探針包括特定的抗原、抗體、酶、吸水或疏水物質、結合某些陽離子或陰離子的化學集團、受體和免疫復合物等具有生物活性的蛋白質。制備時常常采用直接點樣法,以避免蛋白質的空間結構改變。保持它和樣品的特異性結合能力。高密度蛋白質芯片一般為基因表達產物,如一個cDNA文庫所產生的幾乎所有蛋白質均
蛋白質的內源熒光與熒光探針
利用熒光光譜法研究蛋白質一般有兩種方法。一是測定蛋白質分子的自身熒光(內源熒光),另一種是當蛋白質本身不能發射熒光時,通過非共價吸附或共價作用向蛋白質分子的特殊部位引入外源熒光(也稱熒光探針),然后測定外源熒光物質的熒光。 ?蛋白質的內源熒光 含有芳香族氨基酸(色氨酸(tryptophan?,Trp
蛋白質的內源性熒光與熒光探針
利用熒光光譜法研究蛋白質一般有兩種方法。一是測定蛋白質分子的自身熒光(內源熒光),另一種是當蛋白質本身不能發射熒光時,通過非共價吸附或共價作用向蛋白質分子的特殊部位引入外源熒光(也稱熒光探針),然后測定外源熒光物質的熒光。 蛋白質的內源熒光 含有芳香族氨基酸(色氨酸(tryptophan
無定形相變蛋白質探針理性設計方案
? ?近日,中國科學院大連化學物理研究所研究員劉宇團隊與樸海龍團隊、山東大學教授劉曉靜合作,通過系統性研究晶體誘導熒光分子結構與熒光之間的構效關系,實現了活細胞內無定型聚集態蛋白質組的靶向識別,為進一步發展此類探針提供了理性設計和改造方案。相關研究成果發表在《德國應用化學》上。 蛋白質的錯誤折疊
李峰團隊發現蛋白質AIE納米點光學探針制備方法
2001年,香港科技大學教授唐本忠團隊發現了一種與傳統聚集淬滅相反的現象,稱為聚集誘導發光(aggregation-induced emission, AIE)現象,其主要原理是由于分子內運動受到限制,導致非輻射衰減渠道被抑制,輻射衰變增強而發光。與傳統的有機染料相比,AIE熒光材料具有抗光漂白
新型蛋白質分子探針-核酸適配體-治療高度惡性肺腺癌
肺癌是發病率與死亡率最高的惡性腫瘤,而肺腺癌是肺癌的主要病理亞型。以EGFR抑制劑為代表的靶向治療及以PD1/PDL1靶向性抗體為代表的免疫治療極大地改善了肺腺癌病人的生存預后。然而,肺腺癌中惡性程度最高、以細胞快速增殖為主要特征的PP(Proximal-Proliferative)分子亞型肺腺
李峰團隊發展新型蛋白質AIE納米點光學探針制備方法
2001年,香港科技大學教授唐本忠團隊發現了一種與傳統聚集淬滅相反的現象,稱為聚集誘導發光(aggregation-induced emission, AIE)現象,其主要原理是由于分子內運動受到限制,導致非輻射衰減渠道被抑制,輻射衰變增強而發光。與傳統的有機染料相比,AIE熒光材料具有抗光漂白
探針臺的高精度探針臺
目前世界出貨量第一的型號吸收了最新的工藝科技例如OTS,QPU和TTG相關技術,這種全新的高精度系統為下一代小型化的設計及多種測試條件提供保證。特性1:OTS-最近的位置對正系統(光學目標對準) OTS通過對照相機相對位置的測量來保證其絕對位置的精度。這是非常引人注目的技術,來源于東京精密的度量技
基因探針基因探針的基本介紹
基因探針基因探針(probe)就是一段與目的基因或DNA互補的特異核苷酸序列,它可以包括整個基因,也可以僅僅是/基因的一部分;可以是DNA本身,也可以是由之轉錄而來的RNA。 1.探針的來源 DNA探針根據其來源有3種:一種來自基因組中有關的基因本身,稱為基因組探針(genomic probe
探針電流
探針電流 ? ? ??? ? 探針電流直接影響到束斑直徑、圖像信號強度、分辨率以及圖像清晰及失真程度等參數,而這些參數間又存在矛盾。電流越大電子束的束斑直徑越小,使分辨率增大,景深也增大。但是信號弱時,亮度有時會顯得不足、信噪比降低。對于一些高分子材料、生物樣品或一些不導電的樣品采用較大的探針電流,
鈣離子熒光探針:比值型熒光探針
前面我們介紹了熒光指示劑法可以將Ca2+檢測的實驗與其他技術結合使用,如可以與流式細胞儀、熒光分光光度計、或者熒光顯微鏡進行聯合檢測 。紫外光型主要包括Quin-2、Indo-1、Fura-2等,數量較少,可見光型數目較多,包括Fluo-3、鈣黃綠素、Rhod-2等。熒光指示劑根據測光原理和數據
探針引物和探針有什么區別
如果你做的事熒光定量PCR,其引物和一般引物在構成上是沒有什么區別的,只是要更加注意引物二聚體、PCR產物大小等問題。染料法不需要其他東西,探針法還需要taqman探針,這個探針的設計是比較有講究的,并且上面有熒光集團和猝滅基團。具體設計,一般使用相關軟件進行。
成探針克服
成探針克服,比如 Alexa Fluor 系列或 Cy 系列染料。這些專門設計的有機分子表現出很窄的發射光譜(與傳統探針相比)、與弧光燈和激光線相匹配的較大的吸收系數、較高的量子產率、降低的光漂白,且熒光發射對環境變量的依賴性較低。此外,這些先進探針的激發光譜線橫跨大約 400nm,從紫外到近紅外
探針合成實驗
實驗材料基因試劑、試劑盒轉錄緩沖液DTTRNA酶抑制劑CTPATPGTPS-UTP乙酸銨乙酸銨乙醇儀器、耗材水浴鍋離心機培養箱烘箱實驗步驟1. ?在一個含SP6、T3或T7啟動子的載體中,插入目的基因。在編碼序列下游酶切使質粒呈線性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以無菌水重溶沉
探針合成實驗
實驗材料 基因試劑、試劑盒 轉錄緩沖液DTTRNA酶抑制劑CTPATPGTPS-UTP乙酸銨乙酸銨乙醇儀器、耗材 水浴鍋離心機培養箱烘箱實驗步驟 1. ?在一個含SP6、T3或T7啟動子的載體中,插入目的基因。在編碼序列下游酶切使質粒呈線性。DNA以酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,70%乙醇洗后晾干。以無菌
核酸探針標記
實驗概要核酸探針根據核酸的性質,可分為DNA和RNA探針;根據是否使用放射性標記物與否,可分為放射性標記探針和非放射性標記探針;根據是否存在互補鏈,可分為單鏈和雙鏈探針;根據放射性標記物摻入情況,可分為均勻標記和末端標記探針。實驗原理分子生物研究中,最常用的探針即為雙鏈DNA探針,它廣泛應用于轉基因
離子探針方法
離子探針方法是將質譜測定技術與離子發射顯微鏡技術相結合的現代儀器分析方法。能提供一般質譜分析所不能提供的試樣微區質譜。由于它能對固體物質作微區、微量及深度成分分析,在某些條件下檢測靈敏度可達ppb數量級,因此被廣泛地應用于半導體、冶金、地質和生物研究等部門。其原理是利用聚焦的高能一次離子束轟擊試樣表
探針臺分類
探針臺從操作上來區分有:手動,半自動,全自動 從功能上來區分有:溫控探針臺,真空探針臺(超低溫探針臺),RF探針臺,LCD平板探針臺,霍爾效應探針臺,表面電阻率探針臺 經濟手動型 根據客戶需求定制 chuck尺寸:4"*4" 6"*6" 8"*8" 12"*12" (可選) X-Y移動
探針合成實驗
基本方案 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 基因 試劑、試劑盒
Alexa-Fluor-探針
Alexa Fluor 探針之間的光譜疊加程度會隨著探針發射峰之間的距離增加而下降,如 Figure2(b)所示。在這種情況下, Alexa Fluor 488 和深紅色染料 Alexa?Fluor 633 與 Figure2 (a)比較,重疊區域明顯降低。這兩種染料人眼都很容易區分,光譜重疊程度低
離子探針原理
離子探針(IMA)的基本原理是,用高能負氧離子轟擊樣品表面,測定被飛濺活化出來并發生電離的原子(即離子)的同位素組成,以獲得年齡。為一種得到迅猛發展的新型質譜計,它具有許多其他測年方法所沒有的優點:不需要化學處理;具有高的分辨率,可同時獲得幾組年齡以確定被測對象同位素體系是否封閉,有無鉛丟失;可對樣
什么是探針臺,探針臺的分類有哪些?
探針臺主要應用于半導體行業、光電行業、集成電路以及封裝的測試。 廣泛應用于復雜、高速器件的精密電氣測量的研發,旨在確保質量及可靠性,并縮減研發時間和器件制造工藝的成本。 探針臺分類 探針臺從操作上來區分有:手動,半自動,全自動 從功能上來區分有:溫控探針臺,真空探針臺(超低溫探針臺),RF
探針臺如何工作?
探針臺可以固定晶圓或芯片,并精確定位待測物。手動探針臺的使用者將探針臂和探針安裝到操縱器中,并使用顯微鏡將探針尖端放置到待測物上的正確位置。一旦所有探針尖端都被設置在正確的位置,就可以對待測物進行測試。對于帶有多個芯片的晶圓,使用者可以抬起壓盤,壓盤將探針頭與芯片分開,然后將工作臺移到下一個芯片
手動探針臺用途
探針臺主要應用于半導體行業、光電行業、集成電路以及封裝的測試。 廣泛應用于復雜、高速器件的精密電氣測量的研發,旨在確保質量及可靠性,并縮減研發時間和器件制造工藝的成本。手動探針臺的主要用途是為半導體芯片的電參數測試提供一個測試平臺,探針臺可吸附多種規格芯片,并提供多個可調測試針以及探針座,配合測
RNA探針的概念
RNA探針是一類很有前途的核酸探針,由于RNA是單鏈分子,所以它與靶序列的雜交反應效率極高。早期采用的RNA探針是細胞mRNA探針和病毒RNA探針,這些RNA是在細胞基因轉錄或病毒復制過程中得到標記的,標記效率往往不高,且受到多種因素的制約。
高精度探針臺
目前世界出貨量第一的型號吸收了最新的工藝科技例如OTS,QPU和TTG相關技術,這種全新的高精度系統為下一代小型化的設計及多種測試條件提供保證。 特性1:OTS-最近的位置對正系統(光學目標對準) OTS通過對照相機相對位置的測量來保證其絕對位置的精度。這是非常引人注目的技術,來源于東京精密
探針臺如何工作
探針臺可以固定晶圓或芯片,并精確定位待測物。手動探針臺的使用者將探針臂和探針安裝到操縱器中,并使用顯微鏡將探針尖端放置到待測物上的正確位置。一旦所有探針尖端都被設置在正確的位置,就可以對待測物進行測試。對于帶有多個芯片的晶圓,使用者可以抬起壓盤,壓盤將探針頭與芯片分開,然后將工作臺移到下一個芯片上,
低溫探針臺用途
高低溫真空探針臺可以對器件進行非破壞性的測試。可以對材料或器件的電學特性測量、光電特性測量、參數測量、highZ測量、DC測量、RF測量和微波特性測量提供一個測試平臺。優測國芯的高低溫真空探臺該設備已經成為測量納米電子材料(碳納米管、晶體管、單個電子晶體管、分子電子材料、納米線),量子線、點、量子隧
無形“探針”,“洞見”人體
更精準地實現人體器官和病灶部位無損害可視化,一直是人們追求的目標。 5月10日,在復旦大學慶祝建校118周年系列學術報告中,復旦大學化學系教授、上海市生物醫學檢測試劑工程中心主任張凡以《透視人體健康的新技術——近紅外光化學探針用于生物醫學診斷》為題,分享了自己深耕多年的近紅外熒光分子“探針”研