PNAS：RNA剪接調控研究方面新的進展
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制，并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。 RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁，也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中，mRNA前體被剪接成為成熟的mRNA一般需要在多種蛋白質及snRNA的幫助下，經歷兩步轉酯剪接反應來完成。目前對于第二步剪接反應的調控知之甚少。 馮英研究組在前期工作中發現了一種特殊的mRNA前體，該前體在剪接反應已經開啟的情況下，僅將轉酯反應進行到第一步即停止，第二步反應則被完全抑制。馮英研究員指導的博士生李璜等研究人員對造成這一特殊現象的機制進行了深入研究。利用多種體外、體內的剪接模型以及定點突變，研究組發現剪接位點附近形成的RNA二級結構會顯著抑制第二步剪接反應的發生;同時還發現單鏈DNA結合蛋白FUBP1通過與剪接沉默子(ESS)元件結......閱讀全文
PNAS：RNA剪接調控研究方面新的進展
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展。該研究揭示了RNA二級結構在剪接調控中的新機制，并首次證明了MYC調控蛋白FUBP1同樣具有剪接調控活性。 RNA剪接是連接轉錄與翻譯的重要橋梁，也是生物體蛋白質多樣性的重要保證。在真核生物中，mRNA前體被剪
RNA－剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子，連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學（一級學科），細胞遺傳（二級學科）
關于RNA剪接的簡介
大多數脊椎動物基因的編碼序列,無論是編碼多肽的基因還是編碼除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非編碼的間隔序列(內含子)分隔為各個外顯子部分。這些基因的外顯子和內含子都轉錄在一條初級RNA轉錄分子中,接下來,此初級RNA轉錄分子要經過RNA剪接,此過程包括一系列的加工反應：RNA的內含子部分
概述RNA剪接的類型
RNA剪接及其機制的研究,不僅解決了不連續基因“連續”轉錄產物的問題,而且對于了解不連續基因的起源乃至整個生命起源與進化等問題,均產生極大的推動作用,另外,由此發現了核酸分子的催化功能,進一步拓寬了對于酶的認識。不連續基因中的介入序列稱為內含子；被內含子隔開的基因序列稱為外顯子(exon)。一個
RNA剪接為什么會出錯
“這項研究不僅提出了用小分子藥物治療維斯科特-奧爾德里奇綜合征的新目標，而且為RNA剪切的基礎生物學提供了新的線索，這是一個重要的但尚未完全被理解的過程，”共同通信作者Juan Carlos Izpisua Belmonte說，他是Salk基因表達實驗室的教授和Roger Guillemin主席。患
關于RNA剪接的基本介紹
RNA剪接 （RNA splicing）是指從DNA模板鏈轉錄出的最初轉錄產物中除去內含子,并將外顯子連接起來形成一個連續的RNA分子的過程。RNA剪接機制的研究,是80年代生物化學和分子生物學領域中最有生機的研究課題之一,它不僅解決不連續基因轉錄產物的剪接問題,而且對于了解不連續基因的起源乃至
關于RNA剪接的定義介紹
RNA剪接是真核細胞基因表達中非常重要的一個生物過程,通過RNA剪接,可以產生許多具有功能的,帶有編碼信息的mRNA,它對生物的發育及進化至關重要。所以RNA剪接識別是正確理解基因表達過程的重要一步,而剪接的識別的關鍵是依賴于剪接位點的判定。真核細胞pre-mRNA的剪接位點處存在一定的序列保守
關于RNA剪接第Ⅱ類內含子的自我剪接介紹
第Ⅱ類內含子,其5’剪接點和3’剪接點的序列多為…外顯子…↓GUGCG…內含子…嘧啶堿AU↓…外顯子…,除了剪接點序列特征之外,在離3’剪接點上游6-12bp有一段比較保守的序列,一致序列為CUCAC,在這一保守序列A的兩側各有一段3~5核苷酸的短序列能與上游方向的核苷酸互補,而A總是不包含在這
環形RNA可變反向剪接和可變剪接表達圖譜被系統繪制
6月30日，國際學術期刊Genome Research 在線發表了中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所楊力研究組和生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組關于環形RNA研究的最新進展：Diverse alternative back-splicing and alternative spl
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素,Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析,所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析,來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必需的
Nature：針對RNA轉錄和剪接的新觀點！
細胞通常產生區室來控制重要的生物功能。細胞核就是一個很好的例子；它被核膜包圍著，容納著基因組。然而，細胞還含有未被膜包圍的較為短暫存在的封閉室，就像水中的油滴。在過去兩年中，這些稱為液滴狀“凝聚物（condensates）”的封閉室已越來越多地被認為是控制基因的主要參與者。如今，在一項新的研究中
簡述RNA剪接和基因沉默之間的聯系
為了識別在RNA干涉(RNAi)和微RNA介導的基因表達調控中所涉及的因素，Gary Ruvkun及其同事對86種真核生物進行了系統發生分析，所得到的候選物再用轉錄和蛋白組相互作用數據進行Bayesian分析，來估計它們參與小RNA調控的概率。所識別出的小RNA輔因子中大約一半是RNAi沉默所必
PNAS：游戲玩家教你設計RNA
??????? 研究人員發現，與計算機相比，網絡游戲玩家可以更好的預測和設計RNA折疊。這一發現能為新興的分子工程領域帶來什么樣的啟示呢？ RNA可以被彎曲、成環和扭轉形成多種不同的結構，這種自我裝配的分子在生物學和生物工程領域具有關鍵性的作用，其應用前景非常廣闊。許多研究者們都在設計能夠折疊
《PNAS》:RNA“質檢員”被發現
在8月14日的《PNAS》網絡版上，來自日本京都大學的研究人員發表的最新研究成果發現，脊椎動物細胞內有一套嚴格的"質量管理"機制來確保只有正確的信息從細胞核傳遞到細胞質，以防止不可靠信息在蛋白質合成過程中發揮作用。 DNA復制過程是以DNA雙鏈中的一條鏈為模板合成的RNA，而由于合成蛋白組的核糖體在
營養所在RNA剪接調控研究中取得新進展
近日，PNAS在線發表了中科院上海生科院營養科學研究所馮英研究組的最新研究進展：Far upstream element-binding protein 1 and RNA secondary structure both mediate second-step splicing rep
上海生科院揭示反向剪接RNA成環與RNA轉錄的偶聯機制
4月19日，國際學術期刊Cell Reports 發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組與計算生物學研究所楊力研究組最新合作研究論文。此工作深入研究了環形RNA生成與RNA轉錄的偶聯機制，揭示了環形RNA在神經分化過程中表達上調原理。 環形RNA是一類通過反向
METTL16介導通過阻礙對剪接位點的識別從而抑制RNA剪接
RNA m6A修飾是目前RNA表觀遺傳領域研究的熱點，對于m6A的甲基化酶和去甲基化酶，相信大家也是耳熟能詳。事實上，大名鼎鼎的METTL3僅能結合約22%的m6A位點，這提示還有其他m6A甲基化酶。確實，在METTL3之后，METTL16也被鑒定為m6A甲基化酶，但是它的底物遠不如METTL3
Nature：首次發現RNA剪接與衰老之間存在因果關系
生物通報道：衰老是各種破壞性慢性疾病的一個重要危險因素，但是，隨著時間推移生物學因素如何影響“細胞何時以及多快的衰老”，在很大程度上仍然是未知的。現在，由哈佛大學T.H. Chan公共衛生學院帶領的一個研究小組，將細胞機器——其在一個稱為“RNA剪接”的過程中切割和重新連接RNA分子——的一個核
研究揭示甘蔗花葉病毒干擾RNA剪接促進侵染
近日，中國農業大學植物保護學院教授周濤課題組在甘蔗花葉病毒（SCMV）相關研究上獲得了新進展。研究發現，SCMV侵染改變了玉米八氫番茄紅素合成酶基因（ZmPSY1）的轉錄本可變剪接模式，因此促進病毒侵染。相關成果發表于《植物生理學報》。 SCMV是我國和非洲玉米生產上的一種主要病原，廣泛分布于世
Cell－Systems：構建RNA結合蛋白的剪接調控作用預測模型
基因組研究結果顯示，人體內超過90%的基因存在選擇性剪接(alternative splicing)。該過程在不同組織以及不同生理階段受到嚴格的調控，其失調會導致多種疾病的發生。選擇性剪接的體內調控主要由前體mRNA中的順式元件(cis-elements) 招募反式剪接作用因子（trans-a
PNAS顛覆性發現：RNA自行打包
利茲大學的研究人員解析了簡單RNA病毒生命周期中的關鍵階段，開辟了抵御病毒疾病的新戰線。 研究人員首次在單分子水平上觀察到了單鏈RNA病毒的核心遺傳物質(基因組)將自己打包進入蛋白衣殼的全過程。利茲大學Peter Stockley教授介紹說，這項結果顛覆了人們對病毒包裝過程的普遍認知，
PNAS：小分子RNA引發肥胖代謝問題
科學家發現了機體生物事件鏈中的一種關鍵分子，這些事件會導致脂肪肝疾病，2型糖尿病和其他與肥胖有關的代謝異常疾病。通過阻擋這種分子，研究人員就能夠扭轉肥胖小鼠中其引發一些病理發展。這項研究結果刊登在《美國國家科學院院刊》（PNAS）雜志上。MIR-34A是一種小分子RNA，在肥胖小鼠和患有脂肪肝的患者
張建之教授PNAS解析RNA編輯
如果一些編碼位點的RNA編輯受損，就會引起嚴重的疾病。因此，一些人認為編碼性RNA編輯是對人體有利的。 近年來的基因組研究顯示，人類基因組中有超過一千個編碼位點受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)編輯。許多這樣的RNA編輯事件屬于非同義替換。 現在
PNAS：病毒小RNA抑制登革病毒復制
每年有超過100個國家報道了近100百萬例登革病毒(Dengue virus，DENV)感染性疾病，包括50萬例登革出血熱。伊蚊屬的埃及伊蚊(Aedes aegypti)和白紋伊蚊(Aedes albopictus)是DENV的主要傳播者。MicroRNA(miRNA)是一類具有調控功能
常興研究組發現RNA剪接基因編輯的新方法
2018年10月5日，國際知名學術期刊《分子細胞》在線發表了中國科學院上海生命科學研究院（營養與健康研究院）常興研究組題為“Genetic modulation of RNA splicing with a CRISPR-guided cytidine deaminase”的最新研究成果。證明可
GUT揭示癌癥治療靶點調控RNA可變剪接的分子機制
來自浙江大學基礎醫學院，中國藥科大學等處的研究人員發表了題為“SRSF6-Regulated Alternative Splicing that Promotes Tumor Progression Offers a Therapy Target for Colorectal Cancer”的文
PNAS：研究反義RNA的一條捷徑
雙鏈DNA在轉錄過程中打開，其中一條鏈生成作為蛋白翻譯模板的信使RNA。偶爾，另一條DNA也能產生一個反義的RNA分子(asRNA)，這種反義RNA的序列與信使RNA互補。許多細胞中都存在這樣的asRNA，但人們并不了解這些分子有何功能。近日，科學家們開發了一個分離和鑒定反義RNA的新
中科大院士PNAS解析“垃圾”RNA
來自中國科技大學，英國鄧迪大學的研究人員圍繞一種關鍵小蛋白：Stc 1的結構和功能展開了研究，從中揭示出了裂殖酵母中RNAi與染色質修飾之間的分子作用機制，指出了非編碼RNA的又一重要作用。相關成果公布在《美國國家科學院院刊》(PNAS)雜志上。 文章的通訊作者是中國科技大學生命科學學