Nature子刊|堿基編輯器新拓展
作為Cas9核酸酶的進化祖先，IscB蛋白作為緊湊RNA引導的DNA內切酶和缺口酶，使其成為堿基編輯的強有力候選者。然而，目標范圍狹窄限制了IscB系統的應用;因此，有必要找到更多識別不同靶鄰基序(TAMs)的IscB。2024年8月15日，輝大基因張海南、李彤、復旦大學黃錦海、中科院腦科學與智能技術卓越創新中心楊輝共同通訊在Nature Chemical Biology（IF=13）在線發表題為”Engineered IscB–ωRNA system with expanded target range for base editing“的研究論文，該研究開發的工程IscB -ωRNA系統能夠擴展目標范圍的堿基編輯。在這里，研究人員從未培養的微生物中鑒定出19種未表征的IscB蛋白中的10種，這些蛋白在哺乳動物細胞中具有活性。通過蛋白質和ωRNA工程，進一步增強了其同源物IscB的活性。并將其TAM范圍從MRNRAA擴展到NN......閱讀全文
Nature子刊|堿基編輯器新拓展
作為Cas9核酸酶的進化祖先，IscB蛋白作為緊湊RNA引導的DNA內切酶和缺口酶，使其成為堿基編輯的強有力候選者。然而，目標范圍狹窄限制了IscB系統的應用;因此，有必要找到更多識別不同靶鄰基序(TAMs)的IscB。2024年8月15日，輝大基因張海南、李彤、復旦大學黃錦海、中科院腦科學與智能技
湯瑋欣/可愛龍團隊開發基于IscB的微型基因編輯工具
近年來，劉如謙團隊等在CRISPR-Cas系統的基礎上，開發了新一代基因編輯系統——堿基編輯（BE）、先導編輯（PE）。其中，堿基編輯能夠在基因組靶位點有效地轉換單個堿基，而不會引起DNA雙鏈斷裂。目前，研究人員已經開發了CBE、ABE、CGBE、AYBE等多種堿基編輯器。 IscB被認為是C
DNA堿基中產生靶向變化的堿基編輯器－誘導廣泛的脫靶
在一項新的研究中，來自美國麻省總醫院、哈佛醫學院和哈佛大學陳曾熙公共衛生學院的研究人員報道近期開發的幾種在單個DNA堿基中產生靶向變化的堿基編輯器能夠在RNA中誘導廣泛的脫靶效應。他們還描述了對堿基編輯器變體進行基因改造可顯著降低RNA編輯的發生率，這同時也會增加在靶DNA編輯的精確度。相關研究
新進展！構建新型雙堿基編輯器
堿基編輯器是基于CRISPR/Cas9發展的新一代基因組編輯技術，可誘導單個堿基的突變，而鮮有關于特異性介導A-to-G和C-to-G雙突變的堿基編輯工具的研究。此外，關于堿基編輯系統與染色質環境之間的聯系也少見報道。 近日，中國科學院天津工業生物技術研究所研究員畢昌昊帶領的合成生物學技術研究
新型“堿基編輯器”有助治療遺傳疾病
一個美國團隊２５日在英國《自然》雜志發表報告說，它在基因編輯技術方面取得新進展，可通過一種新型“堿基編輯器”在基因中替換堿基，有助科學家增強對遺傳疾病的理解和開發新療法。 基因是脫氧核糖核酸（ＤＮＡ）上的片段，而ＤＮＡ雙鏈螺旋結構由４種化學堿基組成，即腺嘌呤（Ａ）、鳥嘌呤（Ｇ）、胞嘧啶（Ｃ）和
新型堿基編輯器助力工業底盤菌株創制
近年來，生物制造產業發展迅速，已成為推動我國經濟社會可持續發展的重要引擎。工業菌株是生物制造的“靈魂”，性能優良的工業微生物就像一個個高效的“細胞工廠”，只需要攝取簡單的營養甚至廢料，便可合成我們日常所需的各種產品，如蛋白質、生物藥品、化妝護膚成分、生物染料等。傳統的微生物基因改造需要經過一系列的繁
DNA堿基編輯器或能誘導大量脫靶RNA突變！
DNA堿基編輯方法能夠直接在基因組DNA中進行點突變的校正，同時并不會產生任何雙鏈的斷裂（DSBs，double-strand breaks），但潛在的脫靶效應常常限制了這些方法的應用，腺相關病毒（AAV）是DNA編輯基因療法中最常用的傳遞系統，由于這些病毒能夠在體內持續維持基因表達的功能，因此
利用單堿基編輯器實現多位點單堿基編輯DMD及HGPS豬模型
6月28日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在國際學術期刊Nature Communications(《自然-通訊》)發表了題為Efficient base editing for multiple genes and loci in pigs using base editors
廣州生物院開發出新型雙堿基編輯器
近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院賴良學課題組在新型堿基編輯器開發方面取得重要進展，獲得了可同時兼具當前多種單堿基編輯器及CRISPR/Cas9基因編輯功能的多功能堿基編輯器，可廣泛地誘導產生多種模式的突變，對于飽和突變文庫構建、基因突變功能研究等方面具有促進作用。相關研究成果以AGBE: a
新型雙堿基編輯器助力基因飽和突變文庫構建
近日，中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院研究員賴良學課題組在新型堿基編輯器開發方面取得重要進展，獲得了可同時兼具當前多種單堿基編輯器及CRISPR/Cas9基因編輯功能的多功能堿基編輯器，可廣泛地誘導產生多種模式的突變，對于飽和突變文庫構建、基因突變功能研究等方面具有重要促進作用。相關研究在線發表于
全新「堿基編輯器」：不用「切割」也能精準編輯基因
原標題:不用「切割」也能精準編輯基因了，華人學者開發全新「堿基編輯器」摘要：CRISPR 基因編輯技術之外的新工具。基因編輯技術有了重大進展。Broad 研究所的華人學者 David Liu 教授的團隊開發出了一種「堿基編輯器」，可以讓細胞內 DNA 的一種堿基通過簡單的化學反應，變成另一種
多樣化C－to－T植物堿基編輯器被開發
近日，電子科技大學張勇教授、馬里蘭大學YiPing Qi博士、揚州大學張韜教授課題組合作于《Plant Biotechnology Journal》發表了題名《Improved plant cytosine base editors with high editing activity, pur
Nature－Biotechnology：新研究拓寬堿基編輯器的靶向范圍
基因組編輯技術CRISPR/Cas9被《科學》雜志列為2013年年度十大科技進展之一，受到人們的高度重視。CRISPR是規律間隔性成簇短回文重復序列的簡稱，Cas是CRISPR相關蛋白的簡稱。CRISPR/Cas9是由一種原始的細菌免疫系統改編而成的，它的作用方式是首先在基因組的一個靶位點上切割
從同源重組到堿基編輯器－看基因編輯72變
基因編輯尤其是“基因魔剪”CRISPR的新聞報道幾乎每天都能見到。僅在3月份，就有兩篇引起廣泛關注的重磅成果，其一，曾與張峰合作開創“基因魔剪”CRISPR的科技大牛劉如謙（David Liu），利用基因編輯技術研發出給細胞活動拍照的“細胞記錄儀”（CAMERA）。正如黑匣子能記錄事故發生時的
我國科研人員開發新型普適高效的堿基編輯器
?? 在國家自然科學基金項目（項目編號：31730111、91540115、31600654 、31600619、31471241）等資助下，中國科學院上海生命科學研究院楊力研究組與上海科技大學生命學院陳佳研究組和黃行許研究組合作，成功開發出可高效介導甲基化胞嘧啶mC到胸腺嘧啶T的編輯堿基編
糖基化酶堿基編輯器的機器學習研究進展
堿基編輯技術可實現精確的堿基轉換，當前，有三類堿基編輯器被廣泛應用，包括胞嘧啶堿基編輯器（cytosine base editor，CBE）、腺嘌呤堿基編輯器（adenine base editor，ABE）、糖基化酶堿基編輯器（glycosylase base editor，GBE）。 20
科學家首次證實線粒體堿基編輯器的脫靶效應
?脫靶檢測技術工作流程。中國農科院供圖? ? 日前，中國農業科學院深圳農業基因組研究所左二偉團隊與國內其他科研單位合作，首次證實線粒體堿基編輯器（DdCBE）會導致核基因組嚴重的脫靶效應，因而醫學應用存在嚴重的安全風險。該研究對研發高效安全的線粒體堿基編輯器具有指導意義。相關研究成果在線發表在《
不依賴脫氨酶的堿基編輯器開發成功
記者1月14日從中國科學院天津工業生物技術研究所獲悉，該所研究員畢昌昊團隊和研究員張學禮團隊合作開發了不依賴脫氨酶（DAF）的新型堿基編輯器。該成果擴展了堿基編輯器的類型，為工業菌株改造和生物醫藥等領域研究提供了新的技術工具。相關研究成果近日發表于國際期刊《自然-生物技術》。 堿基對是形成DN
優化糖基化酶堿基編輯器研究取得新進展
GBE編輯器可實現堿基C-to-G的編輯，但其仍存在堿基編輯效率偏低、靶向位點范圍受限等問題，這大大限制了GBE堿基編輯器的應用。因此，亟需對現有糖基化酶堿基編輯器進行優化，開發出堿基編輯效率高、靶向位點范圍廣的GBE突變體。近日，中國科學院天津工業生物技術研究所畢昌昊研究員帶領的合成生物技術研究團
一種堿基編輯器成功修改活小鼠腸道細菌基因
科學家設計了一種基因編輯工具，可以改變活小鼠腸道微生物組中的細菌。7月10日，相關研究成果發表于《自然》。 該工具是一種堿基編輯器，可以修改小鼠腸道內90%以上大腸桿菌菌落的靶基因。“我們一直夢想能夠做到這一點。”法國巴黎生物技術公司Eligo Bioscience的聯合創始人、合成生物學家X
新型腺嘌呤堿基編輯器可讓細胞RNA編輯最小化
在一項新的研究中，來自美國布羅德研究所和哈佛大學的研究人員發現有證據表明使用堿基編輯器會導致細胞中出現意想不到的RNA編輯。相關研究結果發表在2019年5月8日的Science Advances期刊上，論文標題為“Analysis and minimization of cellular RNA
天津工生所在構建新型雙堿基編輯器方面取得進展
堿基編輯器是基于CRISPR/Cas9發展的新一代基因組編輯技術，可誘導單個堿基的突變，而鮮有關于特異性介導A-to-G和C-to-G雙突變的堿基編輯工具的研究。此外，關于堿基編輯系統與染色質環境之間的聯系也少見報道。 近日，中國科學院天津工業生物技術研究所研究員畢昌昊帶領的合成生物學技術研究
上海科技大學等研制出“超級細菌”堿基編輯器
上海科技大學物質學院教授季泉江課題組與中科院北京基因組所研究員韓大力課題組合作，首次在金黃色葡萄球菌中建立單堿基編輯技術。相關研究成果近日在線發表于英國皇家化學會旗艦期刊《化學科學》。 圖片來源于網絡 季泉江課題組此前已成功開發出金黃色葡萄球菌中基于CRISPR/Cas9的基因組
糖基化酶堿基編輯器的機器學習研究中獲進展
堿基編輯技術可實現精確的堿基轉換，當前，有三類堿基編輯器被廣泛應用，包括胞嘧啶堿基編輯器（cytosine base editor，CBE）、腺嘌呤堿基編輯器（adenine base editor，ABE）、糖基化酶堿基編輯器（glycosylase base editor，GBE）。 20
Nat－Med：在體內利用新型堿基編輯器有望治療遺傳疾病
2018年10月9日/生物谷BIOON/---新生兒的父母可能都了解一種稱為苯丙酮尿癥（phenylketonuria）的代謝障礙。在瑞士，所有新生兒都會接受這種遺傳疾病的篩查。經發現患有苯丙酮尿癥的兒童需要吃特殊飲食，這樣苯丙氨酸就不會在體內堆積。過量的苯丙氨酸會遲滯精神和運動發育。如果這種遺
人工智能的蛋白結構聚類分析，發現新的堿基編輯器
在一項新的研究中，中國科學院遺傳與發育生物學研究所的高彩霞（Gao Caixia）課題組率先使用人工智能（AI）輔助的方法，通過結構預測和分類發現具有獨特功能的新型脫氨酶蛋白。這種方法為發現和構建理想的植物遺傳性狀開辟了一系列的應用。相關研究結果于2023年6月27日在線發表在Cell期刊上，論
上海科技大學等研制出“超級細菌”堿基編輯器
本報訊 上海科技大學物質學院教授季泉江課題組與中科院北京基因組所研究員韓大力課題組合作，首次在金黃色葡萄球菌中建立單堿基編輯技術。相關研究成果近日在線發表于英國皇家化學會旗艦期刊《化學科學》。 季泉江課題組此前已成功開發出金黃色葡萄球菌中基于CRISPR/Cas9的基因組編輯技術，簡化了該細菌
在糖基化酶堿基編輯器的機器學習研究中獲進展
堿基編輯技術可實現精確的堿基轉換，當前，有三類堿基編輯器被廣泛應用，包括胞嘧啶堿基編輯器（cytosine base editor，CBE）、腺嘌呤堿基編輯器（adenine base editor，ABE）、糖基化酶堿基編輯器（glycosylase base editor，GBE）。 2020
新研究開發出靶向能力和編輯效率得到改善的堿基編輯器
在一項新的研究中，來自美國布羅德研究所、哈佛大學和波士頓兒童醫院的研究人員利用一種稱為“噬菌體輔助的堿基編輯器連續進化（phage assisted continuous evolution of base editors, BE-PACE）”的系統開發出一種改進堿基編輯器的編輯效率的新方法。相
堿基編輯器的效能差異并構建可編輯致病突變數據庫
近日，中國科學院上海營養與健康研究所楊力研究組與上海科技大學生命科學與技術學院陳佳研究組通過合作，系統揭示了一系列具有代表性的基因組堿基編輯器（baseeditor）的效能差異，并進一步構建了可利用20種已報道堿基編輯器進行編輯的人類疾病相關單堿基突變位點的數據庫（BEable-GPS, Bas