上海生化細胞所發現受精卵DNA去甲基化重要機制
近日，中科院上海生科院生化與細胞所一項最新研究發現，小鼠早期胚胎中母源和父源基因組在單細胞的受精卵階段，均會發生大規模的DNA主動和被動去甲基化，DNA雙加氧酶Tet3介導了主動去甲基化的發生，而糖苷酶TDG并不參與該過程。相關研究成果在線發表于學術期刊《細胞―干細胞》。 該研究由中科院上海生科院生化與細胞所徐國良研究組、李勁松研究組和北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組共同完成。 研究中，科學家利用最近發展的單細胞簡并代表性甲基化測序、發夾DNA甲基化測序以及測定等表觀修飾分析技術，結合生殖系選擇性敲除的小鼠模型，對受精卵中母源和父源基因組DNA去甲基化的分子機制進行了系統的研究。結果表明，受精卵中的母源和父源基因組......閱讀全文
家蠶基因組甲基化譜研究獲突破
我國科學家利用新一代測序技術構建家蠶絲腺甲基化譜 由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院、西南大學、上海腫瘤所等合作的研究成果“家蠶基因組甲基化譜”，5月2日在國際著名學術雜志《自然—生物技術》（Nature Biotechnology）上發表，這是中國科學家
研究揭示受精卵DNA去甲基化重要機制
近日，中科院上海生科院生化與細胞所一項最新研究發現，小鼠早期胚胎中母源和父源基因組在單細胞的受精卵階段，均會發生大規模的DNA主動和被動去甲基化，DNA雙加氧酶Tet3介導了主動去甲基化的發生，而糖苷酶TDG并不參與該過程。相關研究成果在線發表于學術期刊《細胞—干細胞》。 該研究由中科院上海生
基因組所等RNA甲基化表觀轉錄組學研究獲進展
2014年1月，中國科學院北京基因組研究所基因組變異與精準生物醫學實驗室“百人計劃”研究員楊運桂研究組，與中國科學院動物研究所“百人計劃”研究員劉峰研究組合作開展的“m6A甲基轉移酶復合物鑒定”研究，發現了WTAP(wilms'tumour 1-associating protein)
基因組DNA甲基化分析方法
早期的基因組DNA甲基化分析技術，如SssI甲基轉移酶分析法、氯乙醛反應法、免疫學抗體技術等，已經不能滿足現代表觀遺傳學研究的需求。今年來常用的基因組甲基化的方法有以下兩種。1. 甲基化敏感擴增多態性實驗甲基化敏感擴增多態性實驗技術被用于檢測雙向型真菌的DNA甲基化，它是在擴增片段長度多態性技術的基
甲基化的基因組直接測序法
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
在基因組范圍定位DNA甲基化
DNA甲基化在哺乳動物基因表達中扮演了重要角色。盡管通過線粒體遺傳且隨時間穩定，但是細胞分化、疾病或環境影響都會改變DNA甲基化的模式。近年來，科學家們開發出多種新方法，試圖在基因組范圍定位DNA甲基化。 盡管從理論上來說，全基因組亞硫酸氫鹽測序能讓研究人員全面觀察甲基化組，但它還是面臨技
全基因組甲基化定量檢測技術ＬＵＭＡ
LUMA介紹基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件，有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此，我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化，稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methylat
全基因組甲基化定量檢測技術ＬＵＭＡ
LUMA介紹 基因組DNA甲基化(Genomic DNA Methylation, GDM)的變化被認為是正常和病理細胞過程中的重要的事件，有助于正常發育和分化以及癌癥和其他疾病。在此，我們介紹一種新的方法評估全基因組DNA甲基化，稱為熒光甲基化檢測(Luminometric Methyl
全基因組測序解讀重要甲基化機制
DNA看起來只是AGTC四種堿基的簡單排列，可一旦它與組蛋白包裝形成染色質，情況就復雜得多了。組蛋白主要有四種，分別是H2A、H2B、H3和H4。這些組蛋白要么令DNA盤繞起來保持沉默，要么將DNA解開允許基因表達。組蛋白上的化學修飾(如甲基化)，能夠影響它對基因的控制。 H3K4me3是
線蟲基因組中存在DNA甲基化現象
2012年10月18日，吉林大學和華大基因合作完成的旋毛形線蟲不同發育階段DNA甲基化差異分析的相關研究成果在國際著名期刊《基因組生物學》(Genome Biology)上發表。該研究首次證實了線蟲基因組中存在DNA甲基化現象，改寫了長期以來認為線蟲中沒有該表觀遺傳修飾的歷史，同時也使以DN
調控受精卵基因組激活和全能樣干細胞轉化的新分子
北京大學分子醫學研究所汪陽明研究組與胡新立以及清華大學那潔實驗室合作在PLOS Biology在線發表最新研究成果“DPPA2/4 and SUMO E3 ligase PIAS4 opposingly regulate zygotic transcriptional program”。該研究發
上海生化細胞所發現受精卵DNA去甲基化重要機制
? ? ? ? 近日，中科院上海生科院生化與細胞所一項最新研究發現，小鼠早期胚胎中母源和父源基因組在單細胞的受精卵階段，均會發生大規模的DNA主動和被動去甲基化，DNA雙加氧酶Tet3介導了主動去甲基化的發生，而糖苷酶TDG并不參與該過程。相關研究成果在線發表于學術期刊
GenomeResearch發表基因組研究新發現基因組
多倫多大學的科學家們發現，作為基因組看門人的C2H2-鋅指蛋白（C2H2-ZF）實際上肩負著更加多樣化的職責。這項發表在Genome Research雜志上的研究，有助于我們更準確地解讀個人基因組。C2H2-ZF有大約七百個成員，是規模最大的一種人類蛋白。然而，人們對這些蛋白一直知之甚少。C2H2-
基因組直接測序法檢測甲基化的介紹
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解
基因組直接測序法檢測DNA的甲基化
基因組直接測序法是過去一直沿用的DNA甲基化的研究方法，用Maxam—Gilbert化學裂解法對基因組DNA進行處理，并以連接介導的PCR來放大信號強度，然后進行序列分析。此法是基于5mC在標準的Maxam—Gilbert胞嘧啶化學裂解反應中不被裂解，故5mC可通過在測序膠上缺少對應于胞嘧啶降解反應
頂級科學家張毅Cell子刊表觀遺傳學新文章
幾年前，湯姆森科技信息集團旗下《科學觀察》(Science Watch)評出了的高影響力論文數量最多的研究人員。原北卡羅萊納大學醫學院生物化學與生物物理學系教授、霍華德?休斯醫學研究院(HHMI)研究員張毅（現就職于哈佛醫學院）成為分子生物學和遺傳學領域高影響力論文的數量最多的前十位頂級科學家之
北京基因組研究所Plant－cell基因組研究新成果
來自中科院北京基因組研究所、荷蘭瓦赫寧根大學和中科院/馬普學會等10多家機構的研究人員組成的一個研究小組，通過測序及分析醉蝶花(Tarenaya hassleriana)的基因組提供了關于十字花科植物繁殖性狀和基因組進化的新認識。相關研究發表在植物學權威期刊The Plant Cell雜志上
上海生科院合作揭示受精卵DNA去甲基化重要機制
9月11日，國際學術期刊《細胞—干細胞》（Cell Stem Cell）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所徐國良研究組、李勁松研究組和北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組的最新研究成果Active and Passive Demethylation
世界首個人類早期胚胎DNA甲基化全景觀圖譜
記者25日從北京大學第三醫院獲悉，該院生殖醫學中心喬杰研究組與北京大學生命科學學院生物動態光學成像中心湯富酬研究組合作，繪就了世界首個人類早期胚胎DNA甲基化全景觀圖譜。這一成果日前已在線發表于《自然》，影響因子達38.597。 據介紹，哺乳動物的胚胎發育起始于單個受精卵細胞，父母的表觀遺傳記
Nature－Genetics：單細胞全基因組DNA甲基化組新發現
北京大學北京未來基因診斷高精尖創新中心，北大生命科學學院與第三醫院等處的研究人員發表了題為“Single-cell DNA Methylome Sequencing of Human Preimplantation Embryos”的文章，利用單細胞DNA甲基化組高通量測序方法，首次在單細胞分辨
《基因組研究》：首張貓基因組草圖繪就
貓是研究人類失明和艾滋病模型之一，因此測序結果大有用處 一只名為“肉桂”（Cinnamon）的4歲雌性阿比西尼亞貓有幸成為第一只完成基因組測序草圖的貓。它也因此加入了包括狗、小鼠、大鼠以及黑猩猩等在內的基因組“俱樂部”。相關論文11月1日在線發表于《基因組研究》（Genome Research）雜
北京基因組所RNA－m6A甲基化調控mRNA剪切研究獲進展
6-甲基腺嘌呤【N6-methyl-adenosine(m6A)】是高等生物mRNA中含量最為豐富的甲基化修飾形式之一，發生于保守序列RRACH（R=G ,A； H=A,C or U）中，富集在mRNA的外顯子編碼區及3’-非編碼區。類似于DNA甲基化修飾，RNA的m6A甲基化修飾也是可逆的，由
進行全基因組甲基化檢測需要多少錢
建庫是5000塊錢一個庫，測序就是1500每G，看您要測多少G的數據量，信息分析大概要5000塊錢左右吧。。。
北京基因組所發表RNA甲基化新發現
在分子生物學的中心法則中，遺傳信息從DNA、RNA最后流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學修飾，這些修飾可以在不改變DNA序列的基礎上調控基因的表達，并由此決定細胞的分化和發育情況。實際上，mRNA和其他RNA上也存在類似的調控機制。 N6-methyladenosine（m
人類基因組DNA甲基化數據分析
近期來自電子科技大學，清華大學等處的研究人員從CpG島等基本定義出發，闡述了高通量DNA甲基化的檢測技術以及針對芯片技術與下一代測序技術的低水平數據處理方法，并重點對比了基于機器學習理論對CpG位點及CpG島甲基化水平的預測算法，以及所利用的特征對預測效果的影響與發展趨勢。 DNA甲基化是表觀
中國學者Cell子刊解析細胞重編程分子機制
報道 來自北京生命科學研究所、同濟大學和中科院動物所等處的研究人員，在新研究中證實小鼠受精卵中的親代原核(Pronuclei)具有不對稱重編程的能力。這一研究發現發表在3月13日的《Cell reports》雜志上。 任職于北京生命科學研究所和同濟大學的高紹榮(Shaorong G
Nature：北大繪就首個人類早期胚胎DNA甲基化全景觀圖譜
近日，北京大學交叉研究取得重要研究成果：繪就出世界首個人類早期胚胎DNA甲基化全景觀圖譜。此項研究工作為人們提供了一個全面的人類早期胚胎DNA甲基化調控網絡的研究框架，對于人類認識自身早期胚胎發育過程中表觀遺傳調控機制、輔助生殖技術的安全性評估與改善，以及臨床上疑難病例的診治均具有非常重要的意義
基因組所人類基因組突變研究獲進展
序列變異的周期性和與TCR相關聯的突變 基因突變會導致人類疾病的產生，因此研究遺傳變異的產生過程和那些能夠引起疾病的突變對生命科學基礎研究以及人類健康是十分關鍵和重要的。 近日，中國科學院北京基因組研究所于軍研究員帶領其研究團隊，在有關人類基因組中以轉錄為中心的突變研究方面取得新進展
The－Scientist：最熱門基因組研究
The Scientist雜志是由科學信息研究所(ISI，現為湯姆森路透科技集團)的創始人Eugene Garfield于1986年創辦的一份雙周刊報紙，后又轉變為一本每月出版的雜志，同時伴有每日更新的在線新聞。主要刊登生命科學相關信息，并幫助科學家分析研究的，以協助決策影響他們的
進擊的古基因組研究
? 今年5月，《科學》在線發表了一項中國科學院古脊椎動物與古人類研究所（以下簡稱古脊椎所）領銜的關于華夏族群探源的突破性研究成果，它揭開了有關中國南北方史前人群格局及遷移與混合這一重大學術問題上的若干謎團；兩個月后，該團隊又發布最新發現：通過古基因組研究最新發現距今約1.1萬年的中國南方未知現代人群