老鼠基因組單體型圖譜出爐
美國的研究人員希望通過對15只常用于生物醫藥研究的小鼠的DNA進行研究來幫助科研人員確定出與環境疾病敏感性相關的基因。目前這些數據被存放在了基因變異數據目錄之下，即小鼠基因組單體型圖譜（將染色體分隔成許多小的片段），從而幫助研究人員找出小鼠中影響健康和疾病的基因和遺傳變異。這個單體型圖譜公布在7月29日的《自然》雜志上，該圖譜首次完整描述了小鼠基因組測序和SNP計劃的分析數據。該研究計劃由美國環境衛生科學研究院進行。 這些數據使研究人員能夠比較一個小鼠與另外一個小鼠的遺傳組成，并進行必要的遺傳分析來確定出一些個體對疾病更敏感的原因。這項研究成果使人們向著了解對人類對環境毒素的個體敏感性前進了一步。研究人員還希望開放環境疾病藥物的制藥企業將能夠利用這些數據。 這項研究詳細地描述了用于確定出15個小鼠的基因組中分布的827萬個高質量的SNP的方法。SNP即單核苷酸多態性是發生在DNA序列中的單個核苷酸的遺傳變異。 研究人員利用......閱讀全文
老鼠基因組單體型圖譜出爐
美國的研究人員希望通過對15只常用于生物醫藥研究的小鼠的DNA進行研究來幫助科研人員確定出與環境疾病敏感性相關的基因。目前這些數據被存放在了基因變異數據目錄之下，即小鼠基因組單體型圖譜（將染色體分隔成許多小的片段），從而幫助研究人員找出小鼠中影響健康和疾病的基因和遺傳變異。這個單體型圖譜公布在7月2
谷子單倍體型圖譜及全基因組關聯分析研究出爐
由中國農科院作物所、中科院上海生科院植生生態所國家基因中心、中科院遺傳發育所等8家單位合作，在國際上率先完成了谷子單倍體型圖譜的構建和大量農藝性狀的全基因組關聯分析，該成果于6月24日在Nature Genetics(自然-遺傳學)發表，標志著我國在谷子遺傳學研究領域取得了重要的突破。
《自然—生物技術》：美教授“自繪”個人基因組圖譜
斯蒂芬·夸克(Stephen Quake) 一臺機器、3個人、5萬美元，美國斯坦福大學教授斯蒂芬·夸克(Stephen Quake)最近用“自繪”個人基因組圖譜的經歷說明，這項“游戲”已不再是誰也玩不起的了。 斯坦福大學8月10日發表聲明說，夸克在兩名同事的幫助下，利用一臺冰箱大
首個山羊基因組圖譜在《自然?生物技術》雜志發表
2012年12月24日，由中國科學院昆明動物研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成的首個山羊全基因組圖譜在《自然?生物技術》(Nature Biotechnology)雜志在線發表。本研究采用新一代測序技術(NGS)與全基因組酶切圖譜(Whole-genome mapping)技術相結
任兵教授Nature重要成果：首張小鼠功能基因組圖譜
通常被稱之為“生命之書”的人類基因組非常地難于閱讀。在沒有充分了解其語法和句法的情況下，基因組中29億的腺嘌呤與胸腺嘧啶、鳥嘌呤和胞嘧啶堿基對為了解人類的基礎遺傳學提供了有限的認識。 在發表于7月1日《自然》(Nature)雜志上的一篇論文中，來自德維格癌癥研究所和加州大學圣地亞哥醫學院的
中國科學家繪就谷子基因組單倍型圖譜
由中國農科院作物科學研究所、中科院上海生科院國家基因研究中心、中科院遺傳與發育生物學研究所等8家單位組成的科研團隊，在國際上率先完成了谷子單倍體型圖譜的構建和47個主要農藝性狀的全基因組關聯分析。相關成果6月23日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據介紹，谷子為二倍體，基因組小、自花
小豆F2群體的簡化基因組測序構建高密度SNP遺傳圖譜
小豆營養豐富、醫食兩用，在促進健康、改善膳食結構等方面具有重要作用。然而，小豆遺傳研究相對緩慢，導致新基因發掘及資源利用效率低下，難以滿足生產和市場的需求。 近期，中國農業科學院作物科學研究所食用豆種質資源研究程須珍課題完成的題為“Construction of a high-density
最大動物基因組圖譜——南極磷蝦基因組圖譜破譯
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495141.shtm ??? Cell官網截圖。黃海水產研究所供圖 ? 日前，由中國水產科學研究院黃海水產研究所聯合青島華大基因研究院、德國阿爾弗雷德?魏格納研究所、澳大利亞聯邦科學
科學家繪制細胞游離DNA單分子全基因組突變圖譜
體細胞突變是腫瘤發生的標志，可用于癌癥的無創診斷。美國約翰·霍普金斯大學醫學院繪制細胞游離DNA單分子全基因組突變圖譜，用于癌癥無創檢測。該研究成果于近日發表在《Nature Genetics》雜志上，題為：Single-molecule genome-wide mutation profile
應用SNP芯片測基因組知起源地
歐洲的歷史上充滿著戰爭、入侵和移民，這些因素似乎可以徹底地將不同人種混合在一起。然而，美國和荷蘭科學家獨立進行的兩項最新研究表明，一個歐洲人的基因組信息足以表明他的地理起源，歐洲人的基因地圖和地理地圖間存在著一種映射關系。相關論文分別發表在《自然》和《當代生物學》雜志上。?領導其中一項研究的是美國加
應用SNP芯片測基因組知起源地
歐洲的歷史上充滿著戰爭、入侵和移民，這些因素似乎可以徹底地將不同人種混合在一起。然而，美國和荷蘭科學家獨立進行的兩項最新研究表明，一個歐洲人的基因組信息足以表明他的地理起源，歐洲人的基因地圖和地理地圖間存在著一種映射關系。相關論文分別發表在《自然》和《當代生物學》雜志上。 領導其中一項
南京農大棉花遺傳育種研究發權威期刊
棉花是重要的經濟作物，也是紡織工業的主導原料，在世界及我國國民經濟中占重要地位。隨著植物基因組計劃的不斷發展，對作物進行分子設計和基因工程改良是21世紀植物科學領域中的重要課題。目前，國內外研究人員在棉花遺傳育種工作中取得了一定的進展。 五月二十四日，南京農業大學作物遺傳與種質創新國家重點實驗
高分辨率人類基因變異圖譜繪成
由中、美、英等多國共同發起的國際合作項目“千人基因組計劃”協作組近日宣布，已成功完成高分辨率人類基因組遺傳變異整合圖譜。相關研究論文11月1日在《自然》雜志上在線發表。 “千人基因組計劃”是由中國華大基因研究院、英國桑格研究所、美國國立人類基因組研究所等多家機構共同啟動的一項大規模人類基因
《自然》發表中國人泛基因組參考圖譜，26家單位聯合研究
近日，復旦大學、西安交大、中國醫學科學院等26家單位聯合發布了中國人群泛基因組聯盟（CPC）一期研究進展。6月14日，相關成果以《基于36個族群的中國人泛基因組參考圖譜》為題發表于《自然》（Nature）主刊。這是我國學者領導的人群基因組研究首次發表在《自然》主刊。這項研究初步構建了我國人群的泛基因
科學家篩選出易患膿毒癥關鍵靶點
第三軍醫大學大坪醫院野戰外科研究所第四研究室創傷基礎研究課題組助理研究員曾靈、副研究員顧瑋等在973科學家蔣建新的帶領下，發現并篩選出易患膿毒癥的關鍵靶點，為膿毒癥易患性創傷患者早期預測、預警和干預提供了重要的臨床依據。相關研究論文日前發表在國際外科領域權威期刊美國《外科學年鑒》上
首款鯰魚高密度SNP芯片的開發
為了破譯鯰魚抗病性狀的遺傳機制，改善鯰魚的養殖，美國奧本大學(Auburn University)的研究人員利用Affymetrix公司的Axiom基因分型技術，開發出第一款高密度的鯰魚SNP芯片——Catfish 250K SNP array。這項研究成果于近日發表在《BMC Rese
9月2日《自然》雜志精選
?封面故事：細菌產生抗藥性的機制? 對抗菌素有抗藥性的細菌菌種的出現，是臨床環境中一個越來越大的威脅，但人們對它們出現的過程卻不是很了解。利用暴露于濃度不斷增大的氟喹諾酮抗菌藥“諾氟沙星”的一個大腸桿菌連續培養物所做實驗表明，少數自然出現的抗藥變體能保護其種群的絕大部分。這些具有高
北京基因組所開發完成DNA甲基化重編程數據庫
DNA甲基化是一個重要的表觀遺傳標記，在胚胎早期發育過程中起到至關重要的作用，不同物種所采用的機制亦各不相同。因而，整合多個物種的海量甲基化數據并提供在線的數據瀏覽、獲取及其功能分析，可幫助更多研究人員深入探析不同物種在早期發育時期的DNA甲基化差異，并揭示其DNA甲基化重編程過程與機制。
Nature公布大麥基因組圖譜
大麥是世界上最重要的糧食作物之一，17日Nature公布了目前為止最完善的大麥基因組測序圖譜。這項由美國農業部主導的大工程，在德國、日本、芬蘭、澳大利亞、英國、美國和中國科學家們的共同努力下，歷經六年終于取得了重大進展。大麥基因組圖譜將成為人們提高大麥產量、增強大麥抗蟲抗病能力、增加大麥營養價值
基于低深度測序的關聯分析方法
由于缺少非人類生物的單倍型參考panel，研究人員很難對這類生物進行全基因組關聯分析（GWAS）。為了解決這個問題，牛津大學、威康信托人類遺傳學中心和加州大學洛杉磯分校的研究人員開發了一種生物信息學方法，利用低覆蓋度的全基因組測序數據填充基因型。該項研究近期發表在《Nature Genetics》上
劉伯寧：后基因組時代10年間生命科學的發展與挑戰
8月2日，我國科學家利用“全基因組關聯分析”的方法，在人類1號染色體上發現了肝癌的易感基因區域。這將為肝癌的風險預測、早期預防和個體化治療提供理論依據。 事實上，自2000年人類基因組草圖繪制完成迄今，科學家已經相繼發現70余種疾病的易感基因，基于此的基因診斷產業已經初現端倪，但10
基于SNPs－研究的單倍型圖譜計劃
尋找標記SNPs 的國際遺傳變異圖譜計劃，即國際單倍型圖譜計劃(Haplotype Map Project)已于2002年10月正式啟動，2003 年中國承擔了“國際單倍型圖譜計劃”10% 的任務，這表明我國基因科學研究能力的提高和在國際生命科學領域學術地位的提升。該計劃的啟動將為人類致病基
首個小鼠大腦代謝物圖譜發表
來自小鼠大腦代謝組學圖譜的數據截圖顯示了大腦區域中腺苷隨年齡的分布。 據最新一期《自然·通訊》雜志報道，美國加州大學戴維斯分校研究團隊發表了首個小鼠大腦代謝物圖譜。該數據集涵蓋雄性和雌性小鼠從青春期、成年再到老年的10個大腦區域的1547種不同分子。 論文的資深作者、加州大學戴維斯分校基因組中心
小鼠大腦皮層基因活性圖譜問世
一國際研究小組最新發表在《神經細胞》雜志上的論文稱，他們使用一種最新測序技術，首次成功描繪出小鼠大腦基因活性的完整圖譜。該圖譜覆蓋了整個基因組的所有基因，十分詳細地顯示了小鼠大腦皮層各層次的基因活性情況。研究人員指出，該研究成果不僅有助于科學家進一步理解哺乳動物大腦的組織結構情況，
《自然》發布重要單細胞RNA圖譜：首張小腸細胞圖譜
我們腸道上皮是人體內多樣性最高，最具活力的組織之一, 作為機體與外界的主要界面之一，組成了一個細胞的生態系統。為了更好地理解這些復雜的組織及其功能，還有影響它的疾病，麻省理工學院、哈佛大學和麻省總醫院研究人員領導的一個研究團隊通過分析從小鼠腸道或腸道類器官中取樣的5.3萬多個單獨的細胞，完成了一
國際上首個橡膠草高密度SNP遺傳圖譜構建
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/3/495561.shtm
補全中國人“拼圖”－《自然》發表中國人群泛基因組參考圖譜
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/6/502872.shtm6月14日，《自然》期刊在線發表了西安交通大學、復旦大學、中國醫學科學院等26家單位聯合發布的中國人泛基因組聯盟（CPC）一期研究進展——《基于36個族群的中國人泛基因組參考圖譜》。人
Neogen農業基因組學解決方案（三）
豬的基因組學解決方案GeneSeek 的豬基因組學解決方案為窺探豬的遺傳結構打開了一個重要的窗口，包括是否易感染治療昂貴的疾病以及繁殖中對想要性狀的鎖定。GeneSeek豬全基因組低密度微珠芯片該微珠芯片提供約 10,000個 SNP，包括經常使用的 USDA血統和身份 SNP、用于識別品種的 SN
小鼠肝基因組DNA制備
原理DNA 以核蛋白形式存在于細胞核中，制備 DNA 的原則是既要將 DNA 與蛋白質、脂類和糖類等分離，又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及鏈霉蛋白酶 E 的應用使這兩個原則得到了保證。蛋白酶K 或鏈霉蛋白酶 E 均為廣譜蛋白酶，其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。
小鼠肝基因組DNA制備
原理DNA 以核蛋白形式存在于細胞核中，制備 DNA 的原則是既要將 DNA 與蛋白質、脂類和糖類等分離，又要保持 DNA 分子的完整。蛋白酶K 及鏈霉蛋白酶 E 的應用使這兩個原則得到了保證。蛋白酶K 或鏈霉蛋白酶 E 均為廣譜蛋白酶，其重要特性是能在 SDS 和 EDTA 存在下保持很高的活性。