《自然》：美首次對老鼠基因組調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分——調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗室主任任兵教授（音譯）表示：“10多年前，我們就精確知道組成人類基因組的字母系統（包括堿基等），但是，這些字母如何編排成有意義的單詞、段落甚至生命，我們還知之甚少。例如，我們知道，起作用的基因組中只有1%—2%的部分會為蛋白質編碼，但除此之外，基因組內還有很多區域影響著基因和疾病的發育情況。很顯然，這些區域會做一些事情；而且它們本身也可能發生變化或者消失。” 這些區域中最主要的是順式調控元件，它們是存在于基因旁側序列中能影響基因表達的序列，調控著基因的轉錄活動，而基因調控出錯可能會導致癌癥等疾病的出現。任兵和同事使用高通量測序技術，......閱讀全文
《自然》：美首次對老鼠基因組調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分——調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗
美首次對老鼠基因組的調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分――調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗室主任任兵教
重疊基因的調控序列
①在5′端轉錄起始點上游約20～30個核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。TATA框是一個短的核苷酸序列，其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序，它是RNA聚合酶的重要的接觸點，它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時，mRN
割裂基因的調控序列種類介紹
①在5′端轉錄起始點上游約20～30個核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。 TATA框是一個短的核苷酸序列，其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序，它是RNA聚合酶的重要的接觸點，它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時，
測序技術及DNA序列測定結果分析
實驗概要?在分子生物學研究中，DNA的序列分析是進一步研究和改造目的基因的基礎。目前用于測序的技術主要有Sanger等（1977）發明的雙脫氧鏈末端終止法和Maxam和 ? Gilbert（1977）發明的化學降解法。這二種方法在原理上差異很大，但都是根據核苷酸在某一固定的點開始，隨機在某一個特定的
液相序列捕獲系統與高通量測序
Nature Biotechnology 2009年2月封面文章:基于安捷倫寡核苷酸序列合成技術的液相序列捕獲系統 – 高通量平行靶向測序的最佳解決方案來自美國麻省理工學院和哈佛大學Broad研究院的研究人員，利用安捷倫(Agilent Technologies)卓越的寡核苷酸序列合成技術，合成
關于斷裂基因的調控序列種類介紹
①在5′端轉錄起始點上游約20～30個核苷酸的地方，有TATA框(TATA box)。TATA框是一個短的核苷酸序列，其堿基順序為TATAATAAT。TATA框是啟動子中的一個順序，它是RNA聚合酶的重要的接觸點，它能夠使酶準確地識別轉錄的起始點并開始轉錄。當TATA框中的堿基順序有所改變時，m
三代測序技術實現44倍測序序列連續性提升
2019年9月3日，PNAS（美國科學院院報）在線發表了上海交通大學王文琴副教授團隊課題組題為“Plant evolution and environmental adaptation unveiled by long-read whole-genome sequencing of Spirodel
測序解析miRNA調控害蟲發育機制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范圍內嚴重危害十字花科作物生長的鱗翅目害蟲，據估計每年造成的損失和防治成本達到40-50億美元。最近的轉錄組分析和基因組測序為了解小菜蛾適應環境脅迫的分子機制提供了一個極好的機會。盡管Etebari等1發現了在寄生脅迫下二齡幼蟲中的一組miRNA
古老病毒序列，竟可調控鳥類大腦基因！
病毒與宿主在漫長的演化過程中的相互作用，會對宿主產生深遠的影響。近日，我國科學家最新發現了古病毒與鳥類演化的有趣關聯。研究人員發現，古老病毒曾經插入到鳥類DNA中，并伴隨著雀形目鳥類的物種大爆發，從而在鳥類宿主里不斷增殖。有意思的是，鳥類不僅可以高效的清除掉增殖的病毒DNA，有時還會利用殘余的病毒來
“條形碼”序列測序（BRBseq）廉價且高效
RNA測序是一種通過觀察基因表達來分析整個基因組的技術。如今，這種全基因組表達分析是基因組研究的標準工具，因為它們依賴于高通量技術，而這些技術本身已經變得廣泛可用。 盡管如此，RNA測序仍然是昂貴和費時的，因為它首先需要昂貴的準備一個完整的基因組庫——由細胞RNA生成的DNA池——同時數據本身
DNA序列和大規模DNA測序策略的探討（圖）
人類基因組計劃的核心內容之一是基因組測序。隨著人類基因組圖譜趨于完成，人類基因的 定位克隆、鑒定分析直至全基因組測序取得了突破性進展，測序策略的成熟、測序方法的改進、自動測序儀的廣泛應用、計算機數據分析系統的擴展以及測序分析能力的提高， 大大推進了大規模DNA測序的進程。第一節 DNA測序的基本方法
三篇Nature－Methods：定位基因組的調控序列
科學家們利用染色質對DNase消化和Tn5轉座的敏感性，對基因組的調控序列進行定位和解讀。 近來越來越多的證據顯示，許多遺傳學差異并非直接影響基因，而是改變控制基因開/關的調控序列。近期Nature Methods雜志上發表了三篇文章，介紹了在基因組中定位調控序列的新技術，闡述了進行數
Nature：CRISPRa截然不同的非編碼調控序列分析技術
來自加州大學舊金山分校的一組研究人員修改了現有的基因編輯CRISPR技術，用以來尋找增強子，他們的方法并不是編輯增強子，令其發揮作用，而是利用一種稱為CRISPRa（CRISPR activation）的工具，搜尋影響T細胞免疫細胞發育的一種基因的增強子。這項研究發現將有助于解析自身免疫疾病，如
麻栗坡兜蘭簡單重復序列表達調控關鍵基序獲揭示
華南農業大學教授王艇團隊、福建農林大學教授劉仲健團隊和中山大學教授蘇應娟團隊在國家自然科學基金、廣東省基礎與應用基礎研究基金等項目的資助下，基于統計基因組學分析揭示了麻栗坡兜蘭簡單重復序列的表達調控關鍵基序。相關成果近日發表于《先進科學》（Advanced Science）。簡單重復序列（SSR）在
中國農大:測序解析miRNA調控害蟲發育機制
小菜蛾（Plutella xylostella）是全球范圍內嚴重危害十字花科作物生長的鱗翅目害蟲，據估計每年造成的損失和防治成本達到40-50億美元。最近的轉錄組分析和基因組測序為了解小菜蛾適應環境脅迫的分子機制提供了一個極好的機會。盡管Etebari等1發現了在寄生脅迫下二齡幼
測序與芯片揭示miRNA調控海參夏眠機制
海參（Apostichopus japonicus），是生活在海邊至海底8000米的海洋棘皮動物，以海底藻類和浮游生物為食。當夏季來臨，上層海水由于太陽光強烈照射，溫度上升。此時，海底的小生物都浮到海面，進行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海參，迫于夏季食物中斷，進入夏眠，此時，其基礎代謝率明
放射自顯影和從測序凝膠上讀取－DNA－序列實驗
實驗步驟 材料緩沖液和溶液貯存液、緩沖液和試劑的配方見附錄 1。將貯存液稀釋到合適的濃度。凝膠固定液300 ml 甲醇2.4L 水300 ml 冰醋酸放射性混合物放射性墨水或化學發光標記物參見附錄 9。可重復使用的放射性墨水主要是選擇 Stratagene 的冷光標記物（Glosos)。標記物能被多
放射自顯影和從測序凝膠上讀取－DNA－序列實驗
實驗步驟 材料緩沖液和溶液貯存液、緩沖液和試劑的配方見附錄 1。將貯存液稀釋到合適的濃度。凝膠固定液300 ml 甲醇2.4L 水300 ml 冰醋酸放射性混合物放射性墨水或化學發光標記物參見附錄 9。可重復使用的放射性墨水主要是選擇 Strat
首個亞洲人源基因檢測序列標準物質完成研制
6月，中國計量科學研究院和深圳華大基因研究院共同發布首個亞洲人源(炎黃一號)DNA序列標準物質(BW-5201)和大腸桿菌O157基因組DNA序列標準物質(BW-5202)。這是全球首次發布亞洲人源DNA和微生物基因組DNA序列標準物質，為基因檢測產業評估測序和數據分析的準確性提供了參考標準。
放射自顯影和從測序凝膠上讀取－DNA－序列實驗
本實驗介紹關于放射自顯影和從測序凝膠上讀取 DNA 序列的過程。本實驗來源于分子克隆實驗指南（第三版）下冊，作者：〔美〕J. 薩姆布魯克 D.W.拉塞爾。實驗步驟材料緩沖液和溶液貯存液、緩沖液和試劑的配方見附錄 1。將貯存液稀釋到合適的濃度。凝膠固定液300 ml 甲醇2.4L 水300 ml 冰醋
重磅|華大智造首度公開旗下測序儀文庫構建核心序列
2018年9月8日，在華大基因集團19周年慶前夕，華大智造首次向業內公開華大智造測序儀文庫構建核心序列，致敬華大基因集團。華大智造成立于2016年，一直致力于研發和生產基因測序設備。如行業內小伙伴們所知，華大智造已擁有四款高通量測序儀——BGISEQ-500、BGISEQ-50、MGISEQ-2
Science：新測序法挖掘新的核糖調控元件
最近，以色列魏茨曼科學研究所分子遺傳學系的副教授Rotem Sorek帶領的一個研究小組，開發出一種新的測序技術，為細菌核糖調控打開了大門。相關研究結果發表在《Science》雜志。 當涉及到調節基因時，細菌與真核生物有很大的不同。在細菌中，稱為核糖開關（riboswitches）的功能性調控
安捷倫：用于RNA測序的文庫制備與靶向序列捕獲解決方案
簡化的RNA和DNA測序解決方案，用于精簡臨床NGS 2020年9月1日，北京——安捷倫科技公司（紐約證交所：A）今日宣布推出SureSelect XT HS2 RNA試劑盒。該解決方案采用模塊化設計，為RNA 和 DNA樣品提供了一種簡單的平行分析方法，從而確保客戶能夠簡化并整合其工作流程，而無
我國學者在合成生物基因調控序列智能設計領域取得進展
圖1 跨物種基因調控序列的逆向設計圖2 基于TFBU的增強子模塊化建模與智能設計 在國家自然科學基金項目（批準號：62250007、62225307）等資助下，清華大學自動化系汪小我教授團隊在合成生物基因調控序列智能設計取得進展，系列研究成果連續發表兩篇論文：（1）以“系統表示與優化實現細菌跨物種
科學家闡明攝食全過程的序列性神經調控機制
自然環境變幻莫測。自然界中的動物即使在攝食過程中也需要時刻關注環境中的各種線索，一方面有助于及時發現危險，另一方面利于獲取更多資源。長期以來，由于缺乏細致分析動物多種自發行為的手段，科學家主要利用攝食量這一指標來評價動物的攝食行為。當前的研究將攝食行為簡化為三個階段——饑餓-尋找食物、攝入食物、飽食
中海大：測序與芯片揭示miRNA調控海參夏眠機制
海參（Apostichopus japonicus），是生活在海邊至海底8000米的海洋棘皮動物，以海底藻類和浮游生物為食。當夏季來臨，上層海水由于太陽光強烈照射，溫度上升。此時，海底的小生物都浮到海面，進行一年一度的大量求食和繁殖。而留在海底的海參，迫于夏季食物中斷，進入夏眠，此時，其基礎代謝
西北農林科技大學PLOSGenetics發表紅棗基因組序列測序結果
高品質的干棗基因組序列，以及從其近緣種樹木的基因序列，能夠闡明這種人類已經種植超過7000年的古老果樹的馴化歷史。近期，西北農林科技大學與美國康奈爾大學Boyce Thompson植物研究（BTI）以及北京林業大學的研究人員合作，對中國干棗進行了基因組測序，相關結果發表在12月22日的《PLOS G
揭示重復序列對三維基因組區隔化的調控作用
Cell Research | 沈曉驊/孫育杰課題組合作揭示重復序列對三維基因組區隔化的調控作用 哺乳動物基因組DNA全長近2 m，經過多層有序組織與折疊后分布于直徑5-10 μm的細胞核中。染色質高級結構對基因表達，細胞分化和胚胎發育起著至關重要的作用。其中，基因組A/B區隔化（A/B c
全轉錄組測序技術揭示circRNA新的調控機制（二）
3. 環狀RNA的差異表達與前列腺癌的進展有關研究者對144個前列腺癌進行了聚類分析，與線性RNA相比，環狀RNA最強模式與它們在每個樣本中的總體豐度相一致。另外，極端circRNA分布的患者的預后明顯較circRNA分布穩定的患者差，同時極端circRNA index組也與更高的轉移發生率