RNA實驗方案和應用(二)
miRNA 模擬物是化學合成的,雙鏈RNA分子(通常長度為18–24個核苷酸),通過轉染到細胞中,模擬成熟的內源性miRNA分子。miRNA抑制劑是單鏈(通常長度為21–25個核苷酸),經過修飾的RNA分子,通過轉染到細胞中,特異性的抑制miRNA的功能。模擬物和抑制劑包含一些化學修飾,以便提高活性或者增強其在體內的穩定性。通過將miRNA模擬物轉染到細胞中,并進行下游的基因表達分析或者表型分析,可以闡明特定miRNA分子的目標和發揮的作用。這些實驗可以研究單個miRNA錯誤調節所造成的生物學影響,也能用于確定某個miRNA分子的特異性靶標基因。miRNA轉染之后,如果降低或者提高基因的表達水平,說明研究的miRNA參與調節了這個基因的表達。類似的,miRNA在很多通路中的作用,都可以通過檢測miRNA模擬物或者抑制劑轉染之后的特定表型來研究。miRNA模擬物/抑制劑轉染對于下游應用的影響,通常可以通過如下方案來分析:......閱讀全文
純化RNA實驗
從培養的細胞中純化總RNA 從組織中純化總RNA ? ? ? ? ? ? 實驗材料 細胞
RNA干涉實驗
RNA 干涉(RNA1) 是指在真核細胞中引入雙鏈 RNA ( doubt-stranded RNA,dsRNA ) 分子從而導致具有序列同源性的基因產生特異件基內沉默(gene silencing ) 的現象。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理當確定了靶基因上的 siRN
RNA干涉實驗
化學合成siRNA分子實驗 體外轉錄合成siRNA分子實驗 采用RNA聚合酶Ⅲ啟動子表達siRNA分子 采用RNaseⅢ制備siRNA分子實驗 ? ? ? ? ? ? 實驗方法
RNA干涉實驗
實驗方法原理 當確定了靶基因上的 siRNA 分子作用位點以后,根據靶位點的序列可以很方便地推導得到相應的 siRNA 分子的正義與反義 RNA 鏈序列。它們包含 19 bp 的互補雙鏈區和兩側的不配對區(每側為 2 個 U 成 2 個 T ),在合成時用 T 替代 U 可以降低成本并可以提
RNA分離與分析實驗_分離RNA
實驗材料標記細胞試劑、試劑盒乙酸緩沖液儀器、耗材漩渦器實驗步驟1. 收獲標記細胞。2. 小心處置上清液,用含 0.3% SDS 的 10 mmol/L 乙酸緩沖液懸浮細胞沉淀,每 1 ml 壓積細胞用 10 ml 緩沖液。3. 于室溫用漩渦器振蕩裂解細胞。4. 加等體積的水飽和酚,充分混勻,于 60
RNA干擾回復實驗
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA干擾主體實驗
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
病毒RNA提取實驗
實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料 TMV病毒液試劑、試劑盒 TE-飽和酚:氯仿氯仿NaAc乙醇TE緩沖液雙菌水儀器、耗材 冷凍臺式離心機低溫真空干燥儀電泳儀電泳槽實驗步驟 一、實驗
動物RNA提取實驗
實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA 純化系統)可在1小時內從組織、培養細胞和白細胞中提取純化完整總RNA,方法簡單、快速。該系統以膜為基礎,根據組織類型的不同,每次最多可純化60 mg 組織。系統包含DNase 處理步驟,直接在小離
總RNA提取實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 一些公司推出的總RNA 提取試劑盒,可以用來制備高質量的可用于建庫的RNA 。該總RNA 純化系統采用兩種著名的RNA 酶抑制劑,異硫氰酸弧(GTC)和β-巰基乙醇,加上整個操作都在冰浴下進行,這樣就能顯著降低RNA 的
動物RNA提取實驗
SV總RNA試劑盒提取法 Trizol試劑提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SV Total RNA Isolation System (SV 總RNA
病毒RNA提取實驗
TE-飽和酚/氯仿提取法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲
RNA實驗方法
Solublization of RNA in Formamidecontributed by James McCaughern-Carucci, Yale UniversityResuspending RNA in Formamide (as reported by Chomczynski et
病毒RNA提取實驗
病毒RNA提取可以:(1)用于RNA病毒復制機制研究;(2)用于反向遺傳學研究;(3)用于分子病毒學其他研究。實驗方法原理大多植物病毒RNA 為單鏈RNA ,并且其極性與mRNA 極性相同,植物病毒RNA 提取較為簡單,一般使用酚氯仿即可獲得滿意結果。實驗材料TMV病毒液試劑、試劑盒TE-飽和酚:氯
RNA干擾主體實驗
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
RNA干擾回復實驗
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
真菌RNA提取實驗
實驗方法原理 液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA進入水相,離心后可形成水相層和有機層,這樣RNA與仍留在有機相中的蛋白質和DNA分離開。?實驗材料 菌絲體試劑、試劑盒 NaCl蒸餾水SDSTr
總RNA提取實驗
實驗方法原理 GTC和N-十二烷基肌氨酸鈉的聯合使用,將促使核蛋白復合體的解離,使RNA 與蛋白質分離,并將RNA 釋放到溶液中。而進一步從復合體中純化RNA ,則根據Chomc zynski和Sacchi的一步快速抽提法進行,采用酸性酚-氯仿混合液抽提。低pH值的酚將使RNA 進入水相
細菌RNA制備實驗
實驗材料 RNA試劑、試劑盒 STET氯仿乙酸鈉氯化銫無水乙醇EDTA儀器、耗材 離心機分光光度計搖床實驗步驟 1. ?培養100 ml 大腸桿菌或500 ml 藍細菌至對數生長期,加入1/20體積終止緩沖液,置于冰上。2. ?于4℃用JA-10轉子17 700 g 離心5 min 收集細胞。3.
細菌RNA制備實驗
革蘭氏陰性細菌中提取 革蘭氏陽性細菌中提取 ? ? ? ? ? ? 實驗材料 RNA 試
真菌RNA提取實驗
真菌RNA的提取可以:(1)用于真菌RNA干擾機制研究;(2)用于cDNA文庫構建等研究;(3)用于真菌分子生物學相應研究。實驗方法原理液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA進入水相,離心后可形成
真菌RNA提取實驗
液氮研磨法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚
RNA干擾回復實驗
RNA干擾回復實驗,主要是為了說明Off-target效應。Off-target效應Off-target effects(脫靶效應)最早由Dharmacon科學家Jackson和他的同事們提出(Fedorov,Y.,et al. "Off-targeting By siRNA Can Induce
RNA點雜交實驗
實驗概要了解RNA點雜交實驗,包括純化的RNA的點雜交和狹線雜交,RNA斑點印跡。實驗步驟純化的RNA的點雜交和狹線雜交:1. 安裝印跡裝置?? 1) 切一張合適大小的帶正電荷尼龍膜。用鉛筆標上表示方向的記號。用水把膜簡單弄濕,在20×SSC中室溫泡1 h。?? 2) 在膜浸泡期間,先用0.1 mo
RNA干擾實驗技術
實驗概要本文介紹了RNA干擾的原理及基本實驗方法,包括了siRNA的設計、siRNA的制備和siRNA的轉染等方法,及RNA干擾實驗中的注意事項。實驗原理近年來的研究表明,將與mRNA對應的正義RNA和反義RNA組成的雙鏈RNA(dsRNA)導入細胞,可以使mRNA發生特異性的降解,導致其相應的基因
植物RNA提取實驗
實驗方法原理 獨特的裂解液/β-巰基乙醇迅速裂解細胞和滅活細胞RNA酶,植物RNA助提劑PLANTaid幫助結合多糖多酚并通過離心去除,然后用乙醇調節結合條件后,RNA在高離序鹽狀態下選擇性吸附于離心柱內硅基質膜,再通過一系列快速的漂洗-離心的步驟,去蛋白液和漂洗液將細胞代謝物,蛋白等雜質去除,
植物RNA提取實驗
直接研磨法 液氮研磨法 ? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 通過裂解液β-巰基乙醇迅速裂解細胞和滅活細胞RNA酶,植物RNA助提劑PLANTaid幫助結合多糖多酚并通過離
純化RNA實驗——從組織中純化總RNA
實驗材料組織試劑、試劑盒RNA 抽提緩沖液氯仿實驗步驟1. 從動物取下組織,直接進行第 2 步或在液氮中快速冷凍新鮮解剖的組織。冷凍后的組織可以貯存在 -70℃。2. 組織(0.05~0.3 g)在 2.0 ml RNA 抽提緩沖液中勻漿。3. 每管加 200 μl 氯仿,混合均勻,冰浴 15 分鐘
RNA干擾主體實驗介紹
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準
RNA干擾主體實驗介紹
siRNA表達載體構建好后,即可進行RNA干擾主體實驗。RNA干擾主體實驗的重點在于:成功將siRNA表達載體導入目的細胞如果目的細胞的質粒轉染效率較低(低于70%),則應采用腺病毒或慢病毒載體,利用病毒載體的高感染率、高表達特性,更好地開展RNA干擾主體實驗。設置好分組和對照按照nature的標準