隨機RNA文庫的SELEX篩選實驗
實驗方法原理 SELEX 技術是一種利用隨機寡核苷酸(DNA 或 RNA)文庫篩選靶分子的特異性配基的組合化學技術。最常用的是隨機 RNA 文庫,因為 RNA 分子中除 G-C、A-U 堿基對以外,還有 G-U 等變偶堿基對的存在,可以形成發夾、假結、凸環、G-四聚體等多種空間結 構,它們與靶分子通過氫鍵、范德華力等相互作用,或嵌合,或包被,形成穩定的復合物。 即使很小的一段 RNA 分子也能形成相當穩定的剛性結構。一個包含 25 個隨機序列的隨機 RNA 文庫理論上可以產牛 425~1015 個具有不同空間結構的 RNA 分子,擁有巨大的篩選潛力。實驗材料 X 線膠片可拆卸酶聯板蛋白 A sepharose 凝膠micropure-EZ 脫酶管和 microcon-脫鹽管pGKM-T 載體RiboMAXTM 大體積轉錄試劑盒AMV 反轉錄酶T4 DNA 連接酶pfu Taq DNA 聚合酶r Taq......閱讀全文
隨機RNA文庫的SELEX篩選實驗
隨機RNA文庫的SELEX篩選實驗可用于:(1)體外診斷;(2)體內治療等。實驗方法原理SELEX 技術是一種利用隨機寡核苷酸(DNA 或 RNA)文庫篩選靶分子的特異性配基的組合化學技術。最常用的是隨機 RNA 文庫,因為 RNA 分子中除 G-C、A-U 堿基對以外,還有 G-U 等變偶堿基對的
隨機RNA文庫的SELEX篩選實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SELEX 技術是一種利用隨機寡核苷酸(DNA 或 RNA)文庫篩選靶分子的特異性配基的組合化學技術。最常用的是隨機 RNA 文庫,因為 RNA 分子中除 G-C、A-U 堿基對以外,還有 G-U 等變偶堿基對的存在,可以形
隨機RNA文庫的SELEX篩選實驗
實驗方法原理 SELEX 技術是一種利用隨機寡核苷酸(DNA 或 RNA)文庫篩選靶分子的特異性配基的組合化學技術。最常用的是隨機 RNA 文庫,因為 RNA 分子中除 G-C、A-U 堿基對以外,還有 G-U 等變偶堿基對的存在,可以形成發夾、假結、凸環、G-四聚體等多種空間結 構,它
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗可用于:(1)體外診斷;(2)體內治療等。實驗方法原理SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。實驗材料3
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。
單鏈DNA文庫的SELEX篩選實驗
實驗方法原理 SELEX 技術除了可以使用 RNA 文庫以外,還可以使用單鏈 DNA 文庫進行篩選。單鏈 DNA 形成高級結構的豐富性也足夠用于對許多靶分子的篩選,而且 DNA 文庫具有更好的穩定性,操作也相對簡便。實驗材料 3' 引物鏈親和素磁珠儀器、耗材 電泳儀PCR 儀離心機凝膠成像儀
【卡梅德生物】SELEX技術|核酸適配體文庫篩選服務
? ?核酸適配體文庫篩選是一項關鍵的技術,為發現特定核酸序列與目標分子高度親和結合的適配體提供了強有力的工具。這一技術在諸多領域中展現了突破性的應用,包括藥物開發、診斷技術以及基因治療等。? ?核酸適配體是一類能夠與目標分子特異性結合的寡核苷酸序列,其結構和功能類似于抗體。與抗體相比,核酸適配體具有
天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗
細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 mRNA 的相互作用調控基因的表達。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛
天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗
實驗方法原理 細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 mRNA 的相互作用調控基因的表達。實驗材料 mRNA寡核苷酸試劑、
天然RNA文庫篩選與蛋白特異性結合的RNA序列實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 細胞中,蛋白質與 RNA 結合參與多種生理調控和發育過程。在 mRNA 的加帽,多聚腺苷酸化,剪切,核外運,翻譯起始及降解等過程中都存在著蛋白質與 RNA 的直接相互作用。在發育的各個階段,RNA 結合蛋白可以通過與 m
YAC實驗——YAC文庫篩選
實驗步驟1. ?YAC中心實驗室用于篩選文庫的方法進展很快。2. ?將一塊或多塊微量滴定板微孔中的YAC克隆轉印到尼龍膜上,用單拷貝探針進行雜交,就可以篩選YAC文庫了。3. ?然而,由 于雜交實驗的信噪比較低以及制備所有的轉印尼龍膜所需的花費巨大,絕大多數實驗室已采用PCR方法來篩選文庫。4. ?
建立隨機重疊DNA插入文庫實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 乙酸銨 ATP 乙醇 甘油 蒸餾水 IPTG MgCl2 NaCl 酚
建立隨機重疊DNA插入文庫實驗
下面的方案描述了鳥槍法測序的起始步驟,從靶 DNA 的剪切到用 M13 噬菌體載體構建 DNA 片段文庫,也包括斷裂靶 DNA 的兩種方法--超聲法和噴霧法,以及用 DNA 聚合酶修復片段末端的技術要點。本實驗來源于分子克隆實驗指南(第三版)下冊,作者:〔美〕J. 薩姆布魯克 D.W.拉塞爾。試劑、
SELEX技術
這個技術就是一個文庫技術(library)加一套篩選技術(bio-panning)。當然,SELEX技術僅僅是分子進化工程的一種而已。實際上,理解了文庫技術和篩選技術,不僅selex理解了,其他熱門技術如Phage display等等也懂了。我知道的著作中,趙康等主編的Frontiers of Bi
液相法篩選cDNA表達文庫中RNA結合蛋白實驗
實驗方法原理 將 cDNA 文庫表達的蛋白固定于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,然后用標記的 RNA 對其進行篩選的方法是篩選 RNA 結合蛋白研究中最常用的技術。實驗材料 TY試劑、試劑盒 儲存液溶菌酶干粉細菌裂解緩沖液甘油水溶液實驗步驟 一、材料與設備1. 2X TY:16 g 蛋白胨,10 g 酵母提
液相法篩選cDNA表達文庫中RNA結合蛋白實驗
將 cDNA 文庫表達的蛋白固定于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,然后用標記的 RNA 對其進行篩選的方法是篩選 RNA 結合蛋白研究中最常用的技術。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理將 cDNA 文庫表達的蛋白固定于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,然后用標記的 RNA 對其進行篩選的方法
液相法篩選cDNA表達文庫中RNA結合蛋白實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 將 cDNA 文庫表達的蛋白固定于硝酸纖維素膜或尼龍膜上,然后用標記的 RNA 對其進行篩選的方法是篩選 RNA 結合蛋白研究中最常用的技術。 實驗材料
SELEX技術——抗體工程的新紀元1
回顧20世紀,分子生物學及其相關學科的發展給科學研究和人類生活帶來了日新月異的變化,同時也更新了一些傳統概念。比如,自20世紀30年代以來,人們一直認為"所有的酶都是蛋白質"。1986年,Lerner等首次研制成功催化水解羧酸酯的抗體,稱之為抗體酶(Abzyme)。1987 年,Cech等發
Northwestern篩選蛋白表達文庫實驗
實驗方法原理 Northwestern 篩選蛋白表達文庫的方法是通過構建 IPTG 可誘導的融合蛋白表達文庫(融合蛋白的 N 端由載體序列編碼,C 端由克隆到載體的 cDNA 文庫編碼),進而誘導融合蛋白表達,并將蛋白質固定于硝酸纖維素濾膜上,以標記的 RNA 探針進行篩選,最終獲取能與靶
Northwestern篩選蛋白表達文庫實驗
Northwestern 篩選蛋白表達文庫的方法是通過構建 IPTG 可誘導的融合蛋白表達文庫(融合蛋白的 N 端由載體序列編碼,C 端由克隆到載體的 cDNA 文庫編碼),進而誘導融合蛋白表達,并將蛋白質固定于硝酸纖維素濾膜上,以標記的 RNA 探針進行篩選,最終獲取能與靶 RNA 分子特異性結合
Northwestern篩選蛋白表達文庫實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 Northwestern 篩選蛋白表達文庫的方法是通過構建 IPTG 可誘導的融合蛋白表達文庫(融合蛋白的 N 端由載體序列編碼,C 端由克隆到載體的 cDNA 文庫編碼),進而誘導融合蛋白表達,并將蛋白質固定于硝酸纖維素濾
CDNA文庫篩選
CDNA文庫篩選(一)λgt11 cDNA文庫鋪平板宿主細菌制備1.用一個E.coli宿主菌株單菌落分別接種2×5ml LB培養基(Y1088用于噬菌斑雜交,Y1090用于免疫篩選),于37℃振蕩培養過夜。2.將過夜培養物以3000×g離心5min。3.分別用2ml?λ-dil(10 mmol/L
CDNA文庫篩選
(一)λgt11 cDNA文庫鋪平板宿主細菌制備1.用一個E.coli宿主菌株單菌落分別接種2×5ml LB培養基(Y1088用于噬菌斑雜交,Y1090用于免疫篩選),于37℃振蕩培養過夜。2.將過夜培養物以3000×g離心5min。3.分別用2ml?λ-dil(10 mmol/L tris-Cl,
細胞-SELEX(CellSELEX)技術篩選適配體的方法介紹
該方法的主要靶標物質是細胞、細菌或病毒等,操作過程中采用離心、沉淀的方法分離去除未結合適配體,再通過熱解離或酶切作用獲得特異性適配體序列。Liang 等針對感染狂犬病毒的活細胞,應用 Cell-SELEX 經過35 輪重復篩選獲得了 5 條 DNA 適配體。病毒效價測定與實時定量反轉錄 PCR
熒光磁珠-SELEX(FluMagSELEX)技術篩選適配體的介紹
熒光磁珠 SELEX(FluMag-SELEX)技術。FluMag-SELEX 是結合應用磁珠與 SELEX技術篩選熒光適配體的一種方法,該方法需要靶標量少且可通過熒光直觀測定結合適配體的量。Kim 等應用FluMag-SELEX 技術篩選獲得廣譜抗炎性藥物布洛芬的5條特異性適配體。其中三條是外
Dharmacon文庫在RNAi文庫篩選的應用
1.什么是文庫?――大幅提高研究效率的利器以往的實驗室研究中,無論是尋找新基因的功能、探索已知基因致病的機制、解析復雜信號通路網絡、探索疾病發生發展的機制,藥物敏感性測試或者是尋找藥物開發的新靶點,科研工作者們往往是圍繞著潛在的單個目標基因進行改造,包括針對該基因的過表達、沉默、敲除、激活、修飾、突
篩選質粒載體構建表達文庫實驗
試劑、試劑盒 封閉緩沖液氯仿裂解緩沖液檢測抗原-抗體復合物所用試劑SMTNT 緩沖液洗滌緩沖液 125I 標記的蛋白質 A 或 125I 標記的免疫球蛋白放射性碘化第二抗體第一抗體LB 或 SOB 瓊脂平板儀器、耗材 空氣培養箱平頭鑷子 裝有防水黑墨水(印度墨水)并帶有 18 號針頭的注射器硝酸纖維
篩選質粒載體構建表達文庫實驗
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 封閉緩沖液 氯仿 裂解緩沖液 檢測抗原-抗體復合物所用試劑 SM TNT 緩沖液 洗滌緩沖液
篩選質粒載體構建表達文庫實驗
檢測結合抗體的方法有以下 3 種:放射化學篩選,生色反應篩選及化學發光反應篩選。3 種方法的優缺點在本章導言中有所論述。本實驗來源于分子克隆實驗指南(第三版)下冊,作者:〔美〕J. 薩姆布魯克 D.W. 拉塞爾。試劑、試劑盒封閉緩沖液氯仿裂解緩沖液檢測抗原-抗體復合物所用試劑SMTNT 緩沖液洗滌緩
基于-PCR-的-DNA-文庫篩選實驗方法
? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 PCR 混合物 PCR 引物寡核苷酸 雜交寡核苷酸 PCR 正對照 PCR 主要混合物 蒸餾水