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  • BAC文庫構建方法與技巧

    基因組DNA文庫有十分廣泛的用途,如用于分析、分離特定的基因片段,用以基因表達調控、人類及動植物基因組工程的研究。通常情況下,基因組文庫構建的基本流程可以歸為4大步驟:分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。 一、分離基因組DNA(gDNA) 毫無疑問,優質的基因組DNA對于基因組文庫構建是至關重要的。研究者需要查閱文獻,通過經驗來選擇合適的基因組DNA分離方法,在分離過程中保證DNA不被過度剪切或降解,同時也要盡量保證DNA的純度。 二、處理基因組DNA 根據研究目的,研究者需要選擇合適的載體。不同的載體對基因組DNA的長度有不同的要求,研究者必須選擇合適長度的基因組DNA來構建基因組文庫。 構建黏粒基因組DNA文庫,研究者需要將基因組DNA用注射器抽打來隨機剪切DNA;接著用末端修復酶修復DNA,可以提高DNA連接入載體的效率;然......閱讀全文

    DNA文庫的構建及其篩選

    DNA文庫的構建和篩選可以用于:(1)將某生物的全部基因組DNA用限制性內切酶或機械力量切割成一定長度的DNA片段,再與適合的載體在體外重組并轉化相應的宿主細胞獲得的所有陽性菌落。 (2)采用“化整為零”策略,將龐大的基因分解成一段段,每段包含一個或幾個基因。實驗方法原理高等植物基因組的一個顯著特征

    cDNA文庫的構建和篩選

    材料許多生物是疾病研究或探索使細胞和機體應對和存活于不同刺激下的分子適應機制的優良模型。 cDNA 文庫的構建和隨后目的基因的篩選可促使研究者發現在調節和響應某些外部特定環境壓力中有重要作用,而在其他體系中可能不表達或者不存在的新基因。確定這些新基因的可讀框,進一步分析其編碼蛋白質的功能可以開創全新

    基因組文庫和cDNA文庫的構建及篩選

    劉芝華 中國醫學科學院腫瘤研究所??分子腫瘤學國家重點實驗室?概念:?基因組文庫是含有某種生物體全部基因的隨機片段的重組DNA克隆群體;cDNA文庫是指含有所有重組cDNA的克隆群體。???基因組文庫:來源于基因組DNA,反映基因組的全部信息,用于基因組物理圖譜的構建,基因組序列分析,基因在染色體上

    基因組DNA文庫構建的基本流程

    基因組 ?DNA文庫有十分廣泛的用途,如用于分析、分離特定的基因片段,用以基因表達調控、人類及動植物基因組工程的研究。通常情況下,基因組文庫構建的基本流程可以歸為4大步驟:分離基因組DNA、對基因組DNA作相關的處理、將基因組DNA片段連接入載體、將重組載體轉入宿主細胞。 一、分離基因組DN

    構建人VH基因節段文庫

    構建人VH基因節段文庫[器材和試劑]● PCR試劑和設備● 自pHENl中天然scFv文庫制備的scFv基因文庫模板DNA(單鏈和雙鏈DNA 10ng/ul)● Genecle&n試劑盒(Qbiogene)● PVH3FoR1引物: 5'-TCG CGC GCA GTA ATA CAC GG

    cDNA文庫構建的注意事項

    構建全長cDNA文庫分為噬菌體文庫和質粒文庫,二者大同小異。無論怎樣,應當注意如下幾個方面:?一、保證獲得數量足夠的高質量的起始RNA。構建cDNA文庫要求的RNA量比做RACE和Northern blot的要多,在材料允許的情況下一般的試劑盒均推薦采用純化總mRNA后進行反轉錄,這比直接采用總RN

    人VL基因文庫的構建

    [器材和試劑]●? PCR試劑和設備●? cFv基因文庫單鏈模板DNA,制備自pHENl中的天然scFv文庫(10ng/u1)●? Gelleclean試劑盒(Qbiogene)●? Wtzard PCR純化試劑盒(ProlneSa)●? RJHl/2Xho引物:? 5'-GGC ACC C

    全長cDNA文庫的構建—SMART技術

    ? ? ? ? 真核細胞的mRNA在加工過程中有一個比喻為“穿鞋戴帽”的過程,因此mRNA的3'末端都帶有一段Poly A,這是利用逆轉錄酶制備cDNA文庫的基礎。但是由于cDNA的5'端的序列各不相同,如何獲得全長的cDNA,如何擴增由微量的mRNA逆轉錄得到的cDNA文庫、如何利

    構建cDNA文庫的注意事項

      噬菌體文庫或質粒文庫均對載體與cDNA的連接效率要求很高,也對連接產物轉染或轉化大腸桿菌的效率要求很高。連接效率高低直接關系到文庫構建是否成功,更要注意的是文庫連接與一般的片段克隆的連接不一樣。一般的片段克隆連接是固定長度的載體與固定長度的目的DNA連接,而文庫連接是固定長度的載體與非固定長度的

    RACE技術擴增構建全長cDNA文庫

    實驗概要利用RACE(利用PCR技術快速擴增全長mRNA)技術構建全長cDNA文庫是傳統C庫構建技術的改進。本實驗即是利用寡核苷酸帽法,進行全長C庫的構建,從而掌握RACE技術的原理與基本操作方法。實驗原理其原理是利用真核mRNA的3’poly(A)和5’帽子結構作為標簽,用通用引物識別并配對標簽序

    高效構建60120-bp-短片段-cfDNA-文庫的方法

    簡介:從血漿中分離的cfDNA(游離DNA)能夠在創新式的非入侵條件下提供極具價值的基因組信息。cfDNA片段的大小主要集中于170bp,即纏繞一個核小體的DNA片段。越來越多的研究認為更短的cfDNA片段(40-170bp)保留著關于胎兒、腫瘤相關拷貝數變異和細胞起源的基因組信息(Jiang

    BAC-DNA分離方法-Isolation-of-BAC-DNA-from-Largescale-Cultures

    Isolation of BAC DNA from Large-scale CulturesJoseph SambrookPeter Maccallum Cancer Institute and The University of Melbourne, AustraliaDavid W. Russe

    Construction-of-BAC-Libraries:Construction-of-a-BAC-library

    Once high molecular weight (HMW) DNA has been prepared it must somehow be fragmented and DNA in the desired size range isolated. In general, as the de

    篩選質粒載體構建表達文庫實驗

    試劑、試劑盒 封閉緩沖液氯仿裂解緩沖液檢測抗原-抗體復合物所用試劑SMTNT 緩沖液洗滌緩沖液 125I 標記的蛋白質 A 或 125I 標記的免疫球蛋白放射性碘化第二抗體第一抗體LB 或 SOB 瓊脂平板儀器、耗材 空氣培養箱平頭鑷子 裝有防水黑墨水(印度墨水)并帶有 18 號針頭的注射器硝酸纖維

    篩選質粒載體構建表達文庫實驗

    ? ? ? ? ? ? 試劑、試劑盒 封閉緩沖液 氯仿 裂解緩沖液 檢測抗原-抗體復合物所用試劑 SM TNT 緩沖液 洗滌緩沖液

    篩選質粒載體構建表達文庫實驗

    檢測結合抗體的方法有以下 3 種:放射化學篩選,生色反應篩選及化學發光反應篩選。3 種方法的優缺點在本章導言中有所論述。本實驗來源于分子克隆實驗指南(第三版)下冊,作者:〔美〕J. 薩姆布魯克 D.W. 拉塞爾。試劑、試劑盒封閉緩沖液氯仿裂解緩沖液檢測抗原-抗體復合物所用試劑SMTNT 緩沖液洗滌緩

    單域抗體|納米抗體|VHH文庫構建

    單域抗體,也稱為VHH(Variable domain of heavy chain of HCAb)抗體或納米抗體,是一種小型抗體分子。與傳統抗體相比,VHH具有更小的分子尺寸、更高的穩定性和更易于工程化的特點,具有廣泛的生物醫學應用潛力。單域抗體文庫的構建是開發和優化這些抗體的關鍵步驟之一。?一

    DNA文庫構建和Illumina測序化學原理

    單細胞測序方法和原理系列:所謂DNA文庫,實際上是許多個DNA片段,在兩端接上了特定的DNA接頭,形成的DNA混合物。文庫有2個特點:1. 當中這一段插入的DNA,它的序列是各種各樣的。2. 它的兩頭的街頭序列,是人工特異加上去的,是已知的。要構建文庫,首先需要把基因組DNA用超聲波打斷,之后把兩端

    Construction-of-BAC-Libraries:SOLUTIONS-FOR-BAC-LIBRARY-CONSTRUCTION

    SOLUTIONS FOR BAC LIBRARY CONSTRUCTION10X Homogenization Buffer (HB) stock: (1 liter)IngredientAmountFinal ConcentrationTrisma base12.1 g0.1 MKCl59.7

    基于堿基編輯的全基因組擾動文庫構建與篩選技術

      通過全基因組規模擾動文庫的構建與篩選,從宏觀基因組層面系統研究基因型與表型的對應關系,是微生物功能基因組學研究的重要方法。相較于單個基因擾動文庫的構建與篩選,混合文庫的構建與篩選可通過一次實驗實現特定條件下對上千個基因的同時篩選,顯著提高通量。近年來,CRISPR/Cas技術憑借著精簡高效、可編

    全自動化DNA文庫構建技術簡介

    在二代測序中,基因文庫的構建是一項十分耗時耗力的工作,需要熟練的科研技術人員在整個操作過程中保持需高度注意力,花費大量時間和精力才能完成建庫工作。因此,大多數實驗室有將文庫構建工作自動化的需求,以節省人力。應文庫構建自動化的需求,派瑪.迪格(PrimaDiag)公司研發了ACSIA NGSLib

    人VL基因文庫(genomic-library)的構建

    [器材和試劑]?● PCR試劑和設備?● cFv基因文庫單鏈模板DNA,制備自pHENl中的天然scFv文庫(10ng/u1)?● Gelleclean試劑盒(Qbiogene)?● Wtzard PCR純化試劑盒(ProlneSa)?● RJHl/2Xho引物: 5'-GGC ACC CT

    構建小鼠基因組CRISPR導向RNAs文庫

      研究人員開發出一種方法,構建出了一個可誘導小鼠基因組全基因靶向突變的CRISPR導向RNA(gRNAs)綜合文庫。人們可利用這一文庫來調查不同細胞類型中每個基因的作用。這一突破性的研究成果在線發表在12月23日的《自然生物技術》(Nature Biotechnology)雜志上。   CR

    NGS基因文庫構建大比拼(二)

    隨著測序技術的發展,科學界也開始越來越多地應用測序技術來解決生物學問題。在過去的十年里,新一代測序技術—第二代測序(NGS)迅猛發展,越來越多測序實驗室的采用NGS技術作為測序主要手段。而且NGS高通量的特點,使之成為研究DNA和RNA的主要工具。在NGS過程中,構建基因文庫是整個測序進程中第一個步

    電轉化連接物及構建抗體文庫

    實驗概要本實驗通過電轉化連接物,構建了抗體文庫。主要試劑1. SOC培養基(將20g細菌培養用胰蛋白胨、5g酵母提取物及0.5g NaCl溶于950ml水中。加入10m1 250mmol/L KCl,5mol/L NaOH調整pH至7.0并加入去離子水至IL。高壓滅菌。手感變涼后,再加入5m

    構建cDNA文庫的層析柱cDNA分級

      這一步稍不注意會影響成功性或影響獲得的cDNA的片段分布特點。這一步的操作要小心,尤其要在加入cDNA之前通過反復懸浮和試滴保證柱子能正常工作,cDNA的加入和收集要精力集中。獲得的每一級的cDNA量很少,檢測時帶型很暗,所以要用新鮮做的透明薄膠檢測,根據檢測結果一定要舍棄太短的cDNA(一般4

    cDNA文庫構建技術cDNA鏈的反轉合成

    構建cDNA文庫是一種獲得目標基因并進一步進行基因重組,基因克隆的重要方法,而在該文庫構建中有mRNA 逆轉錄出cDNA是一步極為關鍵的操作。mRNA的逆轉錄主要由MMLV、AMV兩種逆轉錄酶催化合成cDNA,在這個逆轉錄過程中,模板mRAN及逆轉錄酶是兩個最重要的影響因素。對于mRNA來講,一

    cDNA文庫構建技術cDNA鏈的反轉合成

    實驗概要構建cDNA文庫是一種獲得目標基因并進一步進行基因重組,基因克隆的重要方法,而在該文庫構建中有mRNA 逆轉錄出cDNA是一步極為關鍵的操作。mRNA的逆轉錄主要由MMLV、AMV兩種逆轉錄酶催化合成cDNA,在這個逆轉錄過程中,模板mRAN及逆轉錄酶是兩個最重要的影響因素。對于mR

    PCR剪接VHCDR3基因文庫和VL基因構建scFv基因文庫

    [器材和試劑]Winard?PCR純化試劑盒?(Promega)PCR試劑和設備用于連接scFv和pHENl?DNA以及將scFv文庫電轉化到大腸桿菌TGl株的試劑和設備 FDSEQ引物擴增的VHCDR3基因文庫和VL基因,[方法]1. 配制4個25ulPCR反應液,包含:去離子水,10.25ul1

    PCR剪接VHCDR3基因文庫和VL基因構建scFv基因文庫

    [器材和試劑]Winard PCR純化試劑盒 (Promega)PCR試劑和設備用于連接scFv和pHENl DNA以及將scFv文庫電轉化到大腸桿菌TGl株的試劑和設備 FDSEQ引物擴增的VHCDR3基因文庫和VL基因,[方法]1. 配制4個25ulPCR反應液,包含:去離子水,10.25ul1

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