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  • 基因組“暗物質”挑戰遺傳學中心法則?

    1953年,DNA雙螺旋模型的提出標志著近代分子生物學的誕生。1957年,弗朗西斯·克里克進一步提出了經典的遺傳學中心法則,開啟了分子生物學時代。經過幾十年的研究,科學家對于非編碼RNA的認知極大豐富了人類對中心法則的理解。從廣義上講,非編碼RNA在真核生物轉錄組中占據了非常大的部分,包括小RNA、長非編碼RNA、環形RNA以及高度重復序列的RNA等多種類別。更重要的是,盡管非編碼RNA不具備編碼蛋白質的能力,但可以直接調控生物性狀。我和非編碼RNA的淵源可以追溯到我在博士階段接觸的第一個課題。當時,我就對非編碼RNA的研究產生了濃厚興趣。回國建立自己的實驗室后,我提出了一個猜想:并非所有長非編碼RNA都具有當時科學界所認為的、類似信使RNA的結構,可能存在一些新型長非編碼RNA家族有待發現。基于這個猜想,我們實驗室創建了針對無多聚腺苷酸尾RNA的研究新體系,為發現新型長非編碼RNA分子奠定了基礎。通過對人類細胞中無多聚腺苷酸尾......閱讀全文

    Nature:復雜生命難道不需要非編碼DNA?

      非編碼DNA僅占據絲葉貍藻基因組3%的組成成分,這是否證明了對于復雜生命來說,非編碼DNA并不需要呢?   自從科學家們首次發現超過95%的人類基因組是由非編碼元件組成以來(非編碼元件是指不會編碼任何特殊蛋白質的 DNA 片段),他們就一直致力于了解這種所謂的“垃圾” DNA 的作用。在過

    非編碼DNA可用于開發癌癥特異性疫苗

      癌癥疫苗,是科學家們五十多年來一直潛心研究的疑難課題,但直到最近的一項研究才得以證明這種疫苗是有效的。  近日,加拿大蒙特利爾大學免疫和癌癥研究所(IRIC)的一個研究團隊證明了癌癥疫苗可以起作用。不僅如此,它還可以成為一種非常有效、非侵入性以及低成本的抗癌工具。這項研究剛發表在《Science

    Nature子刊:長非編碼RNA可模擬DNA起作用

      長期以來,人們一直認為基因組的大部分區域屬于“禁飛區”。這些區域不編碼任何蛋白,因此細胞的基因讀取機器很少接近。然而近年來科學家們發現,許多非編碼序列其實能夠轉錄成RNA,Gas5就是其中之一。  GAS5是一段基因間的長非編碼RNA(lincRNA),它來自于非編碼的“垃圾DNA”或“基因組的

    非編碼區的作用

    非編碼區雖然不能編碼蛋白質,但對于遺傳信息表達是不可缺少的。在它上面有調控遺傳信息表達的核苷酸序列,是有遺傳效應的。比如RNA聚合酶結合位點。非編碼區對目的基因是不可缺少的。非編碼區上有與RNA聚合酶的結合位點,具有調控作用。基因非編碼區的堿基的插入、缺失和替代也屬于基因突變事件,盡管大多數的研究是

    非編碼區的定義

    基因是由成千上萬個核苷酸對組成。組成基因的核苷酸序列可以分為不同區段。在基因表達的過程中,不同區段所起的作用不同。能夠轉錄為相應信使RNA,進而指導蛋白質合成(也就是能編碼蛋白質)的區段叫做編碼區。不能編碼蛋白質的區段叫做非編碼區。非編碼區位于編碼區前后,同屬于一個基因,控制基因的表達和強弱 。

    新發現!非編碼DNA突變也可引發癌癥-|-Nature子刊

      基因與癌癥的關系遠比人類已了解的更加復雜。近日,美國科學家在一項新研究中鑒定出了近200個在不同的癌癥中發揮作用的非編碼DNA突變。   圖片來源:Nature Genetics(doi:10.1038/s41588-018-0091-2)   在人類基因組中,有98%的信息是看似無用的“垃

    新發現!非編碼DNA突變也可引發癌癥-|-Nature子刊

      基因與癌癥的關系遠比人類已了解的更加復雜。近日,美國科學家在一項新研究中鑒定出了近200個在不同的癌癥中發揮作用的非編碼DNA突變。   image.png   圖片來源:Nature Genetics(doi:10.1038/s41588-018-0091-2)   在人類基因組中,有9

    Cell驚人發現:誰說非編碼RNA不編碼?

      來自德克薩斯大學西南醫學中心的Eric Olson和同事們在分析梳理肌肉特異性的長鏈非編碼RNAs(lncRNAs)以了解它們的功能時,發現了一種在骨骼肌中特異性表達的lncRNA。盡管這一RNA以往被歸類為是非編碼RNA,它的序列中包含的一小段卻看上去好像一個編碼區域。這一研究發現發布在《細胞

    “垃圾DNA”或是編碼DNA的“衛士”

       “垃圾DNA”的概念是在上世紀70年代提出來的,用來形容那些基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列,而在學術上被稱為非編碼DNA序列。  由于當時的科學家普遍認為有生物學意義的蛋白質才是決定生物性狀的關鍵,而且也沒有一種好的理論和技術手段來解釋這些“垃圾”存在的原因,于是“垃圾DNA”這一觀念便形

    “垃圾DNA”或是編碼DNA的“保鏢”

    "垃圾DNA"的概念源自上世紀70年代,用來形容基因組中不是編碼蛋白質的DNA序列,在學術上被稱為非編碼DNA序列。 非編碼DNA"開關說"究竟是個啥? 科學家們發現,人類基因組中包含多達400萬個基因開關和功能調節因子,它們的載體便是"垃圾DNA"。這強烈地沖擊了"DNA序列=生物性

    非編碼序列的定義

    中文名稱非編碼序列英文名稱non-coding sequence定 ?義基因中不具有編碼功能的序列。如真核生物基因的內含子、啟動子等。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    簡述非編碼RNA的成熟

      多數生物體中的非編碼基因(ncRNA)被轉錄為需要進一步加工的前體。核糖體RNA(rRNA)通常被轉錄為含有一個或多個rRNA的前體rRNA,前體rRNA后來在特定位點被大約150種不同的snoRNA切割和修飾。轉移RNA(tRNA)的5'和3'端序列分別被RNase P和tRN

    非編碼序列的概念

    中文名稱非編碼序列英文名稱non-coding sequence定  義基因中不具有編碼功能的序列。如真核生物基因的內含子、啟動子等。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)

    長非編碼RNA與肺癌轉移

      我們體內的大多數DNA(約80%)并沒有編碼蛋白,不過它們會轉錄為RNA。這些非編碼的RNA分子負責在細胞中實現多種功能。microRNA等小RNA已經被研究得很多了,近年來人們又發現了一類長非編碼RNA,這些RNA擁有兩百個以上的核苷酸。   長非編碼RNA對細胞周期、細胞生長和細胞死亡等細

    良好的開端:破譯非編碼突變!

      12月14日,《Science》雜志報道,一項針對將近2000個家庭的全基因組測序研究顯示,自閉癥患者基因組的“啟動子”區發生了突變,首次在全基因組分析背景下,揭示了人類基因組中非編碼突變的作用。  大多數自閉癥等疾病的測序研究都集中在基因組的編碼區,因為人們認為編碼基因是構建蛋白質的“食譜”。

    Nature解析癌癥與非編碼RNA

      人類基因組可生成1萬多種長鏈非編碼RNA(lncRNA) 分子,但人們至今卻只知道其中幾十種轉錄物的功能。在發表在8月14日《自然》(Nature)雜志上的一篇新研究中,來自加州大學的楊柳青(Liuqing Yang,音譯)等研究人員揭示,兩種lncRNAs結合并控制了雄激素受體的功能。

    《自然》:研究揭示mRNA非編碼功能

      由1962年諾貝爾生理學或醫學獎獲得者英國科學家克里克和美國科學家沃森提出的分子生物學中心法則認為,遺傳信息是從DNA(脫氧核糖核酸)傳遞給mRNA(信使核糖核酸),再從mRNA傳遞給功能蛋白質,由此來完成遺傳信息的轉錄和翻譯過程的。  根據這一中心法則,mRNA似乎只有唯一的功

    細胞化學詞匯非編碼小RNA

    中文名稱:非編碼小RNA英文名稱:small non-messenger RNA;snmRNA定  義:細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科:生物化學

    自閉癥或因父親基因突變-非編碼區DNA結構變體潛藏禍端

      《科學》雜志官網近日消息稱,一項探索非編碼DNA的新研究發現,調節基因活性區域的改變也可能導致自閉癥,令人驚訝的是,這些變化傾向于從非自閉癥的父親那里繼承而來。  過去十年中,研究人員已經發現了數百種可能影響大腦發育,從而增加自閉癥風險的基因變異,但這些變異主要來自直接編碼蛋白質的DNA中。此外

    非程序DNA合成檢測實驗

    實驗方法原理 非程序DNA合成(Unscheduled DNA Synthesis:UDS)即S期外的DNA合成。在一般情況下細胞內DNA合成只見于S期,但當處于非S期細胞DNA受損傷時,隨著DNA損傷的修復也將發生DNA合成現象,即UDS。在化學致突變物、致癌物作用誘發細胞DNA損傷時,也誘導DN

    非程序DNA合成檢測實驗

    實驗方法原理非程序DNA合成(Unscheduled DNA Synthesis:UDS)即S期外的DNA合成。在一般情況下細胞內DNA合成只見于S期,但當處于非S期細胞DNA受損傷時,隨著DNA損傷的修復也將發生DNA合成現象,即UDS。在化學致突變物、致癌物作用誘發細胞DNA損傷時,也誘導DNA

    Nat-Genet.:非編碼蛋白DNA在二型糖尿病中或起重要作用

      近日發表在Nature Genetics雜志上的文章稱,基因組非編碼蛋白質序列在二型糖尿病中或起重要作用。   不編碼蛋白質的DNA序列一度被認為是"垃圾DNA",但是近日越來越多的實驗結果表明這些序列與基因的表達調控相關。   遺傳因素被認為與二型糖尿病有很大的相關性,除此之外還有體重,飲

    長鏈非編碼-RNA-測序案例分析

    背景:人類壽命的延長伴隨著神經退行性疾病的發病幾率的增加,因而價格不貴的血液診斷的發展迫在眉睫。通過 RNA-seq 分析血液細胞的轉錄本是發現新的生物標志物的非常高效的途徑。 目的:利用 Illumina 測序平臺對帕金森病人白血球中 lncRNAs 進行分析,探討其對 mRNA 選擇性剪接的

    非編碼小RNA的基本信息

    中文名稱非編碼小RNA英文名稱small non-messenger RNA;snmRNA定  義細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科生物化學與分子生

    Nature重要發現:獨特的非編碼RNA

      我們的皮膚表皮是由許多不同細胞類型構成的混合體,每種細胞類型都有非常明確的職責。這樣復雜的組織,其生成或分化在細胞水平上需要進行大量的協調,這一過程發生故障可以導致災難性的后果。現在,來自斯坦福大學醫學院的研究人員確定了這一分化過程的一個主要調控因子。研究成果發表在12月2日的《自然》(Natu

    關于長非編碼核糖核酸研究

      10月6日,中國科學院分子細胞科學卓越創新中心(生物化學與細胞生物學研究所)研究員陳玲玲在《自然-方法》(Nature Methods)上,發表了題為Towards higher-resolution and in vivo understanding of lncRNA biogenesis

    長鏈非編碼RNA調控腫瘤生長

      人類基因組能夠產生10000多種長鏈非編碼RNA(lncRNA),但是至今為止,人們只知道幾十種lncRNA分子的功能。   加州大學圣地亞哥分校的Liuqing Yang等人發表在Nature上的一項研究成果表明,兩種lncRNAs可以與雄激素受體結合并控制其功能。雄激素受體是一種轉錄因

    非編碼小RNA的結構和功能

    中文名稱非編碼小RNA英文名稱small non-messenger RNA;snmRNA定  義細胞中一大類由幾十核苷酸到幾百核苷酸組成的、不編碼蛋白質的RNA。本身或與蛋白質結合形成的復合體有生物學功能。如核小RNA、核仁小RNA、微RNA、干擾小RNA、時序小RNA等。應用學科生物化學與分子生

    長鏈非編碼-RNA(lncRNA)研究策略

    長鏈非編碼 RNA(long noncoding RNA,lncRNA)指的是轉錄本長度在 200-100000 nt 之間的 RNA 分子,它們不編碼蛋白,位于細胞核或胞質內,具有保守的二級結構。研究顯示,lncRNA 并非以前所認識的那樣沒有功能,它可與蛋白質、DNA 和 RNA 相互作

    DNA損傷的三種分子生物檢測方法

    DNA是攜帶生物體遺傳信息的重要分子,它的完整性對細胞存活至關重要。然而,在生命活動中,DNA時刻遭受著內源性(氧化自由基、復制叉崩塌等)或外源性(電離輻射、烷化劑等)刺激,DNA損傷不可避免。檢測DNA損傷的方法有很多,根據其原理大致可以分為3類:?基于損傷DNA理化性質的改變檢測DNA損傷、基于

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