高深度空間代謝組學助力腫瘤微環境研究
腫瘤的發展除了與癌細胞自身基因突變導致的惡性增殖有關以外，還與腫瘤微環境息息相關。在癌癥中，正常組織中和諧的細胞相互作用關系被破壞，原本保護正常細胞生存的微環境在腫瘤細胞的影響下，逐漸演變成適應腫瘤生長的條件。針對腫瘤微環境的檢測和表征研究也可為癌癥治療提供新的思路。目前空間多組學技術已用于研究幾種類型癌癥中腫瘤免疫微環境的轉錄組、蛋白質組和代謝組，從這些方法獲得的數據已與免疫組化和多參數分析相結合，以產生癌癥進展的標記物。傳統分析技術受樣品空間分辨率以及分析靈敏度的限制，無法精準獲取靶向部位，而對其中特異代謝物的差異表征就更加困難。組織切片伴隨著顯微鏡技術等的發展而得到廣泛的應用，而激光顯微切割 (LMD, laser microdissection) 技術可以方便地對特定的組織區域的精確分離（圖2）。結合高靈敏度的液質聯用檢測技術，基于ZenoTOF? 7600 系統，將空間定位準確的微區細胞代謝譜進行全面準確的表......閱讀全文
高深度空間代謝組學助力腫瘤微環境研究
腫瘤的發展除了與癌細胞自身基因突變導致的惡性增殖有關以外，還與腫瘤微環境息息相關。在癌癥中，正常組織中和諧的細胞相互作用關系被破壞，原本保護正常細胞生存的微環境在腫瘤細胞的影響下，逐漸演變成適應腫瘤生長的條件。針對腫瘤微環境的檢測和表征研究也可為癌癥治療提供新的思路。目前空間多組學技術已用于研究幾種
代謝組學——腫瘤研究的利器
細胞內許多生命活動是發生在代謝物層面的，代謝物更多地反映了細胞所處的環境，比如細胞現在是不是健康？藥物是否起效？環境污染物是不是正在傷害細胞？等等。由此，20世紀90年代，衍生出了一門新學科：代謝組學。它回答了基因組學和蛋白質組學不能回答的問題：細胞到底發生了什么？ 1、腫瘤與代謝組學 腫瘤
LCMS8060助力廣泛靶向代謝組學研究
mGWAS (metabolome ?Genome-Wide Association ?Study)指基于代謝組學的全基因組關聯分析，是將代謝組數據作為表型，與基因型數據進行關聯分析的一種方法。由于代謝組數據對表型鑒定更為精細，因此關聯分析的精度比傳統GWAS分析更高。?海南大學和華中農業大學的羅杰
布魯克發布全新空間單細胞代謝組學研究策略
摘要 * 創新的無偏原位空間單細胞代謝組學（SSCM）能夠以單細胞分辨率實現高通量代謝組織樣本表征； * 基于 timsTOF fleX MALDI 的全新 5 μm microGRID 技術可在大視場內提供幾乎無偽影的小分子圖像； * 創新的 4D-代謝組學可通過 CCS-Predict
島津超快速質譜助力靶向代謝組學研究
靶向代謝組學中，通常需要同時檢測多個目標組分，這對質譜數據的采集速度提出了很高的要求。 島津超快速質譜（UFMS）擁有業內首屈一指采集速度。以LCMS-8050為例，其駐留時間（Dwell time≥0.8 ms）、切換時間（Pause time≥1 ms）、掃描速度（Scan s
島津超快速質譜助力靶向代謝組學研究
靶向代謝組學中，通常需要同時檢測多個目標組分，這對質譜數據的采集速度提出了很高的要求。??島津超快速質譜（UFMS）擁有業內首屈一指采集速度。以LCMS-8050為例，其駐留時間（Dwell time≥0.8 ms）、切換時間（Pause time≥1 ms）、掃描速度（Scan speed≤3
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？ 代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
代謝組學研究對象及定量代謝組學介紹
什么是代謝組學？代謝組學是用來解決什么問題的？? ? ? ?代謝組學（Metabonomics/Metabolomics）是20世紀90年代末期發展起來的一門新興學科，是研究關于生物體被擾動后（如基因的改變或環境變化后）其代謝產物（內源性代謝物質）種類、數量及其變化規律的科學。代謝組學著重研究的是生
AFADESI空間代謝組學高級研修班
為做好AFADESI空間代謝組學技術服務工作，由中國科學院高能物理研究所測試中心和中國科學院-香港大學金屬組學與健康和環境聯合實驗室共同承辦的“AFADESI空間代謝組學高級研修班”將于2023年4月26日-4月27日在京召開。在這里，我們將竭誠為您提供豐富的前沿應用信息和與專家零距離交流的平臺
Cell：腫瘤微環境中的代謝戰爭
腫瘤微環境是指腫瘤周圍的細胞和組織，與癌癥的發生和發展有著密切的關系。雖然目前的癌癥治療主要以腫瘤為目標，但人們已經逐漸意識到了腫瘤微環境的重要性。 華盛頓大學的科學家們最近在Cell雜志上發表文章指出，腫瘤細胞和T細胞在腫瘤微環境中進行著一場激烈的葡萄糖爭奪戰。這種代謝競爭會影響T細胞的殺傷
J－Proteome－Res:－代謝組學應用于微囊藻毒素代謝研究
微囊藻毒素(MCLR)，作為一種肝毒素，正在威脅著人類的公共衛生安全。在體內，肝臟是MCLR主要攻擊的器官，然而具體代謝變化目前任然未知。近日，中國科學院水生生物研究所謝平等研究人員在與上海敏芯信息科技公司的合作下，通過對灌服MCLR的大鼠模型進行代謝組學的研究，向我們揭示了MCLR擾亂肝臟代謝
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
Nat－Commun：通過整合細胞形態學和空間轉錄組學深度剖析腫瘤生態系統
埃默里大學（Emory University）的胡健團隊與得克薩斯大學MD Anderson腫瘤醫院的王凌華團隊在Nature Communications上發表論文METI: Deep profiling of tumor ecosystems by integrating cell morp
代謝組學－|－腫瘤治療之靶向葡萄糖代謝
能量代謝重編程是腫瘤的十大特征之一，其中葡萄糖代謝異常是腫瘤代謝最突出的特征。在氧氣充足的情況下，腫瘤細胞依然傾向于進行糖酵解，將葡萄糖代謝為乳酸。腫瘤細胞有氧糖酵解能力是正常細胞的20 ～ 30倍，為腫瘤代謝提供 大量能量和中間產物。因此，靶向糖酵解等異常環節的代謝酶是抗腫瘤治療的重點。一些研
空間組學新技術破解腫瘤細胞早期空間侵襲模式
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2024/1/516182.shtm近日，上海交通大學醫學院分子醫學研究院楊朝勇團隊和附屬仁濟醫院泌尿科鄭軍華團隊開發了一種空間轉錄組學測序新技術Decoder-seq，并運用該技術探究了早期腎細胞癌（RCC）兩種亞型腫
腫瘤微環境的研究意義
腫瘤與環境，兩者既是相互依存，相互促進，又是相互拮抗，相互斗爭的。它是現代腫瘤生物學的一個關鍵和核心的問題。近年來由于腫瘤細胞學和分子生物學的進展，人們對于腫瘤和環境的相互關系有了更加深入的了解。這不僅對于認識腫瘤的發生、發展、轉移等有著重要的意義，而且對于腫瘤的診斷、防治和預后亦有著重要的作用。除
單細胞組學解碼泛癌腫瘤微環境中的T細胞
T細胞是最關鍵的抗腫瘤免疫細胞。腫瘤微環境中存在“腫瘤浸潤T細胞”亞群，能夠對腫瘤抗原產生反應，肩負著清除腫瘤細胞的重任，也是摧毀癌細胞的“主力軍”。然而，隨著腫瘤發展，這些英勇的“戰士”常常陷入功能失調狀態，“戰斗力”大幅下降，被科學家稱為“T細胞耗竭”。越來越多的證據表明，不同癌癥的腫瘤微環境對
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為：“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”，兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度
“代謝組學”技術與方法研究
【基于質譜的分析方法聯用對”代謝組學”進行研究】 代謝組學”研究可分為：“發現代謝組學”和“靶標代謝組學”，兩者共同組成了“代謝組學”研究的“生態系統”。本文將介紹基于質譜的分析方法聯合統計學分析法對“代謝組學”進行研究。質譜能在一個廣泛的動態范圍內保持極高的檢測靈敏度、高度的穩定性、重現
做好代謝組學研究的關鍵
首先明確代謝組學的核心任務。對小分子代謝物的定性、定量分析并發現差異代謝物：（1）對生物體系中的內源性代謝物及其變化規律進行表征；（2）以差異代謝物作為核心對生命奧秘進行解析。而基于色譜/質譜聯用的分離分析技術具有靈敏度高、選擇性好、動態范圍寬、信息豐富等優點，已成為代謝組學研究的主流技術平臺。其次
許國旺AC發文——多維LCMS技術用于代謝組學深度覆蓋研究
近日，中國科學院大連化學物理研究所高分辨分離分析及代謝組學研究組（1808組）在利用多維液相色譜-質譜技術用于代謝組深度覆蓋研究中取得新進展，相關研究結果被Analytical Chemistry雜志收錄。 酰基輔酶A是一類重要的代謝物，在許多生物過程中發揮作用。由于其性質差異較大，很難用一種
空間轉錄組學研究案例簡析
01空間轉錄組研究解析前列腺癌異質性特征[1]影響因子：11.878發表時間：2018.06發表期刊：Nat Commun腫瘤內異質性是當今癌癥治療中最大的挑戰之一。在這里，研究人員使用空間轉錄組學（ST）技術研究整個多灶性前列腺癌的全組織基因表達異質性。利用一種新的去卷積方法，分析12個區域的近6
長壽的代謝特征代謝組學研究的啟示
長生不老是人類自古以來的夙愿。 中國古代神話故事中，有菩提老祖的大品天仙訣，王母娘娘盛會上的蟠桃，太上老祖煉丹爐里的不老丹，還有妖怪們夢寐以求的唐僧肉都可以實現長生不老。在史學瀚海中，《史記》記載秦始皇東巡碣石，攜童男童女入海求仙，尋求長生不老藥；在現代科學中，衰老仍然是生物醫學領域熱門主題之
關于腫瘤微環境的研究意義
腫瘤與環境，兩者既是相互依存，相互促進，又是相互拮抗，相互斗爭的。它是現代腫瘤生物學的一個關鍵和核心的問題。近年來由于腫瘤細胞學和分子生物學的進展，人們對于腫瘤和環境的相互關系有了更加深入的了解。這不僅對于認識腫瘤的發生、發展、轉移等有著重要的意義，而且對于腫瘤的診斷、防治和預后亦有著重要的作用
臨床代謝組學研究常見問題
分享一些我們舉辦完第一期微信公開課——臨床代謝組學研究策略后，所收集到的常見問題，供大家學習和參考。Q：如何設置驗證集和測試集？A：按我理解你想問的問題是：training set訓練集和test set測試集的設置問題。我們做分析化學、生物化學或者分子生物學的初學者通常會混淆這幾個數據集概念，通常
中藥基礎物質、代謝及代謝組學研究方案
中藥組成成分復雜、作用環節多樣，中藥藥效物質基礎以及臨床療效機理的闡明，已成為中醫藥現代化研究的重要內容。如何快速地從海量的質譜數據中獲取有價值的信息，減輕繁重的數據處理工作量，成為廣大中醫藥研究工作者的心聲。 賽默飛的Compound Discoverer軟件針對中藥成分鑒定、體內代謝轉化和
618萬－上海市腫瘤研究所購置一套非靶向空間代謝組學質譜成像系統
一、項目編號?? ? ? ?? ? ? ?? ? ? ?? ? ? ?? ??310000000241129152577-00184863?二、項目名稱?? ? ? ?? ? ? ?? ? ? ?? ? ? ?? ??非靶向空間代謝組學質譜成像系統?三、中標（成交）信息?? ? ? ?? ? ? ?