973計劃支持蔬菜基因組學研究取得重要進展
在973計劃的支持下，中國農業科學院蔬菜花卉研究所黃三文研究員的研究團隊構建了包含360多萬個位點的黃瓜全基因組遺傳變異圖譜，為全面了解黃瓜這一重要蔬菜作物的進化及多樣性提供了新思路，并為全基因組設計育種打下了基礎。該研究成果于10月21日由《自然 遺傳學》雜志在線發表。 黃瓜是最重要的蔬菜之一，相比其他園藝作物有著較小的基因組，因此常被用來作為研究植物或者蔬菜重要經濟性狀形成的重要模式系統。在該研究中，科研團隊對115個黃瓜品系進行了重測序，并對一個野生黃瓜進行了從頭測序。他們共發現330多萬個單核苷酸多態性位點(SNPs)，33萬多個小插入和刪除，594個獲得/缺失變異。基于這些數據，研究人員構建了一個單核苷酸分辨率的黃瓜遺傳變異圖譜。利用該遺傳變異圖譜，科學家證實了黃瓜發源于印度，同時將控制葉片、果實大小以及苦味等性狀的關鍵基因定位在了染色體上，為下一步利用這些重要蔬菜馴化基因打下了基礎。 973計劃2......閱讀全文
多吃水果蔬菜喔！不信？有數據哩
我們一直念叨，或者被念叨，要多吃水果和蔬菜。可是具體要吃多少，才有助于身體健康呢？ 近日，倫敦帝國理工學院的科學家們給出了一份答案：每天吃5份（400g）以上的水果、蔬菜能夠有效降低心臟病、中風、癌癥的概率，且可以預防過早死亡！ 吃多少果蔬？5份可以，10份更佳！ 每天我們需要攝取多少水果
缺乏數據使用指導原則，基因組數據共享遇阻
基因組數據共享將生物醫學研究推向快車道，但向公共領域發布的現有數據指南一方面承認免費和無條件使用數據的重要性，另一方面還未能解決這種重要性與數據生產者首次發布數據的“權利”之間的關系。 在美國能源部聯合基因組研究所負責人Nikos Kyrpides看來，這種自相矛盾導致了數據生產者和數據使用
973計劃支持蔬菜基因組學研究取得重要進展
在973計劃的支持下，中國農業科學院蔬菜花卉研究所黃三文研究員的研究團隊構建了包含360多萬個位點的黃瓜全基因組遺傳變異圖譜，為全面了解黃瓜這一重要蔬菜作物的進化及多樣性提供了新思路，并為全基因組設計育種打下了基礎。該研究成果于10月21日由《自然 遺傳學》雜志在線發表。 黃瓜是最重要
蔬菜中心：繪成世界首張西瓜基因組序列圖譜
我國是世界第一西瓜生產與消費大國，但是人們卻始終未能從外到內了解它，直到2013年1月，國際學術頂級刊物《自然·遺傳學》發表了世界首張西瓜基因組序列圖譜（影響因子35.532），標志著人類成功破譯了西瓜遺傳“密碼”。這項由蔬菜中心主任許勇的研究團隊牽頭進行的科研創新，為高效培育兼具優質、高產、抗
基因組數據分析的“金標準”
五月十八日，美國安大略癌癥研究所、俄勒岡健康與科學大學、賽智生物網絡（Sage Bionetworks）、分布式DREAM 團體(Dialog for Reverse Engineering Assessment and Methods)和加州大學圣克魯茲分校的癌癥研究人員，在《Nature M
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank－3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0，并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題，在線發表在Nucleic Acids Rese
國家基因組科學數據中心公布數據資源整合挖掘體系
近日，國家基因組科學數據中心在國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）在線發表題為Database Resources of the National Genomics Data Center in 2020 的文章，以整體形式介紹基因組數據資源整合與挖掘體系建設
國際癌癥基因組聯盟公布逾1萬個癌癥基因組數據
國際癌癥基因組聯盟(International Cancer Genome Consortium，簡稱"ICGC")近日向科研界公布了超過1萬個癌癥基因組的數據。這些數據能更好地幫助全世界的癌癥研究者從基因方面了解癌癥，加快對癌癥的研究并幫助更多癌癥靶向治療的發展。 安大略癌癥研究所所
北京基因組所數據資源建設取得進展
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心團隊研究論文在線發表于《核酸研究》期刊。該研究成果的發表是國內首次以數據中心為模式，整體發布我國生命組學數據資源建設情況，標志著生命與健康大數據中心建設取得實質性重要進展，也標志著我國建設綜合性基因組數據資源獲得國際同行認可。 生命與健康大數
為何大家愿意公開自己基因組數據？
2007年，在諾貝爾獎得主James Watson共同發現DNA結構的54年之后，他成為了第一個完成個人基因組測序的人，當時這花費了近100萬美元。但隨著近年來測序成本的下降，到了測序先驅Craig Venter這里，已經可以在一個小時內，花不到100美元的錢就能得到個人基因組序列了。 這一市
又一滅絕物種全基因組數據解析
日前，吉林大學考古學院蔡大偉教授團隊與西北農林科技大學動物科技學院姜雨教授團隊在馬屬動物古DNA研究領域取得重要進展。該研究在國際上首次成功獲取已滅絕馬屬動物奧氏馬的高質量全基因組數據，重建了馬屬動物的演化歷史。 馬科動物自古以來就與人們的關系密切,對人類社會文明的發展產生了重大影響。中國家馬起源
基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺，是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重
中國開放最新家蠶基因組研究數據
“我們通過網絡，以開放的姿態與世界共享家蠶基因組最新研究成果”，中國家蠶基因組計劃項目主持人、中國工程院院士向仲懷26日介紹，包含有最新研究數據的中國家蠶遺傳數據庫目前已收到來自國內外科研人員的訪問25萬余次。 向仲懷介紹，中國家蠶遺傳數據庫由西南大學家蠶基因研究團隊和深圳華大基因研究院合
蔬菜保鮮有什么方法？蔬菜保鮮機
蔬菜保鮮有什么方法？蔬菜保鮮機：蔬菜一旦采摘下來后，就意味著得不到水分的補充，這個時候它還是一個活體，還會呼吸，因此這個時候它的含水量是越來越少的，于是我們就會發現蔬菜干啥變蔫，直至干枯腐爛，這樣的蔬菜是不會有人要的，在家里會丟棄，而在超市、酒店里面，要么低價處理，要么丟棄了之，因此如何給蔬菜保
北京基因組所構建完成質體基因組結構變異數據庫
多相催化是實現高效定向化學轉化的關鍵技術，其中的一個重要基礎科學問題是如何通過精確設計和調控催化活性位結構及所在環境，從而強化其定向催化功能并創造新型高效催化劑。近日，中國科學技術大學熊宇杰教授課題組和江俊教授課題組繼在電催化體系中提出表面極化概念后,再次通過與黃偉新教授課題組合作，證實界面極化
華北理工搭建首個蔬菜作物激素基因數據庫平臺
植物激素對蔬菜和多種作物的耐鹽等逆境脅迫和生長發育具有非常重要的作用。激素主要有生長素、乙烯、細胞分裂素、脫落酸和赤霉素等十余類。然而，目前沒有一個數據庫能夠全面展示這些激素在不同蔬菜中的作用及調控模式。這嚴重制約了激素相關基因的比較和功能組學研究。對此，華北理工大學教授宋小明團隊對469種蔬菜及代
基因組新數據或改寫人類進化史
新的人類進化模型表明，人類起源于非洲大陸的多個祖先種群。5月17日發表在《自然》雜志上的一項新研究對主流理論提出了挑戰，認為智人是從非洲多個不同的種群進化而來的，在經歷了長期的基因混合后，最早可檢測到的分裂發生在12萬至13.5萬年前。 在檢測非洲當前種群的遺傳物質，并將其與那里早期智人種群的現有
15000年前“農民”全基因組數據出爐
英國《自然·通訊》雜志近日發表的一項遺傳學報告中，德國科學家公布了生活在15000年前的安納托利亞“農民”的首個全基因組數據。該研究結果有助于認識歐亞大陸的農業起源。圖片來源于網絡 農業在公元前10000年至9000年左右起源于亞洲西南部的新月沃土（Fertile Crescent），隨后傳
加拿大個人基因組計劃公布首批數據
加拿大個人基因組計劃（PGP-Canada）于2012年啟動，欲建立一個在線的加拿大人基因組數據庫，供全世界的研究人員使用。近日，該計劃公布了首批測序數據。根據《加拿大環球郵報》（the Globe and Mail）的報道，研究人員發現了許多意想不到的結果。 這個計劃測序了首批56名參與者的
癌癥研究人員聯手匯集腫瘤基因組數據
研究人員希望，數據分享將為利用諸如這些腦部腺癌細胞等腫瘤的基因組信息帶來更好的方法。 這是為大型癌癥研究中心的很多病人提供的最新希望：“讓我們測序你的腫瘤，或許我們能將其同擊敗這種惡性疾病的藥物匹配。”不過，現實是基因組分析仍然僅為癌癥病人提供了一小部分幫助。“我們多半時候不知道如何處理這些
Illumina收購Edico－Genome，加速基因組數據分析
Edico的DRAGEN? Bio-IT平臺為新一代測序帶來了更快更簡化的輸出。 圣迭戈——2018年5月15日——Illumina公司（納斯達克代碼：ILMN）宣布收購新一代測序（NGS）數據分析加速解決方案的領先供應商Edico Genome。Edico Genome的DRAGEN? B
科學家搭建草莓基因組數據庫
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓為薔薇科草莓屬，因芳香多汁、營養豐富受到喜愛，在全國各地均可種植。栽培草莓為異源多倍體，基因組復雜，雜合度高。 2019年，《自然—遺傳學》發表了利用三代測序數據組裝的高
全球藥典草藥基因組數據庫已上線
近期，中國中醫科學院中藥研究所團隊建立了全球藥典基因組數據庫(GPGD)。該數據庫是全球首個針對藥典收載草藥物種的大型基因組學數據庫。相關研究成果發表在《Science China-Life Sciences》雜志，標題為“Global Pharmacopoeia Genome Database
研究發現微型蔬菜比成熟蔬菜更耀眼
在最近發表在《科學報告》雜志上的一項研究中，研究人員評估并比較了六種微型蔬菜的營養概況和生物活性化合物，以評估它們作為功能性食品的潛力及其對全球營養和健康的影響。背景微蔬菜含有獨特的揮發性芳香化合物，其中黑蘿卜的香氣最為復雜，其次是豌豆和向日葵，這表明微蔬菜具有天然增強食物風味的潛力。你知道嗎？全世
研究稱食用有機蔬菜比普通蔬菜更健康
愛爾蘭農業與食品發展部食品研究中心的一項研究為食用有機蔬菜比普通蔬菜更健康的觀點提供新佐證。研究顯示，生長過程中沒有被施用有毒化學農藥的蔬菜黃酮醇含量更高。這種抗氧化劑有助預防身體受損。 研究人員在2009年至2014年間檢測有機種植和普通種植的兩種洋蔥的黃酮醇水平，發現有機洋蔥的黃酮醇含
迄今最詳細人類基因組分析數據出爐
迄今最詳細的人類基因組分析數據出爐。圖片提供：ENCODE計劃? ?一項大型國際計劃顯示，與青少年在學校掌握的知識相比，人類基因組—— 一個人的遺傳信息總和——包含有更多的蛋白質編碼基因。當研究人員決定在上世紀90年代晚期對人類基因組進行測序時，他們專注于尋找那些用來確定全部生
基因組數據顯示現代人類進化細節
據物理學家組織網報道，發表在5日出版的《公共科學圖書館·生物學》雜志上的研究論文顯示，對英美兩國21萬人基因組數據分析發現，在長壽人群中，較少發生與阿爾茨海默癥和重度吸煙相關的遺傳變異，這表明自然選擇一直在“努力”消除這些不利種群的變異。 進一步研究發現，與心臟病、高膽固醇、肥胖和哮喘相關的遺
首次公布！河南仰韶村遺址古人基因組數據發表
近日，河南省文物考古研究院、廈門大學等單位在國際學術期刊《科學通報》發表研究成果。研究發現，仰韶村遺址仰韶文化與龍山文化相關人群之間具有高度的遺傳連續性，并對中華民族的形成有著重要的遺傳貢獻。 河南省文物考古研究院和廈門大學的研究人員取樣提取和測序了仰韶村遺址的古人DNA，并于論文《古代基因組
北京基因組所開發系列特色科學數據庫
近日，中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心（BIG Data Center，BIGD）有七篇數據庫文章在國際學術期刊《核酸研究》（Nucleic Acids Research）雜志在線發表，并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas