Science：華大參與三種鱷魚基因組測序
最近，德克薩斯理工大學的生物學家帶領一個50多名科學家的研究小組，測定了三種鱷魚——美洲鱷、咸水鱷和印度鱷的基因組序列。 生物學副教授David Ray指出，通過測定這些基因組序列，科學家們可以更好地了解鳥類的進化，它們是這類食肉動物的最近親緣種。該研究小組完成了這三種鱷魚的基因組，可以說真正完成了鱷魚基因組的“全家福”。這項研究主要由美國國家科學基金會資助，于12月12日發表在國際權威雜志《Science》。 Ray說：“這項研究的一個主要發現是，與鳥類相比，鱷魚基因組變化很緩慢。我們把鳥類、鱷魚與烏龜進行比較，烏龜是包括鳥類、鱷魚的這個群組的最近親緣種。我們發現，它們也進化的很緩慢。對此最好的解釋是，所有這三個物種的共同祖先是一個”緩慢的進化者“，反過來這又表明，在鳥類中，快速進化是獨立演變的事情。” 從2009年開始，研究人員嘗試僅測定1%的鱷魚DNA序列。然而，不久之后，每測定一百萬個堿基的價格從1000美元下......閱讀全文
Science：華大參與三種鱷魚基因組測序
最近，德克薩斯理工大學的生物學家帶領一個50多名科學家的研究小組，測定了三種鱷魚——美洲鱷、咸水鱷和印度鱷的基因組序列。 生物學副教授David Ray指出，通過測定這些基因組序列，科學家們可以更好地了解鳥類的進化，它們是這類食肉動物的最近親緣種。該研究小組完成了這三種鱷魚的基因組，可以說真正
Science：華大參與三種鱷魚基因組測序
最近，德克薩斯理工大學的生物學家帶領一個50多名科學家的研究小組，測定了三種鱷魚——美洲鱷、咸水鱷和印度鱷的基因組序列。 生物學副教授David Ray指出，通過測定這些基因組序列，科學家們可以更好地了解鳥類的進化，它們是這類食肉動物的最近親緣種。該研究小組完成了這三種鱷魚的基因組，可以說真正
基因組序列草圖的概念
中文名稱基因組序列草圖英文名稱draft genome sequence定 義已測定序列占到90%以上、測序精度在1%的基因組序列圖。應用學科遺傳學（一級學科），基因組學（二級學科）
解析現代月季基因組序列
科學家研究現代月季基因。圖片來源：monticelloshop.org 近日，法國農業科學研究院、里昂大學、法國國家科學研究中心的研究人員解密了現代月季的基因組序列。現代月季擁有獨特的顏色與香味，廣受稱贊，這項研究幫助人們從分子角度了解這背后的基因和代謝流程。4月30日，相關論文在線刊登于《自然
揚子鱷基因組有助揭開鱷魚生存與進化之謎
來自浙江大學、深圳華大基因研究院等單位的研究人員對瀕危物種——揚子鱷進行了全基因組測序及分析，最新研究成果于2013年8月6日在《細胞研究》(Cell Research)雜志發表。揚子鱷基因組為全球首個公開并發表的鱷魚基因組。在本研究中，科研人員對揚子鱷長時間潛水行為的遺傳學機制、進化以及性
概述釀酒酵母的基因組序列
1996年6月，在國際互聯網的公共數據庫中公布了釀酒酵母的完整基因組順序，它被稱為遺傳學上的里程碑。因為首先，這是人們第一次獲得真核生物基因組的完整核苷酸序列；其次，這是人們第一次獲得一種易于操作的實驗生物系統的完整基因組。 [10] 在釀酒酵母測序計劃開始之前，人們通過傳統的遺傳學方法已確定
首次測定玉米蛇基因組序列
在現有的5000種哺乳動物中，有超過100種已經進行了基因組測序，但是，只有9種爬行動物（在10000個物種當中）的基因組對科學界來說是可用的。最近，瑞士日內瓦大學（UNIGE）的一個研究小組，構建了一個大的數據庫，其中就包括一種爬行動物——玉米蛇的新基因組測序，這種蛇越來越多地被用來了解爬行動
新軟件按需組裝無縫基因組序列
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/2/494014.shtm 科技日報北京2月16日電?（記者張夢然）美國國立衛生研究院研究人員發布了一種創新的軟件工具，用于組裝來自各種物種的真正完整（即無縫）的基因組序列。這種名為Verkko的軟件在芬蘭
胡蘿卜基因組序列草圖成功繪出
來自美國的一個研究小組稱，他們完成了對30余種胡蘿卜樣品的測序，繪制出了胡蘿卜基因組序列草圖。這很可能是迄今最完整的蔬菜基因組序列草圖。研究人員稱，這一研究闡明了胡蘿卜的起源和演化過程，對改善胡蘿卜和其他農作物的營養價值提供了可能。相關論文在線發表在《自然·遺傳學》雜志網站上。 胡蘿卜和生菜
白菜甘藍油菜全基因組序列測定
? 由中國科學家領銜的白菜、甘藍和油菜全基因組測序項目取得階段性重大成果,獲得了白菜全基因組的精細圖,甘藍和油菜全基因組的框架圖。 研究表明，白菜、甘藍和油菜的基因組大小分別約為5億、6.5億和11億個堿基對,白菜和甘藍含有的基因總數目分別約4.2萬和4.5萬個,油菜基因覆蓋度85%以上。該
－震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！
?震驚！Genbank參考基因組序列多處錯誤！ 隨著基因組測序技術的飛速發展以及測序成本的快速降低，全基因組數據也在急速增加。盡管參考基因組數據是非常有價值的資源，但是由于測序過程中的外源污染或者研究者對數據組裝方法的誤用，使得基因組數據面臨很多問題。 近日，約翰霍
馬鈴薯基因組序列框架圖全球發布
中國科學家的創新性思路助推測序工作提前完成 9月23日，由14國科學家組成的“國際馬鈴薯基因組測序協作組”分別在北京、阿姆斯特丹、倫敦、紐約、利馬等地同時宣布了馬鈴薯基因組序列框架圖的完成。此次公布的馬鈴薯基因“藍圖”繪制工作的中國參與單位主要來自中國農業科學院蔬菜花卉所和深圳華大基因研究院。
生物學術語表達序列標簽的定義
表達序列標簽從互補DNA（cDNA）分子所測得部分序列的短段DNA（通常300~500bp）。從cDNA文庫所得到的許多表達序列標簽集合組成表達序列標簽數據庫，代表在一定的發育時期或特定的環境條件下，特定的組織細胞基因表達的序列。可用于驗證基因在特定組織中的表達，推導全長cDNA序列，或作為標簽標志
生物學術語表達序列標簽的方法
EST作為表達基因所在區域的分子標簽因編碼DNA序列高度保守而具有自身的特殊性質，與來自非表達序列的標記（如AFLP、RAPD、SSR 等）相比更可能穿越家系與種的限制，因此EST標記在親緣關系較遠的物種間比較基因組連鎖圖和比較質量性狀信息是特別有用。同樣，對于一個DNA序列缺乏的目標物種，來源于其
生物學術語表達序列標簽的原理
EST是從一個隨機選擇的cDNA克隆進行5’端和3’端單一次測序獲得的短的cDNA部分序列，代表一個完整基因的一小部分，在數據庫中其長度一般從20到7000bp不等，平均長度為360±120bp 。EST來源于一定環境下一個組織總mRNA所構建的cDNA文庫，因此EST也能說明該組織中各基因的表達水
草魚全基因組序列圖譜繪制完成
近日，記者從中國科學院水生生物研究所獲悉，該所魚類功能基因組學學科組負責的草魚全基因組序列圖譜繪制完成。該成果由水生生物研究所、中國科學院國家基因研究中心和中山大學等機構合作完成，相關研究成果于5月4日在線發表于《自然—遺傳學》雜志。 據該所研究員汪亞平介紹，該研究采用鳥槍法測序策略，分別對一
中國新型冠狀病毒的基因組序列
《自然》雜志2月3日發表了新型冠狀病毒的基因組序列（論文：A new coronavirus associated with human respiratory disease in China），病毒樣本系從一名曾在最先爆發疫情的海鮮市場工作過的患者體內分離得到。基因組分析顯示，該病毒與此前在
史上最全小麥基因組序列圖集問世
??據最新一期《自然》雜志報道，加拿大薩斯喀徹溫大學領導的國際團隊在一項對全球小麥生產具有里程碑意義的研究——10+基因組計劃中，對代表全球育種計劃的15個小麥品種的基因組進行了測序。這將使科學家和育種人員能夠更快地識別出具有影響力的基因，從而提高小麥產量、害蟲抗性和其他重要的農作物性狀。 小麥
四篇Science文章公布最新基因組序列
小麥是全球最重要的糧食作物之一，提供了20%人類所需的熱量。2010年英國科學家宣布他們繪制出了小麥基因組草圖，但這一序列并不完整。在7月17日Science雜志上，兩個研究組分別公布了Chinese Spring小麥品種的每個染色體臂的基因組序列，以及小麥染色體3B基因組序列，另外兩個研究小組
牡蠣全基因組序列圖譜繪制完成
牡蠣基因組部分序列及其分析牡蠣基因組計劃（OGP）團隊成員在深圳華大基因研究院討論項目中國科學院海洋研究所和深圳華大基因研究院簽約儀式牡蠣是產量最大的海水養殖動物 牡蠣養殖 近日，牡蠣基因組計劃（Oyster Genome Project，OGP）項目組宣布，
《Genome－Research》：根據基因組序列預測MRSA毒性
微生物毒力一直是一個復雜的多因素表型，與病原體的進化軌跡有著復雜的關聯。毒性，破壞宿主細胞膜和粘附的能力，粘附到人體組織的能力，是許多細菌病原體的主要毒力因子，包括金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)。 金黃色葡萄球菌是臨床上常見的毒性較強的細菌，自從上世紀40
三篇Nature－Methods：定位基因組的調控序列
科學家們利用染色質對DNase消化和Tn5轉座的敏感性，對基因組的調控序列進行定位和解讀。 近來越來越多的證據顯示，許多遺傳學差異并非直接影響基因，而是改變控制基因開/關的調控序列。近期Nature Methods雜志上發表了三篇文章，介紹了在基因組中定位調控序列的新技術，闡述了進行數
科學家破譯“純種馬”基因組序列
馬有90多種遺傳疾病與人類的遺傳疾病相似??? ? ?一個國際科研小組11月5日報告說，他們破譯了“純種馬”的基因組序列。這項研究成果將刊登在6日出版的新一期《科學》雜志上。??? ? ?報告中所指的“純種馬”最早是300多年前英國培育的一種名貴賽馬品種，后被一些歐美和亞洲國家引進，主要用于賽馬和馬
《自然》：美首次對老鼠基因組調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分——調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗
我國完成朱鹮全基因組序列圖譜繪制
?????? 4月15日，深圳華大基因研究院與西安交通大學聯合在西安公布了瀕危野生動物朱鹮的全基因組序列圖譜，這是繼雞基因組、珍珠鳥基因組、火雞基因組之后，我國完成 的第四個鳥類基因組測序項目和全基因組序列圖譜。朱鹮這種被稱為“東方寶石”的珍稀鳥類目前世界僅存千余只，這一研究成果將對于挽救和保護朱
首次測定南極抗凍魚基因組序列
近，包括美國東北大學H. William Detrich教授在內的一個國際研究小組，首次測定了南極抗凍魚（Antarctic notothenioid fish）的基因組序列。他說，這一突破性成果，將闡明動物對寒冷水域獨特的進化適應性，將有助于揭示魚類如何應對海水溫度上升，由于氣候變化，預計接下
美首次對老鼠基因組的調控序列測序
美國科學家在7月1日出版的英國《自然》雜志上撰文表示，他們首次詳細標示出了老鼠基因組功能序列中一個重要部分――調控序列的詳細情況。老鼠是生物醫學研究中最廣泛使用的哺乳動物模型，因此，最新研究也將有助于我們進一步解讀人類基因組。 加州大學圣地亞哥分校路德維格癌癥研究所基因調控實驗室主任任兵教
首個完整人類基因組序列公布
? 由美國國家人類基因組研究所、加利福尼亞大學圣克魯斯分校、華盛頓大學等機構研究人員領銜的國際科研團隊3月31日公布了首個完整、無間隙的人類基因組序列。與這項重大成果相關的6篇論文當天發表在美國《科學》雜志上。美國國家人類基因組研究所在一份公報中表示，人類基因組含有約30億個DNA（脫氧核
蠶“姑娘”終于有了完整的基因組序列
西南大學資源昆蟲高效養殖與利用全國重點實驗室教授代方銀團隊首次獲得了家蠶W染色體完整基因組序列，并揭示鱗翅目昆蟲W染色體起源與進化的新機制。日前，相關研究成果在線發表于《科學進展》。雌蠶。課題組供圖雄蠶。課題組供圖在昆蟲中，性染色體組成以XX/XY系統為主，而鱗翅目昆蟲性染色體組成與大部分昆蟲不同，
科學家完成辣椒全基因組序列測定
由我國科技人員主導完成的“栽培種和野生種辣椒的全基因組測序揭示辣椒屬的馴化與特異性”研究論文，今年3月在國際著名期刊《美國國家科學院院刊》(PNAS)刊發。該論文的正式發表，標志著辣椒基因組序列成功解碼，我國辣椒基礎性研究取得重大進展，進入分子育種階段。 美國農藝學會主席、新墨西哥州立大學