專訪汪洋:具有抑癌作用的“電影剪輯大師”
人類基因組中大約有25,000個基因,這個數字不大,甚至和小小的果蠅基因數目相同,那區別于其它動物的人類智能,還有“千人千面”的多種族多面孔,又是如何而來呢?科學家告訴我們其中的一個重要原因就在于人類基因組DNA序列能以不同的方式拼接在一起,創建各種信使RNA,從而產生了人類需要的許多不同蛋白質,這就像是一個“電影剪輯大師”,選擇性地將電影場景片段拼接在一起,創造出大片來。 但是這個“電影剪輯大師”有時也會出現問題,一旦發生突變或缺失,對我們人體的健康就會產生重大的影響,比如引發諸如強制性肌營養不良,還有癌癥之類的疾病。 近期來自大連醫科大學、美國北卡羅萊納大學的研究人員就發現了這樣一個關鍵的“剪輯大師”――RBM4, 與正常組織相比,癌組織(包括肺癌和乳腺癌)中的RBM4表達量明顯下降。也就是說RBM4需要保持合適的數量,保證基因被正確剪接,才能確保癌癥不會發生發展。這一研究成果公布在著名的癌癥研究期刊《Cance......閱讀全文
選擇性剪接
中文名選擇性剪接外文名alternative splicing別????名可變剪接作????用mRNA前體加工特????點表達水平的不同而導致不同的表型定義選擇性剪接(也叫可變剪接)是指從一個mRNA前體中通過不同的剪接方式(選擇不同的剪接位點組合)產生不同的mRNA剪接異構體的過程,使得最終的蛋白
致癌新機制:“選擇性剪接”
由于正常細胞周期基本機制(如復制、DNA修復和細胞死亡)遭到破壞,在世界范圍內,癌癥已成為死亡的主要原因之一。 在基因組測序技術的幫助下,如今的生物醫學研究人員已經可以鑒定不同腫瘤患者體內的常見遺傳突變。 通常情況,人們認為只有DNA突變會導致癌癥。9月21日《Cell Reports》雜志
中科院Cell子刊發布選擇性剪接研究新發現
來自中科院上海生命科學研究院營養科學研究所的研究人員證實,SRSF10通過調控選擇性剪接在成肌細胞分化及葡萄糖生成中起重要作用。這一研究發現發布在11月11日的《Cell Reports》雜志上。 領導這一研究的是中科院上海生命科學研究院營養科學研究所代謝性疾病的基因表達調控研究組組長馮英(Y
營養所揭示SRSF10調控mRNA選擇性剪接的新機制
1月18日,Nucleic Acids Research在線發表了中科院上海生命科學研究院營養科學研究所研究員馮英組的最新研究進展:Transcriptome analysis of alternative splicing events regulated by SRSF10 reve
Nature子刊:深度學習預測傳統RNASeq無法檢測的選擇性剪接
項目負責人Yi Xing博士是CHOP計算和基因組醫學中心主任,本周他與博士生Zijun Zhang和Zhicheng Pan在《Nature Methods》報道了這款DARTS的框架。DARTS,又稱為深度學習加強的RNA-seq轉錄剪接分析(Deep-learning Augmented
原代腫瘤細胞的選擇性培養:匯合飼養層腫瘤細胞篩選...
原代腫瘤細胞的選擇性培養:匯合飼養層腫瘤細胞篩選實驗飼養層技術取決于通過其他接觸抑制細胞形成的單層預防成纖維細胞的過度生長。 飼養層技術并不能選擇性抑制正常上皮細胞, W為正常表皮細胞和正常乳腺上皮都能在 匯合的伺養層上形成克隆。然而,神經膠質瘤研究的結果表明,在同種飼養層上選擇培養等同的正常細胞是
原代腫瘤細胞選擇性培養:匯合飼養層腫瘤細胞篩選實驗
實驗方法原理在指數生長中期,用絲裂霉素C處理飼養層細胞,將細胞培養形成匯合的單層。通過膠原蛋白酶消化從活檢標本分離腫瘤細胞,或者用胰蛋白酶消化從原代培養物獲得腫瘤細胞,然后將腫瘤細胞接種到匯合的單層上(圖24.1)。上皮性腫瘤細胞可以在3周至3個月內形成克隆。纖維肉瘤和神經膠質瘤并不總是形成克隆,而
原代腫瘤細胞的選擇性培養:匯合飼養層腫瘤細胞篩選
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 在指數生長中期,用絲裂霉素C處理飼養層細胞,將細胞培養形成匯合的單層。通過膠原蛋白酶消化從活檢標本分離腫瘤細胞,或者用胰蛋白酶消化從原代培養物獲得腫瘤細胞,然后將腫瘤細胞接種到匯合的單層上(圖24.1)。上皮性腫瘤細胞可以在3
異常剪接?
中文名異常剪接定????義指對序列庫中異常剪接mRNA的鑒定和分析隸屬領域生物領域主要功能處理多順反子性轉錄單元,調控轉錄效率和mRNA的穩定性,同時可以增加產物蛋白的多樣性
RNA-剪接
中文名稱RNA 剪接英文名稱RNA splicing定 義在真核細胞核中從RNA初始轉錄物切除內含子,連接外顯子形成成熟的mRNA的過程。應用學科細胞生物學(一級學科),細胞遺傳(二級學科)
自剪接
自剪接(self-splicing)出現在稀少的內含子組成核酸酶,核酸酶在只有RNA的情況下代替了剪接體的功能。自剪接的內含子有兩種,稱為I型及Ⅱ型。I型及Ⅱ型內含子以與剪接體類似的方式進行剪接,但不需要任何蛋白質。這種相似性使人相信這些內含子與剪接體在演化過程上有著關連。自剪接亦可能是非常古老,且
以毒攻毒——利用腺病毒選擇性殺傷腫瘤細胞
IDIBAPS生物醫學研究所和IRB Barcelona的生物醫療研究所的科學家們領導一個研究項目,他們利用一個新測量對病毒進行基因改造,讓它們選擇性地攻擊腫瘤細胞,放過健康組織。 傳統的腫瘤治療手段因為欠缺細胞選擇特異性,通常會造成一些不良的副作用。杜絕這些狀況是非常重要的(病沒治好,人先被
腫瘤選擇性肺轉移炎癥機制獲揭示
中國醫學科學院院長曹雪濤院士研究小組,發現腫瘤細胞為何選擇性轉移至肺部的新型免疫炎性分子機制,為阻斷腫瘤肺轉移提供了新思路。《癌細胞》近日發表了該最新研究結果并對此工作專門配發了評論。 目前認為,在腫瘤轉移之前,原發灶腫瘤能通過向血液釋放一些可溶性因子,募集骨髓細胞到即將轉移的遠端靶器官,營造
剪接體
剪接體(英文:spliceosome)定義:由核小RNA(snRNA,U1、U2、U4、U5、U6等)和蛋白質因子(約100多種)動態組成、識別RNA前體的剪接位點并催化剪接反應的核糖核蛋白復合體。只與SMT蛋白理解與糖性一致。
剪接位點
中文名稱剪接位點英文名稱splicing site;splice site定 義剪接體可識別的RNA前體中內含子和外顯子連接邊界的序列和接頭位點。根據位置不同可以分為供體和接納體剪接位點。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),基因表達與調控(二級學科)
廣州生物院腫瘤miRNA選擇性治療研究獲進展
近期,國際學術期刊《癌基因》(Oncogene)發表了中國科學院廣州生物醫藥與健康研究院張必良實驗組的研究成果Selective killing of lung cancer cells by miRNA-506 molecule through inhibiting NF-κB p65 to
簡述第Ⅳ類內含子的剪接tRNA的剪接
酵母基因組共有約400個tRNA基因,含有內含子的基因僅占十分之一。內含子的長度從14到46個堿基對不等,它們之間并無保守序列,切除內含子的酶識別僅是共同的二級結構,而不是共同的序列。通常內含子插入到靠近反密碼子處,與反密碼子堿基配對,未成熟tRNA的反密碼子環不存在,而是以插入的內含子所構成的
調控NMD因子UPF3A的選擇性剪接在結直腸癌中的重要功能
4月11日,國際學術期刊International Journal of Cancer 在線發表了中國科學院上海營養與健康研究所馮英組的最新研究進展“U2-related proteins CHERP and SR140 contribute to colorectal tumorigenesi
藍光和環境溫度通過CRY2CIS1調控RNA選擇性剪接及開花時間
11月18日,《自然-通訊》(Nature Communications)在線發表了中國科學院分子植物科學卓越創新中心劉宏濤研究組撰寫的題為CRY2 interacts with CIS1 to regulate thermosensory flowering via FLM alternati
關于RNA剪接第Ⅱ類內含子的自我剪接介紹
第Ⅱ類內含子,其5’剪接點和3’剪接點的序列多為…外顯子…↓GUGCG…內含子…嘧啶堿AU↓…外顯子…,除了剪接點序列特征之外,在離3’剪接點上游6-12bp有一段比較保守的序列,一致序列為CUCAC,在這一保守序列A的兩側各有一段3~5核苷酸的短序列能與上游方向的核苷酸互補,而A總是不包含在這
前剪接體和剪接體的分離及分析實驗
實驗方法原理 剪接體是由 RNA 和蛋白質構成的核糖核蛋白體(RNP),它在前體 mRNA 的剪接過程中可去除前體 mRNA 的內含子。snRNP 是由 snRNA 及其結合蛋白組成,在前體 mRNA 的剪接過程起著重要作用。實驗材料 PIP 10 載體核苷酸焦磷酸酶RNasinT7 RNA 聚合酶
前剪接體和剪接體的分離及分析實驗
剪接體是由 RNA 和蛋白質構成的核糖核蛋白體(RNP),它在前體 mRNA 的剪接過程中可去除前體 mRNA 的內含子。snRNP 是由 snRNA 及其結合蛋白組成,在前體 mRNA 的剪接過程起著重要作用。本實驗來源「RNA 實驗指導手冊」主編:鄭曉飛。實驗方法原理剪接體是由 RNA 和蛋白質
前剪接體和剪接體的分離及分析實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 剪接體是由 RNA 和蛋白質構成的核糖核蛋白體(RNP),它在前體 mRNA 的剪接過程中可去除前體 mRNA 的內含子。snRNP 是由 snRNA 及其結合蛋白組成,在前體 mRNA 的剪接過程起著重要作用。
關于第Ⅲ類內含子的剪接hnRNA的剪接的介紹
核基因hnRNA內含子的剪接點序列為…外顯子…↓GU…內含子…AG↓…外顯子…,這就是普遍適用的所謂Breathnach-Chambon規則(GU-AG規則)(GU-AG rule),此規律不適合于線粒體和葉綠體的內含子,也不適合于tRNA和某些編碼rRNA的核結構基因,酵母的分支位點序列是高度
第1類內含子自我剪接rRNA的自我剪接介紹
第1類內含子,其5’剪接點和3’剪接點的序列絕大部分為…外顯子…U↓…內含子…G↓…外顯子…,除了剪接點序列特征之外,第1類內含子還具有比較保守的4種10一12核苷酸的序列,分別以5’-P-Q-R-S-3’表示,P、Q、R、S的一致序列。序列能與Q序列互補,R序列能與S序列互補,形成一個所謂中部
專訪汪洋:具有抑癌作用的“電影剪輯大師”
人類基因組中大約有25,000個基因,這個數字不大,甚至和小小的果蠅基因數目相同,那區別于其它動物的人類智能,還有“千人千面”的多種族多面孔,又是如何而來呢?科學家告訴我們其中的一個重要原因就在于人類基因組DNA序列能以不同的方式拼接在一起,創建各種信使RNA,從而產生了人類需要的許多不同蛋白質
研究發現全新自主產權抗腫瘤選擇性抑制劑
近日,西安交通大學藥學院李義平教授團隊和美國佛羅里達大學藥學院李成龍教授開展國際合作,針對磷脂酰肌醇-3-激酶α(PI3Kα)選擇性抑制劑的發現,歷經十年,在設計合成的600多個6H-苯并[c]苯并吡喃母核化合物中,發現了全新結構、具有完全自主知識產權的PI3Kα選擇性抑制劑,編號為XJTU-L45
組織選擇性如何作用于腫瘤抑制基因BAP1
眾所周知,腫瘤抑制基因的喪失導致一小部分癌癥出現在特定組織中。但是為什么僅是那些組織? 由腫瘤抑制基因發生突變引起的惡性腫瘤具有不明原因的組織傾向性。比如,一種稱為BAP1的腫瘤抑制基因編碼組蛋白H2A的去泛素化酶,但是生殖細胞中的BAP1突變主要與葡萄膜黑色素瘤和間皮瘤存在關聯。 在一項新
關于RNA剪接的簡介
大多數脊椎動物基因的編碼序列,無論是編碼多肽的基因還是編碼除mRNA以外的RNA分子的基因,都是由非編碼的間隔序列(內含子)分隔為各個外顯子部分。這些基因的外顯子和內含子都轉錄在一條初級RNA轉錄分子中,接下來,此初級RNA轉錄分子要經過RNA剪接,此過程包括一系列的加工反應:RNA的內含子部分
關于基因剪接的簡介
基因組中或基因組間發生遺傳信息的重新組合,被稱為DNA重組(DNA recombination),其中發生在基因組中的DNA重組又稱DNA重排。包括同源重組、特異位點重組和轉座重組等類型,廣泛存在于各類生物。體外通過人工DNA重組可獲得重組體DNA,是基因工程中的關鍵步驟。